期刊文献+
共找到8篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
基于cpSSR标记的红松天然群体自由授粉子代的父本分析 被引量:1
1
作者 赵丹 隋心 +1 位作者 孙晓艳 冯富娟 《经济林研究》 2011年第4期23-27,共5页
为了研究天然红松林的花粉传播规律,利用筛选出的9对多态性高的cpSSR引物,对红松天然群体内28个单株的280个自由授粉子代进行了父本分析。9对引物共检测到21个等位基因,每个位点的等位基因数在2~4之间,平均2.3个。试验群体平均观测杂... 为了研究天然红松林的花粉传播规律,利用筛选出的9对多态性高的cpSSR引物,对红松天然群体内28个单株的280个自由授粉子代进行了父本分析。9对引物共检测到21个等位基因,每个位点的等位基因数在2~4之间,平均2.3个。试验群体平均观测杂合度、平均期望杂合度及平均多态信息含量分别为0.405 1,0.510 4和0.411 8。采用最大似然法对子代进行父本分析,在95%的可信度水平下可确定59个子代的父本,占子代群体的21%,其累积排除概率为90.16%。在自由授粉状态下,红松自交率为0。绝大多数亲本的雄性繁殖适合度在1%~2%之间,平均为1.34%。各项指标均表明红松天然群体内亲本群体与子代群体的遗传多样性水平十分接近,得出了自由授粉的天然种群具有较好的遗传多样水平的保持性和传续性。 展开更多
关键词 红松 天然群体 cpssr标记 父本分析
下载PDF
基于cpSSR标记的山药种质资源DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析 被引量:2
2
作者 张静珍 王连军 +3 位作者 雷剑 柴沙沙 杨新笋 张文英 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2021年第7期1222-1233,共12页
采用叶绿体SSR(cpSSR)分子标记对从国内外引进的64份山药种质资源进行遗传多样性分析,构建DNA指纹图谱,旨在为山药品种亲本选择,山药种质创新及品种改良提供依据。结果显示:从21对cpSSR引物中筛选出10对扩增稳定、多态性高的引物,在64... 采用叶绿体SSR(cpSSR)分子标记对从国内外引进的64份山药种质资源进行遗传多样性分析,构建DNA指纹图谱,旨在为山药品种亲本选择,山药种质创新及品种改良提供依据。结果显示:从21对cpSSR引物中筛选出10对扩增稳定、多态性高的引物,在64份山药种质材料中扩增出69个条带,多态性条带59个,多态性比率高达85.51%,平均观测等位基因数(Na)为2,平均有效等位基因数(Ne)为1.5693(1.2311~1.9160),平均Shannon信息指数为0.5606(0.3290~0.6711),平均Nei's基因多样性指数(He)为0.3781(0.1848~0.4781),表明64份山药种质资源具有丰富的遗传多样性。聚类分析结果表明,遗传相似系数变幅为0.55~0.93,在相似系数为0.63时,可将64份山药种质资源分为4类,结果表明,基于cpSSR分子标记的山药种质资源的分类在种间具有较好的区分能力,但是cpSSR分类表现出较大的地理分布的相关性,而与形态特征关系不密切。选用较少的引物区分较多的品种为原则,采用2对引物成功构建供试种质的DNA指纹图谱,为山药种质资源鉴定和品种选育亲本的选择提供理论依据。 展开更多
关键词 山药 种质资源 cpssr标记 DNA指纹图谱 遗传多样性
下载PDF
基于cpSSR标记的甘薯品种亲缘关系及遗传多样性分析 被引量:5
3
作者 王崇 王连军 +4 位作者 苏文瑾 雷剑 柴沙沙 杨新笋 张文英 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期1687-1696,共10页
在甘薯遗传多样性研究中,目前主要采用细胞核基因组的遗传信息。而放任授粉(集团杂交)是甘薯育种的重要手段,但基于叶绿体微卫星(chloroplast simple sequence repeat,cpSSR)标记技术的甘薯的遗传多样性分析和指纹图谱构建的研究报道较... 在甘薯遗传多样性研究中,目前主要采用细胞核基因组的遗传信息。而放任授粉(集团杂交)是甘薯育种的重要手段,但基于叶绿体微卫星(chloroplast simple sequence repeat,cpSSR)标记技术的甘薯的遗传多样性分析和指纹图谱构建的研究报道较少。本研究基于cpSSR标记技术,对16份甘薯品种进行分子鉴别,并建立相对应的指纹图谱。利用在19对cpSSR引物中筛选出的11对特异性引物进行cpSSR扩增,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,结果显示,共扩增出43个条带,其中多态性条带33条,平均每对引物扩增出3个多态性条带,多态性百分率为76.74%。16份甘薯品种的遗传距离变异范围为0.0912-0.5067,平均遗传距离是0.2301。聚类分析表明,cpSSR标记能大致反映出不同品种之间的亲缘关系。该指纹图谱的建立,可为中国甘薯品种数据库的完善、近缘甘薯品种的鉴定、育种亲本的选择和品种保护提供参考依据。 展开更多
关键词 甘薯 cpssr标记 品种鉴定 指纹图谱
原文传递
叶绿体基因组微卫星标记(cpSSR)研究进展 被引量:7
4
作者 李博 刘合霞 《安徽农业科学》 CAS 2012年第13期7638-7639,7649,共3页
随着测序技术的发展,叶绿体基因组微卫星标记(cpSSRs)的开发和应用越来越普遍。该研究介绍了叶绿体基因组分子标记的特点、用途、开发方法以及已开发的cpSSRs所具有的特点。随着cpSSRs开发成本的降低及研究技术的成熟,新的cpSSRs不断开... 随着测序技术的发展,叶绿体基因组微卫星标记(cpSSRs)的开发和应用越来越普遍。该研究介绍了叶绿体基因组分子标记的特点、用途、开发方法以及已开发的cpSSRs所具有的特点。随着cpSSRs开发成本的降低及研究技术的成熟,新的cpSSRs不断开发,将会有越来越多的叶绿体基因组SSR分子标记应用于群体遗传学、生物地理学和杂交育种的研究。其在野生植物进化过程研究中所具备的潜力在不久的将来将被充分认识和利用。 展开更多
关键词 叶绿体基因组 微卫星标记 叶绿体基因组微卫星标记cpssrs
下载PDF
Investigation on Genetic Characteristics of Salvia miltiorrhiza Bge. by Using cpSSR Technology
5
作者 王海 何冬梅 +3 位作者 王睿婷 宋杰 郭晓恒 严铸云 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2012年第6期1157-1163,共7页
[Objective] This study aimed to analyze the genetic characteristics of Salvia miltiorrhiza by using cpSSR (chloroplast microsatellites) molecular marker method. [Method] Twelve pairs of SSR primers with ideal cpSSR ... [Objective] This study aimed to analyze the genetic characteristics of Salvia miltiorrhiza by using cpSSR (chloroplast microsatellites) molecular marker method. [Method] Twelve pairs of SSR primers with ideal cpSSR amplification result, good repeatability and clear amplification bands were selected for cpSSR detection and analysis of S. miltiorrhiza samples from 31 sampling locations in 25 counties of 8 provinces in China. [Result] S. miltiorrhiza shows an overall medium level in the cytoplasmic inheritance (cpSSR) and varying degrees of differences in the regions. Based on Shannon’s Information index (I) and Nei’s genetic diversity index, the cytoplasmic genetic diversity in different provinces shows a decreasing order of Shanxi, Henan, Shandong, Hebei, Sichuan, Jiangsu, Shaanxi, Anhui. Genetic variations of S. miltiorrhiza in eight provinces were found mainly among populations. Gene flow among populations with in a province is less than that among different provinces. [Conclusion] Comprehensive analysis shows that S. miltiorrhiza cultivated in genuine producing areas and traditional main producing areas are mainly introduced from the local before introduction of some foreign germplasm resources during cultivation. The exchange of S. miltiorrhiza germplasm resources exists very early among genuine producing areas such as Sichuan, Shandong and Henan, while S. miltiorrhiza germplasm resources in new producing areas are mainly introduced from genuine producing areas. However, no geographical correlation was observed in the genetic differentiation, which further reveals that there is a wide range of genetic exchange among S. miltiorrhiza germplasm resources in China, resulting from the artificial introduction from allopatry. 展开更多
关键词 Salvia miltiorrhiza Bunge cpssr Molecular marker Genetic diversity
下载PDF
104个甘薯品种的cpSSR指纹图谱构建及遗传多样性分析 被引量:4
6
作者 王崇 王连军 +5 位作者 杨新笋 雷剑 柴沙沙 张文英 焦春海 田小海 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2021年第6期1549-1556,共8页
基于甘薯叶绿体基因组,利用cpSSR分子标记,对104份甘薯栽培品种和地方品种进行遗传多样性分析并构建指纹图谱,为甘薯资源的保护鉴定和遗传改良提供参考。使用了11对cpSSR引物,在104个甘薯材料中总共扩增得到58条条带,多态性条带为47条,... 基于甘薯叶绿体基因组,利用cpSSR分子标记,对104份甘薯栽培品种和地方品种进行遗传多样性分析并构建指纹图谱,为甘薯资源的保护鉴定和遗传改良提供参考。使用了11对cpSSR引物,在104个甘薯材料中总共扩增得到58条条带,多态性条带为47条,单条引物平均扩增的条带数为5.27,平均多态性百分率为81.03%。根据引物在甘薯材料中的扩增结果,构建104个甘薯品种的指纹图谱。对104个甘薯品种的扩增结果进行聚类分析,每个品种间的遗传距离为0.0386~5.2723,平均遗传距离为0.2201,在遗传系数为0.74时将104个甘薯品种分为5组。 展开更多
关键词 甘薯 cpssr分子标记 遗传多样性 指纹图谱
下载PDF
山核桃属叶绿体基因组微卫星特征分析及分子标记开发 被引量:1
7
作者 娄文睿 莫正海 +3 位作者 杨旭风 翟敏 郭忠仁 宣继萍 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2024年第22期7421-7428,共8页
本研究利用山核桃属6个不同物种的叶绿体基因组(chloroplast genome DNA, cpDNA)序列信息,分析其简单重复序列(chloroplast simple sequence repeat, cpSSR)特征及开发分子标记。结果表明,山核桃属各物种叶绿体平均长度为163 048 bp,每... 本研究利用山核桃属6个不同物种的叶绿体基因组(chloroplast genome DNA, cpDNA)序列信息,分析其简单重复序列(chloroplast simple sequence repeat, cpSSR)特征及开发分子标记。结果表明,山核桃属各物种叶绿体平均长度为163 048 bp,每个基因组平均有224个微卫星,cpSSR分布频率平均约为1.37个/kb。山核桃属cpSSR以A/T类型的单核苷酸重复基序为主,占微卫星总数的85.79%,各物种碱基重复基序类型较为一致;cpSSR在叶绿体基因组上的分布主要集中在大单拷贝区(large single copy, LSC)和小单拷贝区(small single copy, SSC),在两个反向重复序列(inverted repeat sequence, IRa和IRb)分布最少;山核桃属各物种cpSSR主要分布于cpDNA的非编码区。以薄壳山核桃的cpSSR为基准,其他物种与其进行BLAST比对,结果发现共有62种cpSSR (包括34种完全型,28种复合型cpSSR)具有种间差异,对具有种间差异的cpSSR进行引物设计,共成功设计出61对引物。以山核桃属5个物种共9个样品的DNA为模板,对这61对引物进行PCR扩增。选用的61对引物中有49对引物扩增出的产物有目的条带,其中6对引物扩增良好,在种间具有明显的多态性。本研究为山核桃属植物的遗传多样性、系统发育、种质资源鉴定等研究提供理论基础。 展开更多
关键词 山核桃属 cpssr标记 叶绿体基因组 薄壳山核桃
原文传递
利用叶绿体微卫星标记分析东亚柳杉群体的谱系地理结构
8
作者 李鑫玉 戴旻峻 +4 位作者 王敏求 袁美灵 武星彤 蔡梦颖 文亚峰 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2024年第18期6081-6089,共9页
柳杉(Cryptomeria japonica)是东亚特有孑遗植物,分为中国柳杉(C.japonica var.sinensis)和日本柳杉(C.japonica var.japonica)两个地理变种,但其谱系空间格局与形成机制仍不清楚。本研究利用叶绿体微卫星(cpSSR)标记,研究东亚柳杉群体... 柳杉(Cryptomeria japonica)是东亚特有孑遗植物,分为中国柳杉(C.japonica var.sinensis)和日本柳杉(C.japonica var.japonica)两个地理变种,但其谱系空间格局与形成机制仍不清楚。本研究利用叶绿体微卫星(cpSSR)标记,研究东亚柳杉群体的遗传多样性及其谱系地理结构,分析空间分布与现有谱系之间的关联。结果表明,11个cpSSR多态性位点共检测到127个单倍型,各群体的单倍型数(A)从4到16不等,不同群体私有单倍型数(P)为1~11个。在物种水平,柳杉遗传多样性高(H=0.890),且遗传分化显著(FST=0.594,P<0.001)。与其空间分布一致,基于cpSSR标记的STRUCTURE分析将柳杉分为中国柳杉和日本柳杉两大群体,群体间存在明显谱系地理结构(G_(ST)=0.102<R_(ST)=0.702)。结合气候变化资料,推测第四纪气候变化和长期地理隔离是东亚柳杉谱系地理格局形成的主要原因。研究结果可为东亚植物区系演化和柳杉遗传资源保护提供科学依据。 展开更多
关键词 谱系地理结构 叶绿体微卫星标记(cpssr) 单倍型 柳杉
原文传递
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部