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题名月月竹竹秆变色后全长转录组分析
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作者
邵欣瑜
熊星
杨峰
赵云飞
刘昌来
刘国华
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机构
南京林业大学竹类研究所/南方现代林业协同创新中心
菏泽化工高级技工学校
临沂市公安局
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出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2024年第3期538-551,共14页
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基金
国家重点研发计划项目(2023YFD2201901)。
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文摘
为探究月月竹竹秆受到光照由绿色变为紫色的分子机制,本研究采集月月竹同一竹节紫色部分(Z)、渐变部分(M)和绿色部分(L)的竹青,提取RNA,利用PacBio Sequel三代全长转录组测序技术,结合生物信息学方法对不同颜色的竹青进行全长转录组分析。结果表明,经过三代测序和数据质量控制,共获得非冗余转录本66961条,长度为500~3000 bp,平均长度1389.22 bp,序列总长度为93.02 Mbp,N50为1830 bp,G+C碱基含量为49.56%。利用NR、Swiss-Prot、COG、GO、KEGG和Pfam数据库对所有转录本进行功能注释,共有56938条转录本被成功注释,占全部转录本的85.03%;49115条转录本被GO注释,其中催化活性、细胞器、代谢过程分别是GO数据库分子功能、细胞组分和生物过程中含转录本最多的项目;28231个转录本被KEGG数据库注释,其中与碳水化合物代谢和基因翻译相关的转录本最多。结合GO注释和KEGG注释,66961条转录本中有381条转录本与光信号的感受、传递以及光调控相关,包括红光和远红光的受体蛋白PHYA、PHYB及信号通路蛋白PIF3、ELF3,蓝光的受体蛋白CRY、ZTL及信号通路蛋白COP1、SPA1、ELF3、GI、HY5等。类黄酮(包括花青素)代谢、叶绿素合成、类胡萝卜素合成等与植物色素合成相关通路分别含有转录本187条、44条和72条。全长转录本共获得2079个转录因子,其中包括18个由35个转录本编码的与花青素合成相关的R2R3MYB转录因子。CNCI、CPC、Pfam、PLEK等数据库同时注释到的长链非编码RNA(LncRNA)6359个,数量高于孝顺竹等其他竹种。本研究获得了高质量的月月竹竹青全长转录组数据,与竹秆变色相关的红光和蓝光受体及光信号传递蛋白,与花青素、叶绿素和类胡萝卜素合成相关的转录因子及长链非编码RNA(LncRNA),为进一步深入分析月月竹竹秆变色机制提供基础。
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关键词
月月竹
变色竹秆
全长转录组测序
光信号
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Keywords
Chimonobambusa sichuanensis
color-changing bamboo culm
full-length transcriptome sequencing
light signal
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分类号
S795.6
[农业科学—林木遗传育种]
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题名花毛竹秆色特征和类型划分研究
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作者
曾庆南
余林
程平
王海霞
彭九生
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机构
江西省林业科学院
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出处
《世界竹藤通讯》
2018年第4期32-35,共4页
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基金
江西省林业科学院社会公益类研究项目(编号:2017510901)
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文摘
以江西省林业科学院竹种园和江西省遂川县五指峰林场栽植的花毛竹为研究对象,观测研究了花毛竹秆黄绿色条纹的数量、宽度等秆色特征,拟定了花毛竹类型的划分标准并进行了类型划分。结果表明:花毛竹秆黄绿色条纹总数为8~44条,平均值为24条,花毛竹秆黄色条纹宽度所占比率为9.15%~87.50%,绿色条纹宽度所占比率为12.50%~90.85%,黄色条纹最小宽度变幅比绿色条纹最小宽度变幅小,而黄色条纹最大宽度变幅与绿色条纹最大宽度变幅相近。花毛竹秆黄色条纹比率在不同单株和不同节间存在一定的差异,可以将其作为花毛竹类型的划分指标。以秆色条纹出现部位和黄色条纹比率为划分指标,将花毛竹分为金丝型花毛竹、绿条型花毛竹、黄条型花毛竹、金条型花毛竹、黄槽型花毛竹和绿槽型花毛竹6个类型。
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关键词
花毛竹
秆色
黄色条纹
绿色条纹
类型划分
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Keywords
Phyllostachys edulis cv. Tao kiang
culm color
yellow stripe
green stripe
type classification
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分类号
S795
[农业科学—林木遗传育种]
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题名绿竹良种‘花绿竹’
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作者
王月英
夏海涛
李效文
金川
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机构
浙江省亚热带作物研究所
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出处
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2016年第8期169-169,共1页
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基金
浙江省竹木农业新品种选育重大科技专项(2012C12908-3)
温州市科技计划项目(N20120018)
瑞安市科技计划项目(NY2015034)
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文摘
花绿竹系绿竹自然变异选育而成,笋体马蹄形或锥形,秆色绿底间黄条;分枝习性低,多自地上第2~3节始抽枝。成竹高5~12 m,胸径3~8 cm。出笋期自6月初—10月中旬,7—8月为出笋盛期。3~4年生竹,产量5 250~7 200 kg·hm^-2,成龄竹产量可达7 500~9 000 kg·hm^-2。笋质优良,含糖量高,口感甜,可笋用、观赏兼用。
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关键词
绿竹
品种
秆色
含糖量
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Keywords
Dendrocalamopsis oldhami
variety
the color of bamboo culm
sugar content
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分类号
S722
[农业科学—林木遗传育种]
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题名高温热处理对毛竹材颜色和平衡含水率的影响
被引量:8
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作者
南博
王书强
李延军
殷丽萍
黄成建
王丽
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机构
浙江农林大学工程学院
浙江省木材科学与技术重点实验室
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出处
《浙江林业科技》
北大核心
2015年第3期57-60,共4页
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基金
浙江省自然科学基金项目(LZ13C160003)
浙江省科技厅资助项目(2013C14006)
+1 种基金
国家级大学生创新创业计划项目(201310341005)
大学生科技创新推广项目(2014R412043)
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文摘
以毛竹(Phyllostachys heterocycla cv.pubescens)材为研究对象,探讨热处理温度(100~200℃)和时间(2h、3h)对去青去黄后的毛竹材表面颜色和平衡含水率的影响规律。结果表明:热处理能使毛竹材表面颜色均匀加深,随着处理温度和时间的增加,毛竹材的明度(L*)、黄蓝色品指数(b*)和平衡含水率显著下降,红绿色品指数(a*)先上升后下降,总体色差(?E*)显著上升,说明热处理后竹材表面颜色逐渐由原色过度到棕褐色;在本研究范围内,通过高温热处理毛竹材的明度、黄蓝色品指数、红绿色品指数最大降低56.45%、54.34%、37.40%,平衡含水率降低46.57%。
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关键词
毛竹材
热处理
表面颜色
平衡含水率
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Keywords
bamboo culm
heat treatment
color
equilibrium moisture content
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分类号
S718.29
[农业科学—林学]
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