基于转录组的巨龙竹CesA基因家族的生物信息学分析

纤维素是植物细胞壁的重要组成成分,主要由多个纤维素合成酶(CesA)基因家族参与编码。本研究基于巨龙竹单分子实时测序(SMRT)转录组数据库,利用高质量转录本非冗余序列结合转录本功能注释,共筛选出45个CesA基因候选序列。巨龙竹CesA基因家族编码蛋白的氨基酸数目为351~1652个,其分子量为40.45~186.12 kD,且大部分蛋白以α-螺旋和无规则卷曲为主。通过CesA基因家族成员之间的同源性分析,以及与水稻、毛竹、绿竹和慈竹4个禾本科物种的CesA基因家族共同构建的系统进化树分析发现,巨龙竹CesA基因家族成员可分成10个类群。F01_cb9914_c103031/f5p6/3907与F01_cb9914_c4357/f4p0/4200两个基因与巨龙竹初生壁纤维素生物合成有关,其中且由共同的祖先演化而来,发生了基因功能的分化,使得巨龙竹笋的组织特异性表达存在较大差异。本研究结果对巨龙竹CesA基因家族基因的进一步研究及其功能鉴定奠定了基础。