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Unconditional and Conditional QTL Mapping for Tiller Numbers at Various Stages with Single Segment Substitution Lines in Rice(Oryza sativa L.) 被引量:6
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作者 ZHAO Fang-ming LIU Gui-fu ZHU Hai-tao DING Xiao-hua ZENG Rui-zhen ZHANG Ze-min LI Wen-tao ZHANG Gui-quan 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2008年第3期257-265,共9页
Tiller is one of the most important agronomic traits which influences quantity and quality of effective panicles and finally influences yield in rice. It is important to understand "static" and "dynamic" informati... Tiller is one of the most important agronomic traits which influences quantity and quality of effective panicles and finally influences yield in rice. It is important to understand "static" and "dynamic" information of the QTLs for tillers in rice. This work was the first time to simultaneously map unconditional and conditional QTLs for tiller numbers at various stages by using single segment substitution lines in rice. Fourteen QTLs for tiller number, distributing on the corresponding substitution segments of chromosomes 1, 2, 3, 4, 6, 7 and 8 were detected. Both the number and the effect of the QTLs for tiller number were various at different stages, from 6 to 9 in the number and from 1.49 to 3.49 in the effect, respectively. Tiller number QTLs expressed in a time order, mainly detected at three stages of 0-7 d, 14-21 d and 35-42 d after transplanting with 6 positive, 9 random and 6 negative expressing QTLs, respectively. Each of the QTLs expressed one time at least during the whole duration of rice. The tiller number at a specific stage was determined by sum of QTL effects estimated by the unconditional method, while the increasing or decreasing number in a given time interval was controlled by the total of QTL effects estimated by the conditional method. These results demonstrated that it is highly effective and accurate for mapping of the QTLs by using single segment substitution lines and the conditional analysis methodology. 展开更多
关键词 single segment substitution line unconditional qtl mapping conditional qtl mapping tiller number RICE
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野生稻单片段代换系苗期耐旱性评价及QTL鉴定
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作者 廖冰 黄秀艳 +2 位作者 陈科 傅雪琳 何平 《广东农业科学》 CAS 2024年第3期70-80,共11页
【目的】干旱是影响水稻生产力的主要非生物因素之一,筛选抗旱水稻可有效保障水稻产量。【方法】选取以南方野生稻和展颖野生稻为供体、‘华粳籼74’(HJX74)为受体构建的93份单片段代换系(Single-segment substitution lines,SSSLs)为... 【目的】干旱是影响水稻生产力的主要非生物因素之一,筛选抗旱水稻可有效保障水稻产量。【方法】选取以南方野生稻和展颖野生稻为供体、‘华粳籼74’(HJX74)为受体构建的93份单片段代换系(Single-segment substitution lines,SSSLs)为供试材料,以HJX74为对照,采用20%PEG-6000模拟干旱条件进行苗期耐旱性试验,以4个生长发育性状指标(相对苗高、相对苗干质量、相对根干质量、相对根长)作为评价指标,采用隶属函数法对SSSLs进行排序、筛选相关性状,并筛选与HJX74差异显著的SSSLs,进行QTL鉴定与加性效应分析,初步鉴定与苗期耐旱性状相关的QTL。【结果】4个生长发育性状指标与平均隶属函数值的相关性分析结果均为极显著正相关,可作为SSSLs苗期耐旱性鉴定和评价指标。隶属函数法分析结果显示,93份SSSLs平均隶属函数值范围为0.20~0.71,HJX74平均隶属函数值为0.54;有29个SSSLs的平均隶属函数值> HJX74的平均隶属函数值,其中,M124的隶属函数值最大,表明M124具有较强的耐旱性。通过单因素方差分析,从8个SSSLs(M78-1、M78-2、M124、M107、M151、M103、M130、M115)鉴定出7个相对苗高QTLs(qRSH1-1、qRSH1-2、qRSH2-1、qRSH3-1、qRSH3-2、qRSH5-1、qRSH6-1),分别分布在1、2、3、5、6号染色体,其加性效应为0.05~0.06,表型贡献率为6.97%~9.01%;从3个SSSLs(M79、M145、M148)中鉴定出3个相对根干质量QTLs(qRRDW10-1、qRRDW11-1、qRRDW11-2),分别分布在10、11号染色体,其加性效应为0.12~0.20,表型贡献率为12.51%~19.95%;从2个耐旱SSSLs(M80、X149)中鉴定出1个相对苗干质量QTL(qRSDW5-1),分布在5号染色体,加性效应为0.07,表型贡献率为10.5%。【结论】筛选出13份SSSLs携带苗期耐旱QTLs,为后续苗期耐旱QTLs精细定位与克隆研究奠定基础。 展开更多
关键词 单片段代换系 干旱胁迫 PEG-6000 野生稻 隶属函数 qtl鉴定
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野生稻单片段代换系芽期耐旱性评价及QTLs鉴定 被引量:1
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作者 黄秀艳 栗俊波 +2 位作者 廖冰 傅雪琳 何平 《干旱地区农业研究》 CSCD 北大核心 2023年第4期32-40,共9页
于2020-2021年以60份来自展颖野生稻和南方野生稻的单片段代换系(Single chromosome segments substitution lines, SSSLs)及其受体亲本‘华粳籼74’(‘HJX74’)为试验材料,在20%PGE-6000干旱胁迫浓度下开展水稻芽期耐旱性试验,以6个生... 于2020-2021年以60份来自展颖野生稻和南方野生稻的单片段代换系(Single chromosome segments substitution lines, SSSLs)及其受体亲本‘华粳籼74’(‘HJX74’)为试验材料,在20%PGE-6000干旱胁迫浓度下开展水稻芽期耐旱性试验,以6个生长发育性状指标的相对值(相对芽长、相对根长、相对胚芽鞘长、相对根数、相对根干质量、相对芽干质量)作为评价指标,采用隶属函数法对SSSLs进行排序并筛选相关性状与‘HJX74’有显著差异的SSSLs,进行QTL鉴定与加性效应分析,初步鉴定与芽期耐旱性状相关的QTL。结果表明:供试SSSLs平均隶属函数值范围为0.14~0.71,‘HJX74’平均隶属函数值为0.58,有12个SSSLs的平均隶属函数值大于‘HJX74’。通过单因素方差分析,筛选出以相对芽长为指标的2份耐旱SSSLs和以相对根数为指标的4份耐旱SSSLs。在20%PGE-6000模拟干旱胁迫处理条件下,以发芽第8天的相对芽长和相对根数为指标鉴定耐旱QTLs, 2份SSSLs(X24、X8)鉴定出1个相对芽长QTL,即qRSL1-1,加性效应分别为0.07、0.08,表型贡献率分别为11.17%、13.85%;4份SSSLs(M77、M120、M133和M142)鉴定出3个相对根数QTLs,即qRRN10-1、qRRN11-1、qRRN12-1,其加性效应为0.11~0.24,表型贡献率为16.64%~36.34%。表明这些SSSLs携带芽期耐旱QTLs,可以作为水稻耐旱基因发掘材料。 展开更多
关键词 染色体单片段代换系 野生稻 耐旱性评价 qtl鉴定
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基于单片段代换系的水稻苗高QTL定位和上位性效应分析
4
作者 张龙廷 吴静 +5 位作者 熊喜娟 董景芳 张少红 赵均良 刘自强 杨梯丰 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期881-888,共8页
【目的】挖掘控制水稻苗高的稳定QTL,并分析其上位性效应,为水稻苗高的分子育种提供QTL和理论参考。【方法】以IR65598-112-2为供体、优良品种‘华粳籼74’为受体的单片段代换系(Single segment substitution line,SSSL)为材料,通过测定... 【目的】挖掘控制水稻苗高的稳定QTL,并分析其上位性效应,为水稻苗高的分子育种提供QTL和理论参考。【方法】以IR65598-112-2为供体、优良品种‘华粳籼74’为受体的单片段代换系(Single segment substitution line,SSSL)为材料,通过测定SSSL与‘华粳籼74’的苗高差异,对苗高QTL进行定位;通过代换作图缩小QTL的区间,并分析2个苗高QTL的上位性效应。【结果】在第3号染色体长臂端定位到2个相邻的苗高QTLs(qSH3-1和qSH3-2),分别位于第3号染色体的32.59—33.08 Mb和33.16—34.81 Mb区间,长度分别为0.49和1.65 Mb;加性效应分别为-0.86和-1.09 cm;加性效应表型贡献值分别为-4.14%和-5.15%;包含这2个QTL的SSSL的苗高与‘华粳籼74’无显著差异。【结论】本研究定位到2个苗高QTL,这2个QTL之间可能存在显著的上位性。 展开更多
关键词 苗高 单片段代换系 代换作图 qtl定位 上位性效应 水稻
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水稻单片段代换系芽期和苗期耐冷性分析及耐冷性QTL鉴定 被引量:20
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作者 周勇 朱孝波 +6 位作者 袁华 郑英 钦鹏 魏应海 王玉平 黄世君 李仕贵 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期381-388,共8页
对籼型两系骨干亲本9311(受体)和粳稻日本晴(供体)构建的单片段代换系群体,在芽期和苗期分别进行低温处理,以芽期处理后的恢复成活率和苗期卷叶程度作为耐冷性的评价指标进行耐冷性评价。结果表明,日本晴在芽期和苗期耐冷性极显著强于93... 对籼型两系骨干亲本9311(受体)和粳稻日本晴(供体)构建的单片段代换系群体,在芽期和苗期分别进行低温处理,以芽期处理后的恢复成活率和苗期卷叶程度作为耐冷性的评价指标进行耐冷性评价。结果表明,日本晴在芽期和苗期耐冷性极显著强于9311,不同代换系芽期和苗期耐冷性也存在极显著差异,芽期和苗期耐冷性较强的代换系X724、X732、X733较好地保持了9311的农艺性状,其产量等性状的一般配合力优于9311;鉴定出18个芽期耐冷性QTL和5个苗期耐冷性QTL,分布于12条染色体上的20个代换片段中,第12染色体的RM1261-RM519和RM17区域同时检测出芽期和苗期耐冷性QTL;芽期耐冷性QTLqCTP9、qCTP11.2、qCTP12.1和苗期耐冷性QTLqCTS1.1、qCTS1.2具有较大加性效应,对应代换系耐冷性较强。 展开更多
关键词 水稻 单片段代换系 芽期 苗期 耐冷性 数量性状基因座
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利用单片段代换系定位水稻抽穗期QTL 被引量:41
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作者 何风华 席章营 +2 位作者 曾瑞珍 Akshay Talukdar 张桂权 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第8期1505-1513,共9页
抽穗期是水稻品种的重要农艺性状之一,对抽穗期QTL进行定位并研究其遗传效应在水稻育种中是至关重要的。本研究利用以6个水稻品种为供体的52个单片段代换系为试验材料,通过t测验比较单片段代换系与受体亲本华粳籼74之间抽穗期的差异,对... 抽穗期是水稻品种的重要农艺性状之一,对抽穗期QTL进行定位并研究其遗传效应在水稻育种中是至关重要的。本研究利用以6个水稻品种为供体的52个单片段代换系为试验材料,通过t测验比较单片段代换系与受体亲本华粳籼74之间抽穗期的差异,对代换片段上的抽穗期QTL进行了鉴定。以P≤0.001为阈值共鉴定出20个抽穗期QTL,这些QTL分布于水稻的10条染色体。QTL加性效应值为–5.9~1.1,加性效应百分率为–7.4%~1.4%。有8个QTL被定位在小于10.0cM的区段内。利用1个单片段代换系与华粳籼74杂交发展的F2群体对qHD-3-1进行了定位。在作图群体中,早抽穗和迟抽穗植株数符合3:1的分离比,早抽穗表现为显性。利用微卫星标记将qHD-3-1定位于3号染色体短臂,PSM304和RM569分别位于其两侧,遗传距离分别为2.4cM和5.1cM。 展开更多
关键词 水稻 单片段代换系 抽穗期 qtl 基因定位 水稻品种 代换系 定位 片段 3号染色体
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用单片段代换系(SSSLs)研究水稻株高及其构成因素QTL加性及上位性效应 被引量:20
7
作者 赵芳明 张桂权 +5 位作者 曾瑞珍 杨正林 朱海涛 钟秉强 凌英华 何光华 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期48-56,共9页
株高是典型的数量性状,易受遗传背景和环境等因素的影响。单片段代换系和双片段聚合系减少了个体间遗传背景的干扰,是鉴定QTL和研究QTL上位性的新型遗传材料。本研究采用随机区组试验设计方法以初级单片段代换系间杂交衍生的16个次级单... 株高是典型的数量性状,易受遗传背景和环境等因素的影响。单片段代换系和双片段聚合系减少了个体间遗传背景的干扰,是鉴定QTL和研究QTL上位性的新型遗传材料。本研究采用随机区组试验设计方法以初级单片段代换系间杂交衍生的16个次级单片段代换系和15个双片段聚合系分析了株高及其构成因素QTL的加性效应及加性×加性上位性效应。共鉴定出11个QTL,其中3个株高QTL,1个倒1节间长QTL,2个倒2节间长QTL,2个倒3节间长QTL和3个倒4节间长QTL,分布于第4、6和10染色体上。鉴定出23对双基因互作,其中7对为没有显著效应的座位间互作,16对为有显著效应的QTL与没有显著效应的座位间互作。结果表明,QTL加性效应和QTL间的上位性效应都是株高及构成因素的重要遗传组成。通过单片段代换系杂交衍生的次级单片段代换系和双片段聚合系可提高QTL鉴定和上位性分析的灵敏度。 展开更多
关键词 水稻 单片段代换系 株高 qtl 上位性效应
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用单片段代换系对不同时期水稻分蘖数QTL的非条件和条件定位 被引量:15
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作者 赵芳明 刘桂富 +5 位作者 朱海涛 丁效华 曾瑞珍 张泽民 李文涛 张桂权 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期322-330,共9页
【目的】了解各个发育时期控制水稻分蘖数QTL的"静态"和"动态"信息。【方法】利用单片段代换系对不同时期的水稻分蘖数QTL同时进行非条件和条件定位分析。【结果】(1)水稻分蘖数至少受14个QTL影响,它们分布在第1、2... 【目的】了解各个发育时期控制水稻分蘖数QTL的"静态"和"动态"信息。【方法】利用单片段代换系对不同时期的水稻分蘖数QTL同时进行非条件和条件定位分析。【结果】(1)水稻分蘖数至少受14个QTL影响,它们分布在第1、2、3、4、6、7和8号共7条染色体的相应代换片段上;(2)各个时期影响水稻分蘖数的QTL数量(变动在6~9之间)和效应(变动在1.49~3.49之间)均不相同;(3)水稻分蘖数QTL的表达具有很强的时序性,主要集中在移栽后0~7d(有6个正表达),14~21d(有9个随机表达)和35~42d(有6个负表达)3个时间段内,正、负表达分别决定了最高分蘖和有效分蘖的数量;(4)每个QTL在整个生育期至少表达1次,有些可多次表达;(5)某个时期的分蘖数量取决于所有QTL的累积效应,而某个时间段内分蘖数的增减量则取决于所有QTL的净效应。【结论】用单片段代换系和条件QTL定位方法对发育性状进行QTL定位分析非常有效和准确。 展开更多
关键词 单片段代换系 非条件qtl定位 条件qtl定位 分蘖数 水稻
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利用单片段代换系研究水稻产量相关性状QTL加性及上位性效应 被引量:14
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作者 赵芳明 张桂权 +4 位作者 曾瑞珍 杨正林 凌英华 桑贤春 何光华 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第11期2007-2014,共8页
产量及其相关性状如单株有效穗数、千粒重、穗实粒数、穗总粒数和结实率等是水稻重要的农艺性状,了解产量及其相关性状QTL的加性及上位性效应对以分子标记聚合育种改良水稻产量具有重要意义。本文以16个单片段代换系及15个双片段代换系... 产量及其相关性状如单株有效穗数、千粒重、穗实粒数、穗总粒数和结实率等是水稻重要的农艺性状,了解产量及其相关性状QTL的加性及上位性效应对以分子标记聚合育种改良水稻产量具有重要意义。本文以16个单片段代换系及15个双片段代换系分析了水稻产量相关性状QTL的加性及上位性效应。共检出影响产量及其相关性状的13个QTL,包括产量性状1个、单株有效穗数1个、千粒重4个、穗实粒数4个、穗总粒数2个和结实率1个,分布于第2、第3、第4、第7和第10染色体上。此外,检出12对双基因互作。结果显示,2个正向(或负向)产量性状QTL聚合,往往会产生负向(或正向)的上位性效应,能否产生更大(或更小)的目标性状,取决于双片段遗传效应(加性效应与上位效应代数和)绝对值与单片段最大加性效应绝对值的差。本研究结果对实施高产分子标记聚合育种方法有重要参考价值。 展开更多
关键词 水稻 单片段代换系 产量相关性状qtl 加性效应 上位性效应
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基于单片段代换系的水稻粒型QTL加性及上位性效应分析 被引量:11
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作者 赵芳明 张桂权 +4 位作者 曾瑞珍 杨正林 凌英华 桑贤春 何光华 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期469-476,共8页
以分子标记辅助选择的手段有目的地进行基因聚合育种,对于加快育种进程具有重要的意义。而基因的加性和上位性效应是决定基因聚合能否成功的关键。本文以16个单片段代换系(SSSL)及15个双片段代换系分析了水稻粒型性状QTL的加性及上位性... 以分子标记辅助选择的手段有目的地进行基因聚合育种,对于加快育种进程具有重要的意义。而基因的加性和上位性效应是决定基因聚合能否成功的关键。本文以16个单片段代换系(SSSL)及15个双片段代换系分析了水稻粒型性状QTL的加性及上位性效应。共检测到9个水稻粒型性状QTL,包括4个粒长QTL、1个粒宽QTL和4个籽粒长宽比QTL,分别位于第2、第3、第4、第7和第10染色体上。此外,还检测出7对双基因互作,其中3对为有显著效应的两座位间互作,1对为两座位均没有显著效应的座位间互作,3对为1个有显著效应的座位与1个没有显著效应的座位间互作。本文结果进一步揭示了同一粒长QTL与不同单片段代换系聚合时会产生不同的互作效应,只有当上位性效应与目标基因的加性效应同向时,才可以达到明显改良粒长的效果。而且,2个长粒或2个短粒QTL聚合很难再产生更长或更短的籽粒。以上结果对于通过分子标记辅助育种手段改良水稻粒型具有重要意义。 展开更多
关键词 水稻 单片段代换系 粒型qtl 加性效应 上位性效应
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玉米开花期性状的QTL及杂种优势位点定位 被引量:9
11
作者 杨慧丽 林亚楠 +3 位作者 张怀胜 卫晓轶 丁冬 薛亚东 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期678-690,共13页
开花期是玉米进化和适应过程中的重要性状,明确开花期杂种优势的遗传机制对培育适应不同生态区的优良玉米品种具有重要的意义。本研究利用以许178为受体,综3为供体构建的包含203个SSSL的单片段代换系群体及其与许178的测交群体,通过2年... 开花期是玉米进化和适应过程中的重要性状,明确开花期杂种优势的遗传机制对培育适应不同生态区的优良玉米品种具有重要的意义。本研究利用以许178为受体,综3为供体构建的包含203个SSSL的单片段代换系群体及其与许178的测交群体,通过2年3个试点玉米开花期性状(散粉期、吐丝期和散粉至吐丝间隔)QTL和杂种优势位点(HL)分析,分别鉴定出40个开花期相关性状的QTL和37个开花期相关性状的HL。其中6个QTL和4个HL在3个地点被同时检测到。在所检测到的染色体区段中,11个区段同时包含调控开花期的QTL和HL。该研究为进一步解析玉米开花期遗传机制和开花期杂种优势的遗传机制提供了基础。 展开更多
关键词 玉米 单片段代换系 开花期 qtl 杂种优势
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染色体单片段代换系的构建及应用于QTL精细定位 被引量:17
12
作者 张丽霞 刘丕庆 刘学义 《分子植物育种》 CAS CSCD 2004年第5期743-746,共4页
染色体片段代换系(Chromosome Segment Substitution Lines, CSSLs),又称为代换系(Substitution lines , SLs)或导入系(Introgression lines, ILs)。只含一个代换片段的代换系,即单片段代换系(Single Segment Sub-stitution Lines, SSS... 染色体片段代换系(Chromosome Segment Substitution Lines, CSSLs),又称为代换系(Substitution lines , SLs)或导入系(Introgression lines, ILs)。只含一个代换片段的代换系,即单片段代换系(Single Segment Sub-stitution Lines, SSSLs)是理想的代换系。单片段代换系只有代换片段与受体亲本不同,其它遗传背景与受体亲本完全一致,对代换区段中的QTL进行分析时遗传背景干扰很小,有利于QTL的分析,不少学者利用单片段代换系材料对许多QTL进行了鉴定和精细定位,并克隆了一些重要性状的QTL。本文介绍了染色体单片段代换系构建的原理和利用微卫星标记(SSR)进行单片段代换系鉴定的方法,讨论了代换系构建过程中值得注意的问题,并对用染色体单片段代换系进行QTL精细定位做了展望。 展开更多
关键词 染色体 单片段 代换系 构建技术 qtl精细定位
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利用单片段代换系群体定位玉米穗部性状的QTL 被引量:8
13
作者 李卫华 王洪秋 +4 位作者 袁亮 张向歌 谢慧玲 胡彦民 汤继华 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期143-146,181,共5页
以具有优良玉米自交系lx 9801背景的昌7-2单片段代换系群体为基础材料,2011年在郑州和浚县两点对玉米穗部性状进行了QTL分析.利用显著性检验的方法共检测到4个玉米穗部性状的22个QTL,其中穗长检测到9个QTL,穗粗检测到4个QTL,穗行数检测... 以具有优良玉米自交系lx 9801背景的昌7-2单片段代换系群体为基础材料,2011年在郑州和浚县两点对玉米穗部性状进行了QTL分析.利用显著性检验的方法共检测到4个玉米穗部性状的22个QTL,其中穗长检测到9个QTL,穗粗检测到4个QTL,穗行数检测到3个QTL,行粒数检测到6个QTL,有4个QTL在两个环境中同时被检测到,这些QTL为进一步基因克隆与利用奠定了基础. 展开更多
关键词 玉米 单片段代换系 穗部性状 qtl定位
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水稻单片段替换系群体的建立及QTL分析 被引量:5
14
作者 何风华 张桂权 《分子植物育种》 CAS CSCD 2003年第4期562-564,共3页
农作物大多数性状都是由多基因控制的数量性状 ,对数量性状基因座 (quantitativetraitloci,QTL)进行鉴定和定位对作物遗传育种具有重要意义。单片段替换系 (singlesegmentsubstitutionlines ,SSSL)消除了遗传背景的干扰 ,是用于QTL分析... 农作物大多数性状都是由多基因控制的数量性状 ,对数量性状基因座 (quantitativetraitloci,QTL)进行鉴定和定位对作物遗传育种具有重要意义。单片段替换系 (singlesegmentsubstitutionlines ,SSSL)消除了遗传背景的干扰 ,是用于QTL分析的重要试验材料。本研究以 6个水稻品种为供体 ,利用回交和微卫星标记辅助选择相结合的方法 ,建立了以华粳籼 74为遗传背景的水稻单片段替换系群体 ,并选用其中的 5 9个单片段替换系对水稻 2 4个重要农艺性状的QTL进行了鉴定 ;还利用一个单片段替换系的次级分离群体对抽穗期基因Hd - 3- 1进行了定位。主要试验结果如下 :1对供体亲本苏御糯、IR6 4、IRAT2 6 1、成龙水晶米、Lemont和IAPAR9与华粳籼 74之间的微卫星标记多态性进行了检测 ,6个供体亲本与华粳籼 74之间的多态率分别为 5 6 33%、 34 93%、 5 9 31%、33 19%、 5 5 90 %和 5 6 5 5 %。2对回交的遗传效应进行了分析 ,在BC2 F1和BC3F1单株中检出替换片段的平均数分别为 8 93个和4 37个 ,在BC2 F1和BC3F1单株中检出替换片段的平均长度分别为 32 2 3cM和 2 7 6 3cM ,BC2 F1和BC3F1受体亲本基因组的回复率分别为 81 5 5 %和 92 32 %。3建立了 118个以华粳籼 74为遗传背景的单片段替换系 ,其中包括 展开更多
关键词 水稻 单片段替换系群体 qtl 数量性状位点 遗传育种 分子标记技术
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基于单片段代换系的水稻芽期耐冷QTL定位和聚合 被引量:2
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作者 杨梯丰 董景芳 +10 位作者 赵均良 周炼 杨武 马雅美 王健 陈洛 陈建松 吴伟 李雯慧 刘斌 张少红 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期1726-1736,共11页
芽期耐冷性是华南双季稻地区水稻育种的一个重要目标。虽然水稻芽期耐冷QTL的标记定位已取得了一定的进展,但是这些QTL/基因尚未在水稻育种中得到有效的应用。定位稳定表达的芽期耐冷QTL,开展QTL聚合育种是水稻芽期耐冷性育种取得突破... 芽期耐冷性是华南双季稻地区水稻育种的一个重要目标。虽然水稻芽期耐冷QTL的标记定位已取得了一定的进展,但是这些QTL/基因尚未在水稻育种中得到有效的应用。定位稳定表达的芽期耐冷QTL,开展QTL聚合育种是水稻芽期耐冷性育种取得突破的关键。在本研究中,利用以粳稻IR65598-112-2为供体,籼稻华粳籼74为受体构建的单片段代换系(SSSL)开展芽期耐冷QTL定位,并进行聚合育种。通过评价SSSL与受体华粳籼74的芽期耐冷性差异,定位了2个稳定的芽期耐冷QTLs(qCTBB-3和qCTBB-12)。试验表明,分别携带有耐冷QTL qCTBB-3和qCTBB-12的SSSL在冷处理后都比华粳籼74表现出更高的幼苗成活率。通过代换作图,发现在qCTBB-3区间存在2个紧密连锁的耐冷QTLs(qCTBB-3a和qCTBB-3b)。利用本研究携带qCTBB-3a/qCTBB-3b的单片段代换系和前期研究鉴定出的芽期耐冷QTL qCTBB-6的单片段代换系为亲本进行杂交,通过分子标记辅助选择,获得了2份含有这3个QTL的聚合系。耐冷性评价表明,来源于两个供体/亲本的QTL不存在显著的上位性效应,聚合系的芽期耐冷性较亲本显著增强。可见,通过聚合芽期耐冷QTLs qCTBB-3a/qCTBB-3b和qCTBB-6能显著提高水稻芽期的耐冷性,获得的QTL及三耐冷QTL聚合系为水稻芽期耐冷性分子育种提供了优良的基因资源和亲本材料。 展开更多
关键词 芽期耐冷性 qtl定位 分子标记辅助选择 聚合育种 单片段代换系 水稻
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水稻单片段替换系群体的建立及QTL定位 被引量:5
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作者 阿克沙 张桂权 《分子植物育种》 CAS CSCD 2003年第4期565-567,共3页
水稻中许多重要的农艺性状属数量性状 ,由多基因 (QTL)控制。研究QTL的遗传特性和遗传效应对于培育高产和稳产的水稻品种具有十分重要的意义。本研究以 6个优良的品种为供体亲本 ,以华粳籼 74为轮回亲本 ,通过微卫星标记辅助回交选择培... 水稻中许多重要的农艺性状属数量性状 ,由多基因 (QTL)控制。研究QTL的遗传特性和遗传效应对于培育高产和稳产的水稻品种具有十分重要的意义。本研究以 6个优良的品种为供体亲本 ,以华粳籼 74为轮回亲本 ,通过微卫星标记辅助回交选择培育了一批单片段替换系 ,随后利用所培育的单片段替换系进行了QTL分析和基因定位。主要结果有 :1、利用 2 5 8个微卫星标记对 6个供体亲本和轮回亲本间的多态性进行了筛选。 6个供体亲本与轮回亲本间的多态率在 32 98%至 6 0 78%之间 ,平均 4 7 81% ,粳型供体亲本比籼型供体亲本的多态性要高。2、随着回交代数的增加 ,植株所含的替换片段数逐渐减少。在BC2 F1、BC3F1、BC3F2 和BC3F3代 ,平均每个植株携带有 12 5 0、 5 98、 1 6 9和 1 4 6个替换片段。替换片段的平均长度也随回交和自交代数的增加而逐渐变短。在BC2 F1、BC3F1、BC3F2 和BC3F3代 ,替换片段的平均长度分别为 2 5 4 3cM、2 2 38cM、 2 0 78cM和 18 15cM。回交世代替换片段变短的速率 (11 99% )比自交世代变短速率(7 15 % )要快。在BC2 F1、BC3F1、BC3F2 和BC3F3代 ,轮回亲本基因组的恢复率分别为 82 2 4 %、92 5 5 %、 98 0 4 %和 98 5 2 %。3、在BC3F2 和BC3F3代 ,共选育出 111个单片段替换系 ,其? 展开更多
关键词 水稻 单片段替换系群体 qtl 数量性状位点 分子标记辅助选择
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水稻抽穗期QTL鉴定及重叠群作图 被引量:1
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作者 徐仅婷 李广贤 +3 位作者 柳絮 蔚亦沛 姚方印 刘开启 《山东农业科学》 2014年第2期1-7,共7页
以40个单片段代换系(Single Segment Substitution Lines,SSSLs)为试材,分别在2012和2013年对水稻抽穗期QTL进行分析,其中30个SSSLs能够在两年中重复检出,占检出SSSLs的78.9%。经重叠群作图分析,鉴定出11个抽穗期QTL,分别位于第1、2、3... 以40个单片段代换系(Single Segment Substitution Lines,SSSLs)为试材,分别在2012和2013年对水稻抽穗期QTL进行分析,其中30个SSSLs能够在两年中重复检出,占检出SSSLs的78.9%。经重叠群作图分析,鉴定出11个抽穗期QTL,分别位于第1、2、3、4、6、8、10染色体上,这些QTL具有较大的加性效应,且受环境影响较小。 展开更多
关键词 水稻 单片段代换系 数量性状基因座 抽穗期
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基于单片段代换系群体的玉米开花期性状QTL分析 被引量:9
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作者 曹浩飞 王彬 +4 位作者 毛克举 李卫华 丁冬 付志远 胡彦民 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期6-10,共5页
以骨干自交系许178背景的综3染色体单片段代换系为基础材料,利用105个SSSLs群体通过在浚县、许昌的田间试验,共鉴定出47个控制玉米开花期相关性状的QTL,包括散粉期的QTL 14个,吐丝期的QTL 16个,ASI的QTL 17个,其中,1个散粉期的QTL、2个... 以骨干自交系许178背景的综3染色体单片段代换系为基础材料,利用105个SSSLs群体通过在浚县、许昌的田间试验,共鉴定出47个控制玉米开花期相关性状的QTL,包括散粉期的QTL 14个,吐丝期的QTL 16个,ASI的QTL 17个,其中,1个散粉期的QTL、2个吐丝天数的QTL和4个ASI的QTL在2种环境下被重复检测到. 展开更多
关键词 玉米 单片段代换系 开花期性状 qtl定位
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氮胁迫与非胁迫条件下玉米叶形相关性状的QTL分析 被引量:3
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作者 郭向阳 陈建军 +7 位作者 卫晓轶 吴迅 祝云芳 王安贵 刘鹏飞 汤继华 陈泽辉 罗红兵 《植物营养与肥料学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期1929-1938,共10页
【目的】叶片是植物光合作用的重要器官,也是蒸腾作用和抗逆的主要器官。在施氮(N+)与不施氮(N–)条件下鉴定玉米叶片相关性状的QTL,为高光效玉米新品种选育提供重要的理论依据。【方法】利用玉米骨干系综3为供体,许178为受体,通过杂交... 【目的】叶片是植物光合作用的重要器官,也是蒸腾作用和抗逆的主要器官。在施氮(N+)与不施氮(N–)条件下鉴定玉米叶片相关性状的QTL,为高光效玉米新品种选育提供重要的理论依据。【方法】利用玉米骨干系综3为供体,许178为受体,通过杂交、回交和分子标记辅助选择的方法,构建了一套以许178为背景的综3单片段代换系(SSSLs)群体,其中包含160个单片段代换系。以这套SSSLs以及许178为材料,在施氮和不施氮条件下,通过一年三点(贵州贵阳、德江和云南罗平)的表型评价,利用复合区间作图法对叶面积、叶绿素含量和穗下绿叶数3个叶片相关性状进行QTL定位。【结果】在基因组范围内,两种氮处理条件下共检测到42个主要叶片相关性状QTLs,分布于10条染色体上。N+条件下,在3个地点共检测出8个叶面积的QTLs,5个穗下绿叶数的QTLs,8个叶绿素QTLs。其中,qLAI1b在3个环境中同时被检测到;qLAI1b在德江、贵阳和罗平点对叶面积的贡献率分别为14.41%、14.47%和16.38%,来自于综3的等位基因起增效作用。同时,穗下绿叶数QTL(qLN7a和qLN7b)在3个环境中均被检测到。在氮胁迫(N–)条件下,3个环境中共检测出9个叶面积QTLs,7个穗下绿叶数QTLs,8个叶绿素QTLs;其中,位于bin3.08的叶面积QTL qLAI3b,片段大小为120.48 cM,在德江、贵阳和罗平的贡献率分别为20.4%、12.8%和13.2%,来自于许178的等位基因起增效作用;玉米穗下绿叶数QTL,位于bin9.01区的穗下绿叶数QTL qLN9(umc1957~umc1867~umc2078),片段大小为62.7 cM。位于bin4.08的叶绿素含量QTL qCHL4a,片段大小为18.69 cM,在德江、贵阳和罗平点对叶绿素含量的贡献率分别为17.6%、10.6%和11.4%,且来自于亲本综3的等位基因起减效作用。【结论】不同氮素处理下,检测出一些共有的玉米氮响应的主效QTLs,如qLAI3b(umc1844~umc1320~bnlg1182)、qLN7a(umc1642~umc2160~umc1929)、qLN7b(phi328175)。这些区段可能在玉米氮素吸收、转运和利用过程中起重要作用,可作为下一步精细定位和图位克隆玉米叶片相关基因的重要候选区域。 展开更多
关键词 玉米 SSSLs 氮胁迫 叶相关性状 qtl
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高氮和低氮条件下玉米穗位叶持绿性状的QTL定位 被引量:4
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作者 李东亚 王祎 +3 位作者 汤继华 许恒 谭金芳 韩燕来 《植物营养与肥料学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期115-122,共8页
【目的】玉米叶片持绿性与籽粒产量、品质性状密切相关,本研究利用单片段代换系群体,对高氮和低氮条件下的玉米穗位叶持绿性状进行了QTL定位,旨在为持绿相关基因的精细定位以及克隆相关主效QTL奠定基础。【方法】以氮效率差异显著的两... 【目的】玉米叶片持绿性与籽粒产量、品质性状密切相关,本研究利用单片段代换系群体,对高氮和低氮条件下的玉米穗位叶持绿性状进行了QTL定位,旨在为持绿相关基因的精细定位以及克隆相关主效QTL奠定基础。【方法】以氮效率差异显著的两个亲本许178和综3构建的172个玉米单片段代换系为研究材料,采用完全随机区组设计,在高氮(N 240 kg/hm^2)和低氮(N 75 kg/hm^2)条件下,进行了两年大田试验。以吐丝后第10天穗位叶的SPAD值作为玉米持绿性的表型值,根据代换系与亲本许178表型值的T-test结果,利用该群体的SSR遗传图谱,在P <0.01条件下定位持绿性状的QTL。【结果】在基因组范围内,两个氮水平下共定位53个穗位叶持绿QTL (贡献率为–2.45%~–22.65%)。上述QTL在玉米的10条染色体上均有分布,其中以第1染色体上检测到的数量最多(14个),第7染色体上检测到的数量最少(1个)。高氮条件下检测的QTL为29个,6个在两年试验条件下被重复检测,分别为qhnSG1d、qhnSG2a、qhnSG3a、qhnSG4a、qhnSG8b和qhnSG10c,其中qhnSG8b和qhnSG10c为高氮特异QTL,两年内QTL的贡献率分别为–4.47%、–9.17%、–9.46%和–5.05%;低氮条件下检测的QTL为16个,2个QTL在两年大田环境被重复检测,分别为qlnSG1f和qlnSG2b。其中qlnSG1f为低氮特异QTL,两年内QTL贡献率分别为–9.70%和–10.85%。【结论】通过对玉米穗位叶持绿性状分析,将高氮特异持绿染色体片段定位到umc1077~umc2350区段内,低氮特异染色体片段定位到umc1013~umc2047区段内。 展开更多
关键词 玉米 单片段代换系 氮水平 持绿 qtl定位
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