宫颈刮片BHLHE22/CDO1和COL2A1基因甲基化检测在早期子宫内膜癌筛查中的作用

目的探讨宫颈刮片BHLHE22/CDO1和COL2A1基因甲基化检测在早期子宫内膜癌筛查中的作用。方法选取徐州市妇幼保健院2022年2月—2024年5月行宫腔镜下诊断性刮宫排除子宫内膜病变的患者78例,妇科检查时进行宫颈刮片细胞采集,并进行BHLHE22/CDO1和COL2A1基因甲基化检测。同时收集患者的基本临床资料及三维能量多普勒超声下子宫内膜血流指数(FI)、血管化指数(VI)、血管化-血流指数(VFI)等资料。以宫腔镜手术获得的组织病理学结果为金标准,利用单因素logistic回归模型分析子宫内膜癌的影响因素,采用受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)分析相关基因甲基化检测联合或不联合子宫内膜血流指标对早期子宫内膜癌的筛查价值。结果患者年龄、体重指数、VI、FI、VFI、BHLHE22/CDO1基因甲基化高风险是子宫内膜癌的影响因素(P<0.05)。宫颈刮片相关基因甲基化检测筛查子宫内膜癌的AUC为0.926(0.846~1.000),其敏感度和特异度分别为90.48%、94.74%。子宫内膜血流指标VFI联合宫颈刮片相关基因甲基化检测可提高敏感度至100%,但特异度降至68.42%。结论宫颈刮片BHLHE22/CDO1和COL2A1基因甲基化检测筛查子宫内膜癌的准确性较高,联合子宫内膜血流指标可以增加筛查的敏感度,但也降低了筛查的特异度,增加了有创操作的风险。

COL7A1基因变异致新生儿营养不良型大疱性表皮松解症1例并文献复习

大疱性表皮松解症是一种遗传相关性皮肤病,临床罕见,男女均可发病^([1])。其临床表现为皮肤受到机械性损伤后出现水疱、大疱,触之破溃,随之出现表皮大片剥脱,皮损多发生于四肢末端及关节部位,严重者水疱不仅局限于表面皮肤,亦可累及体内的软组织(黏膜)。

普通小麦CONSTANS- LIKE(COL)基因家族的鉴定和表达分析

为探究小麦COL基因在生长发育过程中的潜在功能,以中国春为研究对象,采用生物信息学方法在小麦全基因组水平鉴定TaCOL基因并进行系统分析,并利用qRT-PCR检测其在不同组织及不同胁迫条件下的表达。结果显示,在小麦全基因组水平上一共鉴定到48个COL基因,在进化关系上被分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ三组;亚细胞定位预测表明,所有TaCOL蛋白均定位在细胞核中。染色体定位发现,它们不均等地分布在小麦的16条染色体上,其中有4个TaCOL基因组成了4个片段复制基因对。基因结构和保守基序分析发现,相同亚组的TaCOL在基因结构和保守基序组成上类似,其中Motif 1和Motif 2分别是构成B-box和CCT两个保守结构域的主要基序。此外,在TaCOL基因的启动子区分布着许多光调节、激素响应、生长发育等多种类型顺式作用元件。qRT-PCR分析发现,所有的TaCOL基因在小麦的不同组织中均有表达,且大部分基因在叶片中的表达水平较高;多数TaCOL基因响应非生物胁迫和激素的诱导,不同光周期处理也能显著影响TaCOL基因的表达水平。本研究为进一步研究TaCOL基因在小麦的生长发育和作物遗传改良方面奠定了基础。

COL1A1突变致Van der Hoeve综合征家系的遗传和表型分析并文献复习

目的对一个常染色体显性遗传的Van der Hoeve综合征家系进行详尽的临床表型分析及基因突变检测,明确该家系的致病基因突变位点及该突变对基因编码的影响。方法对收集到的Van der Hoeve综合征家系进行包括病史、体格检查及辅助检查在内的临床资料的收集及外周血液样本的采集,并对22位家系成员进行外显子组测序以及Sanger测序,利用生物信息学软件分析数据。结果该家系共五代,各代连续发病,且每一代男女均可患病,符合常染色体显性遗传特点。该家系中12例患者均自出生时巩膜即呈蓝色且身材矮小,8例患者有骨折病史,可正常愈合,3例患者考虑有Van der Hoeve综合征所致的听力下降,12例患者的COL1A1基因第17号外显子有一个碱基的缺失(c.1128delT),使第376位后的氨基酸编码改变,在第539位提前结束氨基酸编码,该家系中10例无症状者无此突变。结论该家系患者确定为由COL1A1基因c.1128delT突变导致的Van der Hoeve综合征。

COL4A1在胆管癌中的表达分析

目的探究胆管癌发生发展的分子机制。方法在GEO数据库中下载数据集GSE89749,并依次进行差异基因分析、GO/KEGG富集分析和蛋白-蛋白网络(PPI)分析以得到关键基因。TCGA数据库中分析COL4A1在肾上腺皮质癌、膀胱尿路上皮癌和乳腺浸润癌等16种癌症的基因表达情况。结果差异基因和GO/KEGG富集分析显示差异基因被显著富集在含胶原蛋白的细胞外基质。PPI分析结果显示基因胶原IVα1基因(COL4A1)为关键基因。COL4A1基因在胆管癌、结直肠癌和食管癌等8种癌症中高表达。结论COL4A1在胆管癌组织中显著高表达,这为探究胆管癌发生发展的分子机制提供了新的角度和实验基础。

正畸力调控下Col1^(+)细胞亚群的分化潜能与机制探究

目的探究正畸力调控下Col1^(+)细胞亚群的多向分化潜能与下游机制,为临床正畸治疗提供新思路。方法建立小鼠正畸牙移动模型,鉴定不同时间节点Col1^(+)细胞亚群在牙周组织中的时间与空间定位;运用谱系示踪及细胞剔除技术,构建Col1Cre ERT2;td Tomato小鼠,证实力学敏感性Col1^(+)细胞在正畸牙移动过程不可或缺的作用;利用流式技术分离扩增小鼠牙周Col1^(+)细胞,运用体外施力模型深入探究细胞内在机制变化;Bulk RNA seq与ATAC seq阐明下游力学响应关键靶点;联合Seahorse、荧光探针与组织免疫荧光等检测细胞的能量代谢变化特征。结果体内模型证实,正畸力施加后第0、3、7、14天,Col1^(+)细胞的数量与增殖活性逐渐升高,且主要聚集于牙周膜附近;条件诱导敲除模型证实,体内剔除Col1^(+)细胞后,正畸牙移动速度减慢;测序分析筛选出Piezo1受体是Col1^(+)细胞响应力的关键靶点,且细胞发生代谢重编程。此外,Seahorse等代谢检测手段揭示,正畸力通过激活线粒体的氧化磷酸化供能途径,调控Col1^(+)细胞的多项分化潜能,在正畸牙移动中发挥关键作用。结论正畸力通过调控Col1^(+)细胞表面Piezo1受体激发细胞代谢重编程与线粒体氧化磷酸化供能途径,激活其多向分化潜能与成骨、成脂、促血管生成等效应,这群力学敏感的Col1^(+)细胞亚群在正畸牙移动中发挥不可或缺的作用,为临床正畸治疗的优化提供新思路。

COL1A2的表达与肺腺癌临床病理特征及预后的关系

目的探究COL1A2的表达与肺腺癌患者临床病理特征和预后的关系。方法从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中下载TCGA-肺腺癌的RNA-Seq表达谱和相应的临床数据,通过生物信息学分析COL1A2在肺腺癌组织与正常肺组织中的表达差异及与肺腺癌患者生存率的关系。收集2018年1月~2020年12月石河子大学第一附属医院收治的肺腺癌患者82例,采用免疫组化法验证COL1A2的表达与肺腺癌患者临床病理特征及预后的关系。结果COL1A2在肺腺癌组织中呈高表达(P<0.05)。免疫组化结果表明,COL1A2表达与肺腺癌患者TNM分期及是否有远处转移有关(P<0.05);Kaplan-Meier生存分析结果表明,COL1A2的表达与肺腺癌患者预后相关(χ^(2)=9.639,P=0.002);多因素COX回归分析结果表明,COL1A2高表达是肺腺癌患者预后的独立危险因素(HR=2.657,95%CI:1.062~6.646,P=0.037)。结论COL1A2在肺腺癌中呈高表达,与肺腺癌患者肿瘤分期、是否有远处转移及预后相关。

胃癌中COL6基因家族的生物信息学分析

目的通过生物信息学方法系统性地分析COL6基因家族各成员在胃癌中的作用。方法利用TIMER2.0和GEPIA2数据库分析COL6家族基因在胃癌组织中的表达与不同病理分期的关系。通过Kaplan-Meier Plotter数据库分析COL6基因家族各成员表达水平与胃癌患者总生存期(OS)和无复发生存期(RFS)之间的关系。通过cBioPortal数据库分析胃癌患者中COL6基因的遗传变异、共表达与邻近基因网络情况。通过STRING数据库和仙桃学术绘制COL6家族蛋白互作网络图,并进行功能富集分析,分析其作用机制。结果在胃腺癌中,COL6基因家族(COL6A1、COL1A2、COL6A3、COL6A4P1、COL6A4P2、COL6A5和COL6A6)的表达相对于邻近的正常组织上调,且COL6A1(P=0.000367)、COL6A2(P=0.00017)、COL6A3(P<0.001)、COL6A4P1(P=0.864)、COL6A4P2(P=0.355)、COL6A5(P=0.187)和COL6A6(P=0.302)的表达与胃癌患者的病理分期相关。高表达的COL6A1(P=0.047)、COL6A2(P=0.017)、COL6A3(P=0.02)、COL6A5(P=0.028)和COL6A6(P=0.025)胃癌患者生存率均较低,而COL6A4P1(P=0.006)、COL6A4P2(P=0.0091)和COL6A6(P=0.002)与患者的转移或复发相关。KEGG功能富集分析显示差异表达的COL6A1、COL6A2、COL6A3、COL6A4P1、COL6A4P2、COL6A5、COL6A6的细胞功能与病灶黏附、细胞外基质受体相互作用信号通路有关。结论COL6家族是胃癌预后的潜在生物标志物,且与胃癌的免疫浸润相关。

经典型皮肤弹性过度综合征COL5A1基因突变分析

目的:明确一例经典型皮肤弹性过度综合征(classic Ehlers-Danlos syndrome,cEDS)散发病例基因突变位点,并回顾总结国内报道cEDS病例的临床遗传特征。方法:对先证者进行全外显子组测序,对先证者及其父母进行Sanger测序验证突变位点,并检索1982年以来国内报道cEDS的所有文献。结果:先证者COL5A1基因第6号外显子发生杂合缺失突变:c.922delG(p.E308Rfs*3),其父母该位点无变异。文献检索到12例cEDS突变病例,11例携带COL5A1基因突变,1例携带COL5A2基因突变。结论:上述COL5A1基因突变为新的突变位点。

LncRNA NEAT1靶向调控miR-582-5p/COL5A1信号通路对肺癌A549细胞生物学功能的影响

目的:探讨长链非编码RNA富含核的丰富转录物1(LncRNA NEAT1)调控miR-582-5p/COL5A1信号通路对肺癌A549细胞生物学功能的影响。方法:体外培养人肺癌A549细胞并随机分为对照组、si-NEAT1组(转染LncRNA NEAT1 siRNA质粒)、miR-582-5p mimics组(转染miR-582-5p mimics)、si-NC+miR-582-5p-NC组(共转染LncRNA NEAT1 siRNA阴性对照与miR-582-5p阴性对照)、si-NEAT1+miR-582-5p inhibitor组(共转染LncRNA NEAT1 siRNA质粒与miR-582-5p inhibitor),分组转染后以实时荧光定量PCR实验检测细胞LncRNA NEAT1、miR-582-5p、COL5A1表达;构建其裸鼠移植瘤模型,测量裸鼠移植瘤质量、体积。以CCK-8实验、克隆形成实验检测细胞增殖;以免疫印迹实验检测细胞及裸鼠移植瘤组织增殖相关蛋白(cyclin D1、PCNA)表达;以Transwell实验检测细胞迁移及侵袭;以免疫印迹实验检测细胞上皮-间质转化(EMT)相关蛋白(Vimentin、MMP2、E-cadherin)表达;以双荧光素酶报告基因实验检测细胞中LncRNA NEAT1对miR-582-5p、miR-582-5p对COL5A1的靶向调控作用。结果:与对照组相比,si-NEAT1组、miR-582-5p mimics组细胞COL5A1 mRNA表达、细胞活力和克隆形成率、裸鼠移植瘤质量和体积、细胞及裸鼠移植瘤组织cyclin D1、PCNA蛋白表达、细胞迁移和侵袭数目、细胞Vimentin和MMP2蛋白表达均降低(P<0.05),细胞miR-582-5p表达、E-cadherin蛋白表达均升高(P<0.05);si-NC+miR-582-5p-NC组各指标均无显著差异(P>0.05)。与si-NEAT1组相比,si-NEAT1+miR-582-5p inhibitor组细胞COL5A1 mRNA表达、细胞活力和克隆形成率、裸鼠移植瘤质量和体积、细胞及裸鼠移植瘤组织cyclin D1、PCNA蛋白表达、细胞迁移和侵袭数目、细胞Vimentin和MMP2蛋白表达均升高(P<0.05),细胞miR-582-5p表达、E-cadherin蛋白表达均降低(P<0.05)。LncRNA NEAT1可靶向下调A549细胞miR-582-5p,且miR-582-5p可靶向下调A549细胞COL5A1(P<0.05)。结论:敲低LncRNA NEAT1可通过上调miR-582-5p表达而降低COL5A1表达,从而抑制肺癌A549细胞的体内外生长,并可减弱其侵袭与迁移活性。

基于生物信息学分析COL1A1在脑胶质瘤中的表达及临床意义

目的研究COL1A1基因在脑胶质瘤中的表达情况并分析该基因与脑胶质瘤患者临床特征及预后的关系,同时探究COL1A1的免疫抑制靶点,为今后脑胶质瘤免疫治疗研究提供理论基础。方法从中国胶质瘤基因组图谱(CGGA)、癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)官方数据库中下载脑胶质瘤的基因表达谱与临床资料数据。使用GraphPad Prism 9软件分析COL1A1与脑胶质瘤分期关系。使用R4.1.2软件及R Studio软件绘制Pheatmap、Heatmap、Ggplot2、Circos图分析COL1A1的表达与脑胶质瘤患者临床信息、预后以及免疫抑制靶点的关系。使用GO、KEGG富集分析研究COL1A1基因功能。使用GSVA富集方法分析脑胶质瘤中特定基因集的富集分数。使用STRING数据库分析与COL1A1基因相互作用的基因网格数。结果WHOⅢ期患者的COL1A1基因表达量显著高于WHOⅠ期和WHOⅡ期的患者,差异均有统计学意义(DataSetmRNAseq_325,P<0.0001;DataSetmRNAseq_693,P=0.0018)。随着COL1A1表达升高,Non-codel 1P19q、Wildtype IDH、un-methylated MGMT等胶质瘤特异性标志物的表达也更密集。Heatmap生存分析图显示,高表达COL1A1基因的患者总体生存率低于低表达患者。GO分析与KEGG分析结果显示,COL1A1基因可能通过细胞胞外区(extracellular region)、内质网内腔(endoplasmic reticulum lumen)、细胞外间隙(extracellular space)、细胞外基质结构成分(extracellular matrix structural constituent)、细胞胶原结合(collagen binding)、整合素结合蛋白(integrin binding)发挥其生物学功能。GSVA富集分析结果符合GO、KEGG分析结果,COL1A1基因表达与上述基因功能呈正相关。Circos图提示,与脑胶质瘤最密切的免疫检查点是信号调节蛋白(SIRP)。STRING数据库结果显示,与COL1A1基因相互作用的基因共有10个。结论COL1A1基因与脑胶质瘤分期密切相关,与患者预后、疾病的恶性进展特征有关,可作为胶质瘤潜在的分子标志物。

COL1A2在头颈部鳞癌中的差异表达及功能分析

目的 采用生物信息学方法探讨COL1A2在头颈部鳞癌(HNSC)中的表达及相关功能。方法 利用TIMER2.0数据库分析COL1A2基因在泛癌中的表达;通过GEPIA数据库、UALCAN数据库分析该基因在HNSC与正常组织中的差异表达情况;并利用STRING数据库构建COL1A2基因蛋白互作网,DAVID数据库分析与该基因互作蛋白基因的相关功能;最后通过GCBI基因雷达数据库预测该基因可能参与的调控网络和转录因子。结果 COL1A2在多种肿瘤中高表达,且在头颈部鳞癌组织与正常组织中有差异表达。COL1A2及相关蛋白基因功能富集分析发现其参与了4个细胞组分、5个分子功能、11个生物学程序、7条信号通路,在基因调控网及转录因子预测发现,COL1A2与多种蛋白、转录因子、lncRNA、micRNA等相互调控。结论 COL1A2与HNSC的发生、发展可能是通过PI3K-Akt信号通路等多种途径、多种蛋白、转录因子共同调控的结果。

电针对负透镜诱导型近视豚鼠视网膜中MMP-3和TIMP-3及Col3α1表达的影响

目的:探讨电针对负透镜诱导型近视豚鼠视网膜中基质金属蛋白酶(MMP)-3、金属蛋白酶组织抑制剂(TIMP)-3和III型胶原α1(Col3α1)表达的影响。方法:将80只豚鼠随机分为正常对照组、负透镜诱导型近视组、电针干预组和假穴组,每组20只。正常对照组不做任何干预,负透镜诱导型近视组、电针干预组和假穴组,右眼均配戴-6.0 D透镜,左眼不戴镜。戴镜同时电针干预组在合谷穴与太阳穴给予电针刺激,假穴组豚鼠在假穴位进行干预。造模前,造模2、4 wk检影验光检测屈光度,A超检测眼轴长度,HE染色观察视网膜组织结构变化,定量聚合酶链反应(Q-PCR)和蛋白免疫印迹(WB)检测视网膜中MMP-3、TIMP-3、Col3α1 mRNA和蛋白表达的情况。结果:造模2、4 wk,负透镜诱导型近视组与正常对照组相比眼轴长度均明显增加(均P<0.05),屈光度均明显降低(均P<0.05);与负透镜诱导型近视组相比,电针干预组干预后眼轴长度均减少(均P<0.05),屈光度均增加(均P<0.05)。HE染色显示,正常对照组豚鼠视网膜组织各层分界明显,排列规则;负透镜诱导型近视组视网膜厚度、内外核层厚度及细胞数量减少,排列不规则;电针干预组视网膜整体结构较为完善,排列较规则,组织各层形态结构未出现明显异常。Q-PCR和WB检测结果显示,负透镜诱导型近视组视网膜中MMP-3、TIMP-3和Col3α1 mRNA及蛋白表达均比正常对照组明显升高(均P<0.05);而电针干预组干预后视网膜中MMP-3、TIMP-3和Col3α1mRNA及蛋白表达均较负透镜诱导型近视组明显降低(均P<0.05)。结论:电针能够延缓负透镜诱导型近视豚鼠眼轴增长,下调负透镜诱导型近视豚鼠视网膜中的MMP-3、TIMP-3及Col3α1 mRNA及蛋白表达。

COL4A3基因新突变导致的Alport综合征1例并文献复习

Alport综合征(AS)是COL4An基因突变所导致的家族遗传性肾脏病,目前尚缺乏针对性的根治性疗法,且该病临床表现与遗传方式相关,极大阻碍了该病的临床诊断。现报道1例由COL4A3基因新突变位点所致AS患者的病历资料,从该患者的临床表现出发,回顾性分析该患者的诊疗经过,并对近几年疾病相关文献进行复习,提高临床对此病的认识,为该病的早期诊断及治疗提供帮助。

COL1A1基因变异导致的临床表型与产前诊断

COL1A1基因编码I型胶原蛋白的α1链,其表达产物是骨骼、肌腱、筋膜、韧带、牙本质、巩膜的重要成分,在维持组织稳定性、修复损伤的过程中起到重要作用。COL1A1基因相关疾病为婴儿骨皮质增生症、Ehlers-Danlos综合征Ⅶ型、成骨不全Ⅰ-Ⅳ型、成骨不全合并Ehlers-Danlos综合征1型。COL1A1基因突变所导致的各种临床表型一定程度上损害先证者的健康与成长,为家庭及社会带来经济负担与精神压力。本文阐述了该基因突变所导致相关临床表型的主要症状与相关机制,应通过产前诊断尽早明确诊断及针对严重表型行选择性流产。

COL1A1和COL1A2基因生信分析及其在梅花鹿不同组织中的表达谱

【目的】探明COL1A1(Collagen type I alpha 1 chain,I型胶原蛋白α1链)和COL1A2(Collagen type I alpha 2 chain,I型胶原蛋白α2链)基因在梅花鹿不同组织中的表达谱,解析其对梅花鹿组织发育的影响,为影响梅花鹿重要经济性状的候选基因筛选提供依据。【方法】采用RT-qPCR方法检测COL1A1和COL1A2基因在雄性梅花鹿心脏、肝脏和脾脏等16个组织器官中的表达水平;结合NetPhos 3.1、Motif Search和ProtParam等系列软件预测分析COL1A1和COL1A2基因的生物信息及其在梅花鹿不同组织中的表达谱,并在此基础上构建COL1A1和COL1A2氨基酸序列的系统发育进化树。【结果】COL1A1和COL1A2基因CDS区分别编码1463和1364个氨基酸,理论PI分别为5.60和9.19,COL1A1和COL1A2均是一种具有信号肽和磷酸化位点的亲水性稳定蛋白质;二者蛋白二级及三级结构均以无规则卷曲构成;与其他动物相比,鹿COL1A1和COL1A2基因均与反刍动物山羊、绵羊和牛的同源性最高,其中,鹿COL1A1基因与山羊、牛、绵羊的同源性分别为99.5%、99.5%和99.2%,鹿COL1A2基因与牛、绵羊、山羊的同源性分别为99.1%、99.0%和98.9%,亲缘关系最近。RT-qPCR结果显示,COL1A1和COL1A2基因在梅花鹿不同组织中均有表达,其中COL1A1基因在心脏、背最长肌和腿肌中的表达较高,显著高于其他组织,COL1A2基因在心脏、肝脏、肾脏和瓣胃中的表达较高,均显著高于其他组织;此外,COL1A1在肌肉组织中的表达较高,COL1A2较低;二者在其余组织中的表达具有一高一低,相互协同的作用趋势。【结论】COL1A1和COL1A2可能通过相互协同共同维持组织结构及组织发育,相关结果为后续深入研究COL1A1和COL1A2影响梅花鹿生长发育奠定基础。

萆薢分清颗粒对单侧输尿管梗阻肾纤维化大鼠mTOR、α-SMA、Col-Ⅰ蛋白表达影响研究

目的 观察萆薢分清颗粒对单侧输尿管梗阻大鼠肾纤维化相关蛋白雷帕霉素靶蛋白(mTOR)、α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)、Ⅰ型胶原(Col-Ⅰ)的影响,探讨萆薢分清颗粒的肾脏保护作用。方法 取60只SPF级雄性SD大鼠,从中随机取10只作为空白组,其余50只大鼠采用单侧输尿管梗阻术构建肾纤维化模型。将造模成功大鼠随机分为模型组、氯沙坦组及萆薢分清高、中、低剂量组,每组10只,萆薢分清高、中、低剂量组分别给予13.12 mL/(kg·d)、6.56 mL/(kg·d)、3.28 mL/(kg·d)萆薢分清颗粒溶液灌胃,氯沙坦组给予氯沙坦2.62 mL/(kg·d)灌胃,空白组和模型组给予等量生理盐水灌胃,均1次/d,连续灌胃4周。末次灌胃结束后检测尿白蛋白与尿肌酐的比值(ACR)、24 h尿蛋白量及血肌酐(SCr)、血尿素氮(BUN)水平,HE染色、Masson染色观察肾脏病理形态,免疫组化法及Western blot法分别检测大鼠肾脏组织中mTOR、α-SMA、Col-Ⅰ表达情况。结果 与空白组比较,模型组大鼠ACR、24 h尿蛋白量及SCr、BUN水平均明显升高(P均<0.05);肾脏发生明显纤维化病变;肾组织中mTOR、α-SMA、Col-Ⅰ阳性表达平均光密度值和蛋白相对表达量均明显升高(P均<0.05)。与模型组比较,氯沙坦组与萆薢分清高、中剂量组大鼠ACR、24 h尿蛋白量及SCr、BUN水平均明显降低(P均<0.05);肾纤维化病变较轻;肾组织中mTOR、α-SMA、Col-Ⅰ阳性表达平均光密度值和蛋白相对表达量均明显降低(P均<0.05)。结论 萆薢分清颗粒可减轻单侧输尿管梗阻大鼠肾纤维化,保护残存肾功能,机制可能与下调mTOR、α-SMA、Col-Ⅰ表达有关。

DNA hypermethylation of COL4A1 in ultraviolet-Binduced age-related cataract models in vitro and in vivo

AIM:To explore the DNA methylation of COL4A1 in ultraviolet-B(UVB)-induced age-related cataract(ARC)models in vitro and in vivo.METHODS:Human lens epithelium B3(HLEB3)cells and Sprague Dawley rats were exposure to UVB respectively.The MTT assay was utilized to evaluate cell proliferation.Flow cytometry was employed for analysis of cell apoptosis and cell cycle.COL4A1 expression in HLEB3 cells and anterior lens capsules were assessed using Western blot and reverse transcription-polymerase chain reaction(RTPCR).The localization of COL4A1 in HLEB3 cells was determined by immunofluorescence.The methylation status of CpG islands located in COL4A1 promoter was verified using bisulfite-sequencing PCR(BSP).DNMTs and TETs mRNA levels was examined by RT-PCR.RESULTS:UVB exposure decreased HLEB3 cells proliferation,while increased the apoptosis rate and cells were arrested in G0/G1 phase.COL4A1 expression was markedly inhibited in UVB treated cells compared to the controls.Hypermethylation status was detected in the CpG islands within COL4A1 promoter in HLEB3 cells subjected to UVB exposure.Expressions of DNMTs including DNMT1/2/3 were elevated in UVB treated HLEB3 cells compared to that in the controls,while expressions of TETs including TET1/2/3 showed the opposite trend.Results from the UVB treated rat model further confirmed the decreased expression of COL4A1,hypermethylation status of the CpG islands at promoter of COL4A1 and abnormal expression of DNMT1/2/3 and TET1/2/in UVB exposure group.CONCLUSION:DNA hypermethylation of COL4A1 promoter CpG islands is correlated with decreased COL4A1 expression in UVB induced HLEB3 cells and anterior lens capsules of rats.

COL1A1在肺腺癌中的表达以及对肿瘤进程的影响

目的探究Ⅰ型胶原α1(collagen typeⅠalpha 1,COL1A1)对肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)恶性进程的影响。方法TIMER数据库用于分析泛癌中COL1A1基因表达情况;UCSC Xena数据库用于分析LUAD中COL1A1基因表达情况;Kaplan-Meier用于分析COL1A1表达与LUAD患者总生存率和无进展生存率的关系;定量逆转录聚合酶链式反应(quantitative reverse transcription PCR,qRT-PCR)用于检测LUAD组织和细胞中COL1A1 mRNA水平;CCK-8法、克隆形成实验、TUNEL实验、划痕实验和Transwell侵袭实验分别用于检测LUAD细胞的增殖、凋亡、迁移和侵袭;Western Blot用于检测COL1A1的蛋白表达。结果COL1A1在16种癌组织中表达上调。COL1A1在LUAD患者的肿瘤样本中高表达(P<0.001),COL1A1高表达与LUAD患者总生存率和无进展生存率较差显著相关(P<0.001)。与si-NC比较,COL1A1敲除在体外抑制了LUAD细胞的增殖、迁移和侵袭,并促进细胞凋亡(P<0.01)。结论COL1A1在LUAD中高表达,并与肿瘤进展和不良预后呈正相关,COL1A1可能是治疗LUAD新的预后生物标志物。

COL10A1、COLⅣ、Cry61表达对直肠癌患者预后的评估价值

目的探究直肠癌患者血清X型胶原A1链(COL10A1)、Ⅳ型胶原(COLⅣ)、富含半胱氨酸蛋白61(Cry61)表达对直肠癌患者预后的评估价值。方法收集62例直肠癌患者临床资料。随访至2023年10月,观察预后情况,根据患者是否死亡分为不良组(n=12例)和良好组(n=50例)。比较两组性别、年龄、淋巴结转移、肿瘤分期、分化程度、COL10A1、COLⅣ、Cry61水平;分析直肠癌患者血清COL10A1、COLⅣ、Cry61水平与临床特征的关系。结果两组患者性别、年龄差异不显著(P>0.05),两组淋巴结转移、肿瘤分期、分化程度差异有统计学意义(P<0.05)。不良组COL10A1、COLⅣ、Cry61水平高于良好组,差异显著(P<0.05)。COL10A1、COLⅣ、Cry61水平与患者性别、年龄无关,与淋巴结转移、Ⅲ~Ⅳ期、低分化有关,淋巴结转移、Ⅲ~Ⅳ期、低分化者COL10A1、COLⅣ、Cry61水平显著高于无淋巴结转移、Ⅰ~Ⅱ期、中高分化患者,差异显著(P<0.05)。COL10A1、COLⅣ、Cry61三者联合检测对直肠癌预后的预测价值良好,AUC为0.863,灵敏度、特异度分别为0.917、0.760,三者联合相对单一指标预测效能较好。三者预测阈值分别为6.840 ng/ml、158.965 ng/ml、481.795 ng/l。结论COL10A1、COLⅣ、Cry61表达水平在直肠癌预后不良患者血清中呈现出显著的升高趋势。COL10A1、COLⅣ、Cry61三者联合对直肠癌预后不良有良好的评估价值。