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Cloning and expression analysis of a homologous expansin gene EXP2 in Picea wilsonii 被引量:1
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作者 Tong Zhang Yanfang Li +1 位作者 Yanni Zhou Lingyun Zhang 《Journal of Forestry Research》 SCIE CAS CSCD 2016年第2期247-255,共9页
Expansins are cell-wall-loosening proteins that have multiple roles during plant development and stress- related processes. In this study, a novel expansin gene PwEXP2 was cloned by rapid amplification of cDNA ends ba... Expansins are cell-wall-loosening proteins that have multiple roles during plant development and stress- related processes. In this study, a novel expansin gene PwEXP2 was cloned by rapid amplification of cDNA ends based on the cDNA library of Picea wilsonii and EST fragment of PwEXP2. It was found that PwEXP2 coded 253 amino acids, and putative signal peptides exist at the N-terminal, followed by 8 cysteines, a HFD (His-Phe-Asp) conserved domain, and 4 tryptophan residues at the C-terminal. PwEXP2 was located in cytoplasm and nucleus when transformed in an onion epidermal cell. Quantitative real-time PCR assays showed that PwEXP2 was expressed in various tissues with a relatively high level in needles and low level in mature pollen. The expression level of PwEXP2 dramatically increased after seed germination. Gene expression profiles in abiotic stresses showed that PwEXP2 was induced by high temperature and osmotic stress but not involved in ABA-dependent signaling path- way. These results display the important roles of the PwEXP2 in plant development and multiple adversity stresses. 展开更多
关键词 expansin Picea wilsonii Stress response gene expression
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Expansin Genes Expressed Differentially in Peduncle Elongation of Near-Isogenic Wheat Rht Lines
2
作者 WANG Jia-li LIU Dong-cheng +2 位作者 GUO Xiao-li YANG Wen-long ZHANG Ai-min 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2014年第10期2091-2101,共11页
The introduction of reduced height (Rht) genes Rht-Blb and Rht-Dlb led to impressive increases in wheat (Triticum aestivum L.) yields during the Green Revolution. In the present study, the dynamic elongation of pe... The introduction of reduced height (Rht) genes Rht-Blb and Rht-Dlb led to impressive increases in wheat (Triticum aestivum L.) yields during the Green Revolution. In the present study, the dynamic elongation of peduncle in a set ofnear-isogenic lines (NILs) carrying different Rht alleles (Rht-Blb, Rht-Dlb, Rht-Blc, Rht-Dlb+Rht-Blb, and Rht-Dlb+Rht-Blc) were investigated. The reduction of the final length of peduncle in NILs was dependent mainly on the elongation rate, which was reduced by Rht genes, during rapid elongation phase. Resin sections showed that Rht genes strongly reduced the cell extension in peduncle. The expression of expansin genes, which mediate cell wall loosening and leading to cell expansion, were analysed by using real- time quantitative PCR (qPCR). Among the 23 possible wheat expansin genes, 17 were expressed in the peduncle. The spatial distribution of expression was further analysed for five expansins that showed high expression levels in the peduncles of Rht lines. Compared to wild type plants, the incorporation of Rht-Dlb allele decreased about 37 and 80% of the expression levels of ExpA 7 and ExpA3 in elongation zone, respectively. The presence Rht-Blc dwarfing genes, however, produced 53% reduction in the expression level of ExpA7, and seriously decreased about 70% of ExpB9 expression. Although the expression levels of five genes exhibited variability among the lines, an expansin gene, ExpB2, showed its expression level highly associated with the cell elongation rate in peduncle of different Rht lines. 展开更多
关键词 expansin PEDUNCLE gene expression dwarfing gene
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苎麻expansin家族成员鉴定与表达分析
3
作者 石亚亮 钟意成 +4 位作者 黄坤勇 牛娟 孙志民 陈建华 栾明宝 《中国麻业科学》 2023年第4期145-151,共7页
苎麻是一种重要的纤维作物,纤维被用作纺织工业的原料。扩展蛋白具有诱导依赖pH的细胞壁伸长和压力松弛的特性。为了对苎麻基因组中expansin家族成员数量和类型进行鉴定,并研究在纤维细度不同的苎麻茎皮中扩展蛋白基因的表达情况,研究... 苎麻是一种重要的纤维作物,纤维被用作纺织工业的原料。扩展蛋白具有诱导依赖pH的细胞壁伸长和压力松弛的特性。为了对苎麻基因组中expansin家族成员数量和类型进行鉴定,并研究在纤维细度不同的苎麻茎皮中扩展蛋白基因的表达情况,研究首先在苎麻中苎1号基因组数据库挖掘到24个扩展蛋白基因家族成员,通过生物信息学方法对其分子量、等电点、信号肽、亚细胞定位、motif及基因结构进行分析和预测。系统进化树结果显示:扩展蛋白包括α亚族成员17个、β亚族4个、α类亚族1个和β类亚族2个,共分为3类;expansin家族同一进化支蛋白结构域比较保守且有一个特有的motif。然后,利用苎麻茎皮扩展蛋白基因家族成员转录组表达分析和qRT-PCR验证,发现两个基因在两个纤维细度差异显著的品种及其5个不同生长期表达量差异显著。该结果有助于了解苎麻expansin家族的进化,为影响苎麻纤维发育和纤维细度相关基因及其功能的研究奠定基础。 展开更多
关键词 苎麻 expansin家族 生物信息学分析 表达分析
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桃EXPANSIN基因家族序列特征及其在根结线虫侵染后的诱导表达分析 被引量:3
4
作者 张倩 曹珂 +3 位作者 朱更瑞 方伟超 王新卫 王力荣 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期1-10,共10页
【目的】探索扩张蛋白(EXPANSIN)基因家族在桃抗南方根结线虫过程中的作用。【方法】首先对桃基因组中的EXPANSIN基因家族进行生物信息学分析,然后利用转录组测序对EXPANSIN基因在南方根结线虫侵染免疫型(‘红根甘肃桃1号’)和高感型(... 【目的】探索扩张蛋白(EXPANSIN)基因家族在桃抗南方根结线虫过程中的作用。【方法】首先对桃基因组中的EXPANSIN基因家族进行生物信息学分析,然后利用转录组测序对EXPANSIN基因在南方根结线虫侵染免疫型(‘红根甘肃桃1号’)和高感型(‘贝蕾’)桃种质根系后的不同时期的表达丰度进行分析。【结果】桃EXPANSIN基因家族有27个成员,这些成员分布在8条染色体上,以第2和第5号染色体上最多,均为5个。基因结构分析显示,这些基因包含1~5个外显子,大部分EXPANSIN基因包含DPBB_1和Pollen_allerg_1保守结构域,聚类分析将这27个成员分为2大类,其中有8个与拟南芥中已注释的与线虫侵染过程中巨细胞形成有关的蛋白质聚在一起,均属于EXPA亚类。转录组分析表明,这8个EXPANSIN基因在对南方根结线虫免疫和高感2种种质不同时期的表达趋势存在明显差异,其中ppa010314m、ppa010226m在‘贝蕾’中表达量随侵染上调,而在‘红根甘肃桃1号’中上调不明显,这2个基因可能是参与南方根结线虫侵染过程中巨细胞形成的关键基因。【结论】桃EXPANSIN家族成员在结构上高度保守,其中多个成员可能参与调控桃抗南方根结线虫过程。 展开更多
关键词 expansin基因家族 南方根结线虫 抗性
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Effect of Ethylene on Polygalacturonase,Lipoxygenase and Expansin in Ripening of Tomato Fruits 被引量:2
5
作者 薛照辉 寇晓虹 +2 位作者 罗云波 朱本忠 许文涛 《Transactions of Tianjin University》 EI CAS 2009年第3期173-177,共5页
Fruit ripening is a complex process and is regulated by many factors.Ethylene and polygalacturonase(PG),lipoxygenase(LOX),expansin(EXP) are all critical regulating factors in fruit ripening and softening process.With ... Fruit ripening is a complex process and is regulated by many factors.Ethylene and polygalacturonase(PG),lipoxygenase(LOX),expansin(EXP) are all critical regulating factors in fruit ripening and softening process.With antisense ACS tomato,Nr mutant tomato and cultivated tomato as materials,Northern blot hybridization showed that PG,LeEXP1 and LOX expressed differently in different parts of cultivated tomato fruit during ripening,which was related to fruit ripening.The ripening process of columella and radial pericarp was faster than pericarp.In both Nr mutant and antisense ACS transgenic tomato fruit,expression levels of PG,LeEXP1 and LOX were generally lower than those in cultivated fruit but still related to fruit ripening.The expression levels of PG,LeEXP1 and LOX increased in the mature green tomato fruits after 0.5 h treatment with ethylene(100 μL/L).These results indicate that gene expression of PG,LeEXP1 and LOX were positively regulated by ethylene.The time and cumulative effect of the concentration exists in the expression of PG regulated by ethylene.The regulation of LOX expression mainly depended on the fruit development after great amount of ethylene was produced.PG played a major role in ripening and softening of tomato fruit,and cooperated with the regulation of EXP and LOX. 展开更多
关键词 番茄果实 果实成熟 LOX 乙烯 NORTHERN杂交 膨大 前列腺素 成熟过程
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芋扩展蛋白基因家族的全基因组鉴定及其在球茎膨大中的表达分析
6
作者 李必聪 李慧英 +4 位作者 肖遥 罗莎 周庆红 黄英金 朱强龙 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第7期1604-1616,共13页
扩展蛋白是一类具有促进细胞壁伸长和增加细胞壁柔韧性作用的蛋白。本研究基于芋全基因组范围鉴定扩展蛋白基因,并分析该家族基因结构特征、系统发育及其在芋球茎膨大中的表达模式。结果表明,芋全基因组包含31个扩展蛋白基因,分布在芋8... 扩展蛋白是一类具有促进细胞壁伸长和增加细胞壁柔韧性作用的蛋白。本研究基于芋全基因组范围鉴定扩展蛋白基因,并分析该家族基因结构特征、系统发育及其在芋球茎膨大中的表达模式。结果表明,芋全基因组包含31个扩展蛋白基因,分布在芋8条染色体及2个重叠群上。在芋和拟南芥、水稻、马铃薯等4个物种中的扩展蛋白基因进行系统发育树分析中,所有的扩展蛋白基因划分到4个亚家族中,其中EXPA有23个,EXPB有5个,EXLA有1个,EXLB有2个。共线性分析表明,芋和拟南芥之间存在7对共线性扩展蛋白基因。基因表达分析发现,芋扩展蛋白基因家族不同成员在不同组织中有不同的表达模式,其中CeEXPA 2、CeEXPA 11、CeEXPA 13、CeEXPA 23和CeEXLA 1等5个基因在球茎膨大过程中高表达且差异显著,表明它们可能对芋球茎的膨大发挥了重要的调控作用。本研究结果将有助于了解芋扩展蛋白基因家族的特征及其在球茎膨大中的分子功能,为揭示芋球茎生长发育的分子调控机理提供理论依据。 展开更多
关键词 扩展蛋白基因家族 球茎膨大 基因表达分析
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巨桉扩展蛋白EgrEXPA8和EgrEXPA10基因的克隆和表达特性分析
7
作者 罗萍 王晓萍 +3 位作者 张昊楠 范春节 王玉娇 徐建民 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期827-834,共8页
为探讨扩展蛋白在桉树生长发育中的作用,以在桉树初生生长到次生生长转换转录组测序中筛选出的差异表达基因EgrEXPA8和EgrEXPA10为基础,从巨桉(Eucalyptusgrandis)中克隆了2个扩展蛋白基因EgrEXPA8和EgrEXPA10,分别编码249和244个氨基酸... 为探讨扩展蛋白在桉树生长发育中的作用,以在桉树初生生长到次生生长转换转录组测序中筛选出的差异表达基因EgrEXPA8和EgrEXPA10为基础,从巨桉(Eucalyptusgrandis)中克隆了2个扩展蛋白基因EgrEXPA8和EgrEXPA10,分别编码249和244个氨基酸,属于亲水蛋白,但Egr EXPA8稳定性高于Egr EXPA10。q RT-PCR分析表明,Egr EXPA8和Egr EXPA10基因均在幼叶和茎尖组织中表达量较高,在木质部和韧皮部表达量较低;且在茎顶端初生生长阶段表达量较高,而在下部次生生长节间表达量较低,可能其主要参与巨桉的初生生长或者负调控次生生长;另外在盐胁迫、茉莉酸甲酯处理下其均被抑制表达;而在水杨酸、缺硼、缺磷处理下均上调表达。这说明EgrEXPA8和EgrEXPA10在巨桉响应逆境胁迫时起到重要作用,且呈现出相似的调控方式。 展开更多
关键词 巨桉 扩展蛋白 基因克隆 基因表达 非生物胁迫
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萝卜扩展蛋白基因RsEXPB1克隆与表达特征分析 被引量:14
8
作者 荆赞革 柳李旺 +3 位作者 龚义勤 姜立娜 孙新菊 周艳孔 《分子植物育种》 CAS CSCD 2009年第4期801-805,共5页
本文根据GenBank中扩展蛋白序列设计特异引物,从萝卜高代自交系"NAU-LVYH06"中克隆到一个扩展蛋白基因RsEXPB1(GenBank accession No.GQ387363,GQ387364)。其编码区基因组序列长度为1430bp,包括4个外显子和3个内含子;RT-PCR... 本文根据GenBank中扩展蛋白序列设计特异引物,从萝卜高代自交系"NAU-LVYH06"中克隆到一个扩展蛋白基因RsEXPB1(GenBank accession No.GQ387363,GQ387364)。其编码区基因组序列长度为1430bp,包括4个外显子和3个内含子;RT-PCR获得长度为898bp的cDNA,开放读码框(ORF)为29~820bp,推导编码263个氨基酸,含有1个组氨酸(His-Phe-Asp,HFD)功能域,ORF和推导蛋白序列与拟南芥AtEXPB3(GenBank accession No.NM118965)同源性分别为87%、92%。半定量RT-PCR检测到该基因主要在萝卜生育前期的幼叶、肉质根木质部和韧皮部中表达,且表达丰度可能与该部位细胞生长分裂状态相关,差异较明显。 展开更多
关键词 萝卜(Raphanus SATIVUS L.) 扩展蛋白 基因克隆 表达特征
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植物膨大素的研究进展 被引量:8
9
作者 张娟 覃芳 +2 位作者 何龙飞 李创珍 韦善清 《南方农业学报》 CAS CSCD 2011年第10期1206-1211,共6页
膨大素是一种能促进细胞壁膨胀,对植物生长发育具有重要作用的广谱蛋白质。它是一个庞大的基因大家族,目前已发现的膨大素被分为α、β、γ和δ四个亚家族。膨大素的功能广泛,除了具有诱导细胞壁松弛和扩展、促进细胞生长的功能外,还在... 膨大素是一种能促进细胞壁膨胀,对植物生长发育具有重要作用的广谱蛋白质。它是一个庞大的基因大家族,目前已发现的膨大素被分为α、β、γ和δ四个亚家族。膨大素的功能广泛,除了具有诱导细胞壁松弛和扩展、促进细胞生长的功能外,还在叶片生长、花发育、果实成熟、种子萌发、根系生长、块茎膨大等方面发挥重要作用。文章综述了膨大素的基因家族、蛋白结构、功能、作用机制等,并指出了存在问题和发展方向,为植物膨大素的研究和利用提供参考。 展开更多
关键词 膨大素 基因家族 生理功能 作用机制 研究进展
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团花树α扩展蛋白基因的克隆及表达分析 被引量:6
10
作者 欧阳昆唏 李俊成 +2 位作者 黄浩 刘明骞 陈晓阳 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第9期62-71,共10页
采用扩增保守区域、基因组步移及3’RACE技术,在团花树中克隆到15个α-expansin基因的cDNA序列,命名为AcEXPA2-16(GenBank注册号JF922686-JF922700),其相对应的基因组序列GenBank注册号为JF922701-JF922715。包括已知的AcEXPA1,这16个E... 采用扩增保守区域、基因组步移及3’RACE技术,在团花树中克隆到15个α-expansin基因的cDNA序列,命名为AcEXPA2-16(GenBank注册号JF922686-JF922700),其相对应的基因组序列GenBank注册号为JF922701-JF922715。包括已知的AcEXPA1,这16个EXPA蛋白的大小及序列高度保守,包括N端的信号肽、3个外显子和2个内含子。通过氨基酸序列比对和系统进化树分析,AcEXPA1-16分为4个亚族,分别为A、B、C和D亚族。定量PCR分析显示AcEXPA1-16基因在同一组织中的表达存在冗余现象,而单个基因在不同的组织中又存在特异表达,尤其AcEXPA8在形成层中的表达水平极高。这表明AcEXPA8在木质部发生的过程中可能起到重要的作用。研究结果为在团花树中研究α-expansin基因与木质部的生长和材质的关系提供信息,并最终为林木分子育种提供潜在的候选基因。 展开更多
关键词 团花树 α扩展蛋白 基因克隆 定量PCR
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水稻扩展蛋白家族的生物信息学分析 被引量:13
11
作者 施杨 徐筱 +2 位作者 李昊阳 徐倩 徐吉臣 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期809-820,共12页
扩展蛋白是植物细胞壁的重要组成部分,具有松驰细胞壁和增加细胞壁柔韧性的作用,在植物的生长发育及抗性等方面起到重要的作用.水稻的全基因组序列统计分析显示,水稻扩展蛋白基因家族包含58个成员,分属于A(34)、B(19)、LA(4)和LB... 扩展蛋白是植物细胞壁的重要组成部分,具有松驰细胞壁和增加细胞壁柔韧性的作用,在植物的生长发育及抗性等方面起到重要的作用.水稻的全基因组序列统计分析显示,水稻扩展蛋白基因家族包含58个成员,分属于A(34)、B(19)、LA(4)和LB(1)4个亚家族,分布在水稻10条染色体上的58个位点,且同一亚家族成员有成簇存在的现象.扩展蛋白基因长度范围为687~1128 bp,编码蛋白质具有保守的结构域,以及保守的半胱氨酸和色氨酸残基.多数情况下,亚家族成员之间的氨基酸一致率小于35%,而同一亚家族成员之间的氨基酸一致率大于35%.在内含子、外显子组成模式上,水稻扩展蛋白呈现明显的亚家族特异性,除个别基因以外,A类基因含有1或2个内含子,B类含有3个内含子,LA和LB类含有4个内含子.密码子使用统计显示,与其他物种相比,水稻中的扩展蛋白具有更多的密码子使用偏好性,有26个高频密码子存在.研究结果展示了水稻扩展蛋白基因家族的基本信息,为深入研究扩展蛋白基因的功能、探讨物种间的进化关系奠定基础. 展开更多
关键词 水稻 扩展蛋白 细胞壁 基因家族 生物信息学
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杨树扩展蛋白基因家族的生物信息学分析 被引量:15
12
作者 李昊阳 施杨 +1 位作者 丁亚娜 徐吉臣 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期59-67,共9页
扩展蛋白是植物细胞壁的重要组成部分,广泛存在于植物基因组中,具有疏松细胞壁组分、增加细胞壁柔韧性的作用,在植物的生长发育及抗性等多个方面起着重要的作用。全基因组序列分析显示,杨树中的扩展蛋白基因家族包含36个成员,分属于EXPA... 扩展蛋白是植物细胞壁的重要组成部分,广泛存在于植物基因组中,具有疏松细胞壁组分、增加细胞壁柔韧性的作用,在植物的生长发育及抗性等多个方面起着重要的作用。全基因组序列分析显示,杨树中的扩展蛋白基因家族包含36个成员,分属于EXPA、EXPB、EXLB和EXLA 4个亚家族。系统生物信息学分析表明,杨树扩展蛋白基因具有保守的序列特征和稳定的蛋白结构,包括9种不同的内含子起源模式以及6个高频密码子。基因表达分析显示,该家族基因在杨树木材形成相关的组织/器官中表达丰度较高,对林木生殖发育也起着重要的作用。研究结果展示了杨树扩展蛋白基因家族的基本信息和特点,为深入研究杨树扩展蛋白基因的功能搭建平台。 展开更多
关键词 杨树 扩展蛋白 细胞壁 基因家族 生物信息学
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雷蒙德氏棉扩展蛋白基因家族的鉴定和特征分析 被引量:3
13
作者 雷忠萍 贺道华 +3 位作者 海江波 邢宏宜 赵俊兴 程雪妮 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2016年第6期44-55,共12页
扩展蛋白具有松驰细胞壁和增加细胞壁柔韧性的功能。为了弄清该基因家族在雷蒙德氏棉中的特征,利用隐马尔科夫模型(HMM)在雷蒙德氏棉基因组中进行扩展蛋白家族基因成员的鉴定,获得了39个扩展蛋白基因家族成员,分布在12条染色体上。系统... 扩展蛋白具有松驰细胞壁和增加细胞壁柔韧性的功能。为了弄清该基因家族在雷蒙德氏棉中的特征,利用隐马尔科夫模型(HMM)在雷蒙德氏棉基因组中进行扩展蛋白家族基因成员的鉴定,获得了39个扩展蛋白基因家族成员,分布在12条染色体上。系统发育分析将其归入EXPA、EXPB、EXLA和EXLB共4个亚家族,分别含有26,4,3,6个基因。各亚家族中扩展蛋白基因具有相对多样化的基因结构;扩展蛋白基因家族在进化中经历了3次扩张;染色体片段重复是该基因家族扩张的主要方式;扩张后纯化选择占主导地位。比较棉纤维发育不同时期及叶片、花瓣的深度测序和基因芯片表达谱,发现大部分扩展蛋白基因参与了雷蒙德氏棉纤维、叶片和花瓣的生长发育,在不同的时空范围均表现出表达多样性。Gr EXLA1、Gr EXLA2和Gr EXPA16在花瓣中优势表达,Gr EXPA23和Gr EXPA24在叶片中表达水平较高,推测这些基因的表达分别参与了花瓣和叶片的发育进程;其余的基因,在纤维的不同发育阶段,表现出不同的表达丰度。研究结果有助于了解棉属扩展蛋白基因家族的特征及功能,为深入剖析棉纤维发育过程中的分子调控机理提供了基础。 展开更多
关键词 雷蒙德氏棉 扩展蛋白 基因结构 系统发育分析 进化分析 表达模式
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地黄扩展蛋白基因RgExpA1的克隆与表达分析 被引量:10
14
作者 臧亚超 孙鹏 +1 位作者 杨太新 李先恩 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期69-73,共5页
采用RT-PCR方法对9个地黄扩展蛋白基因在地黄不同组织器官、不同发育时期的表达特点进行了分析,在此基础上用RACE方法克隆了主要在根中表达的RgExpA1基因的全长,并对该基因编码氨基酸的功能位点、拼接方式以及与同源基因的进化关系作了... 采用RT-PCR方法对9个地黄扩展蛋白基因在地黄不同组织器官、不同发育时期的表达特点进行了分析,在此基础上用RACE方法克隆了主要在根中表达的RgExpA1基因的全长,并对该基因编码氨基酸的功能位点、拼接方式以及与同源基因的进化关系作了初步分析。 展开更多
关键词 扩展蛋白 地黄(Rehmannia glutinousa) 基因克隆 表达分析
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番木瓜果实膨胀素基因部分序列的克隆及分析 被引量:3
15
作者 牛艳梅 沈文涛 +1 位作者 卢雅薇 周鹏 《热带作物学报》 CSCD 2007年第4期47-50,共4页
膨胀素(Expansin)是一类存在于植物细胞壁上,并能快速缓冲张力,使植物细胞壁松驰的蛋白质。以成熟番木瓜果实总RNA反转录得到的cDNA为模板,设计简并引物进行PCR,得到1个大小为531bp的基因片段,编码177个氨基酸,并存在expansin的保守区域... 膨胀素(Expansin)是一类存在于植物细胞壁上,并能快速缓冲张力,使植物细胞壁松驰的蛋白质。以成熟番木瓜果实总RNA反转录得到的cDNA为模板,设计简并引物进行PCR,得到1个大小为531bp的基因片段,编码177个氨基酸,并存在expansin的保守区域,命名为Cp-EXP1。番木瓜expansin的成功克隆为研究番木瓜的生长发育以及其品种的改良等打下了良好的基础。 展开更多
关键词 番木瓜果实 expansin 基因克隆 序列分析
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NtabEXPA12基因过表达对烟草叶片发育及抗逆性的影响 被引量:3
16
作者 丁安明 陈志华 +6 位作者 杨懿德 余祥文 杨洋 鄢敏 杨兴有 王卫锋 孙玉合 《中国烟草科学》 CSCD 北大核心 2021年第4期58-66,共9页
细胞壁松弛因子膨胀素在调控植物生长发育和响应非生物胁迫等方面发挥重要作用,克隆烟草膨胀素基因并研究其功能可为烟草叶片发育调控和抗逆育种提供理论依据。本研究从普通烟草K326中克隆了一个膨胀素基因NtabEXPA12及其启动子ProNtabE... 细胞壁松弛因子膨胀素在调控植物生长发育和响应非生物胁迫等方面发挥重要作用,克隆烟草膨胀素基因并研究其功能可为烟草叶片发育调控和抗逆育种提供理论依据。本研究从普通烟草K326中克隆了一个膨胀素基因NtabEXPA12及其启动子ProNtabEXPA12,通过实时荧光定量PCR、亚细胞定位和过表达等对该基因进行了功能研究,分析了启动子包含的顺式作用元件和活性。结果表明,NtabEXPA12在烟草叶片中具有较高的表达量;ProNtabEXPA12中包含多个响应高盐、干旱和植物激素的顺式元件,并且其活性受到高盐、干旱和ABA等的诱导;过表达NtabEXPA12通过调控细胞扩展促进转基因烟草叶片的生长发育,并可以提高转基因K326对高盐和干旱的抗性。因此,NtabEXPA12在烟草叶片发育调控及抗逆育种中具有潜在的应用前景。 展开更多
关键词 膨胀素 基因功能 叶片发育 耐盐 抗旱性
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马铃薯扩展蛋白基因家族的鉴定与表达分析 被引量:3
17
作者 理向阳 代丹丹 +1 位作者 杨铁钢 郝西 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2017年第5期37-44,共8页
为了分析马铃薯扩展蛋白基因家族的进化与功能,鉴定了马铃薯的扩展蛋白基因家族,分析了其基因结构特征、系统发育及表达模式等。结果表明,马铃薯基因组包含33个扩展蛋白基因,包括A(21)、B(5)、LA(1)和LB(6)4个亚家族,分布在马铃薯11条... 为了分析马铃薯扩展蛋白基因家族的进化与功能,鉴定了马铃薯的扩展蛋白基因家族,分析了其基因结构特征、系统发育及表达模式等。结果表明,马铃薯基因组包含33个扩展蛋白基因,包括A(21)、B(5)、LA(1)和LB(6)4个亚家族,分布在马铃薯11条染色体上。扩展蛋白氨基酸长度为194~488 aa,编码蛋白质具有保守的结构域,蛋白质亚细胞定位预测结果表明所有蛋白均定位于细胞外。基因结构分析表明,马铃薯扩展蛋白家族有23个基因(69.7%)含有2~3个内含子。基因表达分析发现,该家族基因在马铃薯根、茎、匍匐茎、果实及块茎发育过程中表达丰度较高,并且其表达受到高温、盐、激素及病害等逆境的调控。 展开更多
关键词 马铃薯 扩展蛋白 生物信息学 基因家族
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PwEXP1在青杄种子萌发及逆境响应中的表达特征 被引量:4
18
作者 张通 李巧玲 张凌云 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第12期56-62,共7页
采用RACE-PCR技术,从青杄c DNA文库中克隆得到1个青杄Pw EXP1基因,其c DNA全长为1 186 bp,含777 bp的完整开放阅读框,编码259个氨基酸。生物信息学分析发现其理论分子量为27.90 k Da,等电点(p I)为8.07,N端有8个半胱氨酸残基,C端4个色... 采用RACE-PCR技术,从青杄c DNA文库中克隆得到1个青杄Pw EXP1基因,其c DNA全长为1 186 bp,含777 bp的完整开放阅读框,编码259个氨基酸。生物信息学分析发现其理论分子量为27.90 k Da,等电点(p I)为8.07,N端有8个半胱氨酸残基,C端4个色氨酸残基,中部1个HFD结构域,具有扩展蛋白的典型结构。RT-q PCR试验显示Pw EXP1在青杄针叶中相对表达量较高。在种子萌发过程中,未开始萌发的种子表达量较低,萌发第2天和第4天表达量开始升高,萌发6天后达到较高水平。在逆境胁迫下,Pw EXP1在青杄根和叶中的表达模式不同。Na Cl和低温、高温胁迫均能增加Pw EXP1在根中的表达水平;PEG处理的渗透胁迫下,Pw EXP1在根中表达特征呈现前期下调、6 h后上调,而在叶中则在胁迫3 h和6 h时上调、9 h和12 h时下调、24 h时重新上调;在ABA处理后,Pw EXP1在根和叶中均表现下调。推测Pw EXP1在青杄种子萌发和逆境响应中发挥作用。 展开更多
关键词 青杄 扩展蛋白 胁迫响应 基因表达
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杉木木材形成过程扩展蛋白基因的克隆与表达分析 被引量:5
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作者 高燕 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第11期44-51,共8页
扩展蛋白是一类细胞壁结合蛋白,在一定的pH值下无需任何激活蛋白就可诱导细胞壁的伸展。以杉木木材形成的特异表达基因文库中获得的扩展蛋白ESTs序列为基础,通过RLM-RACE技术成功克隆到3条全长扩展蛋白基因。其中ClEXPA1 cDNA全长1033 ... 扩展蛋白是一类细胞壁结合蛋白,在一定的pH值下无需任何激活蛋白就可诱导细胞壁的伸展。以杉木木材形成的特异表达基因文库中获得的扩展蛋白ESTs序列为基础,通过RLM-RACE技术成功克隆到3条全长扩展蛋白基因。其中ClEXPA1 cDNA全长1033 bp,包括247个氨基酸的开放阅读框(ORF)区;ClEXPA2cDNA全长1374bp,包括268个氨基酸的开放阅读框;ClEXLA1cDNA全长1023bp,包括272个氨基酸的开放阅读框。进化树重建结果表明:ClEXPA1和ClEXPA2属于α-expansin(EXPA);ClEXLA1属于γ-expansin(EXLA)。实时定量PCR显示:ClEXPA1和ClEXPA2具有较为相同的表达模式,在形成层区域表达最高,在针叶及茎尖中度表达,成熟木质部表达较低,而根和花粉中几乎不表达;ClEXLA1在形成层及针叶中均有较高的表达,在木质部及茎尖中度表达,花粉中表达较低,而根中几乎检测不到。该组扩展蛋白的成功克隆,将为系统研究扩展蛋白在木材形成过程中的表达、功能及调控机制提供基因资源。 展开更多
关键词 杉木 木材形成 扩展蛋白 木质部分化
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杨树形成层区域扩张蛋白PtEXP1基因的克隆与分析 被引量:4
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作者 张春玲 张德强 +2 位作者 赵树堂 胥耀平 卢孟柱 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2006年第6期52-56,62,共6页
以矮牵牛的cDNA核苷酸序列为基础,利用杨树EST数据库和毛果杨基因组测序结果,通过序列的拼接设计合成了基因特异引物,从毛白杨形成层cDNA中扩增出一个长为1 009 bp的cDNA片段,将该片段连接到pGEM-T载体中并测序。测序结果表明,该片段含... 以矮牵牛的cDNA核苷酸序列为基础,利用杨树EST数据库和毛果杨基因组测序结果,通过序列的拼接设计合成了基因特异引物,从毛白杨形成层cDNA中扩增出一个长为1 009 bp的cDNA片段,将该片段连接到pGEM-T载体中并测序。测序结果表明,该片段含有完整的开放阅读框,共编码258个氨基酸残基。蛋白序列系统进化分析结果表明,该基因属于exp ansin基因家族-αexp ansin中的A亚家族,编码的氨基酸序列与芒果、欧洲山杨×美洲山杨杂交种、拟南芥和矮牵牛的-αexp ansin基因编码的氨基酸序列同源性分别为91%,88%,86%和86%。 展开更多
关键词 毛白杨 扩张蛋白 细胞增大PtEXP1基因 克隆
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