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大口鳒线粒体DNA控制区结构和鲽形目鱼类的系统进化初步研究
被引量:
5
1
作者
张艳春
孔晓瑜
王忠明
《热带海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第6期71-78,共8页
测定大口鳒Psettodes erumei线粒体控制区全序列,并与其他7种鲽形目鱼类控制区结构进行比较分析。结果表明,大口鳒线粒体控制区全长大约1601bp,5’端和3’端分别存在56bp和8bp的串联重复序列。除此之外,其控制区结构和其他种类相似,分...
测定大口鳒Psettodes erumei线粒体控制区全序列,并与其他7种鲽形目鱼类控制区结构进行比较分析。结果表明,大口鳒线粒体控制区全长大约1601bp,5’端和3’端分别存在56bp和8bp的串联重复序列。除此之外,其控制区结构和其他种类相似,分为终止相关序列区(TAS)、中央保守区(CSB-D、CSB-E、CSB-F)、保守序列区(CSB-1、CSB-2、CSB-3),同时在CSB-D后还识别出鲽形目保守的Poly-T结构。比较了8种鲽形目鱼类控制区全序列和去除重复序列后控制区序列的碱基组成变化,结果显示前者的种间差异明显大于后者,变异系数约是后者的两倍。这种差异主要是由于重复序列的异质性如长度及其拷贝数不同、碱基组成不同所造成的。基于控制区部分序列对鲽形目12种鱼类进行系统分析,结果显示,在鲽形目内部大口鳒分类地位最原始;鲽亚目先与鳎亚目聚在一起,后与鳒亚目聚在一起,这个结果与基于形态特征的系统关系相符。
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关键词
线粒体DNA
控制区
大口鳒Psettodes
erumei
系统发生
鲽形目
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职称材料
题名
大口鳒线粒体DNA控制区结构和鲽形目鱼类的系统进化初步研究
被引量:
5
1
作者
张艳春
孔晓瑜
王忠明
机构
中国海洋大学教育部海水养殖研究重点实验室
中国科学院南海海洋研究所海洋生物资源可持续利用重点实验室/热带海洋生物标本馆
出处
《热带海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第6期71-78,共8页
基金
国家自然科学基金项目(30870283)
文摘
测定大口鳒Psettodes erumei线粒体控制区全序列,并与其他7种鲽形目鱼类控制区结构进行比较分析。结果表明,大口鳒线粒体控制区全长大约1601bp,5’端和3’端分别存在56bp和8bp的串联重复序列。除此之外,其控制区结构和其他种类相似,分为终止相关序列区(TAS)、中央保守区(CSB-D、CSB-E、CSB-F)、保守序列区(CSB-1、CSB-2、CSB-3),同时在CSB-D后还识别出鲽形目保守的Poly-T结构。比较了8种鲽形目鱼类控制区全序列和去除重复序列后控制区序列的碱基组成变化,结果显示前者的种间差异明显大于后者,变异系数约是后者的两倍。这种差异主要是由于重复序列的异质性如长度及其拷贝数不同、碱基组成不同所造成的。基于控制区部分序列对鲽形目12种鱼类进行系统分析,结果显示,在鲽形目内部大口鳒分类地位最原始;鲽亚目先与鳎亚目聚在一起,后与鳒亚目聚在一起,这个结果与基于形态特征的系统关系相符。
关键词
线粒体DNA
控制区
大口鳒Psettodes
erumei
系统发生
鲽形目
Keywords
mitochondrial DNA
control region
Psettodes
erumei
phylogenesis
Pleuronectiformes
分类号
Q178.53 [生物学—水生生物学]
Q953 [生物学—动物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大口鳒线粒体DNA控制区结构和鲽形目鱼类的系统进化初步研究
张艳春
孔晓瑜
王忠明
《热带海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
5
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