猪源肠毒素性大肠杆菌菌毛基因多重PCR检测方法的建立

为了对猪源产肠毒素性大肠杆菌(ETEC)的4种主要菌毛(K 88、K 99、F 41和987p)进行快速检测和分型,建立了检测4种菌毛的多重PCR方法。首先设计合成4对4种菌毛特异性的引物,然后用4种菌毛参考ETEC菌株优化了多重PCR方法。该方法对K 88、K 99、F 41和987p 4种菌毛的扩增产物分别为201,314,380和459 bp。对4种扩增产物分别进行酶切鉴定,结果均得到与预期一致的2个片段。对各个参考菌株不同组合的检测结果为100%符合。结果表明,该多重PCR方法具有很好的特异性和敏感性,可用于ETEC性腹泻的辅助诊断及ETEC菌毛抗原分型检测。

猪大肠埃希菌肠毒素基因的多重PCR检测

以产肠毒素性大肠埃希菌(Enterotoxigenic Escherichia coli,ETEC)耐热肠毒素(STa、STb)基因和不耐热肠毒素(LT)基因保守序列为靶序列,设计合成了3对可扩增目的片段为182、108和336 bp的引物,建立了检测ETEC耐热肠毒素基因和不耐热肠毒素基因的多重PCR方法.该方法对肠出血性大肠埃希菌(EHEC)EDL933、猪链球菌Streptcoccus、鼠伤寒沙门氏杆菌Salmonella typhimrium和猪肺疫巴氏杆菌Pasteurella pneumotropic的检测结果均为阴性,并且能检测到102cfu/mL稀释度的标准菌.对11株分离自广东佛山地区腹泻仔猪的待检菌株进行检测,结果为:含STa基因的菌株为5株;含STb基因为2株;含LT基因为3株,其中2株同时具有STb和LT基因.结果表明:该方法的特异性和敏感性较高,可用于ETEC的临床快速诊断和流行病学调查.

猪源产肠毒素大肠杆菌菌毛基因多重PCR检测方法的建立及初步应用

为建立一种可同时快速准确检测5种菌毛类型的产肠毒素大肠杆菌(ETEC)的多重PCR方法,本研究首先通过大肠杆菌特异性基因uidA的PCR方法鉴定大肠杆菌;选取国内外流行的携带K88、K99、F18ab、F18ac和F41菌毛基因的ETEC菌株,根据这5种菌毛基因的保守序列设计5对特异性引物,通过对反应条件的优化,建立了能同时检测上述5种菌毛ETEC的多重PCR方法。uidA基因的PCR结果显示,除了大肠杆菌有特异性扩增外,其他细菌均不能扩增,可以用于大肠杆菌的鉴定。菌毛多重PCR优化后的反应条件为:各混合菌毛基因引物终浓度为3.2μmol/L,各大肠杆菌混合DNA模板浓度为2.5×107拷贝/μL,退火温度为58℃;特异性试验结果显示,该多重PCR方法能够特异性扩增5种ETEC的菌毛基因,而猪源沙门氏菌、猪源链球菌和大肠杆菌DH5α未见扩增,特异性强;敏感性试验结果显示,该方法对携带5种菌毛的大肠杆菌基因组DNA的最低检测量均为2.5×104拷贝/μL,敏感性较高。采用uidA基因的PCR方法检测了河北省腹泻致死仔猪脏器分离的101株细菌,结果均为大肠杆菌。采用该多重PCR方法和单一PCR方法分别检测这101株大肠杆菌的菌毛类型,结果显示二者的符合率为100%;检测结果还显示,河北省仔猪腹泻大多数为携带3种及3种以上菌毛的ETEC混合感染所致,且ETEC携带的优势菌毛类型为K88、K99、F18ab和F41。综上所述,本研究为猪源ETEC菌毛分型及该病的临床诊断、流行病学调查提供了快速准确的鉴定方法。

大肠杆菌菌毛基因多重PCR检测方法的建立与初步应用

为建立一种可以同时扩增大肠杆菌(E.coli)F4、F5、F6、F41和F18菌毛基因保守序列的多重PCR检测方法,本研究设计合成5对分别针对F4、F5、F6、F41和F18菌毛基因的特异性引物,以具有相应菌毛基因的E.coli参考菌株DNA为模板,通过对多重PCR反应条件的优化,建立了检测F4、F5、F6、F41和F18菌毛基因的多重PCR方法。所建立的多重PCR方法能够特异性扩增F4、F5、F6、F41、F18菌毛基因的目的片段,大小分别为770 bp、533 bp、422 bp、643 bp和1140 bp,该方法对沙门氏菌、猪丹毒杆菌、巴氏杆菌以及无菌毛基因的E.coli等参考菌株均无特异性扩增片段,检出F4、F5、F6、F41和F18菌毛基因的最低活菌浓度分别为5.3×10^5cfu/mL、3.7×10^6cfu/mL、3.1×10^5cfu/mL、3.7×10^7cfu/mL、6.9×10^5cfu/mL。用不同批次的引物和试剂进行3次多重PCR检测均能扩增出目的条带,表明建立的多重PCR方法有很好的批内和批间重复性。对90株大肠杆菌临床分离菌株菌毛基因进行检测,F4阳性率为3.33%,F5阳性率为2.22%,未检测到F6、F41和F18阳性菌株,其检测结果与常规单一PCR的检测结果一致。研究表明:建立的E.coli菌毛基因多重PCR分型方法具有很好的特异性、敏感性和重复性,可用于E.coli分离菌株菌毛基因型的快速鉴定,同时提高了检测效率。