目的基于网络药理学和体外实验探究左归丸作用于头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)的靶点并分析潜在机制。方法自2022年11月至2023年3月分别通过TCMSP、BATMAN-TCM、GeneCards、CTD、OMIM数据库筛选左归丸的活性成分并筛选左归丸作用于HNSCC的潜...目的基于网络药理学和体外实验探究左归丸作用于头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)的靶点并分析潜在机制。方法自2022年11月至2023年3月分别通过TCMSP、BATMAN-TCM、GeneCards、CTD、OMIM数据库筛选左归丸的活性成分并筛选左归丸作用于HNSCC的潜在靶点;使用String数据库构建潜在靶点互作网络,并进行多步拓扑分析筛选出核心靶点;使用DAVID和Metascape数据库对潜在靶点进行富集分析;最后运用Auto Dock Vina进行核心成分与靶点的分子对接并通过细胞计数试剂盒(CCK-8)、蛋白质印迹法验证左归丸对HNSCC的治疗作用及机制。结果左归丸的8种活性成分具有487个药物靶点,其中440个为HNSCC相关基因;两步拓扑结构分析得到表皮生长因子(EGFR)、细胞周期蛋白D1(CCND1)、热休克蛋白90α家族A类成员1(HSP90AA1)、核因子kappa B激酶亚基β抑制剂(IKBKB)和螺旋环螺旋结构域扩散激酶(CHUK)5个核心靶点;富集结果提示左归丸通过影响多种生物学功能和信号通路在HNSCC中发挥作用;分子对接结果显示,左归丸与核心靶点之间结合稳定。体外实验显示,与对照组相比,左归丸处理组显著抑制了WSU-HN6和CAL-27细胞增殖能力(P<0.001)并且可以降低CCND1,IKBKB和CHUK(P<0.05)的蛋白表达水平。结论左归丸能够靶向多条促癌信号通路从而对HNSCC起到抑制作用。展开更多
运用网络药理学和分子对接方法,探讨熟地、牛膝、茯苓、肉苁蓉和菟丝子等高频调髓中药治疗股骨头坏死(Osteonecrosis of the femoral head,ONFH)的作用机制。借助TCMSP平台,获取高频调髓中药的活性成分与潜在作用靶点,将上述药物作用靶...运用网络药理学和分子对接方法,探讨熟地、牛膝、茯苓、肉苁蓉和菟丝子等高频调髓中药治疗股骨头坏死(Osteonecrosis of the femoral head,ONFH)的作用机制。借助TCMSP平台,获取高频调髓中药的活性成分与潜在作用靶点,将上述药物作用靶点在Uniprot数据库中进行标准化处理。通过GeneCards和OMIM两大疾病数据库,获取得到ONFH疾病相关基因靶点,对所得到的已规范化的药物活性成分与疾病靶点进行整理合并,得到交集基因靶点。通过Cytoscape软件和String数据库,绘制药物-活性成分-靶点-疾病网络和构建蛋白互作网络,分析网络中关键活性成分和蛋白靶点。利用R软件对交集基因进行基因本体(Geneontology,GO)功能和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopediaof Genesand Genomes,KEGG)通路富集分析,得到交集基因富集的功能与信号通路。为了验证药物活性成分与作用靶点结合的稳定性,使用AutoDockTools和AutoDock Vina软件进行分子对接验证,并在PyMOL软件中进行可视化分析,共得到5味调髓中药54个活性成分,1074个药物靶点,195个作用基因靶点,ONFH相关疾病靶点1219个。调髓中药有效作用靶点与疾病交集靶点39个。GO功能分析得到1619个条目,包括1517个生物过程,10个细胞组成及92个分子功能,其主要与血管生成、骨、脂质代谢和炎症反应等过程相关。KEGG通路富集分析得到119条通路,主要有AGE-RAGE信号通路、PI3K-Akt信号通路和IL-17信号通路等。分子对接结果显示,槲皮素、汉黄芩素和山柰酚等关键活性成分与IL6、P53和VEGF等核心蛋白具有良好的亲和力。本研究表明,高频调髓中药可通过调节免疫炎症反应、血管生成和骨代谢等过程,而达到治疗ONFH的作用,其具有多成分、多靶点和多途径的综合治疗作用特性。展开更多
水下自主航行器的回坞定位导航控制的任务是使水下自主航行器在洋流的影响下以一定的航艏向和姿态驶向接驳系统,并完成入坞这一过程.回坞过程分为3个阶段:远距离追踪式回航阶段、近距离中心线回航阶段、末端姿态调整阶段.针对不同阶段...水下自主航行器的回坞定位导航控制的任务是使水下自主航行器在洋流的影响下以一定的航艏向和姿态驶向接驳系统,并完成入坞这一过程.回坞过程分为3个阶段:远距离追踪式回航阶段、近距离中心线回航阶段、末端姿态调整阶段.针对不同阶段分别采用不同的引导方式:视线法、横向误差法、设计参考航向法实现回坞过程的路径规划,用Proportional Integral Derivative(PID)控制法对回坞过程进行运动控制,并且利用数学模型在Matlab/simulink中对回坞定位导航控制进行仿真.仿真结果显示了文章所采用定位导航控制的有效性.展开更多
目的:基于网络药理学方法探析淫羊藿-牛膝药对治疗股骨头坏死的药效物质基础与潜在的分子作用机制。方法:通过中药系统药理数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP...目的:基于网络药理学方法探析淫羊藿-牛膝药对治疗股骨头坏死的药效物质基础与潜在的分子作用机制。方法:通过中药系统药理数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)挖掘中药淫羊藿、牛膝的主要化学成分,根据ADME筛选出药物活性成分和药物作用的有效蛋白质靶点并通过Uniprot数据库对靶点信息进行标准化;通过GeneCard、OMIM、DrugBank数据库检索股骨头坏死主要作用靶点,借助Cytoscape软件制作PPI互作网络图,并进一步挖掘出更为重要的靶点蛋白;根据Metascape数据库进行GO分析和KEGG通路富集分析,最后对有效成分和核心靶点的结合度进行分子对接验证。结果:淫羊藿-牛膝药对调治股骨头坏死的核心活性成分为槲皮素、山柰酚、汉黄芩素等,核心靶点有TP53、PPARG、PTGS2等。淫羊藿-牛膝药对调治股骨头坏死的生物学通路主要作用于癌症通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路以及HIF-1信号通路等。分子对接结果示山柰酚与TP53、槲皮素与TP53结合力强。结论:淫羊藿-牛膝药对通过槲皮素、山柰酚等成分作用于TP53、PPARG等靶点,癌症通路、PI3K-Akt、MAPK、HIF-1等信号通路密切参与其中,在调治股骨头坏死中发挥了抗炎、恢复成骨细胞等作用。展开更多
文摘目的基于网络药理学和体外实验探究左归丸作用于头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)的靶点并分析潜在机制。方法自2022年11月至2023年3月分别通过TCMSP、BATMAN-TCM、GeneCards、CTD、OMIM数据库筛选左归丸的活性成分并筛选左归丸作用于HNSCC的潜在靶点;使用String数据库构建潜在靶点互作网络,并进行多步拓扑分析筛选出核心靶点;使用DAVID和Metascape数据库对潜在靶点进行富集分析;最后运用Auto Dock Vina进行核心成分与靶点的分子对接并通过细胞计数试剂盒(CCK-8)、蛋白质印迹法验证左归丸对HNSCC的治疗作用及机制。结果左归丸的8种活性成分具有487个药物靶点,其中440个为HNSCC相关基因;两步拓扑结构分析得到表皮生长因子(EGFR)、细胞周期蛋白D1(CCND1)、热休克蛋白90α家族A类成员1(HSP90AA1)、核因子kappa B激酶亚基β抑制剂(IKBKB)和螺旋环螺旋结构域扩散激酶(CHUK)5个核心靶点;富集结果提示左归丸通过影响多种生物学功能和信号通路在HNSCC中发挥作用;分子对接结果显示,左归丸与核心靶点之间结合稳定。体外实验显示,与对照组相比,左归丸处理组显著抑制了WSU-HN6和CAL-27细胞增殖能力(P<0.001)并且可以降低CCND1,IKBKB和CHUK(P<0.05)的蛋白表达水平。结论左归丸能够靶向多条促癌信号通路从而对HNSCC起到抑制作用。
文摘运用网络药理学和分子对接方法,探讨熟地、牛膝、茯苓、肉苁蓉和菟丝子等高频调髓中药治疗股骨头坏死(Osteonecrosis of the femoral head,ONFH)的作用机制。借助TCMSP平台,获取高频调髓中药的活性成分与潜在作用靶点,将上述药物作用靶点在Uniprot数据库中进行标准化处理。通过GeneCards和OMIM两大疾病数据库,获取得到ONFH疾病相关基因靶点,对所得到的已规范化的药物活性成分与疾病靶点进行整理合并,得到交集基因靶点。通过Cytoscape软件和String数据库,绘制药物-活性成分-靶点-疾病网络和构建蛋白互作网络,分析网络中关键活性成分和蛋白靶点。利用R软件对交集基因进行基因本体(Geneontology,GO)功能和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopediaof Genesand Genomes,KEGG)通路富集分析,得到交集基因富集的功能与信号通路。为了验证药物活性成分与作用靶点结合的稳定性,使用AutoDockTools和AutoDock Vina软件进行分子对接验证,并在PyMOL软件中进行可视化分析,共得到5味调髓中药54个活性成分,1074个药物靶点,195个作用基因靶点,ONFH相关疾病靶点1219个。调髓中药有效作用靶点与疾病交集靶点39个。GO功能分析得到1619个条目,包括1517个生物过程,10个细胞组成及92个分子功能,其主要与血管生成、骨、脂质代谢和炎症反应等过程相关。KEGG通路富集分析得到119条通路,主要有AGE-RAGE信号通路、PI3K-Akt信号通路和IL-17信号通路等。分子对接结果显示,槲皮素、汉黄芩素和山柰酚等关键活性成分与IL6、P53和VEGF等核心蛋白具有良好的亲和力。本研究表明,高频调髓中药可通过调节免疫炎症反应、血管生成和骨代谢等过程,而达到治疗ONFH的作用,其具有多成分、多靶点和多途径的综合治疗作用特性。
文摘水下自主航行器的回坞定位导航控制的任务是使水下自主航行器在洋流的影响下以一定的航艏向和姿态驶向接驳系统,并完成入坞这一过程.回坞过程分为3个阶段:远距离追踪式回航阶段、近距离中心线回航阶段、末端姿态调整阶段.针对不同阶段分别采用不同的引导方式:视线法、横向误差法、设计参考航向法实现回坞过程的路径规划,用Proportional Integral Derivative(PID)控制法对回坞过程进行运动控制,并且利用数学模型在Matlab/simulink中对回坞定位导航控制进行仿真.仿真结果显示了文章所采用定位导航控制的有效性.
文摘目的:基于网络药理学方法探析淫羊藿-牛膝药对治疗股骨头坏死的药效物质基础与潜在的分子作用机制。方法:通过中药系统药理数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)挖掘中药淫羊藿、牛膝的主要化学成分,根据ADME筛选出药物活性成分和药物作用的有效蛋白质靶点并通过Uniprot数据库对靶点信息进行标准化;通过GeneCard、OMIM、DrugBank数据库检索股骨头坏死主要作用靶点,借助Cytoscape软件制作PPI互作网络图,并进一步挖掘出更为重要的靶点蛋白;根据Metascape数据库进行GO分析和KEGG通路富集分析,最后对有效成分和核心靶点的结合度进行分子对接验证。结果:淫羊藿-牛膝药对调治股骨头坏死的核心活性成分为槲皮素、山柰酚、汉黄芩素等,核心靶点有TP53、PPARG、PTGS2等。淫羊藿-牛膝药对调治股骨头坏死的生物学通路主要作用于癌症通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路以及HIF-1信号通路等。分子对接结果示山柰酚与TP53、槲皮素与TP53结合力强。结论:淫羊藿-牛膝药对通过槲皮素、山柰酚等成分作用于TP53、PPARG等靶点,癌症通路、PI3K-Akt、MAPK、HIF-1等信号通路密切参与其中,在调治股骨头坏死中发挥了抗炎、恢复成骨细胞等作用。