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A comprehensive and systematic analysis of Dihydrolipoamide S-acetyltransferase (DLAT) as a novel prognostic biomarker in pan-cancer and glioma
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作者 HUI ZHOU ZHENGYU YU# +6 位作者 JING XU ZHONGWANG WANG YALI TAO JINJIN WANG PEIPEI YANG JINRONG YANG TING NIU 《Oncology Research》 SCIE 2024年第12期1903-1919,共17页
Background:Dihydrolipoamide S-acetyltransferase(DLAT)is a subunit of the pyruvate dehydrogenase complex(PDC),a rate-limiting enzyme complex,that can participate in either glycolysis or the tricarboxylic acid cycle(TCA... Background:Dihydrolipoamide S-acetyltransferase(DLAT)is a subunit of the pyruvate dehydrogenase complex(PDC),a rate-limiting enzyme complex,that can participate in either glycolysis or the tricarboxylic acid cycle(TCA).However,the pathogenesis is not fully understood.We aimed to perform a more systematic and comprehensive analysis of DLAT in the occurrence and progression of tumors,and to investigate its function in patients’prognosis and immunotherapy.Methods:The differential expression,diagnosis,prognosis,genetic and epigenetic alterations,tumor microenvironment,stemness,immune infiltration cells,function enrichment,single-cell analysis,and drug response across cancers were conducted based on multiple computational tools.Additionally,we validated its carcinogenic effect and possible mechanism in glioma cells.Results:We exhibited that DLAT expression was increased in most tumors,especially in glioma,and affected the survival of tumor patients.DLAT was related to RNA modification genes,DNA methylation,immune infiltration,and immune infiltration cells,including CD4+T cells,CD8+T cells,Tregs,and cancer-associatedfibroblasts.Single-cell analysis displayed that DLAT might regulate cancer by mediating angiogenesis,inflammation,and stemness.Enrichment analysis revealed that DLAT might take part in the cell cycle pathway.Increased expression of DLAT leads tumor cells to be more resistant to many kinds of compounds,including PI3Kβinhibitors,PKC inhibitors,HSP90 inhibitors,and MEK inhibitors.In addition,glioma cells with DLAT silence inhibited proliferation,migration,and invasion ability,and promoted cell apoptosis.Conclusion:We conducted a comprehensive analysis of DLAT in the occurrence and progression of tumors,and its possible functions and mechanisms.DLAT is a potential diagnostic,prognostic,and immunotherapeutic biomarker for cancer patients. 展开更多
关键词 dihydrolipoamide S-acetyltransferase(dlat) GLIOMA PROGNOSTIC IMMUNOLOGICAL
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铜死亡相关基因DLAT在胰腺癌中的表达及临床意义
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作者 张钦泉 匡鹏 +4 位作者 董毅 王理承 毛连春 李中虎 金炜东 《联勤军事医学》 CAS 2024年第2期105-112,共8页
目的 探讨铜死亡相关基因在胰腺癌中发挥的作用,构建预后模型,筛选并验证铜死亡相关基因在胰腺癌中发挥的重要作用。方法 利用生物学数据库分析胰腺癌中铜死亡相关基因的表达水平、预后分析并构建预后模型。结果 以二氢硫辛酰胺S-乙酰... 目的 探讨铜死亡相关基因在胰腺癌中发挥的作用,构建预后模型,筛选并验证铜死亡相关基因在胰腺癌中发挥的重要作用。方法 利用生物学数据库分析胰腺癌中铜死亡相关基因的表达水平、预后分析并构建预后模型。结果 以二氢硫辛酰胺S-乙酰转移酶(dihydrolipoamide S-acetyltransferase, DLAT)为代表的铜死亡相关基因在胰腺癌中高表达(P均<0.05)。以铜死亡相关基因构建预后模型,与低风险评分胰腺癌患者相比,高风险评分胰腺癌患者预后较差(P<0.05)。公共数据库及临床数据的免疫组织化学法验证了DLAT在胰腺癌中高表达不利于胰腺癌患者预后,其表达水平可作为胰腺癌患者病情进展的独立危险因素(P均<0.05)。结论 铜死亡相关基因可以作为胰腺癌患者潜在的预后预测因子。以DLAT为代表的铜死亡相关基因可能为胰腺癌治疗提供新的途径。 展开更多
关键词 铜死亡相关基因 二氢硫辛酰胺S-乙酰转移酶 胰腺癌 免疫组织化学 预后
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基于多数据库分析代谢相关基因DLAT在结直肠癌中的表达及其临床意义 被引量:10
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作者 王婷 李春晓 +6 位作者 南鹏 王劲松 张竞尧 周彦彤 董德操 王海娟 钱海利 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期311-317,共7页
目的筛选与结直肠癌患者生存相关的代谢相关基因,探讨二氢硫辛酰胺转乙酰基酶(DLAT)在结直肠癌组织中的表达情况及其与临床病理特征和预后的关系,建立DLAT共表达分子调控网络。方法利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库,联合全基因转录组测... 目的筛选与结直肠癌患者生存相关的代谢相关基因,探讨二氢硫辛酰胺转乙酰基酶(DLAT)在结直肠癌组织中的表达情况及其与临床病理特征和预后的关系,建立DLAT共表达分子调控网络。方法利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库,联合全基因转录组测序数据与临床病例资料进行候选代谢相关基因的生存分析;通过基因表达汇编(GEO)及Oncomine、KM-Plotter分析平台分析DLAT在结直肠癌中的表达情况,进而分析其表达水平与结直肠癌患者病理特征和预后的关系;采用cBioPortal、STRING数据库检索DLAT共表达基因集,进行功能及通路聚类分析,构建DLAT分子调控网络。结果在多数据库中进行的生存分析结果表明DLAT为候选代谢基因中与结直肠癌患者生存相关性最高的基因(P<0.001)。与配对正常组织相比,DLAT在包括结肠癌组织在内的肿瘤组织中均显著高表达(P=0.005),但在Ⅲ、Ⅳ期结肠癌组织中的表达低于Ⅰ、Ⅱ期结肠癌组织(P<0.001)。DLAT高、低表达结直肠癌患者的总中位生存时间分别为尚无法计算(死亡发生率未达50%)和51.45个月(P<0.001),其中位无进展生存分别是108.90个月和55.12个月(P=0.007)。KMPlotter数据库中,DLAT的表达与胃癌数据集、直肠癌数据集中患者的总生存时间均有关(依次为P=0.042,P=0.004)。TCGA数据集中,DLAT表达与TNM分期(P=0.001)、淋巴结转移(P<0.001)、脉管侵袭(P=0.013)有关,而与性别、年龄、组织学类型、浸润深度、淋巴管侵袭无关(P>0.05)。DLAT共表达基因集的功能聚类显示其主要参与细胞周期有丝分裂进程、线粒体蛋白翻译的延长和终止、非编码RNA的代谢以及DNA构象改变等生物学过程。KEGG富集分析显示其参与细胞柠檬酸循环、氧化磷酸化及丙酮酸代谢等相关通路。构建DLAT分子调控网络,得到连接度最高的10个节点基因,依次为PAICS、MAD2L1、HSPD1、GART、CS、RRM1、MRPL3、BUB1、CCNB1、CHEK1。结论代谢基因DLAT在结直肠癌组织中的表达高,然而晚期结直肠癌组织的表达低于早期结直肠癌组织,且低表达患者预后较差、TNM分期较晚、更易发生淋巴结转移,该发现为结直肠癌代谢相关潜在分子标志物的研究和应用奠定了一定基础。 展开更多
关键词 结直肠癌 代谢相关基因 癌症基因组图谱 二氢硫辛酰胺转乙酰基酶 预后
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DLAT:一种新型肝细胞癌预后生物标志物和治疗靶点
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作者 陈巍 杨尽晖 《湖南师范大学学报(医学版)》 2024年第2期78-85,共8页
目的:研究二氢硫辛酰胺转乙酰基酶(dihydrolipoamide S-acetyltransferase,DLAT)在肝细胞癌(HCC)中的表达和预后价值,为HCC的预后评估和药物治疗提供新的生物标志物。方法:通过生物信息学分析DLAT在HCC中的表达、预后价值以及相关生物... 目的:研究二氢硫辛酰胺转乙酰基酶(dihydrolipoamide S-acetyltransferase,DLAT)在肝细胞癌(HCC)中的表达和预后价值,为HCC的预后评估和药物治疗提供新的生物标志物。方法:通过生物信息学分析DLAT在HCC中的表达、预后价值以及相关生物学功能。收集湖南省人民医院50例HCC患者的临床病理资料,采用免疫组化分析DLAT在肿瘤组织和癌旁组织中的差异表达,并进一步分析DLAT的预后价值。q-PCR检查HCC细胞系HepG2、Huh-7、SMMC-7721和人正常肝组织细胞系LO2中DLAT mRNA的表达。在HepG2细胞中转染si-DLAT(实验组)和si-NC(对照组),CCK8实验和流式细胞术检测DLAT对细胞增殖和凋亡的影响。结果:DLAT在HCC组织中的表达高于正常组织,并与患者预后不良呈正相关。DLAT在HCC中的高表达与免疫细胞浸润水平和细胞周期调控基因密切相关。沉默DLAT后,HepG2细胞的增殖明显慢于对照组,凋亡比例高于对照组。结论:DLAT可作为HCC患者良好的预后标志物,并可能成为治疗HCC的新靶点。 展开更多
关键词 肝细胞癌 二氢硫辛酰胺转乙酰基酶 预后标志物
原文传递
丙酮酸脱氢酶复合物X蛋白的原核表达与血清学鉴定
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作者 舒翠莉 赵军 +3 位作者 雷历 李靖 高蓉 程云 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第7期668-670,共3页
目的获得丙酮酸脱氢酶复合物的X蛋白(Pro-X)的原核表达蛋白。方法采用RT-PCR技术从人淋巴细胞RNA中扩增出Pro-X的基因片段,克隆至pET28a(+)表达载体进行诱导表达,并对表达产物进行Western blot和ELISA鉴定。结果成功构建了表达载体pET28... 目的获得丙酮酸脱氢酶复合物的X蛋白(Pro-X)的原核表达蛋白。方法采用RT-PCR技术从人淋巴细胞RNA中扩增出Pro-X的基因片段,克隆至pET28a(+)表达载体进行诱导表达,并对表达产物进行Western blot和ELISA鉴定。结果成功构建了表达载体pET28a(+)/Pro-X;表达产物能特异性的被原发性胆汁性肝硬化(primary bili-ary cirrhosis,PBC)患者血清中的抗线粒体抗体识别。结论获得Pro-X蛋白的原核高效表达,为利用原核表达的丙酮酸复合物对PBC患者进行血清学检测进一步奠定了基础。 展开更多
关键词 丙酮酸脱氢酶复合物的X蛋白 克隆表达 酶联免疫吸附试验
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牛支原体pdhc基因的克隆、表达及其亚细胞定位 被引量:5
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作者 张懿 邢小勇 +1 位作者 温峰琴 包世俊 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第9期2377-2385,共9页
试验旨在研究牛支原体(Mycoplasma bovis,M.bovis)武威株二氢硫辛酰胺转乙酰酶(PDHc-E2)基因序列特征及其在牛支原体细胞中的位置。参照GenBank中牛支原体HB0801株pdhc基因(登录号:CP002058.1)设计引物,应用PCR扩增获得牛支原体武威株p... 试验旨在研究牛支原体(Mycoplasma bovis,M.bovis)武威株二氢硫辛酰胺转乙酰酶(PDHc-E2)基因序列特征及其在牛支原体细胞中的位置。参照GenBank中牛支原体HB0801株pdhc基因(登录号:CP002058.1)设计引物,应用PCR扩增获得牛支原体武威株pdhc基因,在测序及序列分析的基础上,应用Overlap PCR完成点突变后将其克隆至pET-28a(+)中,构建原核表达载体pET-pdhc。pET-pdhc转化大肠杆菌Rosetta(DE3)感受态细胞后经IPTG诱导获得融合蛋白,将纯化蛋白免疫新西兰兔制备多抗血清,应用iELISA和Western blotting对牛支原体武威株PDHc-E2在细胞内的分布进行初步研究。结果显示,牛支原体武威株pdhc基因CDS全长735bp,编码244个氨基酸,与国内牛支原体分离株HB0801、Hubei-1、CQ-W70、NM2012等基因序列完全一致,与国际标准株PG45同源性为99.2%,与无乳支原体(M.agalactiae)同源性为90.9%~91.2%,与加利福尼亚支原体(M.californicum)ST6株的同源性仅为78.4%,基因序列非常保守;通过Overlap PCR将该基因中4个编码色氨酸的TGA密码子突变为TGG,且完成点突变后的基因在大肠杆菌中成功表达,重组蛋白大小约为29ku,主要以可溶性形式存在,iELISA结果显示,重组蛋白PDHc-E2具有较高的免疫原性,可刺激新西兰兔产生高水平的抗体,血清效价高达1∶100 000;亚细胞定位结果表明,制备的多抗血清与重组蛋白PDHc-E2、牛支原体全菌蛋白、牛支原体膜蛋白、牛支原体胞浆蛋白均能发生特异性结合,说明该蛋白在牛支原体细胞膜和细胞质中均有分布,为膜相关蛋白,但在细胞质中的分布多于细胞膜。本研究结果为进一步研究牛支原体的生物学功能提供了理论依据。 展开更多
关键词 牛支原体 二氢硫辛酰胺转乙酰酶 原核表达 亚细胞定位
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二氢硫辛酰转乙酰基酶通过乙酰化磷酸葡糖酸脱氢酶促进核酸合成 被引量:3
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作者 孙明明 乔亚亚 +2 位作者 李垒垒 山长亮 张帅 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期339-346,共8页
丙酮酸脱氢酶复合物(pyruvate dehydrogenase complex,PDC)是位于线粒体内的多酶复合物,催化丙酮酸不可逆地氧化脱羧转为乙酰辅酶A,二氢硫辛酰转乙酰基酶(dihydrolipoyl acetyltransferase,DLAT)是PDC的1个亚基。PDC在细胞线粒体呼吸中... 丙酮酸脱氢酶复合物(pyruvate dehydrogenase complex,PDC)是位于线粒体内的多酶复合物,催化丙酮酸不可逆地氧化脱羧转为乙酰辅酶A,二氢硫辛酰转乙酰基酶(dihydrolipoyl acetyltransferase,DLAT)是PDC的1个亚基。PDC在细胞线粒体呼吸中发挥关键作用。但是DLAT在核酸合成中的作用仍不清楚。在本研究中,首先利用GEO数据库、Oncomine数据库和人类蛋白质图谱数据库分析发现,DLAT在肺癌组织中的表达明显高于癌旁组织(P=0.0002),并且高表达DLAT的病人有较短的生存期(HR=1.47,logrank P=4e-09)。因此推测,DLAT在肿瘤生长中发挥关键作用。进而本文构建了敲低DLAT的肺癌细胞系,并用免疫印迹结果验证了DLAT敲低效果。进一步的研究发现,敲低DLAT将降低戊糖磷酸途径第3个酶磷酸葡糖酸脱氢酶(6-phosphogluconate dehydrogenase,6PGD)的乙酰化水平,进而降低6PGD酶活性,从而导致核酸合成受阻(P<0.01),最终抑制肺癌细胞增殖(P<0.01)。机制研究发现,DLAT通过乙酰化6PGD而使其酶活性增强,进而提高核酸合成,从而达到促进肺癌细胞增殖的作用。综上所述,本研究为DLAT作为潜在的靶点,为药物开发和临床肺癌的治疗提供了新的思路。 展开更多
关键词 线粒体 二氢硫辛酰转乙酰基酶 磷酸葡糖酸脱氢酶 戊糖磷酸途径
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