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布鲁氏菌效应蛋白BspH部分生物信息学分析及与其互作宿主蛋白的筛选
1
作者
印双红
张俊波
+6 位作者
孔凯旋
杜昌青
孙馨
李寅翠
张孟琴
王书利
易继海
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第9期938-945,共8页
为分析BspH蛋白的部分分子生物信息学及与其互作的宿主蛋白,本研究通过在线软件Predicting Antigenic Peptides分析BspH蛋白的抗原决定簇、SWISS MODEL预测BspH蛋白的三级结构。委托公司合成BspH基因并构建重组表达质粒pET-B2m-BspH,经...
为分析BspH蛋白的部分分子生物信息学及与其互作的宿主蛋白,本研究通过在线软件Predicting Antigenic Peptides分析BspH蛋白的抗原决定簇、SWISS MODEL预测BspH蛋白的三级结构。委托公司合成BspH基因并构建重组表达质粒pET-B2m-BspH,经酶切和测序鉴定正确后,将pET-B2m-BspH转化BL21(DE3)感受态细胞后经IPTG诱导表达重组BspH蛋白(rBspH),利用镍柱亲和层析法纯化该重组蛋白,并经SDS-PAGE检测。将纯化的rBspH免疫日本大耳兔4次,4免后1周即首免后49 d采血分离血清制备BspH蛋白多克隆抗体(PAb)并经ELISA检测其效价,采用western blot检测该PAb与BspH蛋白的反应性。预测结果显示,BspH蛋白有19个抗原决定簇,三级结构以α-螺旋为主。SDS-PAGE结果显示,在65 ku处出现目的条带,且rBspH主要以包涵体的形式表达,纯化效果较好。ELISA和western blot结果显示,制备的PAb效价为1:1024000,且该PAb可以与纯化的rBspH反应,在65 ku处出现特异性条带。将委托公司构建的重组诱饵质粒pGBKT7-BspH和pGADT7共转化酵母菌感受态细胞,30℃培养3 d~5 d后上述转化的酵母菌在DDO/X培养板上长出蓝色菌落,表明p GBKT7-BspH质粒已转入酵母菌中,且表达了诱饵蛋白BspH;在TDO/X和QDO/X/A培养板上均不生长,且在DDO/X培养板上形成的菌落大小和数量与阴性对照酵母菌基本一致,表明诱饵蛋白BspH在酵母菌中无自激活活性和毒性。在此基础上,将pGBKT7-BspH和小鼠RAW264.7细胞cDNA文库共转化酵母菌Y2H Gold感受态细胞,以表达的BspH作为诱饵蛋白,采用酵母双杂交技术从上述cDNA文库中初步鉴定与BspH存在相互作用的宿主蛋白,结果显示共有28个阳性菌落变蓝,分别提取该28个阳性菌落中的质粒并测序,将测序后的序列在NCBI数据库进行BLASTX比对分析,共得到18种同源性为88.93%~100%并能与BspH蛋白相互作用的宿主蛋白,对其中的5个宿主蛋白进一步经回交验证试验,结果显示,BspH与5个宿主蛋白AKIP1、UBXN1、HSP90AA1、PRC1、PGM1均存在互作。本研究表达并纯化了布鲁氏菌效应蛋白BspH,制备了BspH蛋白的PAb,并筛选到与BspH蛋白互作的5个宿主蛋白,为进一步探究BspH蛋白在布鲁氏菌感染中的功能及其致病机制提供参考依据。
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关键词
布鲁氏菌
效应蛋白
bsph
生物信息学分析
酵母双杂交
互作蛋白
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职称材料
题名
布鲁氏菌效应蛋白BspH部分生物信息学分析及与其互作宿主蛋白的筛选
1
作者
印双红
张俊波
孔凯旋
杜昌青
孙馨
李寅翠
张孟琴
王书利
易继海
机构
铜仁学院大健康学院
铜仁学院农林工程与规划学院
铜仁学院贵州省梵净山地区生物多样性保护与利用重点实验室
商丘师范学院生物与食品学院
石河子大学动物科技学院
出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第9期938-945,共8页
基金
国家自然科学基金项目(82160391)
贵州省省级科技计划项目(黔科合基础-ZK[2021]一般078)
+4 种基金
铜仁市科技局项目(铜市科研[2022]67号、铜市科研[2023]39号、铜市科研[2024]6号)
贵州省大学生创新创业训练计划项目(S202310665003、S202310665004)
贵州省高层次创新人才培养项目(2024-(2022)-054
贵州省高层次创新人才培养项目2018-(2016)-022)
贵州省重点实验室项目(黔科合平台人才[2020]2003)。
文摘
为分析BspH蛋白的部分分子生物信息学及与其互作的宿主蛋白,本研究通过在线软件Predicting Antigenic Peptides分析BspH蛋白的抗原决定簇、SWISS MODEL预测BspH蛋白的三级结构。委托公司合成BspH基因并构建重组表达质粒pET-B2m-BspH,经酶切和测序鉴定正确后,将pET-B2m-BspH转化BL21(DE3)感受态细胞后经IPTG诱导表达重组BspH蛋白(rBspH),利用镍柱亲和层析法纯化该重组蛋白,并经SDS-PAGE检测。将纯化的rBspH免疫日本大耳兔4次,4免后1周即首免后49 d采血分离血清制备BspH蛋白多克隆抗体(PAb)并经ELISA检测其效价,采用western blot检测该PAb与BspH蛋白的反应性。预测结果显示,BspH蛋白有19个抗原决定簇,三级结构以α-螺旋为主。SDS-PAGE结果显示,在65 ku处出现目的条带,且rBspH主要以包涵体的形式表达,纯化效果较好。ELISA和western blot结果显示,制备的PAb效价为1:1024000,且该PAb可以与纯化的rBspH反应,在65 ku处出现特异性条带。将委托公司构建的重组诱饵质粒pGBKT7-BspH和pGADT7共转化酵母菌感受态细胞,30℃培养3 d~5 d后上述转化的酵母菌在DDO/X培养板上长出蓝色菌落,表明p GBKT7-BspH质粒已转入酵母菌中,且表达了诱饵蛋白BspH;在TDO/X和QDO/X/A培养板上均不生长,且在DDO/X培养板上形成的菌落大小和数量与阴性对照酵母菌基本一致,表明诱饵蛋白BspH在酵母菌中无自激活活性和毒性。在此基础上,将pGBKT7-BspH和小鼠RAW264.7细胞cDNA文库共转化酵母菌Y2H Gold感受态细胞,以表达的BspH作为诱饵蛋白,采用酵母双杂交技术从上述cDNA文库中初步鉴定与BspH存在相互作用的宿主蛋白,结果显示共有28个阳性菌落变蓝,分别提取该28个阳性菌落中的质粒并测序,将测序后的序列在NCBI数据库进行BLASTX比对分析,共得到18种同源性为88.93%~100%并能与BspH蛋白相互作用的宿主蛋白,对其中的5个宿主蛋白进一步经回交验证试验,结果显示,BspH与5个宿主蛋白AKIP1、UBXN1、HSP90AA1、PRC1、PGM1均存在互作。本研究表达并纯化了布鲁氏菌效应蛋白BspH,制备了BspH蛋白的PAb,并筛选到与BspH蛋白互作的5个宿主蛋白,为进一步探究BspH蛋白在布鲁氏菌感染中的功能及其致病机制提供参考依据。
关键词
布鲁氏菌
效应蛋白
bsph
生物信息学分析
酵母双杂交
互作蛋白
Keywords
Brucella
effector protein bsph
bioinformatics analysis
yeast two-hybrid
interacting
protein
分类号
S852.61 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
布鲁氏菌效应蛋白BspH部分生物信息学分析及与其互作宿主蛋白的筛选
印双红
张俊波
孔凯旋
杜昌青
孙馨
李寅翠
张孟琴
王书利
易继海
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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