大白猪和莱芜猪肌内脂肪组织circRNAs的鉴定与分析

旨在探索circRNAs在脂肪组织可能发挥的潜在作用,为了解circRNA调控脂肪沉积和脂代谢作用的机制奠定基础。本研究采用RNA-Seq和生物信息学方法鉴定大白和莱芜猪肌内脂肪组织中circRNAs的表达情况,运用miRanda和Targetscan对差异表达circRNA进行靶基因预测,对靶基因进行GO和KEGG富集分析。结果发现,181个差异表达circRNAs得到鉴定,其中,102个在莱芜猪肌内脂肪组织中上调表达,79个下调表达。并对具有较多miRNA结合位点的ssc_circ_0002807、ssc_circ_0009352靶基因进行了GO和KEGG富集分析,发现靶基因富集于胆固醇平衡和磷脂平衡等与脂代谢相关的生物学过程。通过qRT-PCR,验证了ssc_circ_0002807、ssc_circ_0005382、ssc_circ_0009172和ssc_circ_0004824,与测序结果一致。由此推断,ssc_circ_0002807与ssc_circ_0009352可能参与调控脂肪沉积和脂质代谢。

环状RNA与自身免疫性疾病

环状RNA（circRNA）是形成共价闭合的RNA环的非编码RNA,circRNA的发现揭示了转录后基因表达调控的新的层面。目前对circRNA功能的认知虽然有限,但已发现的一些关于circRNA的信息已显示出其具有吸附微小RNA（miRNA）的海绵作用和调节基因表达的作用。目前报道得最清楚的是关于circRNA CDR1as可作为miR-7的海绵的研究。miRNA在自身免疫性疾病的发病及进程中起着重要的作用,而circRNA又可作为海绵吸附miRNA,具有基因表达调控的作用,因此circRNA与自身免疫性疾病密切相关并且可能成为自身免疫性疾病的潜在治疗靶点。未来的研究可深入探究circRNA和自身免疫性疾病之间的关系。本文对circRANs的识别和功能进行综述,并介绍circRNA与人类疾病之间的关联,探索circRNA在自身免疫性疾病的潜在作用。