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Dual functions:A coumarin–chalcone conjugate inhibits cyclic-di-GMP and quorum-sensing signaling to reduce biofilm formation and virulence of pathogens 被引量:1
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作者 Yu Zhang Pramod Bhasme +7 位作者 Dinesh S.Reddy Dejian Liu Zhaoxiao Yu Tianhu Zhao Yaqian Zheng Amit Kumar Haiying Yu Luyan Z.Ma 《mLife》 CSCD 2023年第3期283-294,共12页
Antibiotic resistance or tolerance of pathogens is one of the most serious global public health threats.Bacteria in biofilms show extreme tolerance to almost all antibiotic classes.Thus,use of antibiofilm drugs withou... Antibiotic resistance or tolerance of pathogens is one of the most serious global public health threats.Bacteria in biofilms show extreme tolerance to almost all antibiotic classes.Thus,use of antibiofilm drugs without bacterial-killing effects is one of the strategies to combat antibiotic tolerance.In this study,we discovered a coumarin–chalcone conjugate C9,which can inhibit the biofilm formation of three common pathogens that cause nosocomial infections,namely,Pseudomonas aeruginosa,Staph-ylococcus aureus,and Escherichia coli,with the best antibiofilm activity against P.aeruginosa.Further investigations indicate that C9 decreases the synthesis of the key biofilm matrix exopolysaccharide Psl and bacterial second messenger cyclic-di-GMP.Meanwhile,C9 can interfere with the regulation of the quorum sensing(QS)system to reduce the virulence of P.aeruginosa.C9 treatment enhances the sensitivity of biofilm to several antibiotics and reduces the survival rate of P.aeruginosa under starvation or oxidative stress conditions,indicating its excellent potential for use as an antibiofilm-forming and anti-QS drug. 展开更多
关键词 biofilm cyclic-di-gmp exopolysaccharide Psl Pseudomonas aeruginosa quorum sensing
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外源性C-di-GMP对变形链球菌产酸、耐酸能力的影响 被引量:3
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作者 闫文娟 吴补领 +4 位作者 屈铁军 高杰 赵红萍 苏凌云 余擎 《牙体牙髓牙周病学杂志》 CAS 北大核心 2009年第9期510-512,共3页
目的:初步探讨外源性c-di-GMP对变形链球菌产酸、耐酸能力的影响。方法:外源性c-di-GMP与生理盐水分别加入至含变形链球菌UA159菌液的BHI培养基中,比较两组对变形链球菌产酸、耐酸能力的影响。结果:c-di-GMP处理组与生理盐水组相比,产... 目的:初步探讨外源性c-di-GMP对变形链球菌产酸、耐酸能力的影响。方法:外源性c-di-GMP与生理盐水分别加入至含变形链球菌UA159菌液的BHI培养基中,比较两组对变形链球菌产酸、耐酸能力的影响。结果:c-di-GMP处理组与生理盐水组相比,产酸、耐酸能力明显下降,差异有统计学意义,经t检验,P<0.05。结论:c-di-GMP可以抑制变形链球菌的产酸、耐酸能力,可以单独也可以与其它的抗龋制剂联合应用控制龋病。 展开更多
关键词 c—dj—GMP 变形链球菌 产酸 耐酸
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问号钩端螺旋体GGDEF和EAL/HD-GYP结构域蛋白生物信息学分析 被引量:1
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作者 丁士标 肖国辉 +2 位作者 孔亮亮 严杰 林旭瑷 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期109-113,共5页
目的分析问号钩端螺旋体(钩体)环二鸟苷酸(Cyclic dimeric-GMP,c-di-GMP)调节相关的GGDEF和EAL/HD-GYP结构域蛋白生物信息学结果,为后续的功能研究奠定基础。方法 PSI-BLAST方法分析编码GGDEF和EAL/HDGYP结构域蛋白的基因;利用相应生物... 目的分析问号钩端螺旋体(钩体)环二鸟苷酸(Cyclic dimeric-GMP,c-di-GMP)调节相关的GGDEF和EAL/HD-GYP结构域蛋白生物信息学结果,为后续的功能研究奠定基础。方法 PSI-BLAST方法分析编码GGDEF和EAL/HDGYP结构域蛋白的基因;利用相应生物信息学软件对蛋白信号肽序列、跨膜序列、蛋白结构、同源性进行分析并构建目的蛋白进化树。结果问号钩体中22个蛋白分别含有GGDEF或EAL/HD-GYP结构域,多数蛋白均有感受器结构域和跨膜区。7个具有PAS输入感受器的GGDEF结构域蛋白进化较为独立,位于单独的一个分支,其余6个GGDEF结构域蛋白则分散在不同的分支上。4个EAL结构域蛋白和2个HD-GYP结构域蛋白进化上也较为独立,分别处于同一进化分支。3个GGDEF和EAL结构域耦合的蛋白在进化关系上更趋向于PDE活性蛋白。结论钩体具有多拷贝的合成和降解c-di-GMP相关蛋白编码基因,表明在钩体中c-di-GMP网络具有高度复杂性,同时反映出钩体对环境条件的改变具有复杂的应对机制。 展开更多
关键词 问号钩端螺旋体 环二鸟苷酸 鸟苷酸环化酶 磷酸二酯酶
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黄单胞菌毒性因子调控的研究进展 被引量:1
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作者 唐庆华 张世清 +3 位作者 牛晓庆 朱辉 余凤玉 覃伟权 《生物灾害科学》 2012年第2期134-141,共8页
黄单胞属植物病原细菌寄主非常广泛,能引起许多种重要经济作物发生病害。黄单胞菌在寄主组织内的侵染和繁殖取决于分泌的多糖、脂多糖、吸附素和III型分泌系统等毒性因子。细菌毒性因子的协调表达是通过群体感应途径、双组分系统和Clp、... 黄单胞属植物病原细菌寄主非常广泛,能引起许多种重要经济作物发生病害。黄单胞菌在寄主组织内的侵染和繁殖取决于分泌的多糖、脂多糖、吸附素和III型分泌系统等毒性因子。细菌毒性因子的协调表达是通过群体感应途径、双组分系统和Clp、Zur、FhrR、HrpX和HpaR等转录后调控因子精细调控的。此外,毒力基因表达还受RNA结合蛋白RsmA转录后控制。在本综述中,我们对黄单胞菌控制分泌毒性因子的调控网络的研究进展进行了概括。 展开更多
关键词 黄单胞菌 毒性因子 调控网络 群体效应 双组分系统 环鸟苷二磷酸信号 rna结合蛋白rsma
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氨基酸代谢变化引起的c-di-GMP稳态波动对大肠杆菌致病过程中菌毛合成的影响
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作者 孙敏 高兴 +4 位作者 任方勋 白乾坤 泮欣铭 马家乐 姚火春 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期113-123,共11页
[目的]细菌能够合成多种信号分子,调控自身在各种营养状态或应激条件下的生长代谢及毒力发挥。第二信使环二鸟苷酸(c-di-GMP)在致病菌感应氨基酸饥饿(AAS)的过程中发挥重要作用,调控多种生理活动并显著影响其毒力发挥。本文旨在研究c-di... [目的]细菌能够合成多种信号分子,调控自身在各种营养状态或应激条件下的生长代谢及毒力发挥。第二信使环二鸟苷酸(c-di-GMP)在致病菌感应氨基酸饥饿(AAS)的过程中发挥重要作用,调控多种生理活动并显著影响其毒力发挥。本文旨在研究c-di-GMP在尿道致病性大肠杆菌(UPEC)尿道定殖及毒力发挥过程中的作用。[方法]采用尿液培养UPEC,结合转座子突变技术筛选氨基酸代谢相关生长缺陷基因,采用基因敲除技术、特定氨基酸回补及小鼠尿道感染模型验证尿液生长及尿道定殖缺陷表型;借助表达谱数据、RT-qPCR及β-半乳糖苷酶活性测定法筛选并鉴定受氨基酸饥饿影响的毒力基因及c-di-GMP相关基因;通过多基因敲除及回补技术、凝胶阻滞试验(EMSA)鉴定c-di-GMP对毒力基因的调控机制。[结果]精氨酸、异亮氨酸及蛋氨酸代谢失衡引起UPEC在尿液中生长缺陷,尿道定殖能力显著下降及局部c-di-GMP稳态破坏;YciR及YcgF相关c-di-GMP体系失衡显著下调菌毛基因簇表达;YciR通过调节子MlrA直接调控P菌毛基因簇表达;YcgF通过下游配对调节子YcgE直接调控P菌毛基因簇表达。[结论]c-di-GMP感应尿道定殖过程中的特定氨基酸饥饿,调控菌毛等黏附因子合成,促进UPEC完整毒力发挥。 展开更多
关键词 第二信使环二鸟苷酸 尿道致病性大肠杆菌 P菌毛 I型菌毛 氨基酸代谢
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鱼腥蓝细菌PCC7120 alr3504基因缺失突变体的构建及表型分析
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作者 戴燕 王莉 陈雯莉 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期1532-1536,共5页
c-di-GMP是新发现的真细菌所特有的第二信使,其合成和降解由双鸟苷酸环化酶和磷酸二酯酶分别完成。经生物信息学分析,鱼腥蓝细菌PCC7120基因alr3504可能编码含有保守GGDEF结构域的双鸟苷酸环化酶。【目的】为了鉴定该基因的功能,【方法... c-di-GMP是新发现的真细菌所特有的第二信使,其合成和降解由双鸟苷酸环化酶和磷酸二酯酶分别完成。经生物信息学分析,鱼腥蓝细菌PCC7120基因alr3504可能编码含有保守GGDEF结构域的双鸟苷酸环化酶。【目的】为了鉴定该基因的功能,【方法】采用标记置换方法将alr3504缺失。【结果】敲除该基因后,发现缺失突变体的形态、生长速度及异形胞发育与野生型无明显差异,但在盐胁迫条件下,突变体比野生型对钠盐更敏感。【结论】可见alr3504虽不直接影响异形胞发育,但参与了其它信号途径,研究结果为阐明蓝细菌丰富而复杂的信号转导机制奠定了基础。 展开更多
关键词 鱼腥蓝细菌 c-di—GMP GGDEF结构域 双鸟苷酸环化酶 磷酸二酯酶
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绿原酸通过增强RsmA的表达抑制铜绿假单胞菌生物被膜的形成
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作者 唐小丽 韦俊彬 +4 位作者 封毅 乐宁 梁丹娜 卓少元 尚立国 《微生物与感染》 CAS 2021年第5期322-330,共9页
铜绿假单胞菌是常见的人类条件致病菌,其生物被膜的形成会增强菌体的耐药性。已有文献报道绿原酸可抑制铜绿假单胞菌生物被膜的形成,本研究在此基础上主要探究了其对全局性次级代谢调控系统Gac-Rsm表达的影响。结果显示,绿原酸可抑制铜... 铜绿假单胞菌是常见的人类条件致病菌,其生物被膜的形成会增强菌体的耐药性。已有文献报道绿原酸可抑制铜绿假单胞菌生物被膜的形成,本研究在此基础上主要探究了其对全局性次级代谢调控系统Gac-Rsm表达的影响。结果显示,绿原酸可抑制铜绿假单胞菌生物被膜形成的能力,降低胞外总多糖合成量,但关键胞外多糖psl的合成酶基因pslA转录未受影响,还可增强Gac-Rsm系统中关键调控因子RsmA的表达水平,降低细胞内关键信使分子环二鸟苷酸(cyclic dimeric guanosine monophosphate,c-di-GMP)水平。结果表明,绿原酸可通过增强RsmA的表达来抑制铜绿假单胞菌生物被膜的形成。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 生物被膜 绿原酸 RSMA 环二鸟苷酸
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铜绿假单胞菌中PA0847二鸟苷酸环化酶活性受非催化位点Y700调控
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作者 肖王鑫 杨婷婷 +3 位作者 黄卫东 袁文肃 张燕 林志 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期2337-2351,共15页
【目的】鉴定铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)中PA0847胞内结构域及其突变体的二鸟苷酸环化酶活性,并初步探究其催化机制。【方法】利用刚果红平板染色法验证PA0847胞内域的二鸟苷酸环化酶活性;采用PCR技术构建PA0847 PAS-GGDEF... 【目的】鉴定铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)中PA0847胞内结构域及其突变体的二鸟苷酸环化酶活性,并初步探究其催化机制。【方法】利用刚果红平板染色法验证PA0847胞内域的二鸟苷酸环化酶活性;采用PCR技术构建PA0847 PAS-GGDEF结构域及其单点突变体,并经过表达纯化获得相应蛋白;经凝胶分子筛层析分析蛋白在溶液中的聚集状态;通过体外酶促反应鉴定蛋白的二鸟苷酸环化酶活性,基于噻唑橙荧光染色检测蛋白酶促反应后环鸟苷二磷酸(cyclic diguanylate monophosphate,c-di-GMP)的生成量,并筛选与二鸟苷酸环化酶活性密切相关的氨基酸残基;联用结构预测和分子对接获得PA0847 PAS-GGDEF二聚体以及结合三磷酸鸟苷(guanosine triphosphate,GTP)的复合物结构模型。【结果】PA0847 PAS-GGDEF主要以二聚体形式发挥催化活性,PAS结构域促进二聚体形成,有效提高二鸟苷酸环化酶活性;突变筛选发现,在低蛋白浓度(0.6 mg/m L)下,非催化位点突变体Y700A活性较野生型显著提高;凝胶分子筛层析表明,其高活性可能与Y700A突变促进GGDEF(Gly-Gly-Asp-Glu-Phe)结构域二聚化有关;结构模型分析显示,PA0847 PAS-GGDEF与GTP结合位点保守,其中K722的氨基侧链在结合GTP的磷酸基团中发挥着重要作用,而Y700芳香环侧链与K722所在的α螺旋有疏水互作,因此Y700A突变可能改变了K722所在螺旋的空间取向,进而促进K722与底物GTP的结合以及GGDEF二聚化。【结论】铜绿假单胞菌PA0847的非催化位点Y700可间接调控二鸟苷酸环化酶活性。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 PA0847 环鸟苷二磷酸(c-di-GMP) 三磷酸鸟苷
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铜绿假单胞菌fur基因缺失突变株的构建及其表型分析
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作者 马鑫 李雯雯 +2 位作者 肖维 成娟丽 林金水 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期917-937,共21页
铁摄取调节蛋白(ferric uptake regulator,Fur)是控制铜绿假单胞菌铁代谢和毒力的关键调节因子。许多课题组尝试构建铜绿假单胞菌fur的缺失突变株均失败,因此铜绿假单胞菌的fur一直被认为是必需基因,这导致其生物学功能一直未得到全面... 铁摄取调节蛋白(ferric uptake regulator,Fur)是控制铜绿假单胞菌铁代谢和毒力的关键调节因子。许多课题组尝试构建铜绿假单胞菌fur的缺失突变株均失败,因此铜绿假单胞菌的fur一直被认为是必需基因,这导致其生物学功能一直未得到全面的解析。【目的】构建铜绿假单胞菌fur的缺失突变株,并对该突变株的表型进行分析。【方法】以铜绿假单胞菌PAO1为亲本菌株,通过同源重组的方法构建fur缺失突变株,研究该基因对铜绿假单胞菌生长、铁载体生物合成、抗氧胁迫能力、鞭毛形成、生物被膜形成和毒力等的影响。同时,通过遗传分析对fur缺失突变株生长缺陷表型的原因进行探究。【结果】本研究成功构建了铜绿假单胞菌fur基因的缺失突变株,发现缺失突变fur极大地限制了铜绿假单胞菌的生长能力,并降低了该菌对限铁环境的生长适应性,但不影响该菌对高铁环境的生长适应性。铜绿假单胞菌Δfur的这种生长缺陷表型是细胞生长增殖变慢造成的,而不是诱导细胞死亡引起的。然而,其他异源的fur基因能完全互补Δfur的这种生长缺陷表型,暗示铜绿假单胞菌的Fur蛋白在功能上不存在独特性。尽管Fur与毒素-抗毒素系统PacTA存在功能关联性,但是铜绿假单胞菌Δfur的这种生长缺陷表型却与PacT毒素无关。除了影响铜绿假单胞菌的生长表型,缺失突变fur还使铜绿假单胞菌丧失了对铁载体生物合成的抑制作用,导致该菌对H_(2)O_(2)更敏感并丧失了鞭毛的形成能力,同时降低了该菌对大蜡螟幼虫的毒力。此外,缺失突变fur还显著提升了铜绿假单胞菌的胞内环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)水平,从而诱导pelF和pslA基因的表达,进而促进铜绿假单胞菌生物被膜的形成。【结论】fur是可以缺失的非必需基因,在铜绿假单胞菌的正常生长、铁载体生物合成、抗氧胁迫能力、鞭毛形成、生物被膜形成和毒力等方面都发挥着十分重要的作用,这为针对铜绿假单胞菌的疫苗和抗菌药物开发奠定了基础。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 铁摄取调节蛋白 缺失突变 表型分析 环二鸟苷酸(c-di-GMP) 鞭毛 毒力
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SadC合成的c-di-GMP信号通过PilZ和FlgZ调节铜绿假单胞菌的泳动能力
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作者 董友明 林心铭 +6 位作者 付春情 王倩琪 吴玲娟 卢冰倩 林羲 包其郁 李科伟 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期1115-1127,共13页
【目的】探究铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)鸟苷酸环化酶(diguanylate cyclase,DGC)SadC合成的环二鸟苷酸(cyclic di-GMP,c-di-GMP)信号与PilZ结构域受体间的信号传递关系,分析鉴定出特定PilZ结构域受体的调控功能和机制。【方... 【目的】探究铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)鸟苷酸环化酶(diguanylate cyclase,DGC)SadC合成的环二鸟苷酸(cyclic di-GMP,c-di-GMP)信号与PilZ结构域受体间的信号传递关系,分析鉴定出特定PilZ结构域受体的调控功能和机制。【方法】SadC突变株和过表达菌株的构建及泳动能力分析;SadC过表达背景下,PilZ结构域受体突变各菌株的泳动表型分析和筛选;基因敲除和过表达解析筛选出的PilZ结构域受体功能;定点突变和遗传互补检测筛选出的PilZ结构域受体是否参与SadC合成c-di-GMP对泳动能力的调控。【结果】SadC通过影响鞭毛功能而非鞭毛形成抑制铜绿假单胞菌的泳动能力;PilZ结构域受体突变菌株筛选发现PilZ、FlgZ这2个受体参与了SadC介导的泳动能力抑制;功能分析发现ΔpilZ或ΔflgZ的泳动能力相比野生型PA14显著增强,而过表达PilZ或FlgZ则抑制了泳动能力;定点突变和回补实验发现PilZ第10位和FlgZ第140位氨基酸R对其介导SadC负调控泳动能力至关重要,多序列比对分析表明这些位点是其保守的c-di-GMP结合位点。【结论】SadC合成的c-di-GMP信号通过PilZ和FlgZ调控铜绿假单胞菌的泳动能力。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 SADC 环二鸟苷酸 PilZ结构域蛋白 PilZ FlgZ 泳动能力
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检测大肠杆菌内c-di-GMP水平的双荧光素报告质粒的构建及应用
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作者 张贝贝 胡剑刚 +8 位作者 王欣宇 郭伟奇 姚澜 王芷洋 王帝 祁晶晶 田明星 鲍衍清 王少辉 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期4814-4822,共9页
细菌通过调控第二信使环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)而促进其适应环境、存活及致病。【目的】本研究旨在建立有效的c-di-GMP水平检测方法,为大肠杆菌内c-di-GMP水平检测提供便利条件。【方法】根据c-di-GMP核糖开关受体的调... 细菌通过调控第二信使环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)而促进其适应环境、存活及致病。【目的】本研究旨在建立有效的c-di-GMP水平检测方法,为大肠杆菌内c-di-GMP水平检测提供便利条件。【方法】根据c-di-GMP核糖开关受体的调控方式、荧光报告基因等设计引物,通过重叠聚合酶链反应(overlap polymerase chain reaction,overlap PCR)和同源重组酶构成基于核糖开关的双荧光素报告质粒pAmCherry-Vc2EGFP(pACVcE),然后构建c-di-GMP代谢基因过表达菌株和缺失菌株,利用pACVcE检测大肠杆菌内c-di-GMP水平。【结果】Overlap PCR扩增产物与目的靶序列一致,测序结果证明pACVcE序列正确。表达c-di-GMP合成酶DgcZ的大肠杆菌胞内c-di-GMP水平显著升高,而表达c-di-GMP降解酶PdeK的大肠杆菌胞内c-di-GMP水平显著降低。禽致病性大肠杆菌的胞内c-di-GMP水平检测发现c-di-GMP降解酶基因pdeK缺失后胞内的c-di-GMP水平显著升高。【结论】本研究构建了基于核糖开关的双荧光素报告质粒,可方便、快速检测大肠杆菌胞内c-di-GMP水平。 展开更多
关键词 环二鸟苷酸 核糖开关 双荧光素报告质粒 检测
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New insights on molecular regulation of biofilm formation in plant-associated bacteria 被引量:9
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作者 Luisa F.Castiblanco George W.Sundin 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2016年第4期362-372,共11页
Biofilms are complex bacterial assemblages with a defined three-dimensional architecture, attached to solid surfaces, and surrounded by a self-produced matrix generally composed of exopolysaccharides, proteins, lipids... Biofilms are complex bacterial assemblages with a defined three-dimensional architecture, attached to solid surfaces, and surrounded by a self-produced matrix generally composed of exopolysaccharides, proteins, lipids and extracellular DNA. Biofilm formation has evolved as an adaptive strategy of bacteria to cope with harsh environmental conditions as well as to establish antagonistic or beneficial interactions with their host. Plant-associated bacteria attach and form biofilms on different tissues including leaves, stems,vasculature, seeds and roots. In this review, we examine the formation of biofilms from the plant-associated bacterial perspective and detail the recently-described mechanisms of genetic regulation used by these organisms to orchestrate biofilm formation on plant surfaces. In addition, we describe plant host signals that bacterial pathogens recognize to activate the transition from a planktonic lifestyle to multicellular behavior. 展开更多
关键词 cyclic-di-gmp Erwinia amylovora small RNAs Xanthomonas campestris Xylella fastidiosa
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环二鸟苷酸(c-di-GMP)在微生物体内的作用及其类似物的研究 被引量:5
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作者 那路新 杨振军 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期307-312,258,共6页
环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)是在细菌中普遍存在的第二信使分子,参与调节多种生理功能,包括细胞分化、生物被膜形成、致病因子产生等。细菌细胞内c-di-GMP合成与降解代谢分别受二鸟苷酸环化酶(diguanylate cyclase,DGC)和... 环二鸟苷酸(cyclic diguanylate,c-di-GMP)是在细菌中普遍存在的第二信使分子,参与调节多种生理功能,包括细胞分化、生物被膜形成、致病因子产生等。细菌细胞内c-di-GMP合成与降解代谢分别受二鸟苷酸环化酶(diguanylate cyclase,DGC)和磷酸二酯酶(phosphodiesterase,PDE)调控,DGC和PDE共处于同一个蛋白中,是一个双功能蛋白酶的两个区域,分别负责菌体内c-di-GMP的合成和降解。c-di-GMP作用菌体内下游靶点包括PilZ结构域和GEMM核开关两种类型。目前发现c-di-GMP核开关是唯一不参与代谢活动而参与信号传导的一类核开关。本文综述了c-di-GMP的代谢途径、调控机制、生物学功能,以及c-di-GMP结构类似物合成及生物学评价等方面的最新研究进展。 展开更多
关键词 环二鸟苷酸 C-DI-GMP 细菌信号传导 代谢酶 GEMM核开关
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铜绿假单胞菌环二鸟苷酸代谢及其调控生物膜形成研究进展 被引量:3
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作者 赵文瑾 尚道涵 +2 位作者 谢来工 沈锡辉 张磊 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2022年第12期1468-1474,共7页
铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)是临床中常见的一种条件致病菌,其感染人体后可形成致密的生物膜。生物膜使铜绿假单胞菌具有较强的抗逆性,包括抵御宿主吞噬细胞的吞噬,抵抗宿主的免疫功能,产生耐药性等。铜绿假单胞菌生物膜的形... 铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)是临床中常见的一种条件致病菌,其感染人体后可形成致密的生物膜。生物膜使铜绿假单胞菌具有较强的抗逆性,包括抵御宿主吞噬细胞的吞噬,抵抗宿主的免疫功能,产生耐药性等。铜绿假单胞菌生物膜的形成主要受第二信使分子环二鸟苷酸(c-di-GMP)的调控。铜绿假单胞菌通过控制c-di-GMP的代谢来改变胞内c-di-GMP的浓度,进而实现其在浮游状态与生物膜状态之间的转变。铜绿假单胞菌胞内c-di-GMP结合受体和效应器的多样性是c-di-GMP多层次调控铜绿假单胞菌生物膜形成机制的关键。本文综述了铜绿假单胞菌PAO1菌株中c-di-GMP的代谢及其调控生物膜形成机制的研究进展,为解决铜绿假单胞菌引起的感染问题提供参考。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 生物膜 环二鸟苷酸 综述
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鉴定cyclic di-GMP效应蛋白:高通量筛选策略与实验验证方法 被引量:2
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作者 程寿廷 王芳芳 钱韦 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第9期1376-1389,共14页
环二鸟苷单磷酸(cyclic di-GMP或c-di-GMP)是细菌细胞中广泛存在的第二信使,调控细菌生物被膜发育、致病力、运动性、胞外多糖产生及细胞周期在内的诸多重要生理表型。c-di-GMP通过结合多种类型的效应子(包括核糖开关或效应蛋白)来发挥... 环二鸟苷单磷酸(cyclic di-GMP或c-di-GMP)是细菌细胞中广泛存在的第二信使,调控细菌生物被膜发育、致病力、运动性、胞外多糖产生及细胞周期在内的诸多重要生理表型。c-di-GMP通过结合多种类型的效应子(包括核糖开关或效应蛋白)来发挥调控功能。由于c-di-GMP分子在构象上具有多变性,其结合的效应子同样具有多样性。新型效应蛋白的筛选、鉴定是当前细菌信号转导领域的研究热点和难点,也是解析c-di-GMP调控机制的首要环节。本文在阐述c-di-GMP结合不同类型的效应蛋白并调控细菌生物被膜发育的基础上,综述了目前筛选c-di-GMP效应蛋白的方法,包括遗传筛选、亲和色谱结合质谱鉴定、DRa CALA系统鉴定以及基于分子对接的预测等。同时,对验证c-di-GMP效应蛋白的技术,如等温微量热滴定、表面等离子共振、微量热泳动在内的多种验证方法进行了总结,对比了这些策略和方法在应用上的优、缺点,为在细菌及其真核宿主基因组水平鉴定c-di-GMP效应蛋白的研究提供参考。 展开更多
关键词 环二乌苷酸单磷酸 二乌苷酸环化酶 磷酸二酯酶 效应蛋白 生物被膜
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环二鸟苷酸(c-di-GMP)对大肠杆菌生物学功能的调控作用及机制 被引量:1
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作者 刘家奇 武琥琮 +4 位作者 尹义 张东 夏芃芃 任文凯 朱国强 《生命的化学》 CAS CSCD 2019年第4期681-691,共11页
环二鸟苷酸(cyclic diguanosine monophosphate, c-di-GMP)是在细菌中发现的第二信使之一,参与大肠杆菌运动性、生物被膜形成及毒力等众多功能的调节。合成与水解c-di-GMP的二鸟苷酸环化酶(diguanylate cyclases, DGCs)和特异性的磷酸... 环二鸟苷酸(cyclic diguanosine monophosphate, c-di-GMP)是在细菌中发现的第二信使之一,参与大肠杆菌运动性、生物被膜形成及毒力等众多功能的调节。合成与水解c-di-GMP的二鸟苷酸环化酶(diguanylate cyclases, DGCs)和特异性的磷酸二酯酶(phosphodiesterases, PDEs)在大肠杆菌中分布广泛且丰富度较高。同时,DGCs和PDEs的蛋白结构不仅包括与c-di-GMP相关的酶活性中心,而且还具有多种感受环境变化和接收信号分子调节的结构域。鉴于c-di-GMP的调控复杂且值得深入探索,本文综述了c-di-GMP对大肠杆菌生物学特性的调控作用以及c-di-GMP在大肠杆菌中的两种调控模型,并对最新研究进展和应用进行展望。 展开更多
关键词 环二鸟苷酸 大肠杆菌 运动性 生物被膜 毒力
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