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实验室养殖条件下麦穗鱼(Pseudorasbora parva)eDNA浓度与生物量相关性曲线的拟合与比较分析
被引量:
3
1
作者
郭娟
曾燏
+2 位作者
郑羽晨
赵雨双
钟清
《天津农业科学》
CAS
2023年第6期45-49,共5页
为探究实验室养殖条件下麦穗鱼(Pseudorasbora parva)eDNA浓度与其生物量间关系,根据麦穗鱼线粒体COⅠ基因序列设计特异性引物,通过实时荧光定量PCR(qPCR),得到qPCR标准曲线,采用线性、指数和对数3种模型对麦穗鱼生物量与eDNA浓度的相...
为探究实验室养殖条件下麦穗鱼(Pseudorasbora parva)eDNA浓度与其生物量间关系,根据麦穗鱼线粒体COⅠ基因序列设计特异性引物,通过实时荧光定量PCR(qPCR),得到qPCR标准曲线,采用线性、指数和对数3种模型对麦穗鱼生物量与eDNA浓度的相关性曲线进行拟合和比较分析。结果表明:基于CO I基因设计的引物对麦穗鱼DNA具有特异性扩增,扩增效率为90.94%;qPCR的阈值循环数(Cycle threshold,Ct值)与已知浓度或拷贝数的样品(标准品)间呈现良好的线性关系(R2=0.9952),说明标准品的拷贝数与Ct值之间相关的可信度较好。通过3种曲线进一步拟合比较分析显示:线性模型为麦穗鱼生物量与eDNA浓度间的最佳拟合模型,其R2高达0.9338,y=72.087x+81.978。这表明在本试验条件下,eDNA浓度与麦穗鱼生物量呈正相关性。
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关键词
edna浓度
生物量
麦穗鱼
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职称材料
题名
实验室养殖条件下麦穗鱼(Pseudorasbora parva)eDNA浓度与生物量相关性曲线的拟合与比较分析
被引量:
3
1
作者
郭娟
曾燏
郑羽晨
赵雨双
钟清
机构
西华师范大学生命科学学院
出处
《天津农业科学》
CAS
2023年第6期45-49,共5页
文摘
为探究实验室养殖条件下麦穗鱼(Pseudorasbora parva)eDNA浓度与其生物量间关系,根据麦穗鱼线粒体COⅠ基因序列设计特异性引物,通过实时荧光定量PCR(qPCR),得到qPCR标准曲线,采用线性、指数和对数3种模型对麦穗鱼生物量与eDNA浓度的相关性曲线进行拟合和比较分析。结果表明:基于CO I基因设计的引物对麦穗鱼DNA具有特异性扩增,扩增效率为90.94%;qPCR的阈值循环数(Cycle threshold,Ct值)与已知浓度或拷贝数的样品(标准品)间呈现良好的线性关系(R2=0.9952),说明标准品的拷贝数与Ct值之间相关的可信度较好。通过3种曲线进一步拟合比较分析显示:线性模型为麦穗鱼生物量与eDNA浓度间的最佳拟合模型,其R2高达0.9338,y=72.087x+81.978。这表明在本试验条件下,eDNA浓度与麦穗鱼生物量呈正相关性。
关键词
edna浓度
生物量
麦穗鱼
Keywords
edna
concentration
biomass
Pseudorasbora parva
分类号
S932 [农业科学—渔业资源]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
实验室养殖条件下麦穗鱼(Pseudorasbora parva)eDNA浓度与生物量相关性曲线的拟合与比较分析
郭娟
曾燏
郑羽晨
赵雨双
钟清
《天津农业科学》
CAS
2023
3
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职称材料
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参考文献
引证文献
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