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不对称反应的对映体过量值预测 被引量:2
1
作者 张庆友 张丹丹 +3 位作者 索净洁 李静亚 龙海林 许禄 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2012年第7期1413-1419,共7页
建立了手性催化剂结构与反应产物对映体过量值的定量结构-活性相关性模型,以辅助苯乙酮不对称氢转移反应的催化剂筛选.手性催化剂由手性氨醇配体与金属络合物合成,故采用构象独立手性指数或构象依赖手性指数描述手性氨醇配体,采用指示... 建立了手性催化剂结构与反应产物对映体过量值的定量结构-活性相关性模型,以辅助苯乙酮不对称氢转移反应的催化剂筛选.手性催化剂由手性氨醇配体与金属络合物合成,故采用构象独立手性指数或构象依赖手性指数描述手性氨醇配体,采用指示变量区分金属络合物,然后合并2个指数来描述手性催化剂.通过遗传算法进行变量选择,采用随机森林法建立数学模型以预测对映体过量值,测试集的相关系数R2=0.769,整个数据集的OOB(Out-of-bag)交叉验证结果为R2=0.785. 展开更多
关键词 不对称催化 对映体过量值 手性催化剂 构象独立手性指数 构象依赖手性指数
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有机分子结构的高维空间拓扑编码与手性 被引量:1
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作者 陈惟昌 王文清 《北京大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 1999年第2期230-236,共7页
分析高维空间的拓扑特性,并给出高维空间的标准作图法则。在此基础上,提出一种新的有机分子结构的高维空间拓扑编码方法。这种方法以不同的上标符号代表不同的非氢原子,再根据有机分子中的非氢原子在高维空间中的位置排列和联结方式... 分析高维空间的拓扑特性,并给出高维空间的标准作图法则。在此基础上,提出一种新的有机分子结构的高维空间拓扑编码方法。这种方法以不同的上标符号代表不同的非氢原子,再根据有机分子中的非氢原子在高维空间中的位置排列和联结方式进行编码。这种编码简单明了,普遍适用,统一规范,系统性强,使用方便,同时能够反映出分子的不同异构体和手性。特别对L-型氨基酸及D-型氨基酸的手性及其编码的关系进行深入的分析。 展开更多
关键词 分子结构 高维空间 拓扑编码 手性 有机化合物
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分子进化的几个普适性质全国理论生物物理研讨会(武汉,1999)上的报告 被引量:2
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作者 罗辽复 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 2000年第1期41-46,共6页
第2 至第6 节为全国理论生物物理研讨会(武汉,1999)上的报告,论述了分子进化中的5 个普适性质:分子手性,遗传密码,核苷关联的短程为主性及其进化相关性,以最大信息原理概括突变和选择的进化机制,由二维结构序列决定的... 第2 至第6 节为全国理论生物物理研讨会(武汉,1999)上的报告,论述了分子进化中的5 个普适性质:分子手性,遗传密码,核苷关联的短程为主性及其进化相关性,以最大信息原理概括突变和选择的进化机制,由二维结构序列决定的蛋白质框架结构.第一节为作者在开幕式上致词的一部分,讨论了理论生物学在生命科学中的地位与作用,特应听众要求,发表于此. 展开更多
关键词 理论生物学 分子进化 遗传密码 理论生物物理学
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基于电负性的构象依赖手性指数及其应用
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作者 张庆友 李静亚 +2 位作者 Aires-de-Sousa Joao 许禄 冷吉燕 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2011年第2期257-260,共4页
构象依赖手性指数衍生于分子的三维结构信息和原子的性质,无论分子中是否包含手性中心,它均能区分对映体,因而不依赖于手性中心,是通用的手性描述符。本研究采用σ和π的残余电负性之和作为原子的属性,生成构象依赖手性指数,并将该手性... 构象依赖手性指数衍生于分子的三维结构信息和原子的性质,无论分子中是否包含手性中心,它均能区分对映体,因而不依赖于手性中心,是通用的手性描述符。本研究采用σ和π的残余电负性之和作为原子的属性,生成构象依赖手性指数,并将该手性指数应用于一个包含80个手性仲醇的数据集和该仲醇与(R)-MTPA酯化反应产物的1H NMR化学位移。由此,能够正确识别训练集的60个手性仲醇的96.7%,正确预测测试集的全部20种化合物,整个数据集的交叉验证结果为91.3%。 展开更多
关键词 构象依赖手性指数 电负性 仲醇 核磁共振 化学位移
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A new theoretical model for the origin of amino acid homochirality 被引量:1
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作者 HAN DaXiong1, CHEN WeiZhu2, HAN Bo2 & ZHAO YuFen1,2 1 Department of Pharmacy, Medical College of Xiamen University, Xiamen 361005, China 2 Department of Chemistry, Xiamen University, Xiamen 361005, China 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2007年第5期580-586,共7页
Amino acid homochirality, as a unique behavior of life, could have originated synchronously with the genetic code. In this paper, phosphoryl amino-acid -5′-nucleosides with P-N bond are postulated to be a chiral orig... Amino acid homochirality, as a unique behavior of life, could have originated synchronously with the genetic code. In this paper, phosphoryl amino-acid -5′-nucleosides with P-N bond are postulated to be a chiral origin model in prebiotic molecular evolution. The enthalpy change in the intramolecular interaction between the nucleotide base and the amino-acid side-chain determines the sta-bility of the particular complex, resulting in a preferred conformation associated with the chirality of amino acids. Based on the theoretical model, our experiments and calculations show that the chiral selection of the earliest amino acids for L-enantiomers seems to be a strict stereochemi-cal/physicochemical determinism. As other amino acids developed biosynthetically from the earliest amino acids, we infer that the chirality of the later amino acids was inherited from the precursor amino acids. This idea probably goes far back in history, but it is hoped that it will be a guide for further ex-periments in this area. 展开更多
关键词 GENETIC code phosphate ORIGIN of life chiral selection HOMOchirality
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手性指数的研究及其应用 被引量:3
6
作者 张庆友 Joao Aires-de-Sousa 许禄 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期733-736,共4页
该工作对手性化合物的构效关系进行了研究,其内容包括:(1)对二维拓扑指数A_(mi)进行了扩展,即在指数的衍生中加入手性碳原子的因素,使之成功地应用于14个手性化合物活性的预测;(2)描述了构象独立的手性指数(CICC法)和构象依赖的手性指数... 该工作对手性化合物的构效关系进行了研究,其内容包括:(1)对二维拓扑指数A_(mi)进行了扩展,即在指数的衍生中加入手性碳原子的因素,使之成功地应用于14个手性化合物活性的预测;(2)描述了构象独立的手性指数(CICC法)和构象依赖的手性指数(CDCC法),采用CDCC和CICC预测了80个二级醇的~1H NMR化学位移差的符号,并由此可以确定该类化合物的绝对构型;(3)描述了原子构象依赖的手性指数(aCDCC),并将这种方法用于手性仲醇的α-碳原子的^(13)C NMR在不同手性溶剂中的化学位移差的预测,获得了满意的结果. 展开更多
关键词 手性构效关系研究 手性拓扑指数 构象独立手性指数 构象依赖手性指数 原子构象依赖手性指数
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苯环型化合物定量二维手性程度的研究
7
作者 张庆友 龙海林 +3 位作者 周艳梅 郝军峰 许禄 冷吉燕 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2011年第3期311-315,共5页
基于权原子和,提出了镶嵌在二维空间的苯环型化合物的手性程度,其中权原子和为与原子间的距离有关的原子不对称环境描述.在描述化合物的手性时,并没有采用简单的标记-手性或非手性,而是采用定量的方式来表征化合物的手性程度.定量手性... 基于权原子和,提出了镶嵌在二维空间的苯环型化合物的手性程度,其中权原子和为与原子间的距离有关的原子不对称环境描述.在描述化合物的手性时,并没有采用简单的标记-手性或非手性,而是采用定量的方式来表征化合物的手性程度.定量手性程度能够区分对映体,并且一对对映体的手性程度为相反数.手性程度不仅仅可以采用单值,还可以采用多维向量来表示.此外,还将手性程度推广到三维正烷烃的旋转构象异构体描述,即首先将正烷烃的旋转异构体转化为苯环型化合物,然后采用手性程度描述其三维构象. 展开更多
关键词 苯环型化合物 二进制编码 权原子和 手性程度 构象异构体
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基于电负性构象独立手性指数及应用
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作者 张庆友 李静亚 +1 位作者 郝军峰 许禄 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期1473-1475,共3页
为了采用计算方法研究手性化合物,为了通过结构-活性相关性研究预测与手性有关的性质,本文提出了采用σ和π的残余电负性之和作为原子属性的构象独立手性指数。该手性指数衍生于原子径向分布函数,包含分子几何和原子属性的信息,能够区... 为了采用计算方法研究手性化合物,为了通过结构-活性相关性研究预测与手性有关的性质,本文提出了采用σ和π的残余电负性之和作为原子属性的构象独立手性指数。该手性指数衍生于原子径向分布函数,包含分子几何和原子属性的信息,能够区分对映体。将构象独立手性指数应用于1个包含48对手性氨醇对映体的数据集,该数据集为苯甲醛与二乙基锌发生加成反应的催化剂,每个催化剂均产生特定绝对构型的反应主产物。采用相向传输神经网络建立了手性氨醇催化剂的构象独立手性指数与反应主产物绝对构型的相关性模型,得到了满意的预测结果。对于独立的测试集,90.0%的催化剂被正确地预测;对于训练集,89.5%的催化剂被正确地识别。 展开更多
关键词 构象独立手性指数 电负性 手性氨醇 相向传输神经网络
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