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Prediction of Antagonistic Activity of <i>β</i>-Carboline and Its Derivatives Using Topological Descriptors
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作者 Anil Kumar Soni Gajendra Pal Singh Vishnu Kumar Sahu 《Open Journal of Applied Sciences》 2021年第5期577-584,共8页
Prediction of antagonistic activity of <em>β</em>-carboline and its thirteen derivatives has been made using topological descriptors viz, connectivity index, and kappa shape index of different orders. For... Prediction of antagonistic activity of <em>β</em>-carboline and its thirteen derivatives has been made using topological descriptors viz, connectivity index, and kappa shape index of different orders. For evaluation of values of descriptor, molecular modeling and geometry optimization of all the compounds were carried out with CAChe Pro software by opting semiempirical PM3 method using MOPAC 2002. For prediction of activity multiple linear regression analysis (MLR) was performed. MLR analysis has been made by Project Leader Software associated with CAChe by using the above descriptors as independent variables and biological activity as dependent variables. We were performed leave-one-out methods and the result reflected a direct relationship between biological activity and connectivity index of zero order, while indirect relationship with connectivity index of second order and thus connectivity index is a reliable descriptor to predict the biological activity of <em>β</em>-carboline and its various derivatives. 展开更多
关键词 β–carboline antagonistic activity PM3 connectivity index and kappa shape index
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酚类化合物臭氧氧化速率的神经网络研究 被引量:4
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作者 堵锡华 吴琼 +1 位作者 陈艳 冯惠 《生态毒理学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期675-680,共6页
酚类化合物(BP)是重要的工业原料或中间体,但工业废水含有的酚类化合物会对环境造成污染。为建立酚类化合物臭氧氧化速率的QSPR(quantitative structure-property relationship)预测模型,分析了23种酚的分子结构与臭氧氧化速率之间的相... 酚类化合物(BP)是重要的工业原料或中间体,但工业废水含有的酚类化合物会对环境造成污染。为建立酚类化合物臭氧氧化速率的QSPR(quantitative structure-property relationship)预测模型,分析了23种酚的分子结构与臭氧氧化速率之间的相关关系,计算了这些酚的分子连接性指数和分子形状指数,优化筛选了连接性指数的1χ和2χ、分子形状指数的K1和K2共4种参数,将其作为BP神经网络的输入层变量,臭氧氧化速率作为输出层变量,采用4:2:1的网络结构,获得了令人满意的QSPR神经网络预测模型,模型总相关系数r为0.976,计算得到的臭氧氧化速率的预测值与实验值较为吻合,平均残差仅为0.05;为检验结构参数建立模型的普适性,同样方法建立对酚类化合物的辛醇-水分配系数的预测模型,模型总相关系数r达到0.993,辛醇-水分配系数的预测值与实验值吻合度较为理想,结果表明,本法建构的神经网络模型具有良好的稳健性和预测能力。 展开更多
关键词 酚类化合物 臭氧氧化 分子连接性指数 分子形状指数 神经网络
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醇和酚类污染物对欧洲林蛙蝌蚪及梨形四膜虫毒性的定量结构-活性模型 被引量:11
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作者 堵锡华 王超 《生态毒理学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期250-258,共9页
醇和酚类等有机化合物作为重要的工业原料,广泛应用于医药卫生、有机合成、食品工业等领域,但生产中排放于环境的这些物质,会对生物造成一定的毒性作用。为建立包含醇和酚类有机污染物对欧洲林蛙蝌蚪及梨形四膜虫毒性的定量结构-活性相... 醇和酚类等有机化合物作为重要的工业原料,广泛应用于医药卫生、有机合成、食品工业等领域,但生产中排放于环境的这些物质,会对生物造成一定的毒性作用。为建立包含醇和酚类有机污染物对欧洲林蛙蝌蚪及梨形四膜虫毒性的定量结构-活性相关性模型,计算了227种有机污染物的分子连接性指数和分子形状指数,优化筛选了分子连接性指数的0X、1X、2X、4X和5Xc、分子形状指数的K1和K2共7种参数,将这7种结构参数作为神经网络输入层变量,110种有机污染物对欧洲林蛙蝌蚪的毒性值作为输出层变量,采用7:8:1的网络结构方式,构建了令人满意的对欧洲林蛙蝌蚪毒性的神经网络预测模型,方程总相关系数r为0.988,毒性预测值与实验值之间的平均误差为0.14。为检验指数的普适性,同样用这7个结构参数与117种醇和酚类化合物对梨形四膜虫的毒性进行分析,所得神经网络模型的总相关系数达到0.997,对梨形四膜虫毒性的预测值与实验值之间的平均误差仅为0.065,结果表明,所建模型具有良好的预测有机污染物对林蛙蝌蚪及梨形四膜虫急性毒性的能力。 展开更多
关键词 有机污染物 欧洲林蛙 梨形四膜虫 分子连接性指数 分子形状指数 神经网络
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雌二醇衍生物基于拓扑参数的QSAR研究 被引量:3
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作者 堵锡华 冯长君 《深圳大学学报(理工版)》 EI CAS 北大核心 2008年第1期24-28,共5页
为研究雌二醇衍生物药物的构效关系,应用半经验量子化学AM1法,得到26种雌二醇衍生物分子的优势构象,利用量子化学算法和分子图形学技术获得Kappa形状指数及连接性指数,并将这些参数与雌二醇衍生物的性质关联,得到与26种雌二醇衍生物摩... 为研究雌二醇衍生物药物的构效关系,应用半经验量子化学AM1法,得到26种雌二醇衍生物分子的优势构象,利用量子化学算法和分子图形学技术获得Kappa形状指数及连接性指数,并将这些参数与雌二醇衍生物的性质关联,得到与26种雌二醇衍生物摩尔折射率的二元回归方程,与22种雌二醇衍生物药物的相对亲和力的多元回归方程,两个方程的相关系数均大于0.97.结果表明,估算值与实验值一致. 展开更多
关键词 kappa形状指数 连接性指数 雌二醇衍生物 相对亲和力 摩尔折射率
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神经网络法应用于酚类化合物对青海弧菌毒性的预测 被引量:2
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作者 堵锡华 王超 《生态毒理学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期90-94,共5页
青海弧菌对有毒酚类化合物具有强烈的敏感性,为建立酚类衍生物对青海弧菌毒性的定量结构-活性相关性(QSAR)模型,分析了16种酚类衍生物的分子结构与对青海弧菌毒性之间的相关关系,计算了酚类衍生物的分子连接性指数和分子形状指数,并优... 青海弧菌对有毒酚类化合物具有强烈的敏感性,为建立酚类衍生物对青海弧菌毒性的定量结构-活性相关性(QSAR)模型,分析了16种酚类衍生物的分子结构与对青海弧菌毒性之间的相关关系,计算了酚类衍生物的分子连接性指数和分子形状指数,并优化筛选了分子连接性指数的1阶路径指数(~1χ)和分子形状指数的2阶特征指数(K_2)及1阶和2阶指数乘积值(K_4),用这3种指数与对青海弧菌的毒性进行多元回归分析,多元回归方程的决定系数R^2=0.971。为进一步提高预测精度,将这3种分子结构参数作为神经网络的输入变量,毒性值作为输出变量,采用3:2:1的网络结构,通过反向传播(BP)神经网络法获得满意的QSAR预测模型,总的相关系数r为0.996,计算得到的毒性预测值与实验值较为吻合,平均相对误差仅为1.98%,结果表明该模型具有良好的预测酚类衍生物毒性的能力,可以看出神经网络方法对酚类化合物发光菌毒性预测比多元线性回归方法的统计学意义更加明显。 展开更多
关键词 酚类衍生物 青海弧菌 分子连接性指数 分子形状指数 定性结构-活性相关性
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山楂挥发性组分色谱保留时间的定量构效关系研究 被引量:1
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作者 冷检 秦文斌 秦正龙 《食品研究与开发》 CAS 北大核心 2015年第15期105-108,共4页
计算了山楂香料中51种挥发性成分的分子价连接指数(m XtV)和分子形状指数(m K),采用最佳子集回归方法建立这些拓扑指数与山楂香料中51种挥发性成分色谱保留时间(RT)的定量构效关系模型。该模型的相关系数(R)为0.981,计算值与实验值较好... 计算了山楂香料中51种挥发性成分的分子价连接指数(m XtV)和分子形状指数(m K),采用最佳子集回归方法建立这些拓扑指数与山楂香料中51种挥发性成分色谱保留时间(RT)的定量构效关系模型。该模型的相关系数(R)为0.981,计算值与实验值较好吻合,并用Jackknife方法对模型的稳健性进行了检验。结果表明,所建模型较好地揭示了山楂香料中挥发性成分色谱保留时间的变化规律。 展开更多
关键词 山楂香料 色谱保留时间 分子价连接性指数 分子形状指数 定量结构-保留相关
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白毛银露梅挥发性组分色谱保留时间的预测
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作者 冷检 秦文斌 秦正龙 《包装与食品机械》 CAS 2014年第5期13-17,共5页
基于分子形状指数nK、Kier分子价连接性指数mXtV、原子类型电性拓扑状态指数Ek,通过多元线性回归及最佳变量子集方法,构建白毛银露梅挥发性组分分子结构与色谱保留时间t的定量构效关系模型。并用Jackknife法对模型的稳健性进行检验。结... 基于分子形状指数nK、Kier分子价连接性指数mXtV、原子类型电性拓扑状态指数Ek,通过多元线性回归及最佳变量子集方法,构建白毛银露梅挥发性组分分子结构与色谱保留时间t的定量构效关系模型。并用Jackknife法对模型的稳健性进行检验。结果表明:分子形状指数、Kier分子价连接性指数和原子类型电性拓扑状态指数能够较全面地表征分子结构特征,有效地揭示了影响白毛银露梅挥发性组分色谱保留时间的本质因素。 展开更多
关键词 白毛银露梅 挥发性组分 色谱保留时间 分子形状指数 Kier分子价连接性指数
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多溴代芴热力学性质的理论预测研究 被引量:2
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作者 周俊 堵锡华 《分子科学学报》 CSCD 北大核心 2017年第6期482-485,共4页
为了预测环境污染物多溴代芴的热力学性质,计算了60种多溴代芴的分子连接性指数、电性距离矢量指数、电性拓扑状态指数以及分子形状指数.采用多元线性回归的方法建立了多溴代芴化合物的标准生成焓(Δ_fH^0)、标准熵(S^0)、标准生成吉布... 为了预测环境污染物多溴代芴的热力学性质,计算了60种多溴代芴的分子连接性指数、电性距离矢量指数、电性拓扑状态指数以及分子形状指数.采用多元线性回归的方法建立了多溴代芴化合物的标准生成焓(Δ_fH^0)、标准熵(S^0)、标准生成吉布斯自由能(Δ_fG^0)及等容热容等热力学性质的QSPR相关性模型,方程的相关系数值均在0.99以上.与相关文献的相关系数R和标准误差S进行比较,该模型具有良好的预测能力和稳定性. 展开更多
关键词 多溴代芴 热力学性质 分子连接性指数 电性距离矢量指数 电性拓扑态指数 分子形状指数
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