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利用TCGA及GEO数据集分析claudin11在胃癌中的表达及临床意义 被引量:4
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作者 王硕 李智 +5 位作者 郑春雷 曲秀娟 刘静 曲晶磊 车晓芳 刘云鹏 《武警后勤学院学报(医学版)》 CAS 2016年第6期424-427,F0003,共5页
【目的】研究claudin11在胃癌中的表达及临床价值,预测claudin11参与肿瘤发生发展的机制。【方法】从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)和人类肿瘤相关的基因表达汇编(gene expression omnibu,GEO)数据库收集胃癌数据集,下... 【目的】研究claudin11在胃癌中的表达及临床价值,预测claudin11参与肿瘤发生发展的机制。【方法】从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)和人类肿瘤相关的基因表达汇编(gene expression omnibu,GEO)数据库收集胃癌数据集,下载claudin11基因表达谱及临床信息。分析claudin11表达和临床病理学参数的相关性及对预后的影响。采用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)方法预测claudin11的调控基因。【结果】在TCGA数据集中claudin11表达水平与年龄(P=0.031)、T分期(P=0.007)、有无淋巴结转移(P=0.039)、TNM分期(P=0.03)及分化程度(P<0.001)相关。Claudin11高表达患者总生存期明显短于低表达患者(P<0.001)。Claudin11高表达样本富集了细胞黏附、紧密连接、细胞外基质、骨架蛋白调控等相关等基因集。【结论】Claudin11在胃癌中是一种不良预后因素,可以作为判断预后的标志物。 展开更多
关键词 胃癌 癌症基因组图谱 人类肿瘤相关的基因表达汇编 claudin11 预后
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