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可溶性环氧化物水解酶2基因与中国汉族人群非综合征型唇腭裂的关联研究 被引量:2
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作者 杨梦夕 王艺儒 +3 位作者 殷斌 郑谦 石冰 贾仲林 《华西口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期279-284,共6页
目的探究可溶性环氧化物水解酶2基因(EPHX2)的遗传变异位点与中国汉族人群非综合征型唇腭裂(NSCL/P)的相关性。方法本研究以159个中国汉族NSCL/P患者作为研究对象,对EPHX2基因区域开展了目标区域捕获测序,更全面地检测了EPHX2基因区域... 目的探究可溶性环氧化物水解酶2基因(EPHX2)的遗传变异位点与中国汉族人群非综合征型唇腭裂(NSCL/P)的相关性。方法本研究以159个中国汉族NSCL/P患者作为研究对象,对EPHX2基因区域开展了目标区域捕获测序,更全面地检测了EPHX2基因区域的遗传变异位点。以诺禾致源基因数据库的542名中国汉族健康人的全基因组测序数据作为对照,进行常见变异位点关联分析和针对罕见变异位点的负荷分析。结果在中国汉族人群NSCL/P的关联分析中发现,rs57699806的差异具有统计学意义(P=0.00013,OR=2.849,95%CI:1.691~4.800),其次为rs4732723(P=0.00650,OR=0.662,95%CI:0.491~0.892),rs7829267(P=0.00920,OR=1.496,95%CI:1.117~2.005),rs721619(P=0.01100,OR=1.474,95%CI:1.098~1.980)和rs7816586(P=0.04000,OR=1.310,95%CI:1.015~1.691)。其中rs4732723的C等位基因可能具有保护作用,而其他4个单核苷酸多态性位点的参考等位基因均可能增加NSCL/P的发生风险。罕见变异负荷分析2组差异无统计学意义(P>0.05)。结论本研究发现,EPHX2基因的5个单核苷酸多态性位rs57699806、rs4732723、rs7829267、rs721619和rs7816586与中国汉族人群NSCL/P的发生密切相关,其中rs57699806、rs4732723、rs7829267和rs7816586为新发现的易感位点。 展开更多
关键词 目标区域捕获测序 单核苷酸多态性 可溶性环氧化物水解酶2基因 非综合征型唇腭裂
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环氧化物水解酶2在肝细胞癌中的表达水平与功能作用 被引量:1
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作者 张文桃 胡艳芬 +4 位作者 吴昊 刘铭 李莉 杜根来 朱剑军 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期505-514,共10页
本研究通过公共数据和实验数据,全面分析环氧化物水解酶2(epoxide hydrolase 2,EPHX2)在肝细胞癌中的表达情况、功能作用以及预后意义。利用GEO和MitoCarta数据集,筛选肝细胞癌中呈差异表达的线粒体相关基因;利用TCGA数据库分析EPHX2及... 本研究通过公共数据和实验数据,全面分析环氧化物水解酶2(epoxide hydrolase 2,EPHX2)在肝细胞癌中的表达情况、功能作用以及预后意义。利用GEO和MitoCarta数据集,筛选肝细胞癌中呈差异表达的线粒体相关基因;利用TCGA数据库分析EPHX2及其相关基因在肝细胞癌中的表达水平;运行R包绘制Kaplan-Meier生存曲线和功能富集分析;基于STRING和GSEA构建蛋白质互作网络和基因集富集分析;荧光定量PCR和GEO数据集验证EPHX2在肝细胞癌中的表达水平。本研究共筛选得到15个在肝细胞癌中呈差异表达的线粒体相关基因。EPHX2在肝细胞癌组织中的表达水平显著降低(P<0.01)。EPHX2表达水平与肝癌患者性别、分期和级别有关,而与年龄、T分期等因素无关。与EPHX2低表达组肝癌患者相比,EPHX2高表达组肝癌患者预后较好。功能富集结果显示,EPHX2与补体途径、脂肪酸降解等信号通路有关。蛋白质互作网络结果显示,EPHX2与HAO1、AGXT、ACOX1、GSTκ1、SCP-2、CAT、CYP2C8,CYP2C9,CYP2B6,和CYP2J2等密切相关。GSEA结果显示,EPHX2低表达组与肝癌细胞增殖、肝癌复发等基因集正相关。荧光定量PCR和GEO数据集验证结果显示,EPHX2在肝细胞癌组织和肝癌细胞株中呈显著低表达。EPHX2在肝细胞癌中呈显著低表达,提示其可能在肝细胞癌发生发展过程中发挥抑癌基因作用,但具体作用机制还需进一步验证。 展开更多
关键词 肝细胞癌 环氧化物水解酶2 公共数据库
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CYP1A1,CYP2E1 and EPHX1 polymorphisms in sporadic colorectal neoplasms 被引量:2
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作者 Glaucia Maria M Fernandes Anelise Russo +7 位作者 Marcela Alcantara Proenca Nathalia Fernanda Gazola Gabriela Helena Rodrigues Patrícia Matos Biselli-Chicote Ana Elizabete Silva Joao Gomes Netinho érika Cristina Pavarino Eny Maria Goloni-Bertollo 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2016年第45期9974-9983,共10页
AIM To investigate the contribution of polymorphisms in the CYP1A1, CYP2E1 and EPHX1 genes on sporadic colorectal cancer(SCRC) risk. METHODS Six hundred forty-one individuals(227 patients with SCRC and 400 controls) w... AIM To investigate the contribution of polymorphisms in the CYP1A1, CYP2E1 and EPHX1 genes on sporadic colorectal cancer(SCRC) risk. METHODS Six hundred forty-one individuals(227 patients with SCRC and 400 controls) were enrolled in the study. The variables analyzed were age, gender, tobacco and alcohol consumption, and clinical and histopathological tumor parameters. The CYP1A1 *2A, CYP1A1 *2C CYP2E1 *5B and CYP2E1 *6 polymorphisms were analyzed by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism(PCR-RFLP). The EPHX1 Tyr113 His, EPHX1 His139 Arg and CYP1A1 *2C polymorphisms were detected by real-time PCR. Chisquared test and binary logistic regression were used in the statistical analysis. Haplotype analysis was conducted using the Haploview program, version 2.05.RESULTS Age over 6 2 years was a risk factor for SCRC development(OR = 7.54, 95%CI: 4.94-11.50, P < 0.01). Male individuals were less susceptible to SCRC(OR = 0.55, 95%CI: 0.35-0.85, P < 0.01). The CYP2E1*5B polymorphism was associated with SCRC in the codominant(heterozygous genotype: OR = 2.66, 95%CI: 1.64-4.32, P < 0.01), dominant(OR = 2.82, 95%CI: 1.74-4.55, P < 0.01), overdominant(OR = 2.58, 95%CI: 1.59-4.19, P < 0.01), and log-additive models(OR = 2.84, 95%CI: 1.78-4.52, P < 0.01). The CYP2E1*6 polymorphism was associated with an increased SCRC risk in codominant(heterozygous genotype: OR = 2.81, 95%CI: 1.84-4.28, P < 0.01; homozygous polymorphic : OR = 7. 3 2, 9 5 % C I : 1.85-28.96, P < 0.01), dominant(OR = 2.97, 95%CI: 1.97-4.50, P < 0.01), recessive(OR = 5.26, 95%CI: 1.35-20.50, P = 0.016), overdominant(OR = 2.64, 95%CI: 1.74-4.01, P < 0.01), and log-additive models(OR = 2.78, 95%CI: 1.91-4.06, P < 0.01). The haplotype formed by the minor alleles of the CYP2E1*5B(C) and CYP2E1*6(A) polymorphisms was associated with SCRC(P = 0.002). However, the CYP1A1 *2A, CYP1A1 *2C, EPHX1 Tyr113 His and EPHX1 His139 Arg polymorphisms were not associated with SCRC.CONCLUSION In conclusion, the results demonstrated that CYP2E1*5B and CYP2E1*6 minor alleles play a role in the development of SCRC. 展开更多
关键词 Single-nucleotide polymorphisms Colorectal neoplasms Cytochrome P-450 CYP2E1 Cytochrome P-450 CYP1A1 epoxide hydrolases 1
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基于生物信息学及体外实验研究大黄素治疗胰腺癌的靶点
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作者 卢洁霞 谢春晓 +3 位作者 陈凤平 韦大福 姜海行 覃山羽 《广西医科大学学报》 CAS 2023年第12期1964-1971,共8页
目的:运用生物信息学及细胞实验方法研究大黄素治疗胰腺癌的靶点。方法:从基因表达综合数据库(GEO)获取胰腺癌转录组数据集GSE62452、GSE28753,通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)以及PharmMapper Server协同分析获得大黄素作... 目的:运用生物信息学及细胞实验方法研究大黄素治疗胰腺癌的靶点。方法:从基因表达综合数据库(GEO)获取胰腺癌转录组数据集GSE62452、GSE28753,通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)以及PharmMapper Server协同分析获得大黄素作用靶点,将两者靶基因进行交叉筛选,获得大黄素在胰腺癌中的潜在靶点基因。通过DAVID数据库对靶点基因做KEGG、GO功能富集分析,通过GEPIA数据库对潜在靶点基因做差异表达和生存分析。体外培养胰腺癌细胞,CCK-8法检测不同浓度大黄素对胰腺癌细胞增殖的影响。将细胞分为正常对照组和不同浓度大黄素组,实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测纤溶酶原激活剂(PLAU)、酪氨酸激酶受体(MET)、环氧化物水解酶2(EPHX2)、基质金属肽酶1(MMP1)mRNA表达,west-ern blotting检测EPHX2蛋白表达。结果:获得大黄素和胰腺癌17个共同靶点基因。功能富集分析显示,靶基因主要富集在细胞外空隙、细胞外来体、丝氨酸内切酶活性、蛋白质水解、钙离子结合等通路。差异表达分析显示:胰腺癌组织与正常组织MMP1、EPHX2、PLAU、MET基因表达比较,差异有统计学意义(P<0.05),生存分析显示,MMP1、EPHX2、PLAU、MET、TTR基因在胰腺癌中低表达组与高表达组之间差异具有统计学意义(P<0.05)。体外实验结果显示,随着大黄素浓度的增加,胰腺癌细胞存活率降低(P<0.05)。与正常对照组相比,20μmol/L和40μmol/L大黄素组PLAU、MMP1、MET、EPHX2 mRNA表达水平升高,EPHX2蛋白表达水平升高(均P<0.05)。结论:EPHX2可能是大黄素治疗胰腺癌的潜在靶点。 展开更多
关键词 大黄素 胰腺癌 环氧化物水解酶2 生物信息学
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有机溶剂/缓冲液双相体系中绿豆环氧化物水解酶催化环氧苯乙烯不对称水解反应 被引量:6
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作者 陈文静 娄文勇 +1 位作者 王晓婷 宗敏华 《催化学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2011年第9期1557-1563,共7页
研究了有机溶剂/缓冲液双相体系中绿豆环氧化物水解酶高立体选择性地催化外消旋环氧苯乙烯水解生成(R)-苯基乙二醇反应.结果表明,与单水相反应体系相比,有机溶剂/缓冲液双相反应体系不仅有效地抑制环氧苯乙烯的非酶水解反应,而且明显提... 研究了有机溶剂/缓冲液双相体系中绿豆环氧化物水解酶高立体选择性地催化外消旋环氧苯乙烯水解生成(R)-苯基乙二醇反应.结果表明,与单水相反应体系相比,有机溶剂/缓冲液双相反应体系不仅有效地抑制环氧苯乙烯的非酶水解反应,而且明显提高底物的浓度,产物的收率和ee值更高.在所考察的不同有机溶剂中,正己烷不仅能较好地溶解底物,而且对酶的毒性较小,从而导致反应的初速率较快,产物的收率和ee值较高,是最适宜有机相.在两相体积比(正己烷/缓冲液)为1:1,底物浓度为20mmol/L,缓冲液pH=6.5以及35oC的最适反应条件下,反应的初速率、产物的收率和ee值分别为5.42mmol/(L·h),49.2%和94.3%. 展开更多
关键词 绿豆环氧化物水解酶 环氧苯乙烯 (R)-苯基乙二醇 有机溶剂/缓冲液双相体系 不对称水解
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甘油原料转化生产手性环氧氯丙烷关键酶的开发 被引量:3
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作者 张晓健 郑裕国 《生物产业技术》 2017年第6期65-72,共8页
手性环氧氯丙烷是一种重要的三碳手性合成子,在医药、农药、化工、材料等领域有着广泛的应用。开发以甘油替代石油基原料合成手性环氧氯丙烷的绿色合成工艺具有重要的开发价值。生物催化技术可有效提高过程安全性与原子经济性,降低"... 手性环氧氯丙烷是一种重要的三碳手性合成子,在医药、农药、化工、材料等领域有着广泛的应用。开发以甘油替代石油基原料合成手性环氧氯丙烷的绿色合成工艺具有重要的开发价值。生物催化技术可有效提高过程安全性与原子经济性,降低"三废"排放,提升产品质量。阐述了生物催化合成手性环氧氯丙烷关键酶技术的研究进展,进行了生物合成路线设计、卤化酶酶库构建、卤醇脱卤酶与环氧化物水解酶的筛选与改造、卤醇脱卤酶/环氧化物水解酶双酶串联合成手性环氧氯丙烷工艺构建等技术开发,为手性环氧氯丙烷绿色生物合成技术的研究与应用提供理论基础与技术支持。 展开更多
关键词 甘油 手性环氧氯丙烷 1 3-二氯-2-丙醇 生物催化 卤醇脱卤酶 环氧化物水解酶
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可溶性环氧化酶水解酶抑制剂-1471预防2型糖尿病小鼠胰岛β细胞凋亡的机制
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作者 张洁 万静 +3 位作者 王海蓉 廖宇峰 熊世熙 汪道文 《武汉大学学报(医学版)》 CAS 2017年第2期216-220,共5页
目的:探讨可溶性环氧化酶水解酶抑制剂-1471(sEHI-1471)预防2型糖尿病小鼠胰岛β细胞凋亡的作用及其机制。方法:2型糖尿病KKAy小鼠随机分为2组:sEHI-1471组(18只)及对照组(18只),分别饮用含8mg/L的sEHI-1471或等体积生理盐水的饮用水,... 目的:探讨可溶性环氧化酶水解酶抑制剂-1471(sEHI-1471)预防2型糖尿病小鼠胰岛β细胞凋亡的作用及其机制。方法:2型糖尿病KKAy小鼠随机分为2组:sEHI-1471组(18只)及对照组(18只),分别饮用含8mg/L的sEHI-1471或等体积生理盐水的饮用水,将同周龄的雄性C57BL/6J小鼠设为正常组,饮水不受干预。比较各组小鼠空腹血糖(FBG)和空腹胰岛素水平(FINS),计算胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)。TUNEL检测胰岛β细胞凋亡。Western Blot检测胰腺组织Bcl-2,Bcl-xL,Bim,Bax和Bid表达水平。结果:干预3周后,与正常组相比,对照组FBG、FINS和HOMA-IR指数均显著升高(P<0.05);与对照组相比,sEHI-1471组小鼠FBG、FINS和HOMA-IR指数均显著降低(P<0.05);比较各组凋亡变化的结果,对照组较正常组胰岛β细胞凋亡数显著增加(P<0.05),sEHI-1471组较对照组凋亡细胞数明显下降(P<0.05)。比较各组小鼠胰腺抗凋亡蛋白Bcl-2,Bcl-xL和促凋亡蛋白Bax,Bim,Bid表达水平,对照组相对于正常组Bcl-2,Bcl-xL表达明显降低,Bax,Bim和Bid表达明显升高,而相对于对照组,sEHI-1471组Bax,Bim和Bid表达明显降低,Bcl-2和Bcl-xL表达明显升高(P<0.05)。结论:sEHI-1471能降低血糖,增加糖尿病小鼠对胰岛素的敏感性,减少KKAy小鼠胰岛β细胞凋亡,其机制可能与降低促凋亡蛋白Bax,Bim,Bid表达和增加抗凋亡蛋白Bcl-2和Bcl-xL表达有关。 展开更多
关键词 可溶性环氧化酶水解酶抑制剂 2型糖尿病 凋亡 胰岛Β细胞
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