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基于网络药理学和分子对接探讨痛风舒片治疗痛风的作用机制
被引量:
6
1
作者
王海坤
苏丹
+1 位作者
吴娜
张玉慧
《现代药物与临床》
CAS
2022年第5期952-960,共9页
目的采用网络药理学和分子对接探讨痛风舒片治疗痛风的潜在作用机制。方法检索中药系统药理学分析平台挖掘痛风舒片关键成分和对应靶点;检索PharmGKB、GeneCards、OMIM、TTD、DrugBank数据库,筛选痛风疾病靶点,使用R软件Venn包,获取痛...
目的采用网络药理学和分子对接探讨痛风舒片治疗痛风的潜在作用机制。方法检索中药系统药理学分析平台挖掘痛风舒片关键成分和对应靶点;检索PharmGKB、GeneCards、OMIM、TTD、DrugBank数据库,筛选痛风疾病靶点,使用R软件Venn包,获取痛风舒片与痛风的交集靶点基因。使用Cytoscape 3.8.0软件构建“中药复方成分–靶点”网络图并筛选药物核心成分;使用String平台获取交集靶点基因的蛋白互作(PPI)网络,并使用Cytoscape 3.8.0软件筛选核心靶点基因。应用R软件对交集靶点基因进行GO功能和KEGG通路富集分析,应用AutoDock Vina软件进行分子对接。结果共挖掘出痛风舒片关键成分38种,对应靶点164个,痛风疾病靶点1554个,二者交集靶点基因66个。筛选出核心成分6种(槲皮素、β-谷甾醇、芦荟大黄素、高车前素、泽兰黄醇素、海波拉亭),核心靶点基因6种[V-rel网状内皮细胞过多症病毒癌基因同源物A(RELA)、白细胞介素-1β(IL-1β)、蛋白激酶B1(AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、NF-κB抑制因子α(NFKBIA)、肿瘤蛋白p53(TP53)]。GO功能共富集1963个条目,其中生物过程1830个(涉及对脂多糖的反应等),细胞组分27个(涉及膜筏等),分子功能106个(涉及磷酸酶结合等);KEGG通路共富集154个条目,如白细胞介素(IL)-17、肿瘤坏死因子(TNF)等信号通路。所有核心成分与核心靶点蛋白的结合能均<−5 kcal/mol,大部分结合能<−7 kcal/mol。结论痛风舒片中核心成分槲皮素、β-谷甾醇、芦荟大黄素等可通过作用于RELA、IL-1β、AKT1等核心靶点基因,对IL-17、TNF等信号通路进行调控,从而发挥治疗痛风的作用。
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关键词
痛风舒片
痛风
网络药理学
分子对接
槲皮素、β-谷甾醇、芦荟大黄素、高车前素、泽兰黄醇素、海波拉亭
原文传递
题名
基于网络药理学和分子对接探讨痛风舒片治疗痛风的作用机制
被引量:
6
1
作者
王海坤
苏丹
吴娜
张玉慧
机构
亳州市人民医院药学部
中国科学技术大学附属第一医院安徽省立医院药剂科
亳州市人民医院风湿免疫科
出处
《现代药物与临床》
CAS
2022年第5期952-960,共9页
基金
亳州市重点研发计划项目(bzzc2020020)。
文摘
目的采用网络药理学和分子对接探讨痛风舒片治疗痛风的潜在作用机制。方法检索中药系统药理学分析平台挖掘痛风舒片关键成分和对应靶点;检索PharmGKB、GeneCards、OMIM、TTD、DrugBank数据库,筛选痛风疾病靶点,使用R软件Venn包,获取痛风舒片与痛风的交集靶点基因。使用Cytoscape 3.8.0软件构建“中药复方成分–靶点”网络图并筛选药物核心成分;使用String平台获取交集靶点基因的蛋白互作(PPI)网络,并使用Cytoscape 3.8.0软件筛选核心靶点基因。应用R软件对交集靶点基因进行GO功能和KEGG通路富集分析,应用AutoDock Vina软件进行分子对接。结果共挖掘出痛风舒片关键成分38种,对应靶点164个,痛风疾病靶点1554个,二者交集靶点基因66个。筛选出核心成分6种(槲皮素、β-谷甾醇、芦荟大黄素、高车前素、泽兰黄醇素、海波拉亭),核心靶点基因6种[V-rel网状内皮细胞过多症病毒癌基因同源物A(RELA)、白细胞介素-1β(IL-1β)、蛋白激酶B1(AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、NF-κB抑制因子α(NFKBIA)、肿瘤蛋白p53(TP53)]。GO功能共富集1963个条目,其中生物过程1830个(涉及对脂多糖的反应等),细胞组分27个(涉及膜筏等),分子功能106个(涉及磷酸酶结合等);KEGG通路共富集154个条目,如白细胞介素(IL)-17、肿瘤坏死因子(TNF)等信号通路。所有核心成分与核心靶点蛋白的结合能均<−5 kcal/mol,大部分结合能<−7 kcal/mol。结论痛风舒片中核心成分槲皮素、β-谷甾醇、芦荟大黄素等可通过作用于RELA、IL-1β、AKT1等核心靶点基因,对IL-17、TNF等信号通路进行调控,从而发挥治疗痛风的作用。
关键词
痛风舒片
痛风
网络药理学
分子对接
槲皮素、β-谷甾醇、芦荟大黄素、高车前素、泽兰黄醇素、海波拉亭
Keywords
Tongfengshu Tablets
gout
network pharmacology
molecular docking
quercetin
β-sitosterol
aloe-emodin
dinatin
eupatin
hypolaetin
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学和分子对接探讨痛风舒片治疗痛风的作用机制
王海坤
苏丹
吴娜
张玉慧
《现代药物与临床》
CAS
2022
6
原文传递
已选择
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引证文献
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