克氏原螯虾抗菌肽crustin5基因克隆及其表达分析

【目的】深入了解克氏原螯虾先天免疫过程中抗菌肽的作用与功能,丰富先天免疫中抗菌肽的理论知识,为克氏原螯虾的病害机理研究及防控措施制定提供参考依据。【方法】从克氏原螯虾肝胰腺组织提取总RNA,利用PCR扩增crustin5基因全长cDNA序列,运用DNAMAN 6.0、ProtParam、ProtScale、SOPMA和SWISS-MODEL等在线软件对其进行生物信息学分析,并以实时荧光定量PCR检测crustin5基因在克氏原螯虾各组织中的表达情况。【结果】克氏原螯虾crustin5基因cDNA序列全长954 bp,开放阅读框(ORF)为429 bp,共编码167个氨基酸残基,其编码蛋白相对分子量为16485.42 Da,理论等电点为8.58,为不稳定的疏水性蛋白。克氏原螯虾crustin5蛋白具有典型的crustins家族结构特征,包括N端的信号肽,C端的WAP结构域,以及二者间的半胱氨酸富集区;其二级结构中α-螺旋、β-转角、无规则卷曲和延伸链分别占20.36%、7.78%、58.08%和13.77%。crustin5基因在克氏原螯虾血细胞、肝胰腺、鳃、肠道、肌肉和淋巴器官等6种组织中均有不同程度的表达,以在血细胞中的相对表达量最高,淋巴器官次之,在肌肉组织中的相对表达量最少。【结论】克氏原螯虾抗菌肽crustin5具有典型的crustins家族结构特征,且主要分布在血细胞和淋巴器官中,说明crustin5是在克氏原螯虾的血淋巴中参与先天免疫并发挥抗菌作用。