牛支原体deoC蛋白多抗的制备及生物信息学分析

【目的】研究牛支原体(Mycoplasma bovis,M.bovis)武威株脱氧核糖磷酸醛缩酶(Deoxyribose-phosphate aldolase protein,DERA)基因序列特征及其分布位置,对免疫原性做初步探究。【方法】参照GenBank PG45菌株deoC基因(登录号:CP002188.1)设计引物PCR扩增deoC基因全长,构建原核表达载体pET-deoC。经感受态BL21转化IPTG诱导后纯化蛋白免疫新西兰兔制备多抗血清,应用Western blot与间接ELISA检测对其免疫原性和细胞内的分布进行初步研究。【结果】deoC基因全长为669 bp,重组蛋白为可溶性形式;Western blot与间接ELISA结果具有较高的免疫原性,在细胞质中分布多于细胞膜。与地方株同源性均为95.4%,亲水性蛋白,无信号肽和跨膜结构,存在磷酸化位点和糖基化位点,混合型二级结构。【结论】deoC具有良好的免疫原性,为研究牛支原体抗原提供了一定的理论基础依据。

脱氧核糖核酸酶deoC对变形链球菌生物膜形成的影响

目的研究分析deo C蛋白对变形链球菌(Streptococcus mutans,S.mutans)生物膜形成的影响。方法建立变形链球菌成熟生物膜模型,将变形链球菌UA159分别接种于两种不同的BHI培养液中厌氧培养,实验组加入含有deo C蛋白的BHI+1%蔗糖培养基,对照组加入等体积的BHI+1%蔗糖培养基。运用激光共聚焦扫描显微镜(CLSM)观察各组生物膜中活菌数及其厚度。结果实验组生物膜菌量明显减少,呈条状散在分布;对照组可见生物膜细菌致密,且大部分为活菌。实验组的变形链球菌生物膜厚度及内层、中间层与外层的活菌百分比均明显低于对照组,差异有统计学意义(P<0.01)。结论 deo C蛋白可能通过分解变形链球菌生物膜形成的胞外基质e DNA而抑制变形链球菌的生物膜形成;通过过表达deo C蛋白,减少变形链球菌在口腔软硬组织或修复体表面的附着,降低其对抗菌药物的耐受性可能成为龋病治疗的新方法。

Reed-Solomon码的符号级软判决译码算法

为了在译码性能和复杂度之间获得更好的折中,提出两种Reed-Solomon码的符号级软判决译码算法:一种将置信度排序译码集成到Chase译码的组合译码算法;另一种则采用逐级选择测试序列集的广义Chase-2译码算法。二者在一定的场合能够充分利用软判决信息。仿真结果表明,第一种算法在译码复杂度较低时,能够获得很好的综合性能;而第二种算法则具有很好的灵活性,且在译码复杂度可接受的范围内具有很好的综合性能。两种算法在一些场合中都能获得比目前其它一些常用的符号级软判决译码算法更好的综合性能。

基于协同优化算法的Reed-Solomon码迭代软判决译码

基于协同优化算法推导出一种Reed—Solomon（RS）码的迭代软判决译码（SDD）算法。该算法属于消息传递算法，具有严格的理论基础。仿真结果表明，该算法相对于硬判决译码（HDD）能够获得有效的软判决译码增益，对于（15，9）RS码在误帧率（FER）为4×10^-4时有0．3—1．3dB的增益；同时译码复杂度低，具有很好的工程实用性。此外该算法是一类软输入软输出（SISO）译码算法，能够应用于以RS码为子码的复合码，如级连码和乘积码的迭代译码。