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一株褐家鼠戊型肝炎病毒的发现鉴定及系统发生分析
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作者 宗利东 殷红敏 +6 位作者 杨银 赵维玉 徐粉慧 韩培钰 崔凤灵 何明仙 张云智 《激光生物学报》 CAS 2023年第6期548-553,560,共7页
对云南省大理市小型哺乳动物携带的戊型肝炎病毒(HEV)进行调查,用巢式RT-PCR对捕获的小型哺乳动物样品中的病毒进行检测,用高通量测序对阳性HEV样本进行毒株全基因组测序,用MEGA-X、BESTv1.10.4和Geneious软件进行生物信息学分析。本研... 对云南省大理市小型哺乳动物携带的戊型肝炎病毒(HEV)进行调查,用巢式RT-PCR对捕获的小型哺乳动物样品中的病毒进行检测,用高通量测序对阳性HEV样本进行毒株全基因组测序,用MEGA-X、BESTv1.10.4和Geneious软件进行生物信息学分析。本研究筛查了6属7种共114只小型哺乳动物样本,结果显示:HEV在褐家鼠中的阳性率为8.00%(2/25);高通量测序获得1株编号为DL147的HEV全基因组,经系统发生分析确定其为HEV-C1基因型,与香港1例戊型肝炎患者血清中发现的HEV同源性最高,核苷酸序列一致性达95.21%,两株病毒的最早分歧时间约为2003年。研究证实,云南省大理市褐家鼠存在HEV-C1感染,其与近期报道的人源新发HEV高度同源,有较近的系统发生关系,对戊型肝炎防控有指导作用。 展开更多
关键词 戊型肝炎病毒 人兽共患病 啮齿动物 遗传分析 高通量测序
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e-MAC:一种面向Ad Hoc网络的高吞吐量MAC协议 被引量:3
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作者 张克旺 潘煜 +1 位作者 张琼 张德运 《软件学报》 EI CSCD 北大核心 2010年第10期2666-2676,共11页
解决ad hoc网络中隐藏节点问题、暴露节点问题的最终目的是减少节点间的冲突,提高网络空间复用率,从而提高网络吞吐量.现有MAC协议在解决隐藏节点问题时着重于彻底消除网络中的隐藏节点,忽略了网络空间复用率,即使能够彻底解决隐藏节点... 解决ad hoc网络中隐藏节点问题、暴露节点问题的最终目的是减少节点间的冲突,提高网络空间复用率,从而提高网络吞吐量.现有MAC协议在解决隐藏节点问题时着重于彻底消除网络中的隐藏节点,忽略了网络空间复用率,即使能够彻底解决隐藏节点问题,也不能有效提高网络吞吐量.同样,现有协议在解决暴露节点问题时着重于如何允许暴露节点并行发送数据,忽略了暴露节点接收数据的问题,也影响了网络空间复用率.提出了一种高效的MAC协议e-MAC,协议采用两种方法提高网络空间复用率:首先,协议中接收节点根据接收到发送节点的信号强度动态调整忙音发射功率,使忙音恰好覆盖所有的隐藏节点,在彻底解决隐藏节点问题的同时,提高网络空间复用率;其次,隐藏节点接收到RTS消息后,通过判断RTS消息信号强度与信道中干涉信号的强度之比来决定是否接收数据,允许满足信噪比要求的接收节点接收数据,进一步提高网络空间复用率.仿真结果验证了协议的有效性,在任意拓扑结构下,e-MAC协议的平均吞吐量比DUCHA(dual channel access)协议高87%. 展开更多
关键词 AD HOC网络 隐藏节点问题 网络空间复用率 网络吞吐量 e-MAC
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Evaluation of Energy Consumption of Proactive, Reactive, and Hybrid Routing Protocols in Wireless Mesh Networks Using 802.11 Standards 被引量:2
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作者 Sidoine D. Samo Jean Louis E. K. Fendji 《Journal of Computer and Communications》 2018年第4期1-30,共30页
This paper provides a deep evaluation of the energy consumption of routing protocols. The evaluation is done along with other metrics such as throughput and packet delivery ratio (PDR). We introduce two more metrics t... This paper provides a deep evaluation of the energy consumption of routing protocols. The evaluation is done along with other metrics such as throughput and packet delivery ratio (PDR). We introduce two more metrics to capture the efficiency of the energy consumption: e-throughput and e-PDR. Both are ratios in relation to the energy. We consider the three low layers of the stack. Three types of routing protocols are used: proactive, reactive, and hybrid. At the MAC and PHY layer, three radio types are considered: 802.11a/b/g. Finally, the number of nodes is varying in random topologies, with nodes being static or mobile. Simulations are conducted using NS3. The parameters of a real network interface card are used. From the results in mobile position scenarios, no protocol is outperforming the others;even if OLSR has the lowest energy consumption, most of the time. However, in constant position scenarios, AODV consumed a lower energy, apart from the scenarios using the 802.11a standard where HWMP energy consumption is the lowest. Regarding the energy efficiency, AODV protocols provided the best e-throughput and OLSR the best e-PDR in overall configurations. A framework for selecting energy-efficient routing protocol depending on network characteristics is proposed at the end. 展开更多
关键词 Energy CONSUMPTION ROUTING Protocols Wireless Mesh Networks e-throughput e-PDR
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IEEE802_11e EDCF饱和状态下性能分析 被引量:1
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作者 王婷 伍智超 +1 位作者 贺昕 周正 《无线电工程》 2006年第7期9-11,共3页
IEEE802.11e协议草案以增强型分布式协调功能(EDCF)为基础,用于加强对无线局域网标准IEEE802.11的QoS支持力度。文章简要介绍了802.11中的分布式协调功能(DCF)和点协调功能(PCF),重点阐述了802.11eEDCF的基本原理和组成结构。使用网络... IEEE802.11e协议草案以增强型分布式协调功能(EDCF)为基础,用于加强对无线局域网标准IEEE802.11的QoS支持力度。文章简要介绍了802.11中的分布式协调功能(DCF)和点协调功能(PCF),重点阐述了802.11eEDCF的基本原理和组成结构。使用网络模拟工具NS-2对比了DCF和EDCF的吞吐量,并对EDCF在饱和状态下以及站点慢速移动情况下的性能进行了详细的分析和比较。 展开更多
关键词 IEEE 802.11e DCF EDCF 吞吐量 饱和
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电强化SBR工艺处理苯酚废水及群落动态解析 被引量:1
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作者 隆楚月 崔雨晨 +1 位作者 张海雲 时胜男 《能源环境保护》 2019年第5期17-22,共6页
为了提高苯酚废水的处理效率,构建电强化SBR体系(简称E-SBR体系),考察了E-SBR体系在施加电压和去除电压后对苯酚和COD的降解效率,利用高通量测序揭示了微生物群落的动态变化规律。结果表明,E-SBR体系施加电压和去除电压后对苯酚和COD的... 为了提高苯酚废水的处理效率,构建电强化SBR体系(简称E-SBR体系),考察了E-SBR体系在施加电压和去除电压后对苯酚和COD的降解效率,利用高通量测序揭示了微生物群落的动态变化规律。结果表明,E-SBR体系施加电压和去除电压后对苯酚和COD的降解效率均显著高于单独的电极体系与单独的SBR体系之和,生物降解和电极降解间存在耦合协同效应。相比于单独SBR体系而言,E-SBR体系微生物群落的多样性和丰富度增强。Bacillus、Pseudomonas、Rhizobium以及Sphingomonas为E-SBR体系中优势菌,其含量显著高于单独SBR体系,施加电场促进了优势菌的生长并且提高了处理效率。 展开更多
关键词 苯酚 COD E-SBR体系 苯酚羟化酶 高通量测序
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基于qPCR和16S rDNA高通量测序研究蓝藻暴发期间太湖竺山湾水体浮游细菌群落 被引量:8
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作者 薛银刚 蒋聪 +3 位作者 耿金菊 谢文理 张皓 陈心一 《环境监控与预警》 2017年第3期19-23,共5页
为了探究浮游细菌和蓝藻暴发之间的关系,利用实时荧光定量PCR和高通量测序技术,对夏季蓝藻暴发期间太湖竺山湾表层水和底泥中浮游细菌群落结构和多样性进行研究。结果表明,从门水平来看,水样和底泥中平均相对丰度最高的为变形菌门,放线... 为了探究浮游细菌和蓝藻暴发之间的关系,利用实时荧光定量PCR和高通量测序技术,对夏季蓝藻暴发期间太湖竺山湾表层水和底泥中浮游细菌群落结构和多样性进行研究。结果表明,从门水平来看,水样和底泥中平均相对丰度最高的为变形菌门,放线菌门次之,此外蓝藻门也有一定的比例,可为水华暴发提供预警指示;从属水平来看,水样中的优势细菌主要为GpXI和GpIIa,底泥中为Gp6和GpIIa。 展开更多
关键词 蓝藻暴发 太湖竺山湾 浮游细菌 高通量测序
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A novel adaptive modulation and coding strategy based on partial feedback for enhanced MBMS network 被引量:2
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作者 SHENG Yu PENG Mu-gen WANG Wen-bo 《The Journal of China Universities of Posts and Telecommunications》 EI CSCD 2008年第1期48-54,共7页
The difference in link condition of broadcast/ multicast users and the limitation of uplink resource, make it difficult to utilize adaptive modulation and coding (AMC) in the enhanced multimedia broadcast and multic... The difference in link condition of broadcast/ multicast users and the limitation of uplink resource, make it difficult to utilize adaptive modulation and coding (AMC) in the enhanced multimedia broadcast and multicast service (E-MBMS) network. To obtain the improvement of system throughput, this study proposes an adaptive modulation and coding scheme based on partial feedback, by which only partial users whose channel qualities are lower than the system threshold need to make a response to the modulation coding scheme (MCS) adaptation procedure. By this investigation, an adaptive scheme can be introduced in the E-MBMS network. Both the theoretical analysis and simulation results demonstrate the efficiency of the proposed strategy, in which the performance is close to the ideal one and has a significant throughput improvement when compared with that of the fixed MCS transmission scheme. 展开更多
关键词 E-MBMS partial feedback AMC system throughput
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戊型肝炎病毒高通量中和效价评价模型的建立
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作者 杨帆 唐自闽 +7 位作者 王思令 蔡薇 温桂平 纪文芳 余静菲 张可 夏宁邵 郑子峥 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期1-6,共6页
广泛有效的体外感染模型的缺乏限制了抗戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)抗体及血清定量化中和效价的评估,从而阻碍了对HEV相关抗体应答及免疫机制的深入研究。本研究首先通过在HEV低效复制细胞系HepG2肝癌细胞株上进行了HEV感染细... 广泛有效的体外感染模型的缺乏限制了抗戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)抗体及血清定量化中和效价的评估,从而阻碍了对HEV相关抗体应答及免疫机制的深入研究。本研究首先通过在HEV低效复制细胞系HepG2肝癌细胞株上进行了HEV感染细胞后的连续监测,直到第13d到达病毒载量的检测下限,验证了该细胞系建立感染模型的可行性,进一步采用96孔多通道平行感染、核酸提取及实时荧光定量PCR对五株抗HEV的鼠源单克隆抗体及四位戊肝疫苗接种者的接种前、后血清样本进行了细胞中和试验。结果显示应用该模型能够实现对不同中和能力的单抗及接种疫苗前后的血清进行中和效价的定量化评估。表明本研究已成功建立了HEV体外高通量中和评价模型,同时也显示出该模型在HEV疫苗及抗体应答表位研究中所具有的潜在价值。 展开更多
关键词 阿霉素肾纤维化 三七注射液 转化生长因子-Β1 P38MAPK
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