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我国登革3型病毒广西80-2株基因组全序列分析
被引量:
7
1
作者
苑锡同
耿丽卿
+7 位作者
于曼
胡志君
赵卫
陈水平
王鹏程
范宝昌
杨佩英
秦鄂德
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2001年第5期621-625,共5页
对我国登革 3型病毒 80 2株基因组进行全序列测定 ,为了解其基因组结构与功能的关系提供依据 .根据登革 3型病毒H87株的序列设计并合成引物 ,应用RT PCR和RACE法 ,对 80 2株基因组RNA进行扩增、克隆测序后获得我国登革 3型病毒广西株...
对我国登革 3型病毒 80 2株基因组进行全序列测定 ,为了解其基因组结构与功能的关系提供依据 .根据登革 3型病毒H87株的序列设计并合成引物 ,应用RT PCR和RACE法 ,对 80 2株基因组RNA进行扩增、克隆测序后获得我国登革 3型病毒广西株基因组序列 .该株病毒基因组全长10 696nt ,不含poly(A)尾 ,4种碱基数分别为A :3 4 3 7,C :2 2 15,G :2 773 ,U :2 2 71.包含一个读码框架 ,自 95至 10 2 67位 ,共 10 170个碱基 ,编码 3 3 90个氨基酸 ,5′和 3′非编码区长度分别为 94nt和4 3 2nt.与H 87株比较 ,核苷酸和氨基酸序列同源性均在 99%以上 ,有 2 8个碱基发生改变 ,其中 2 6个碱基突变发生在读码框架内 ,碱基转换 18个 ,颠换 10个 ;碱基突变引起 14个氨基酸的改变 .80 2株与H87株病毒的基因组全序列同源性高 ,变异度小 .
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关键词
登革
3
型病毒
广西株
全序列分析
基因组
下载PDF
职称材料
题名
我国登革3型病毒广西80-2株基因组全序列分析
被引量:
7
1
作者
苑锡同
耿丽卿
于曼
胡志君
赵卫
陈水平
王鹏程
范宝昌
杨佩英
秦鄂德
机构
北京微生物流行病研究所
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2001年第5期621-625,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目 (No .3 9770 0 3 6 )
文摘
对我国登革 3型病毒 80 2株基因组进行全序列测定 ,为了解其基因组结构与功能的关系提供依据 .根据登革 3型病毒H87株的序列设计并合成引物 ,应用RT PCR和RACE法 ,对 80 2株基因组RNA进行扩增、克隆测序后获得我国登革 3型病毒广西株基因组序列 .该株病毒基因组全长10 696nt ,不含poly(A)尾 ,4种碱基数分别为A :3 4 3 7,C :2 2 15,G :2 773 ,U :2 2 71.包含一个读码框架 ,自 95至 10 2 67位 ,共 10 170个碱基 ,编码 3 3 90个氨基酸 ,5′和 3′非编码区长度分别为 94nt和4 3 2nt.与H 87株比较 ,核苷酸和氨基酸序列同源性均在 99%以上 ,有 2 8个碱基发生改变 ,其中 2 6个碱基突变发生在读码框架内 ,碱基转换 18个 ,颠换 10个 ;碱基突变引起 14个氨基酸的改变 .80 2株与H87株病毒的基因组全序列同源性高 ,变异度小 .
关键词
登革
3
型病毒
广西株
全序列分析
基因组
Keywords
dengue type 3 virus
,
guangxi strain
,
complete sequence analysis
分类号
R373.33 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
我国登革3型病毒广西80-2株基因组全序列分析
苑锡同
耿丽卿
于曼
胡志君
赵卫
陈水平
王鹏程
范宝昌
杨佩英
秦鄂德
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2001
7
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