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姜黄素调控长链非编码RNA AK125910的表达介导肝癌细胞凋亡 被引量:12
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作者 过忆 周留勇 +1 位作者 尤建良 薛博瑜 《南京中医药大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期254-257,301,共4页
目的 检测姜黄素诱导肝癌细胞凋亡中lncRNA表达谱的改变及关键lncRNA的筛选鉴定。方法 使用不同浓度姜黄素刺激肝癌细胞株HepG2不同时间后,提取总RNA进行lncRNA芯片杂交检测lncRNA表达谱的改变,筛选出差异表达lncRNA;并利用MTT法和TUNE... 目的 检测姜黄素诱导肝癌细胞凋亡中lncRNA表达谱的改变及关键lncRNA的筛选鉴定。方法 使用不同浓度姜黄素刺激肝癌细胞株HepG2不同时间后,提取总RNA进行lncRNA芯片杂交检测lncRNA表达谱的改变,筛选出差异表达lncRNA;并利用MTT法和TUNEL染色观察HepG2细胞的凋亡,Real-time PCR验证差异表达的lncRNA AK125910在其中的作用。结果 与对照组细胞相比,姜黄素处理后的肝癌细胞中有5 432条lncRNA表达出现改变,而其中变化倍数大于3的lncRNA有8条,表达差异化最显著的是lncRNA AK058003,上调7.62倍。在姜黄素诱导肝癌细胞凋亡中,lncRNA AK125910表达上调7.16倍,与芯片杂交结果基本一致。结论 姜黄素诱导肝癌细胞凋亡过程中lncRNA表达谱出现显著变化,其中差异性表达最显著的lncRNA AK125910可能参与了肝癌细胞的凋亡进程。 展开更多
关键词 长链非编码RNA 姜黄素 AK125910 肝癌细胞 凋亡
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基于编码分组的无线射频识别多标签防碰撞方法 被引量:2
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作者 朱纪铭 闫述 《扬州大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期56-59,共4页
针对无线射频识别(radio frequency identification,RFID)系统的多标签碰撞问题,在分析RFID标签编码规则的基础上,提出根据标签编码规则进行标签分组和标签预淘汰的方法,在读写器识别的初始阶段根据特定的规则淘汰部分标签,从而减少系... 针对无线射频识别(radio frequency identification,RFID)系统的多标签碰撞问题,在分析RFID标签编码规则的基础上,提出根据标签编码规则进行标签分组和标签预淘汰的方法,在读写器识别的初始阶段根据特定的规则淘汰部分标签,从而减少系统工作量,提高系统工作效率.实例证明:在不增加标签结构复杂度的基础上,充分利用已有的有效信息能够有效减少阅读器的查询次数和系统的总通信量. 展开更多
关键词 无线射频识别 防碰撞 编码分组 EPC(electronic PRODUCT code)编码
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与放疗抵抗相关的长链非编码RNA在不同放疗敏感性结直肠癌细胞株中的表达 被引量:20
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作者 徐小雯 袁捷 +3 位作者 左志贵 于志奇 刘永明 傅传刚 《中华胃肠外科杂志》 CAS CSCD 2014年第11期1096-1100,共5页
目的 筛选与结直肠癌细胞放疗敏感性相关的长链非编码RNA(lncRNA).方法 将HT29、SW480、RKO、Lovo和HCT116等5株结直肠癌细胞梯度照光后行克隆形成实验,通过细胞存活率(SF2值)来检测5株细胞的放疗敏感性差异;利用高通量lncRNA芯片... 目的 筛选与结直肠癌细胞放疗敏感性相关的长链非编码RNA(lncRNA).方法 将HT29、SW480、RKO、Lovo和HCT116等5株结直肠癌细胞梯度照光后行克隆形成实验,通过细胞存活率(SF2值)来检测5株细胞的放疗敏感性差异;利用高通量lncRNA芯片筛选在SW480、RKO和Lovo细胞株中两两比较表达差异均大于2倍的lncRNA,并通过实时定量PCR进一步检测所选lncRNA在5株结直肠癌细胞中的表达差异.结果 5株结直肠癌细胞放疗敏感性由低至高(即SF2值由高至低)依次为HT29 (0.83±0.03)、SW480 (0.69±0.02)、RKO (0.53±0.02)、Lovo (0.47±0.05)和HCT116(0.32±0.03)(P<0.01).lncRNA芯片筛选得到5种与结直肠癌细胞放疗敏感性相关的lncRNA基因,其中R05532、NR_015441和NR_033374基因表达水平与细胞放疗抵抗呈正相关(均P<0.01),而NR_073156和AA745020基因表达水平与细胞放疗抵抗无明显相关性(均P>0.05).结论 R05532、NR_015441和NR_033374三种lncRNA可能成为结直肠癌细胞放疗敏感性的预测分子,其高表达提示放疗抵抗。 展开更多
关键词 结直肠肿瘤 放疗敏感性 高通量lncRNA芯片
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长链非编码RNA测序技术应用探讨 被引量:1
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作者 陈冉 王玉明 +3 位作者 李庆 孙岩 张爱兴 胡家伦 《医学分子生物学杂志》 CAS 2016年第3期178-182,共5页
长链非编码RNA ( long non-coding RNA, LncRNA)是一类转录本长度超过200 nt的RNA分子,由RNA聚合酶Ⅱ( RNA polymeraseⅡ)加工合成,是基因组序列转录生成的产物。近年来,随着高通量技术的不断发展,越来越多的LncRNA逐渐被发现... 长链非编码RNA ( long non-coding RNA, LncRNA)是一类转录本长度超过200 nt的RNA分子,由RNA聚合酶Ⅱ( RNA polymeraseⅡ)加工合成,是基因组序列转录生成的产物。近年来,随着高通量技术的不断发展,越来越多的LncRNA逐渐被发现并成为研究热点。 LncRNA作为新兴分子标志物与肿瘤的发生、发展机制密切相关。目前运用于功能性LncRNA筛查的分子高通量新一代测序方法高效且节源,并广泛应用于基因检测。 RNA-seq、 RIP-seq及CLIP-Seq此3种高通量测序在LncRNA中的研究运用已经报道,文章旨在深入探讨技术特点以帮助发掘肿瘤分子标志物。 展开更多
关键词 高通量技术 测序 肿瘤
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长链非编码RNA在消化系统肿瘤中的研究进展 被引量:1
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作者 谢海伟 史卫红 +1 位作者 吕进 曹秀峰 《中华临床医师杂志(电子版)》 CAS 2013年第23期237-240,共4页
长链非编码RNA(lncRNA)是一系列广泛转录自人及其他哺乳动物基因组的长度超过200 nt的核苷酸片段,通常没有蛋白编码功能,一度被认为是基因组的转录"噪音"。近年来一些lncRNA被发现具有多种生物学功能,成为分子生物学领域研究... 长链非编码RNA(lncRNA)是一系列广泛转录自人及其他哺乳动物基因组的长度超过200 nt的核苷酸片段,通常没有蛋白编码功能,一度被认为是基因组的转录"噪音"。近年来一些lncRNA被发现具有多种生物学功能,成为分子生物学领域研究的热点。已经在多种肿瘤中发现有lncRNA的异常表达,并且异常表达的lncRNA和肿瘤的复发、转移及预后有关。本文中将探讨近期发现的与消化系统肿瘤相关的lncRNA,部分着重于具有促癌作用的lncRNA,以期为消化系统肿瘤的诊断、预后及分子治疗提供线索。 展开更多
关键词 消化系统肿瘤 生物学标记
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