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Molecular Cloning and Expression Analysis of a FT Homologous Gene from Solanum tuberosum 被引量:1
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作者 FAN Chun-yuan YIN Jing-ming +2 位作者 WANG Bing ZHANG Yun- feng YANG Qing 《Agricultural Sciences in China》 CSCD 2010年第8期1133-1139,共7页
A homologue of flowering locus T gene, designated StFT, was isolated from Solanum tuberosum by reverse transcriptasepolymerase chain reaction (accession no. GU223211). The DNA sequence of StFT was 1 626 bp long and ... A homologue of flowering locus T gene, designated StFT, was isolated from Solanum tuberosum by reverse transcriptasepolymerase chain reaction (accession no. GU223211). The DNA sequence of StFT was 1 626 bp long and contained four exons and three introns. The open reading frame of the gene was 522 bp long and encoded a putative protein of 173 amino acids with a molecular weight of 19.75 kD and a theoretical pI of 7.76. StFT protein had a conserved PBP domain and a higher degree of identity with FT homologous members from other species. Analysis on the mRNA levels of StFT showed that it was highly expressed in leaves, apical buds, flowers, and swelling stolons. Further analysis indicated that its expression was regulated by CONSTANS gene in StCOL-antisense transgenic potato plants. 展开更多
关键词 cloning expression stft gene solanum tuberosum
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Isolation of a Plasmalemma Aquaporin Encoding Gene StPIP1 from Solanum tuberosum L. and Its Expression in Transgenic Tobacco 被引量:1
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作者 WU Wang-ze PENG Xiao-li WANG Di 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2009年第10期1174-1186,共13页
Aquaporin (AQP) belongs to a highly conserved group of membrane proteins considered as major intrinsic proteins, which facilitate water transport across biological membranes. The discovery of AQPs in plants has resu... Aquaporin (AQP) belongs to a highly conserved group of membrane proteins considered as major intrinsic proteins, which facilitate water transport across biological membranes. The discovery of AQPs in plants has resulted in a paradigm shift in the understanding of plant-water relations, however, the potential relationship between the role of aquaporins in regulating plant water balance and drought tolerance still remains elusive. In this study, the gene encoding potato AQP cDNA, StPIP1 (GenBank accession no. DQ999080), was cloned from the leaf of potato cultivar Gannongshu 2 by reverse transcription-PCR (RT-PCR). Sequence alignment was made by BLASTn in GenBank, the phylogenetic analysis was conducted using PHYLIPWY, the 3D structure was predicted in Swiss-Model server. Subcellular localization of StPIP1 was performed by constructing CaMV35S-StPIP1-GFP and rd29A-StPIP1-GFP fusion proteins and transient expression in onion epidermis. To understand StPIP1 physiological functions in potato under various stress conditions, the StPIP1 gene in a reverse orientation was transformed into tobacco driven by the Cauliflower mosaic virus (CMV) 35S promoter. The expression levels of transgenic and wild-type plants were assessed under various abiotic stress conditions using semi-quantitative RT-PCR, and the morphological and physiological responses of transgenic plants to different stress conditions were investigated. The expression of StPIP1 mRNA decreased in transgenic plants under non-stress and stress conditions, however, the reduction was more severer under drought stress. In both non-stress and stress conditions, StPIP1 was expressed predominantly in root. The morphological and physiological investigation showed no significant differences in growth rate, germination rate, and root fresh weight (FW) between transgenic and wild-type plants when grown under favorable conditions. In contrast, under drought stress, the reduction in StPIPI expression leads to a delay in seed germination and seedling growth, accelerated seedling wilt, and leaf morphological abnormity. Under "enough" water conditions (i.e., water culture), the aerial parts of anti-sense plants showed no differences. However, for the aerial parts to accumulate the same amount of biomass, transgenic plants needed about 3 times more abundant root system to transport water for plant growth than wild-type plants. Morphological investigation showed that the reduction in StPIP1 expression increased the root system in transgenic plants under drought stress. As a result, the increase of root mass might compensate the reduced cellular water permeability in order to ensure a sufficient water supply for the plant. Results demonstrated that StPIP1 plays an important role for water transportation in potato, especially under drought stress conditions. The reduced expression of StPIP1 decreases the cellular water transport and influences the expression of endogenous AQPs genes and thereby, has impacts on seed germination, seedling growth, and stress responses of potato to drought conditions. 展开更多
关键词 AQUAPORIN solanum tuberosum L. drought stress gene cloning sequence analysis gene expression
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Differential Space-Time Expression of StLTPbl Gene Between Resistant and Susceptible Potato Genotypes in Response to Ralstonia solanacearum
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作者 GAO Gang JIN Li-ping +1 位作者 XIE Kai-yun QU Dong-yu 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2008年第6期713-725,共13页
This study is to investigate the role of lipid transfer protein (LTP1) gene of potato (Solanum tuberosum) in bacterial wilt (Ralstonia solanacearum) resistance. A novel cDNA clone encoding nsLTP was isolated fro... This study is to investigate the role of lipid transfer protein (LTP1) gene of potato (Solanum tuberosum) in bacterial wilt (Ralstonia solanacearum) resistance. A novel cDNA clone encoding nsLTP was isolated from cultivated potato (Solanum tuberosum) infected with R. solanacearum by 5'-rapid amplification of cDNA ends (RACE). The temporal and spatial expression of StLTPbl was studied during the early stages of potato-R, solanacearum interaction by reverse transcriptase PCR (RT-PCR) and Northern blotting. The sequence analysis of the cloned cDNA, named StLTPbl, showed 691 bp which encoded a type 1 nsLTP of 91 amino acids. Construction of a phylogenic tree showed that StLTPbl is well conserved in the coding region with high identity at the amino acid level with other Solanaceae nsLTPs. The temporal and spatial expression of StLTPbl was studied during the early stages of potato-R, solanacearum interaction. StLTPbl transcription is induced faster and transcripts accumulate to higher concentrations in resistant compared with susceptible genotypes by the pathogen. Dominant differences in the pathogen-induced gene expression pattern between the upper and lower leaves and stems were observed within the same genotypes. In situ hybridization results showed that the StLTPbl mRNA was localized in phloem cells of vascular tissues in potato leaf and stem tissues after pathogen infection. Salicylic acid, methyl jasmonate and abscisic acid could induce StLTPbl gene expression without significant difference between the upper and lower tissues. These abiotic elicitors could produce a long-lastingeffect on the StLTPbl during early stages of potato-R, solanacearum interaction. Differential expression of StLTPbl gene between resistance and susceptible potato genotypes in response to R. solanacearum suggests that this gene plays a key role in plant defense mechanisms. 展开更多
关键词 solanum tuberosum NSLTP gene expression Ralstonia solanacearum
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Effects of Cerium on Accumulation of Anthocyanins and Expression of Anthocyanin Biosynthetic Genes in Potato Cell Tissue Cultures 被引量:17
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作者 卢其能 杨清 邹华文 《Journal of Rare Earths》 SCIE EI CAS CSCD 2006年第4期479-484,共6页
The effects of Ce (Ⅳ) on callus growth, anthocyanin content, and expression of anthocyanin biosynthetic genes in callus suspension cultures of Solanum tuberosum cv. Chieftain were studied by the measurement of fres... The effects of Ce (Ⅳ) on callus growth, anthocyanin content, and expression of anthocyanin biosynthetic genes in callus suspension cultures of Solanum tuberosum cv. Chieftain were studied by the measurement of fresh weight, spectrophotometric assays, and semiquantitative RT-PCR. The results indicate that 0.1 mmol·L^- 1 Ce ( Ⅳ ) can promote callus growth, increase the accumulation of anthocyanins, and enhance the expression of five anthocyanin biosynthetic genes ( CHS, F3H, F3'5'H, DFR, and 3 GT) most efficiently. At high concentrations of 1 mmol·L^- 1, Ce (Ⅳ) partially inhibits callus growth and at 2 mmol· L^-1 eventually lends to cell death. The results show that Ce( Ⅳ ) can induce the expression of anthocyanin biosynthetic genes to produce and accumulate anthocyanins and increase the yield of anthocyanins. 展开更多
关键词 anthocyanins CERIUM callus suspensive culture expression of genes solanum tuberosum cv. Chieftain rare earths
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马铃薯PYL5基因对非生物胁迫的响应分析及其启动子的活性鉴定
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作者 张春利 解潇飞 +7 位作者 张莹 张锋 孙超 毕真真 刘玉汇 刘震 姚攀锋 白江平 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期302-313,共12页
【目的】脱落酸(ABA)作为一种“应激激素”在植物生长发育和响应干旱、盐等非生物胁迫过程中发挥重要作用,PYR/PYL/RCARs(以下简称“PYL”)作为ABA受体在多种植物中也被广泛研究。基于对马铃薯StPYL5基因生物信息学及表达模式分析,并通... 【目的】脱落酸(ABA)作为一种“应激激素”在植物生长发育和响应干旱、盐等非生物胁迫过程中发挥重要作用,PYR/PYL/RCARs(以下简称“PYL”)作为ABA受体在多种植物中也被广泛研究。基于对马铃薯StPYL5基因生物信息学及表达模式分析,并通过对其启动子活性鉴定,为进一步揭示马铃薯StPYL5功能及抗逆育种提供依据。【方法】根据转录组数据克隆得到StPYL5基因,通过DNAMAN、MEGA等软件分析了StPYL5的分子特征;通过qPCR检测了StPYL5基因的组织特异性及其对非生物胁迫的响应;利用PlantCARE网站对StPYL5基因启动子进行了分析,并通过瞬时转化烟草对其活性进行了鉴定。【结果】StPYL5基因全长534 bp,共编码177个氨基酸,蛋白质分子量20.19 ku,理论等电点(pI)为5.97。系统进化分析显示,StPYL5与SpPYL9-like亲缘关系较近。组织特异性分析结果显示,青薯9号(QS9)中StPYL5在根和叶中表达量较高,其次分别是茎和花,在块茎中表达量较低。不同胁迫下StPYL5表达量分析表明,青薯9号(QS9)中StPYL5在干旱、低温、盐和ABA胁迫下的表达量先升高后降低,且StPYL5的表达受Me JA和SA的诱导。此外,笔者成功克隆得到2 000 bp的StPYL5基因启动子。在烟草中的瞬时转化后的组织化学染色结果表明,StPYL5基因启动子具有成功启动下游GUS报告基因表达的启动子活性。【结论】全面分析了StPYL5基因的分子特征及其在多种非生物胁迫下的表达谱,并成功克隆到具有活性的pStPYL5启动子,该结果为深入研究StPYL5基因的功能以及马铃薯抗逆育种提供依据。 展开更多
关键词 马铃薯 ABA信号通路 StPYL5 基因克隆 非生物胁迫 表达分析
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蒜芥茄SsFLS2基因的克隆及其表达分析
6
作者 孙茂 吴丽艳 +4 位作者 龚亚菊 鲍锐 桂敏 黎志彬 杜光辉 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第8期1669-1676,共8页
【目的】克隆云南野生蒜芥茄(Solanum sisymbriifolium Lam.)中的FLS2基因,并对其编码蛋白的理化性质、亚细胞定位、系统进化以及表达情况予以分析,初步探究野茄FLS2基因在黄萎病胁迫下的生物学功能。【方法】基于前期所测转录组数据(... 【目的】克隆云南野生蒜芥茄(Solanum sisymbriifolium Lam.)中的FLS2基因,并对其编码蛋白的理化性质、亚细胞定位、系统进化以及表达情况予以分析,初步探究野茄FLS2基因在黄萎病胁迫下的生物学功能。【方法】基于前期所测转录组数据(蒜芥茄接种黄萎病病原菌),克隆获取蒜芥茄FLS2基因,命名为SsFLS2;利用生物信息学分析软件对SsFLS2基因的理化性质进行分析,并通过实时荧光定量PCR(Real-time fluorescence quantitative PCR,RT-qPCR)检测其在蒜芥茄根、茎、叶的表达以及在接种黄萎病病原菌后不同时间的表达情况。【结果】蒜芥茄SsFLS2基因全长3655 bp,具有完整的ORF框,编码1126个氨基酸。其编码蛋白的分子式为C_(5596)H_(8814)N_(1494)O_(1627)S_(4),理论分子量为124.34 kD,理论等电点(pI)为7.33,总平均亲水性系数为0.081。该蛋白二级结构主要由42.81%的无规则卷曲、40.23%的α-螺旋、13.23%的延伸链以及3.73%的β-折叠组成,且存在跨膜结构,定位于细胞膜上,其中可被磷酸化且超过阈值线的位点,共计151个。SsFLS2蛋白的氨基酸序列与马铃薯(Solanum tuberosum)同源蛋白(XP 006358149.2)的关系最近。RT-qPCR检测发现,在蒜芥茄根、茎、叶中均有SsFLS2基因的表达,且根、叶中的相对表达量极显著高于茎部;接种黄萎病病原菌后72 h内,处理组和对照组均在24 h时,SsFLS2基因的相对表达量大幅度增加且极显著高于其他时间点。【结论】本研究成功克隆蒜芥茄的SsFLS2基因,并对其编码蛋白的理化性质及基因表达情况等进行分析。结果表明,SsFLS2是蒜芥茄响应黄萎病胁迫的重要基因,结果可为进一步研究该基因在蒜芥茄黄萎病抗性中的功能奠定基础。 展开更多
关键词 蒜芥茄 Flagellin sensing 2(FLS2) 基因克隆 生物信息学 基因表达
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野生茄子(Solanum torvum)抗黄萎病相关基因StoVe1的克隆与分析 被引量:12
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作者 史仁玖 殷玥 +4 位作者 王忠 陈敏 黄权生 黄乐平 杨清 《植物生理学通讯》 CSCD 北大核心 2006年第4期638-642,共5页
采用RT-PCR和RACE技术从野生茄子中扩增克隆到一个抗黄萎病相关基因,命名为StoVe1,其cDNA全长3400bp,含有3153bp的完整开放阅读框,编码1051个氨基酸,该基因编码的蛋白序列与刚果野茄、类番茄和番茄Ve1编码的氨基酸序列同源性分别为82%、... 采用RT-PCR和RACE技术从野生茄子中扩增克隆到一个抗黄萎病相关基因,命名为StoVe1,其cDNA全长3400bp,含有3153bp的完整开放阅读框,编码1051个氨基酸,该基因编码的蛋白序列与刚果野茄、类番茄和番茄Ve1编码的氨基酸序列同源性分别为82%、81%和80%,且有很高的功能区段保守性。将该cDNA全长序列提交GenBank,登陆号为DQ020574。半定量PCR表明该基因为组成型表达,在根中表达最多,叶中最少。 展开更多
关键词 野生茄子 StoVel基因 克隆 表达
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马铃薯WOX基因家族的鉴定及在离体再生和非生物胁迫中的表达分析
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作者 张玉 石磊 +7 位作者 巩檑 聂峰杰 杨江伟 刘璇 杨文静 张国辉 颉瑞霞 张丽 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期170-180,共11页
【目的】WUSCHE-相关同源盒(WUSCHEL-related homeobox,WOX)基因家族是植物特有的转录因子家族,在植物生长发育、干细胞分化调控、逆境胁迫响应等过程中扮演重要角色。开展马铃薯WOX基因家族鉴定与功能研究,将为马铃薯遗传改良提供优良... 【目的】WUSCHE-相关同源盒(WUSCHEL-related homeobox,WOX)基因家族是植物特有的转录因子家族,在植物生长发育、干细胞分化调控、逆境胁迫响应等过程中扮演重要角色。开展马铃薯WOX基因家族鉴定与功能研究,将为马铃薯遗传改良提供优良基因资源与理论依据。【方法】基于拟南芥、番茄、烟草和水稻WOX蛋白序列,利用HMMER 3.0和BLASTP鉴定马铃薯WOX基因家族成员,使用MCScanX软件分析WOX基因家族成员在马铃薯种内及种间的共线性,并采用邻接法构建系统发育进化树。利用ExPASy、GSDS等软件分析马铃薯WOX基因家族成员理化性质、基因结构、蛋白motif、启动子区域转录因子结合位点。基于PGSC数据库中马铃薯转录组数据,分析StWOXs在不同组织和非生物胁迫下的表达模式;以可能参与离体再生过程的StWOX5作为候选基因,利用实时荧光定量PCR技术分析该基因在具有不同离体再生能力的4个马铃薯品种(系)再生过程中的表达情况。【结果】鉴定得到11个马铃薯WOX基因家族成员,分布在5条染色体上,分为WUS、中间和古老共3个进化分支,不同分支中StWOXs基因结构、蛋白motif组成、转录因子结合位点类型和数量存在不同程度的差异。表达模式结果表明,马铃薯WOX基因家族成员参与离体再生和非生物胁迫响应,StWOX4/5/11/13在愈伤组织中特异表达,StWUS、StWOX1/3c/4/5/13在甘露醇处理下上调表达,StWOX3a/11在NaCl处理下上调表达,StWOX4/5/13在热胁迫中上调表达,且StWOX5相对表达量与愈伤组织分化率呈正相关。【结论】不同马铃薯WOX基因具有潜在的功能多样性,StWOX5具有促进马铃薯离体再生分化的作用,参与了非生物胁迫反应。 展开更多
关键词 马铃薯 WOX基因家族 愈伤组织 基因表达
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蒜芥茄PR-10基因的克隆与表达分析 被引量:1
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作者 程捷 张涵雪 +4 位作者 蔚亚楠 尹梦莹 董相书 吴丽艳 杜光辉 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2023年第8期1569-1578,共10页
黄萎病是由轮枝菌属(Verticillium spp.)真菌引起的一种土传病害,是茄子生产中的重要病害之一,严重影响茄子的产量和品质。目前,对于茄子黄萎病的防治还限于嫁接和化学防治,但二者均不能较好防止该病的发生,而挖掘茄子中黄萎病抗性基因... 黄萎病是由轮枝菌属(Verticillium spp.)真菌引起的一种土传病害,是茄子生产中的重要病害之一,严重影响茄子的产量和品质。目前,对于茄子黄萎病的防治还限于嫁接和化学防治,但二者均不能较好防止该病的发生,而挖掘茄子中黄萎病抗性基因,结合基因工程技术培育抗病品种,是防治黄萎病的最佳途径。蒜芥茄(Solanum sisymbriifolium Lam.)为云南野生茄,对黄萎病具有高抗性。PR基因是编码植物病程相关蛋白(pathogenesis related protein)的基因,与植物抗病防御密切相关,其中,PR10蛋白是具有核酸酶相似结构的一类蛋白,但其在蒜芥茄中的抗病作用机制尚不明确。本研究以蒜芥茄为试验材料,利用前期建立的蒜芥茄转录组数据库,通过RT-PCR技术从中分离并克隆得到PR10同源基因,命名为SsPR-10,测序得到645 bp,其中基因编码区长480 bp,共编码159个氨基酸。将测序得到的编码区序列进行生物信息学分析,结果显示:SsPR-10蛋白是分子量为17.71 kDa、等电点为5.54的酸性亲水蛋白;跨膜区和信号肽预测显示SsPR-10蛋白无跨膜区和信号肽;亚细胞定位结果表明SsPR-10定位于细胞质;保守结构域预测结果显示,SsPR-10含有“P-LOOP”环(47~52位)和保守序列PATHOGENESIS_BETVI(88~120位)。序列比对与系统进化树分析结果表明,SsPR-10蛋白与黄果茄PR10蛋白同源性最高,其次是马铃薯STH-2蛋白。通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术对SsPR-10基因的表达进行分析,SsPR-10在蒜芥茄根部的表达量最高,具有组织特异性;在接种大丽轮枝菌(V.dahliae)24h后,SsPR-10的表达量达到初始表达量的8.16倍,表明黄萎病病菌可能诱导SsPR-10的表达。本研究对野生蒜芥茄PR-10基因进行了克隆和表达分析,为进一步研究SsPR-10基因响应黄萎病等生物胁迫的机制提供一定的理论基础。 展开更多
关键词 蒜芥茄 PR10蛋白 基因克隆 表达分析
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马铃薯非特异性脂质转移蛋白基因StLTPa1的克隆和表达 被引量:12
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作者 郜刚 任彩虹 +2 位作者 金黎平 谢开云 屈冬玉 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期1510-1517,共8页
非特异性脂质转移蛋白(nsLTP)是植物中大量存在的小分子脂类结合蛋白,具有多种生物学功能,如抗菌防御、信号传导、胞壁松弛、蛋白酶抑制等。通过接种青枯菌(Ralstonia solanacearum),从马铃薯栽培品种中薯3号中获得一个新的非特异性脂... 非特异性脂质转移蛋白(nsLTP)是植物中大量存在的小分子脂类结合蛋白,具有多种生物学功能,如抗菌防御、信号传导、胞壁松弛、蛋白酶抑制等。通过接种青枯菌(Ralstonia solanacearum),从马铃薯栽培品种中薯3号中获得一个新的非特异性脂质转移蛋白cDNA克隆StLTPa1,序列分析表明该基因含636bp核苷酸,编码91个氨基酸,属于I类非特异性脂质转移蛋白。基于氨基酸序列构建的系统发生树揭示,该基因与其他茄科nsLTP具有高度保守的序列相似性,核酸和氨基酸水平分别具75%~85%和60%~92%的同源性。对该基因在互作早期基因表达时空性分析表明,StLTPa1基因不仅受病菌的诱导,在不同抗、感病的马铃薯基因型中差异表达,而且受一定浓度外源非生物激发子如水杨酸、茉莉酸和脱落酸的诱导并产生一定时间的持续效应,其诱导表达模式也表现出一定的差异。原位杂交结果显示StLTPa1主要在马铃薯茎、叶维管束系统的韧皮部细胞中表达。这些结果说明StLTPa1基因受病菌和非生物激发子诱导,在植物防御反应中发挥作用。 展开更多
关键词 马铃薯 非特异性脂质转移蛋白 StLTPa1 克隆 表达
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紫色马铃薯查尔酮合成酶基因(CHS)的克隆及分析 被引量:14
11
作者 胡朝阳 周友凤 +3 位作者 龚一富 金思 王何瑜 赵群芬 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期832-839,共8页
【目的】从紫色马铃薯中克隆CHS的cDNA全长序列,并分析其组织表达水平以及诱导剂处理后基因的表达与花青素含量积累之间的关系。【方法】采用RT-PCR和RACE方法克隆紫色马铃薯CHS的cDNA全长序列,通过在线软件进行核苷酸序列和氨基酸序列... 【目的】从紫色马铃薯中克隆CHS的cDNA全长序列,并分析其组织表达水平以及诱导剂处理后基因的表达与花青素含量积累之间的关系。【方法】采用RT-PCR和RACE方法克隆紫色马铃薯CHS的cDNA全长序列,通过在线软件进行核苷酸序列和氨基酸序列分析,半定量RT-PCR检测StCHS在紫色马铃薯组织中的表达特异性以及蔗糖和赤霉素处理后StCHS的表达。采用分光光度计法测定紫色马铃薯花青素含量。【结果】克隆获得紫色马铃薯CHS的cDNA全长1 490 bp,包含1 170 bp的ORF,该基因编码389个氨基酸。推测StCHS蛋白含有Cys164、Phe215、His303和Asn3364个活性位点,构成CHS蛋白的催化中心。StCHS的表达具有组织特异性,在茎、叶柄和叶中表达较强,在根、块茎和叶轴中几乎检测不到CHS的表达。赤霉素能促进CHS的表达从而促进花青素的积累;蔗糖能够显著促进紫色马铃薯花青素的积累,但对CHS的表达影响不明显。【结论】从紫色马铃薯中克隆获得CHS的cDNA全长序列,该基因表达具有组织特异性,StCHS是紫色马铃薯花青素合成途径中的一个限速酶基因。 展开更多
关键词 紫色马铃薯 查耳酮合成酶基因 花青素 赤霉素 蔗糖 基因表达
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马铃薯SGAs合成代谢途径末端SGT酶基因克隆及序列分析 被引量:11
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作者 牛继平 张金文 +3 位作者 王旺田 王蒂 陆艳梅 张俊莲 《草业学报》 CSCD 北大核心 2012年第3期106-116,共11页
糖苷生物碱(SGAs)是一类存在于茄科植物和百合科植物的重要次生代谢物,与植物抗逆性和产品品质有密切关系,同时在医药上具有广泛的药理学活性。茄啶:糖基转移酶(SGT)为SGAs合成代谢途径末端关键酶,研究其基因结构及其编码的酶蛋白特性,... 糖苷生物碱(SGAs)是一类存在于茄科植物和百合科植物的重要次生代谢物,与植物抗逆性和产品品质有密切关系,同时在医药上具有广泛的药理学活性。茄啶:糖基转移酶(SGT)为SGAs合成代谢途径末端关键酶,研究其基因结构及其编码的酶蛋白特性,对于调控植物体内SGAs合成及其通过微生物发酵生产SGTs有重要的作用和意义。通过生物信息学分析方法预测3个糖基转移酶cDNA编码的酶蛋白结构和特性。以马铃薯块茎表皮总RNA为模板,采用RT-PCR的方法扩增出3个糖基转移酶(SGT1、SGT2和SGT3)基因片段并克隆到pMDR19-T载体。阳性克隆经PCR鉴定后进行测序,序列分析结果表明,克隆到的sgt1、sgt2和sgt3三个同源的序列片段(1 467~1 518bp),编码488~505个氨基酸;所得序列与GenBank中注册的高等植物SGT酶基因核苷酸序列(U82367.2、DQ 218276.1和DQ 266437)的同源性均在99.12%以上,氨基酸同源性达到99%以上,3个基因都具有UDPG糖基转移酶保守结构域及许多重要功能位点;PI为5.52~5.62。三级结构预测表明,该氨基酸同糖基转移酶单体结构模型相似,都为糖基转移酶家族成员,具有合成类固醇糖苷生物碱的功能,基因序列已注册到Gen-Bank,序列注册号分别为:sgt1,JN695005;sgt2,JN695006;sgt3,HM188447。 展开更多
关键词 马铃薯 糖苷生物碱 茄啶糖苷转移酶 基因克隆 生物信息学分析
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马铃薯HMGR基因的克隆、序列分析及其表达特征 被引量:12
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作者 陈大华 叶和春 +1 位作者 李国凤 刘彦 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2000年第7期724-727,共4页
采用RT_PCR技术 ,从马铃薯 (SolanumtuberosumL .)幼叶中克隆了一个约 1.0kb的cDNA片段 ,序列分析结果表明 ,该cDNA与已报道的马铃薯HMGR基因家族的三种类型基因具有较高核酸序列同源性 ,与HMGRⅠ基因同源性为 77.0 % ,HMGRⅡ基因为 93.... 采用RT_PCR技术 ,从马铃薯 (SolanumtuberosumL .)幼叶中克隆了一个约 1.0kb的cDNA片段 ,序列分析结果表明 ,该cDNA与已报道的马铃薯HMGR基因家族的三种类型基因具有较高核酸序列同源性 ,与HMGRⅠ基因同源性为 77.0 % ,HMGRⅡ基因为 93.2 % ,HMGRⅢ基因为 77.1%。其中 3′端非翻译区序列与HMGRⅠ、HMGRⅡ、HMGRⅢ三种基因同源性分别为 5 0 .2 %、80 .3%和 5 0 .7% ,因此推测该cDNA片段为HMGR基因家族中HMGRⅡ亚基因家族新发现的成员之一 ,命名为HMGR_c2。以特异探针进行的Southern杂交结果初步证明 ,HMGR_c2基因至少以两个以上拷贝形式存在于马铃薯基因组中 ;Northern杂交分析表明 ,HMGR_c2基因的全长mRNA约为 2 .0kb。定量RT_PCR分析表明 ,HMGR_c2基因在根、茎、叶等组织中均有表达 ,且在叶片表达量最高 ,约为根、茎的两倍。 展开更多
关键词 马铃薯 HMGR基因 序列分析 表达 类异戊二烯代谢
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马铃薯WRKY6基因的克隆、序列分析与原核表达研究 被引量:9
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作者 李立芹 黄玉碧 王西瑶 《草业学报》 CSCD 北大核心 2011年第2期177-183,共7页
在高等植物中WRKY转录因子家族成员众多,它广泛参与植物对生物胁迫、非生物胁迫、生长发育和代谢过程的调控。本研究采用同源序列克隆的方法获得马铃薯WRKY6基因,序列分析表明该蛋白属于WRKY家族第3组成员,锌指结构为C-X7-C-X23-H-X-C... 在高等植物中WRKY转录因子家族成员众多,它广泛参与植物对生物胁迫、非生物胁迫、生长发育和代谢过程的调控。本研究采用同源序列克隆的方法获得马铃薯WRKY6基因,序列分析表明该蛋白属于WRKY家族第3组成员,锌指结构为C-X7-C-X23-H-X-C。构建系统发育树结果表明它与拟南芥WRKY70亲缘关系较近,相似性达58%。然后将其完整编码区构建到大肠杆菌表达载体。在培养温度18℃条件下添加0.2 mmol/L IPTG(异丙基硫代半乳糖苷),诱导培养8 h可获得高表达融合蛋白。进一步实验获得特异性和纯度非常高的纯化蛋白。本研究为进一步确定该蛋白的体外活性及生物学功能奠定了坚实基础。 展开更多
关键词 马铃薯 WRKY 克隆 序列分析 原核表达
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马铃薯类黄酮-3-O-葡萄糖基化酶基因的克隆与表达分析 被引量:20
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作者 卢其能 杨清 沈春修 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2009年第4期11-16,共6页
根据茄科植物花色苷生物合成相关基因的资料,设计简并引物,通过RT-PCR的方法从马铃薯(Solanum tuberosumcv.Chieftain)紫色芽的cDNA中克隆到类黄酮-3-O-葡萄糖基化酶基因(3GT)的全长cDNA。序列分析表明,这个3GT基因编码的多肽为448个氨... 根据茄科植物花色苷生物合成相关基因的资料,设计简并引物,通过RT-PCR的方法从马铃薯(Solanum tuberosumcv.Chieftain)紫色芽的cDNA中克隆到类黄酮-3-O-葡萄糖基化酶基因(3GT)的全长cDNA。序列分析表明,这个3GT基因编码的多肽为448个氨基酸残基,在氨基酸水平上与茄科的矮牵牛和茄子的一致性最高,均为76%,多重比较和系统发育分析均表明,该基因为3GT家族中的一个新成员。用半定量RT-PCR进行了表达分析表明,3GT在根、叶和块茎中的表达量远高于茎和花;此外,3GT在Chieftain的红色愈伤组织中表达而在非红色愈伤组织中不表达,可见,3GT的表达与花色苷的积累是相关的。 展开更多
关键词 花色苷 CDNA克隆 表达模式 solanum tuberosum 类黄酮-3-O-葡萄糖基化酶
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马铃薯PPR蛋白家族基因SoDIPPR的克隆及其在干旱条件下的表达特征分析 被引量:8
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作者 范敏 金黎平 +1 位作者 刘庆昌 屈冬玉 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第8期2249-2257,共9页
【目的】PPR(pentatricope ptide repeat)蛋白家族在植物的生长发育、细胞器形成、细胞质雄性不育的育性恢复、RNA的编辑加工、细胞核与细胞器之间信号传递、逆境防御等方面具有重要作用。研究旨在了解PPR蛋白家族SoDIPPR基因在马铃薯... 【目的】PPR(pentatricope ptide repeat)蛋白家族在植物的生长发育、细胞器形成、细胞质雄性不育的育性恢复、RNA的编辑加工、细胞核与细胞器之间信号传递、逆境防御等方面具有重要作用。研究旨在了解PPR蛋白家族SoDIPPR基因在马铃薯中的表达情况及其在干旱胁迫下的作用【。方法】以抗旱马铃薯二倍体品系H145为材料,利用cDNA-AFLP技术寻找与抗旱性密切相关的基因cDNA片段,利用RACE技术克隆其基因全长cDNA,并利用半定量RT-PCR和Northern杂交法研究其在干旱条件下的表达情况。【结果】从抗旱马铃薯二倍体品系H145中克隆了一个836bp全长cDNA序列,命名为SoDIPPR,该序列开放阅读框长为588bp,编码195个氨基酸序列。序列分析表明,SoDIPPR蛋白存在PPR结构域、激酶结合区、和C端SMR(small MutS related protein)区域。SoDIPPR蛋白序列与GenBank数据库中的其它PPR蛋白进行同源序列比对,构建系统进化树,发现SoDIPPR与其它14个高等植物的PPR蛋白同源性为57%~82%,与苜蓿DNA错配修复蛋白MuTs2、水稻盐诱导蛋白(Q9LS25)和叶绿体RNA结合蛋白(Q75IP8)的同源性达69%~82%。半定量RT-PCR和Northern杂交结果表明,SoDIPPR基因在干旱胁迫下叶片和根系里的表达量明显增加,说明SoDIPPR基因在马铃薯抗旱中起一定作用。在持续干旱条件下,SoDIPPR基因在抗旱品系H145与干旱敏感品系H214中表达模式不同。【结论】马铃薯SoDIPPR基因编码的蛋白与其它植物PPR家族蛋白同源性较高,SoDIPPR基因参与马铃薯对干旱胁迫的应答反应,可能对抵抗干旱胁迫有一定作用。 展开更多
关键词 马铃薯(Solarium tuberosum L.) 抗旱性 全长CDNA PPR(pentat ricopeptide repeat)蛋白 克隆 表达
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番茄SYTA的克隆及表达分析 被引量:7
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作者 潘琪 刘旭旭 +6 位作者 彭浩然 蒲运丹 张永至 叶思涵 吴根土 青玲 孙现超 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第15期2936-2945,共10页
【目的】克隆获得番茄 SYTA (Solanum lycopersicum SYTA,S.l SYTA),分析其基因序列生物信息学特征和预测蛋白的结构特征,明确S.l SYTA亚细胞定位和组织表达,并分析其在绿色荧光蛋白(green fluorescence protein,GFP)标记的烟草花叶病... 【目的】克隆获得番茄 SYTA (Solanum lycopersicum SYTA,S.l SYTA),分析其基因序列生物信息学特征和预测蛋白的结构特征,明确S.l SYTA亚细胞定位和组织表达,并分析其在绿色荧光蛋白(green fluorescence protein,GFP)标记的烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)侵染下的表达变化及其对TMV移动的影响,为明确S.l SYTA在植物病毒侵染致病过程中的作用提供理论依据。【方法】根据番茄基因组含有的SYTA同源基因序列,利用Primer Premier 5.0软件设计克隆引物,采用RT-PCR技术克隆S.l SYTA全长序列;应用生物信息学方法分析该基因的序列特征;使用MEGA 7.0对S.l SYTA蛋白序列及其同源序列进行多序列比对,并构建同源物种间系统进化树;通过与GFP蛋白融合进行亚细胞定位;利用实时荧光定量PCR(q RT-PCR)检测番茄各部位S.l SYTA的表达量以及在TMV胁迫的番茄中S.l SYTA的表达变化;构建植物瞬时表达载体p CV-SYTA-m GFP,通过农杆菌介导在本氏烟草中瞬时表达,TMV-GFP攻毒,利用酶联免疫吸附实验(ELISA)检测在本氏烟中瞬时表达S.l SYTA时TMV-GFP的积累和移动情况。【结果】克隆得到1 620 bp的S.l SYTA基因开放阅读框全长,序列比对及生物信息学分析表明,其编码的氨基酸序列具有SYTs家族的典型特征,含有N端的跨膜区、胞间连接区和C端的两个C2结构域;多序列对比及系统进化树分析发现,与茄科林生烟草、绒毛状烟草等植物亲缘关系较近,与黄瓜较远;亚细胞定位显示S.l SYTA定位于细胞质膜。在番茄的根、茎和叶中S.l SYTA的表达量从高到低依次为根>叶>茎;TMV-GFP侵染番茄导致其S.l SYTA表达量在接种后第1天显著上调,在第7天降至正常水平。在S.l SYTA瞬时表达的本氏烟叶片部位接种TMV-GFP,TMV-GFP在接种第5天时已经到达新叶,而接种部位仅表达空载体对照的本氏烟新叶中未观察到TMV-GFP,且接种第5天时TMV-GFP在接种叶和新叶中的积累量均明显高于其在空载体对照处理的叶片。【结论】获得的S.l SYTA具有SYTs家族的典型特征。S.l SYTA定位于细胞质膜,S.l SYTA在番茄根中表达量最高。在TMV-GFP胁迫下,番茄中S.l SYTA表达呈现先上升后下降至正常水平。在本氏烟中瞬时表达S.l SYTA有利于TMV-GFP侵染初期的积累和移动。 展开更多
关键词 番茄 S.l SYTA 克隆 表达分析 TMV-GFP
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马铃薯sgt2基因启动子的克隆及其活性分析 被引量:4
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作者 魏桂民 张金文 +3 位作者 王蒂 张俊莲 陆艳梅 高宜峰 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期41-47,53,共8页
糖苷生物碱(SGAs)是一类存在于茄科和百合科植物的重要次生代谢物,与植物的抗逆性和产品品质有密切关系.茄啶葡糖基转移酶(SGT2)是SGAs合成代谢途径的末端关键酶之一,研究其编码基因的启动子序列对于SGAs生物合成代谢调控有重要的作用... 糖苷生物碱(SGAs)是一类存在于茄科和百合科植物的重要次生代谢物,与植物的抗逆性和产品品质有密切关系.茄啶葡糖基转移酶(SGT2)是SGAs合成代谢途径的末端关键酶之一,研究其编码基因的启动子序列对于SGAs生物合成代谢调控有重要的作用和意义.本研究采用染色体步移技术,克隆到马铃薯茄啶葡糖基转移酶基因(sgt2)起始密码子上游2 098bp的启动子序列,已注册到GenBank(注册号:KC331038).构建该启动子驱动报告基因gfp∶∶gus的植物双元表达载体p1304sgt2p,采用农杆菌介导的烟草叶片瞬时表达,通过GUS组织化学染色分析sgt2p启动子的活性.结果表明:gus基因在转化烟草叶片中高效表达,克隆的启动子具有活性. 展开更多
关键词 马铃薯 糖苷生物碱 茄啶葡糖基转移酶 启动子克隆 瞬时表达
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马铃薯GBSS基因5′侧翼区调控作用的研究 被引量:10
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作者 宋东光 孙国枫 +4 位作者 单海燕 彭翔寅 王光清 汪训明 谈家桢 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 1998年第9期796-802,共7页
将0.4、0.8、1.6、2.9kbGBSS基因的5′侧翼区与GUS基因融合,构建了双元表达载体。0.8kbGBSSGUS通过基因枪介导在块茎切片中获得了瞬间表达。以上建构物通过农杆菌介导转入了马铃薯(Solanu... 将0.4、0.8、1.6、2.9kbGBSS基因的5′侧翼区与GUS基因融合,构建了双元表达载体。0.8kbGBSSGUS通过基因枪介导在块茎切片中获得了瞬间表达。以上建构物通过农杆菌介导转入了马铃薯(SolanumtuberosumL.cv.Desiree)。XGluc染色及PCR结果证实已获得转基因植株。利用离体块茎诱导系统,GUS表达用荧光进行定量检测,结果显示,2.9、1.6、0.4kbGBSSGUS的表达均以块茎明显高于茎段,达2~10倍。0.8、1.6、2.9kbGBSSGUS表达高于0.4kbGBSSGUS。蔗糖浓度的升高可诱导GBSSGUS的表达,而光照抑制了GBSSGUS的表达。 展开更多
关键词 马铃薯 基因调控 GBSS基因 块茎专一表达 诱导
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受青枯菌诱导表达的马铃薯转录因子类StWRKY8的克隆与表达分析 被引量:3
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作者 薛珍 李卉 +2 位作者 孔超越 段婷婷 郜刚 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第21期4219-4226,共8页
[目的]从接种青枯菌(Ralstonia solanacearum)的马铃薯中薯3号(Solanum tuberosum)中克隆类St WRKY8部分序列,分析其序列结构特征,研究该基因在感、抗病基因型马铃薯中受诱导的差异表达模式及其不同的组织表达定位。[方法]分别培养抗病... [目的]从接种青枯菌(Ralstonia solanacearum)的马铃薯中薯3号(Solanum tuberosum)中克隆类St WRKY8部分序列,分析其序列结构特征,研究该基因在感、抗病基因型马铃薯中受诱导的差异表达模式及其不同的组织表达定位。[方法]分别培养抗病基因型马铃薯ED13、感病基因型中薯3号至9—10叶期,以伤根浸菌法接种青枯菌菌株PO41。提取叶片总RNA,反转录为cDNA,使用PCR筛选cDNA差减试剂盒构建消减文库,筛选出384个阳性克隆作为原始SMART cDNA文库,采用5'-RACE法根据SMART-RACE cDNA扩增试剂盒说明克隆全长类St WRKY8。并分别应用生物信息学软件Bio Edit、BLAST、MEGA 5.0分析类St WRKY8的基因序列、序列相似性比对以及建立系统进化树。利用Prot Param、Prot Scale、SWISS-MODEL、Net Phos2.0 Server、WOLF PSORT、Target P1.1Server等在线服务器预测类St WRKY8的理化特性、三级结构、磷酸化位点以及亚细胞定位。提取马铃薯ED13、中薯3号接种青枯菌后的叶片总RNA,采样时间点分别为处理后6 h、12 h、1 d、2 d、3 d、4 d和6 d,运用反转录PCR和荧光定量PCR检测类St WRKY8的表达情况。以类St WRKY特异PCR产物制备地高辛标记探针,取材料茎、叶组织制作石蜡切片,并与标记探针进行原位杂交,定位其组织表达。[结果]获得了类St WRKY8 cDNA部分序列,长563 bp,包括一个完整开放阅读框258 bp,编码85个氨基酸。类St WRKY8属于第二类WRKY,锌指结构类型为C2H2,具有一个典型的WRKY保守结构域。其氨基酸序列与茄科(Solanaceae)其他成员具有高度同源性,与马铃薯转录因子St WRKY8相似性高达98%。预测类St WRKY8等电点约为9.1,半衰期大于5.5 h,为水溶性蛋白,其三维结构为非球状分子,含有3个磷酸化位点,亚细胞定位于细胞内。类St WRKY8受青枯菌诱导后表达上调,且在感、抗病基因型马铃薯中表达有差异。类St WRKY8在感病基因型马铃薯接种青枯菌6 h内表达量较低,而在抗病基因型马铃薯接种青枯菌6 h内高强度表达。该基因主要在茎叶维管束系统的韧皮部表达,具有组织特异性。[结论]类St WRKY8具有转录因子的一般结构特征,受青枯菌等病菌的诱导表达,同时受寄主植物固有抗性的影响,在感、抗病基因型中表达模式不同。推测其在植物防御反应中发挥作用并参与机体调控。 展开更多
关键词 马铃薯 青枯菌 转录因子 类StWRKY8 基因表达 组织定位
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