一起儿童病毒性脑炎暴发肠道病毒ECHO6型分离株VP1基因特征分析

目的对埃可病毒6型(ECHO6)福建龙岩分离株进行分子生物学分析,阐明ECHO6病毒福建龙岩分离株的分子生学特征及其与世界其它分离株的基因关系。方法采集暴发病例脑脊液标本,用RD细胞进行分离病毒,阳性分离物采用中和试验及PCR序列分析确定其血清型别;RT-PCR扩增VP1基因全长,测定序列进行同源性及亲缘进化树分析。结果 13例细胞培养阳性分离物经中和试验及序列分析结果均为ECHO6。随机选取4株病毒株进行VP1全基因序列分析显示:4个病毒株之间同源性>99%;与山东病毒株E6/SD/sewage/081226/2-2同源性高于其他参考株。在遗传进化树上,4株分离病毒株同属一个分支,为C2亚型。结论 ECHO6是引起本次福建省龙岩市长汀县儿童病毒性脑炎暴发的病原体,其基因型为C2亚型。

毛花猕猴桃‘赣猕6号’主要生物学特性研究

为了对‘赣猕6号’的推广及制定合理栽培管理措施提供参考依据,试验采用田间观测与室内测试相结合的试验方法对其主要生物学特性进行观测研究。结果表明,在江西省奉新地区,伤流期在2月中旬,初花期在5月上旬,谢花期在5月下旬,果实成熟期在10月下旬,为晚熟品种;根系浅,肉质,以须根为主;花单性,二歧聚伞花序,平均单株花量为550~675朵,花红色,极具观赏性;以中果枝和长果枝结果为主,分别占66.0%与28.5%;果实为长圆柱形,平均单果重72.5 g,最大单果重96 g;果实的Vc、总糖、可滴定酸以及SSC平均含量分别为829.23 mg/100g、11.31%、1.32%和14.42%。毛花猕猴桃‘赣猕6号’生物学性状遗传稳定,具有较高的发展前景。

干扰素调节因子6基因致病的Van der Woude综合征的家系调查和遗传特点分析

目的探讨中国人Van der Woude综合征(VWS)的临床表型及遗传学特点。方法先证者法收集14个VWS家系并进行口腔专科检查、家系调查及基因突变分析,分析不同VWS家系个体或同一家系不同个体的临床表型,绘制家系图谱,明确遗传方式及致病基因,计算表型分布频率和表型基因频率。结果 VWS家系基本符合常染色体显性遗传特征,患者多数表现为典型的VWS,致病基因为干扰素调节因子6(IRF6)。VWS表型分布频率为:唇瘘91.9%,唇腭裂73.0%,牙畸形8.1%。不同家系个体和同一家系的不同个体临床表型存在明显差异。结论收集的家系均为常染色体显性遗传,表现度变异大。中国人群VWS致病基因为IRF6,为Ⅰ型VWS。

花生新品种闽花6号的选育及优异性状研究

闽花6号是福建农林大学以汕油523为母本、以Q6为父本有性杂交选育而成,于2006年通过福建省农作物品种审定委员会认定,2009年通过农业部花生品种鉴定。该品种在福建省及全国花生新品种区域试验中表现为高产稳产、高蛋白、较抗黄曲霉。该品种分枝数较多、株高较矮、单株结果数多、饱果数多、出仁率高、籽仁含油量50.08%,蛋白质含量30.63%,属高蛋白品种,脂肪和蛋白质之和高达81.8%。根据福建省花生品种区试数据,应用AMMI模型对参试品种的稳定性分析表明,闽花6号高产、适应性强。对闽花6号进行重要农艺性状的通径分析显示,各性状对产量的直接贡献大小依次为:荚果饱满度>单株结果数>百果重>主茎高>总分枝数>出仁率>侧枝长>百仁重>结果枝数。

漳州市葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症筛查情况及其分子遗传学特征

目的分析漳州市30000例葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(glucose 6-phosphate dehydrogenase,G6PD)缺乏症患儿的筛查情况及其分子遗传学特征。方法选取2018年1月至2021年12月在漳州市出生的30000例新生儿为研究对象,行新生儿足跟血滤纸干血片G6PD荧光斑点法测定,对筛查为阳性的患儿联合基因检测及G6PD活性酶学进行诊断,记录确诊情况及分子遗传学特征。结果30000例新生儿全部接受滤纸干血片G6PD荧光斑点法测定,初筛阳性新生儿1522例,初筛阳性率5.07%。经基因检测及G6PD活性酶学诊断,最终确诊1321例。共检出9种基因突变,其中以c.1024C>T、c.1376G>T、c.1388G>A为检出率最高的三种基因突变类型。c.487G>A、c.1360C>T两种基因型突变女性占比高于男性,其余基因型突变均为男性占比高于女性。按照致病性变异对最终确诊者分类后发现,以Ⅳ类为主,共861例,占65.18%(861/1321)。结论漳州市新生儿中G6PD缺乏症发生率较高,且基因突变型较多,其中c.1388G>A型最为多见,且致病性分类以Ⅳ类为主,程度较轻。因此,应加强对新生儿G6PD缺乏症的筛查,提高疾病检出率。

2013年云南省元江县健康儿童肠道病毒病原学调查及E6病毒VP1区3′端基因特征分析

目的对2013年云南省元江县健康儿童肠道病毒(enterovirus,EV)病原谱进行调查,并对埃可病毒6型(echovirus 6,E6)VP1区3′端的基因特征进行分析。方法采集400名≤5岁健康儿童的粪便标本,进行病毒分离和基因测序定型,从GenBank基因库下载E6病毒参考株VP1区基因序列,用MEGA 5.2软件构建基因进化树。结果 2013年从元江县400名儿童粪便标本中分离到EV 39株,分离率为9.75%(39/400)。其中,A组病毒(enterovirus A,EV-A)1株,1个血清型(CV-A4);EV-B 36株,5个血清型(CV-B2、CV-B4、CV-B5、E25和E6);EV-C 2株,2个血清型(CV-A13、CV-A24);B组病毒占绝大多数(92.31%,36/39);共分离到E6病毒10株,占EV总分离数的25.64%(10/39),是分离比率较高的病毒。10株E6病毒分属于B和C 2个基因型,其中4株为B2亚型,6株为C5亚型。结论元江县健康儿童EV带毒率较高,分离到EV-A、EV-B和EV-C组病毒,未分离到EV-D组病毒和脊髓灰质炎病毒(poliovirus,PV)。B2和C5亚型共同在元江县健康儿童中传播和流行。今后应加强对E6病毒的实验室和流行病学监测。

2013-2019年浙江省湖州市急性胃肠炎病例GⅡ.P7-GⅡ.6型诺如病毒基因特征分析

目的分析2013—2019年浙江省湖州市急性胃肠炎病例诺如病毒基因特征,为疾病监测和防控提供参考。方法采用荧光定量反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)方法对2013年12月、2014年4、12月、2019年3月发生的4起学校/托幼机构急性胃肠炎患者送检粪便标本进行诺如病毒核酸检测。采用RT-PCR法对核酸阳性标本的多聚酶和衣壳蛋白部分区域进行扩增,并对扩增产物进行序列测定。利用在线分型工具和系统进化分析对病原序列进行基因特征分析。结果共计28份标本中分别有5、4、2、5份为GⅡ型诺如病毒核酸阳性,阳性率为57.1%(16/28)。4次疫情各有1份标本测序成功;在线分型和系统进化分支分析显示,4起疫情的病原均为GⅡ.P7-GⅡ.6重组型诺如病毒,但进化分支不同,其中2013年疫情标本检出GⅡ.P7-GⅡ.6c型;2014年2起疫情均为GⅡ.P7-GⅡ.6b型,2019年疫情中检出的GⅡ.P7-GⅡ.6a型。结论GⅡ.P7-GⅡ.6型重组型诺如病毒是引起湖州市2013—2019年4起急性胃肠炎暴发疫情的病原体,每年毒株存在一定基因进化分支的差异。鉴于该病毒在全球范围内具有持续和广泛的流行能力,应进一步加强对该型别重组型诺如病毒的监测。

湖南省2009～2014年分离埃可病毒6型的基因特征分析

为了解中国埃可病毒6型(Echovirus type 6,ECHO6)的基因特征。通过对2009~2014年从湖南省手足口病病例监测中分离到的6株ECHO6病毒部分VP1序列测定,并与来自中国5个省和世界范围的138株ECHO6病毒进行序列对比和构建系统进化树。中国ECHO6病毒形成2个彼此独立的进化分支,分支1和分支2。湖南省ECHO6病毒均聚集在2c亚分支中,可能具有共同的进化来源。分支2病毒在我国分布较广且流行时间较长,可能是我国的优势流行株。以核苷酸差异>30%为分组依据,可将ECHO6病毒划分为4个基因组A^D,以核苷酸差异在15%~30%之间分组,将D基因组再划分为10个基因亚组,D1~D10。湖南省ECHO6病毒均属于D7基因亚型。研究结果显示,2009~2014年期间,湖南省存在着具有共同进化来源的ECHO6病毒流行。中国至少存在4个不同进化分支的ECHO6病毒流行。

人类埃柯病毒6的基因特征分析

目的对来自10个国家和中国4个省不同时间分离的69株ECHO6病毒VP1区基因特征进行分析。方法在GenBank,EMBL和DDBJ 3个基因库中进行BLASTN搜索,共得到69株ECHO6病毒基因可用,用Mega软件计算病毒基因同源性并构建基因进化树。结果 69株ECHO6病毒可分为4个基因型(基因型A～D),C基因型又可分为7个亚型,D基因型可分为8个亚型。不同毒株的核苷酸差异率为10.6%～24.5%(氨基酸差异率为0.8%～7.3%),不同基因型之间的核苷酸差异率为17.6%～22.4%(氨基酸差异率3.5%～6.6%)。结论 ECHO6不同基因型/亚型可以在同一个地区流行很长时间,同一时间内不同的基因型/亚型又可在不同的地区流行,具有明显的时间和地域流行特点。

四川省德阳市埃柯病毒6型的基因特征分析

目的了解四川省德阳市埃柯病毒6型(echovirus 6,E6)的基因特征。方法对2013年德阳市手足口病咽拭子标本的病毒分离阳性株进行核苷酸测序,获取的E6毒株序列与世界各地的E6参考株序列构建进化树并分析基因特征。结果4株E6分离株中,3株VP1区核苷酸序列一致,与另1株仅有1个核苷酸差异。同E6原型株(D'Amori)比较,核苷酸一致性≥77.0%。进化树分析显示,德阳市E6分离株为C2基因亚型,与部分山东分离株聚集在同一进化分支上。结论德阳市E6为C2基因亚型。其中3份标本来自同一地区的不同月份,提示E6在此地持续传播。

昆明市病毒性脑炎病例中埃可病毒6型分离株的VP1编码序列基因特征分析

目的对2010-2014年昆明市病毒性脑炎病例中分离的4株埃可病毒6型(echovirus 6,E6)VP1编码序列特征进行分子流行病学分析。方法对昆明市2010-2014年传染病重大专项脑炎综合征实验室监测系统分离到的4株E6病毒的VP1区基因进行基因扩增和测序;按参考文献下载基因库中E6病毒VP1编码序列参考序列,用MEGA5.1软件计算不同毒株的核苷酸和氨基酸差异率,并构建系统进化树,进行VP1编码序列特征和分子流行病学分析。结果 2010-2014年云南省病毒性脑炎病例中分离到的103份肠道病毒中共检出E6病毒4株,占3.88%(4/103),E6病毒的阳性总检出率为0.29%(4/1 376)。VP1编码序列特征分析表明,云南4株E6毒株均为C2基因亚型(genotype C2)。结论除原型株为A基因型外,其他E6毒株可分为3个基因型(基因型B、C和D),C基因型又分为4个亚型,云南分离株分布在C2基因亚型,且2010年和2011年的云南分离株与部分山东地区的分离株较为接近,而2013年和2014年的云南分离株自成一簇,为云南省特有的亚型,该病毒可能在昆明地区存在小范围流行。

河北省儿童病毒性脑炎和脑膜炎患者埃可病毒6型VP1基因特征分析

目的 阐明河北省儿童病毒性脑炎/脑膜炎患者中埃可病毒6型(Echovirus 6,ECHO6)分离株的基因特征及与国内外其他流行株的进化关系.方法 对河北省2013-2015年间儿童病毒性脑炎/脑膜炎病例中鉴定为肠道病毒阳性的157份脑脊液标本进行毒株分离,通用引物分段扩增毒株VP1基因获得序列;BLAST比对确定ECHO6毒株,并与来自中国9个省和其他国家的175株ECHO6病毒VP1基因序列进行同源性及亲缘关系分析.结果 获得19株ECHO6分离株;我国ECHO6流行株属于C及D基因型,本研究中19株河北分离株分属C及D9c基因亚型.19株分离株间VP1基因核苷酸同源性为79.3％-100％,氨基酸同源性为95.8％-100％,与原型株(D'Amori)核苷酸和氨基酸同源性分别为76.2％-78.3％和92.3％-95.1％.VP1基因的序列分析显示,19株ECHO6分别与我国云南、浙江和山东的ECHO6分离株存在较高核苷酸和氨基酸同源性.结论 2013-2015年间引起河北省儿童病毒性脑炎/脑膜炎的ECHO6病毒流行株主要为C及D9c基因亚型,同时存在多个传播链.

海南省2014-2017年手足口病病原构成及柯萨奇病毒A组6型基因特征分析

目的 分析海南省2014-2017年手足口病(HFMD)流行特征及病原谱构成,阐明海南省流行的柯萨奇病毒A组6型(CV-A6)基因特征。方法 采用描述性流行病学方法分析手足口病流行特征及病原构成变化,利用Sequencher、Bioedit和MEGA软件,结合GenBank数据库中1949-2017年CV-A6序列和本研究的海南省CV-A6毒株序列,构建亲缘性进化树揭示其基因特征。结果 病原监测结果显示:2014-2017年,海南省HFMD实验室诊断2 520例HFMD病例,其中肠道病毒A组71型(EV-A71)895例(35.52%)、柯萨奇病毒A组16型(CV-A16)463例(18.37%)和其他肠道病毒(EV)1 162例(46.11%)。但不同年份和不同月份的优势病原呈现动态变化,除2014年EV-A71为优势病原(占56.00%)外,其余年份均以其他EV为主,各年占比分别为59.04%、33.69%、67.72%;不同病例类型病原构成有明显差异,轻症病例优势病原除2014年为EV-A71 (58.84%)外,其余年份均为其他EV (分别占59.77%、44.66%和78.81%);重症病例中2014和2016年EV-A71为优势病原(分别占85.92%、48.72%),2015和2017年其他EV为优势病原(分别占51.87%、100.00%);死亡病例病原全部为EV-A71。2014-2016年送检标本中未检出CV-A6,故仅分析2017年CV-A6的基因特征:2017年84株肠道病毒阳性标本,经血清型鉴定CV-A640例(占47.62%),提示CV-A6为海南省2017年HFMD中的主要优势病原;海南省CV-A6序列均属于国内流行的D3a进化分支,并与我国其他省份CV-A6毒株共同进化。结论 本研究揭示了2014-2017年海南省HFMD病原谱构成及流行的CV-A6基因型和基因亚型,为海南省HFMD防控策略制定以及是否研制多价手足口病疫苗提供了科学数据。应继续加强海南省HFMD病原谱动态监测。

我国四株埃可病毒6型全基因组序列及重组特征分析

埃可病毒6型(Echovirus 6,ECHO6)作为肠道病毒B组(Enterovirus B,EV-B)的一员,在临床上常导致无菌性脑膜炎(Aseptic meningitis,AM)、急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)、手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)等多种疾病。本文挑选四株中国大陆地区不同年份、地区及疾病严重程度的代表毒株进行全基因组测定分析,与GenBank上ECHO6全长代表株及EV-B组原型株比对分析,了解其进化特征,并筛选BLAST结果的EV-B组流行株,探究我国流行的ECHO6与其他血清型的基因重组特征。结果提示,本研究四株ECHO6毒株在非结构蛋白区与EV-B其他血清型均发生重组,其中死亡病例标本重组模式更为复杂,可能与疾病严重程度有关。通过本研究分析,可进一步揭示ECHO6的遗传特征,为肠道病毒血清型研究提供基础数据,对了解其进化变异及临床致病力影响具有重要意义。