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引导RNase P对HCMV UL54 mRNA片段体外切割的EGS构建
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作者 吕静竹 李月琴 周天鸿 《生物学杂志》 CAS CSCD 2009年第5期4-6,共3页
HCMV是一种广泛存在的疱疹病毒,在免疫抑制和免疫功能低下人群中,HCMV感染可引起严重疾病。RNase P是细胞内催化tRNA5′末端成熟的酶,当EGSs与靶mRNA互补结合并形成类似tNRA的复合物时,大肠杆菌RNase P催化亚基M1 RNA可具备对靶mRNA特... HCMV是一种广泛存在的疱疹病毒,在免疫抑制和免疫功能低下人群中,HCMV感染可引起严重疾病。RNase P是细胞内催化tRNA5′末端成熟的酶,当EGSs与靶mRNA互补结合并形成类似tNRA的复合物时,大肠杆菌RNase P催化亚基M1 RNA可具备对靶mRNA特异的催化切割活性。为研究抗病毒制剂,针对HCMV DNA多聚酶UL54 mRNA设计并构建特异性的EGS-C6,通过对UL54基因亚克隆片段转录产物体外切割研究,证实该EGS具备引导M1 RNA对UL54 mRNA特异切割的能力,可发展成一种新型抗病毒制剂。 展开更多
关键词 RNASE P 外部引导序列 人巨细胞病毒 UL54基因
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Chloromycetin resistance of clinically isolated E coli is conversed by using EGS technique to repress the Chloromycetin acetyl transferase 被引量:3
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作者 Mei-Ying Gao Chuan-Rui Xu +2 位作者 RU Chen Shou-Gui Liu Jiang-Nan Feng 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2005年第46期7368-7373,共6页
AIM: To explore the possibility of repression of chloromycetin (Cm) acyl transferase by using external guided sequence (EGS) in order to converse the clinical E coli isolates from Cm- resistant to Cm- sensitive. ... AIM: To explore the possibility of repression of chloromycetin (Cm) acyl transferase by using external guided sequence (EGS) in order to converse the clinical E coli isolates from Cm- resistant to Cm- sensitive. METHODS: EGS directed against chloromycetin acetyl transferase gene (cat) was cloned to vector pEGFP-C1 which contains the kanamycin (Kin) resistance gene. The recombinant plasmid pEGFP-C1+EGScatl+cat2 was constructed and the blank vector without EGS fragment was used as control plasmids. By using the CaCl2 transformation method, the recombinant plasmids were introduced into the clinically isolated Cm resistant but Km sensitive E coli strains. Transformants were screened on LB agar plates containing Kin. Extraction of plasmids and PCR were applied to identify the positive clones. The growth curve of EGS transformed bacteria cultured in broth with Cm resistance was determined by using spectrophotometer at A600. Drug sensitivity was tested in solid culture containing Cm by using KB method. RESULTS: Transformation studies were carried out on 16 clinically isolated Cm-resistant (250 μg/mL of Cm) E colistrains by using pEGFP-C1-EGScatlcat2 recombinant plasmid. Transformants were screened on LB-agar plates containing Km after the transformation using EGS. Of the 16 tested strains, 4 strains were transformed successfully. Transformants with EGS plasmid showed growth inhibition when grown in liquid broth culture containing 200 μg/mL of Cm. In drug sensitivity test, these strains were sensitive to Cm on LB-agar plates containing 200 μg/mL of Cm. Extraction of plasmids and PCR amplification showed the existence of EGS plasmids in these four transformed strains. These results indicated that the Cat of the four clinical isolates had been suppressed and the four strains were converted to Cm sensitive ones. CONCLUSION: The EGS directed against Cat is able to inhibit the expression of Cat, and hence convert Cm- resistant bacteria to Cm-sensitive ones. Thus, the EGS has the capability of converting the phenotype of clinical drug-resistant isolates strains to drug-sensitive ones. 展开更多
关键词 external guide sequence Drug-resistant bacteria Conversion of drug resistance
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EGS-C^(67)抑制HCV基因表达及其抗病毒活性的测定
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作者 张成成 李小英 +1 位作者 伍婧茹 张文军 《基础医学与临床》 CSCD 2017年第1期56-61,共6页
目的基于丙肝病毒(HCV)基因组保守区5'UTR的序列,设计一段相应的外部引导序列(EGS),鉴定其体外靶向切割活性及胞内抗病毒作用。方法用计算机软件对HCV基因保守区的5'非翻译区(5'UTR)序列与结构进行分析,选择针对HCV第67位... 目的基于丙肝病毒(HCV)基因组保守区5'UTR的序列,设计一段相应的外部引导序列(EGS),鉴定其体外靶向切割活性及胞内抗病毒作用。方法用计算机软件对HCV基因保守区的5'非翻译区(5'UTR)序列与结构进行分析,选择针对HCV第67位胞嘧啶C与第68位鸟嘌呤G之间的位点,作为设计的靶位,设计相应的EGS(EGS-C^(67)),将该EGS导入HCV感染的Huh7.5.1细胞,通过Northern blot及Western blot试验检测HCV基因的表达,通过荧光定量PCR检测EGS-C^(67)的抗病毒活性。结果体外切割试验表明EGS-C^(67)对HCV RNA片段具有明显的靶向引导活性。在宿主细胞内EGS-C^(67)可显著抑制HCV基因的表达,可使Huh7.5.1细胞培养上清中HCV的滴度降低约150倍(P<0.01)。结论 EGS-C^(67)作为一种新型抗HCV核酸分子,其成功构建为抑制HCV增殖提供了一种新的抗病毒策略。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 外部引导序列 抗病毒
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对HCMVUL54 mRNA片段特异性切割的M1GS构建 被引量:4
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作者 吕静竹 李弘剑 +4 位作者 陈浩军 李月琴 周天鸿 唐冬生 张欣 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期83-86,共4页
人巨细胞病毒是一种DNA病毒,在人群中一般呈亚临床感染和潜伏感染。为研究病毒基因沉默工具和抗病毒制剂,以人巨细胞病毒UL54基因mRNA序列设计互补的外部引导序列,共价结合到大肠杆菌来源RNaseP催化核心M1RNA上,从而构建成M1GS-T6核酶... 人巨细胞病毒是一种DNA病毒,在人群中一般呈亚临床感染和潜伏感染。为研究病毒基因沉默工具和抗病毒制剂,以人巨细胞病毒UL54基因mRNA序列设计互补的外部引导序列,共价结合到大肠杆菌来源RNaseP催化核心M1RNA上,从而构建成M1GS-T6核酶。通过对DNA聚合酶UL54基因亚克隆片段转录产物体外切割研究,证实该核酶具备对UL54mRNA片段的特异切割能力。 展开更多
关键词 人巨细胞病毒 UL54基因 RNASE P 外部引导序列
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改进型外部引导序列抑制人巨细胞病毒UL49基因的表达(英文) 被引量:1
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作者 周琪 曾志锋 +6 位作者 李弘剑 李月琴 崔延伟 杨丹 邹奕 杨光 周天鸿 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期522-527,共6页
外部引导序列(EGS)技术(The EGS-based technology)是一种新型的基因沉默技术,能诱导内源性的核酶P(RNase P)对靶mRNA进行有效切割.以人类巨细胞病毒(HCMV)UL49基因mRNA片段为靶序列,基于前人实验基础上设计出更为精简与高效的改进型EGS... 外部引导序列(EGS)技术(The EGS-based technology)是一种新型的基因沉默技术,能诱导内源性的核酶P(RNase P)对靶mRNA进行有效切割.以人类巨细胞病毒(HCMV)UL49基因mRNA片段为靶序列,基于前人实验基础上设计出更为精简与高效的改进型EGS(miniEGS),DNA片段长度仅为12bp.构建稳定表达HCMVUL49的细胞系,通过应用荧光定量PCR及Western印迹分别鉴定miniEGS对内源性UL49的抑制效率.结果显示,miniEGS能在HeLa细胞中能达到很高的转染效率(97.9%),并且在转染稳定表达UL49的HeLa细胞系后,发现UL49基因的mRNA与蛋白表达水平都出现明显下降(50%).研究表明,改进型的EGS序列不仅能有效抑制目的基因的表达,同时因其序列设计的精简性与高效性,可更好地应用到以后的抗病毒研究中. 展开更多
关键词 外部引导序列(egs) 核酶P 人巨细胞病毒 基因沉默
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外源指导序列逆转淋球菌多重耐药性 被引量:2
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作者 吴志洪 陈宏翔 +6 位作者 陈嵘袆 帅俊 许莉 俞莺 严小枫 李家文 涂亚庭 《华中科技大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期368-371,共4页
目的研究外源指导序列(external guide sequence,EGS)在体外逆转淋球菌多重耐药株为敏感株中的作用。方法构建针对多传递耐药(multiple transferable resistance,mtr)系统中MtrC基因,并含卡那霉素抗性基因的EGS重组质粒pET-28a(+)-EGS-M... 目的研究外源指导序列(external guide sequence,EGS)在体外逆转淋球菌多重耐药株为敏感株中的作用。方法构建针对多传递耐药(multiple transferable resistance,mtr)系统中MtrC基因,并含卡那霉素抗性基因的EGS重组质粒pET-28a(+)-EGS-MtrC,采用常规CaCl2法将重组质粒导入临床分离的多重耐药淋球菌中,通过菌落PCR进行鉴定,并利用分光光度计检测阳性转化菌在含不同浓度氨苄西林的培养基中的生长情况,测定淋球菌转化前后对阿奇霉素、结晶紫、红霉素、TritonX-100、四环素的最小抑菌浓度(MIC)。结果PCR结果显示阳性转化菌含有预期大小的转化片段;多重耐药淋球菌在浓度为50、100μg/ml的氨苄西林培养基中生长良好,而导入EGS-MtrC的转化菌在含100μg/ml氨苄西林的培养基中不能生长,在50μg/ml氨苄西林培养基中生长受抑制。导入EGS-MtrC的转化菌对阿奇霉素、结晶紫、红霉素、TritonX-100、四环素的MIC值均有明显下降。结论pET-28a(+)-EGS-MtrC转化淋球菌成功;导入EGS-MtrC的转化菌部分恢复了对氨苄西林的敏感性;转化菌对阿奇霉素、结晶紫、红霉素、TritonX-100、四环素的敏感性增加。 展开更多
关键词 淋球菌 外源指导序列 多传递耐药
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RNase P对人巨细胞病毒mRNA的体外靶定切割研究 被引量:2
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作者 何华坤 李月琴 +3 位作者 王波 张文军 苏运贞 周天鸿 《中国优生与遗传杂志》 2004年第2期8-10,共3页
目的 探讨核酶P对HCMVUL97mRNA的体外切割能力。方法 以人巨细胞病毒 (humancytomegalovirus ,HCMV)磷酸转移酶mRNA序列为靶设计externalguidesequences(EGS) ,共价结合到大肠杆菌来源M 1RNA中 ,构建成M 1GS-T5核酶。对其进行UL97基... 目的 探讨核酶P对HCMVUL97mRNA的体外切割能力。方法 以人巨细胞病毒 (humancytomegalovirus ,HCMV)磷酸转移酶mRNA序列为靶设计externalguidesequences(EGS) ,共价结合到大肠杆菌来源M 1RNA中 ,构建成M 1GS-T5核酶。对其进行UL97基因亚克隆片段转录产物的体外切割实验。结果 该核酶在一定离子浓度下具对UL 97mRNA片段产生特异切割能力。结论 新构建得到的核酶MIGS -T5具特异性切割活性 ,可发展为一种抗病毒试剂。 展开更多
关键词 核酶P 引导序列 人巨细胞病毒 磷酸转移酶
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外源指导序列逆转绿脓杆菌耐药性
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作者 汪超英 张涛 +2 位作者 高美英 齐俊英 封江南 《基础医学与临床》 CSCD 北大核心 2001年第4期310-312,共3页
本研究利用CaCl2 转化法 ,将构建的含针对氨苄青霉素耐药基因bla的外源指导序列 (EGS)的编码序列的质粒PMMB2 0 7 AmpEGS导入绿脓杆菌A6 19菌株中 ,通过原位杂交挑选转化菌 (t A6 19) ,并检测其在含氨苄青霉素LB培养基中的生长情况。结... 本研究利用CaCl2 转化法 ,将构建的含针对氨苄青霉素耐药基因bla的外源指导序列 (EGS)的编码序列的质粒PMMB2 0 7 AmpEGS导入绿脓杆菌A6 19菌株中 ,通过原位杂交挑选转化菌 (t A6 19) ,并检测其在含氨苄青霉素LB培养基中的生长情况。结果表明 ,利用针对氨苄青霉素耐药性基因的外源指导序列 (EGS) ,能将氨苄青霉素耐药菌株A6 展开更多
关键词 外源指导序列 绿脓杆菌 耐药性 氨苄青霉素 菌株 质粒
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RNase P核酶对人巨细胞病毒UL54基因mRNA体外切割作用
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作者 周乐平 李弘剑 +4 位作者 陈浩军 李月琴 何华坤 王波 周天鸿 《中国病毒学》 CAS CSCD 2004年第2期110-113,共4页
外部引导序列(EGSs)是mRNA靶序列互补并引导RNase P切割的小RNA片段。我们设计与人巨细胞病毒HCMV(Human Cytomegalovirus) UL54基因mRNA序列互补的EGSs,将其与大肠杆菌来源RNase P催化核心M1 RNA构建成M1GS核酶。通过对UL54基因亚克隆... 外部引导序列(EGSs)是mRNA靶序列互补并引导RNase P切割的小RNA片段。我们设计与人巨细胞病毒HCMV(Human Cytomegalovirus) UL54基因mRNA序列互补的EGSs,将其与大肠杆菌来源RNase P催化核心M1 RNA构建成M1GS核酶。通过对UL54基因亚克隆片转录产物体外切割研究,证实该核酶具备对UL54 mRNA片段的特异切割能力,可以发展成为一种抗病毒试剂。 展开更多
关键词 人巨细胞病毒HCMV UL54基因 MRNA RNaseP 外部引导序列
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RNase P体外靶定切割人巨细胞病毒UL54 mRNA片段研究
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作者 吕静竹 李月琴 周天鸿 《蚌埠医学院学报》 CAS 2010年第6期552-554,共3页
目的:观察大肠埃希菌RNase P催化亚基M1 RNA在细胞外水平上对人巨细胞病毒(human cytomegalovirus,HCMV)DNA聚合酶UL54 mRNA的切割效果,探讨核酶作为新型抗病毒制剂的应用前景。方法:针对HCMVUL54 mRNA设计特异性的外部引导序列(externa... 目的:观察大肠埃希菌RNase P催化亚基M1 RNA在细胞外水平上对人巨细胞病毒(human cytomegalovirus,HCMV)DNA聚合酶UL54 mRNA的切割效果,探讨核酶作为新型抗病毒制剂的应用前景。方法:针对HCMVUL54 mRNA设计特异性的外部引导序列(external guide sequences,EGSs)EGS-T6,观察其引导M1 RNA特异的细胞外切割活性。结果:在EGS-T6引导下,大肠埃希菌RNase P催化亚基M1 RNA在细胞外可特异地对靶mRNA进行有效切割。结论:EGS-T6具备引导M1 RNA对UL54 mRNA特异切割的能力,可发展成一种新型抗病毒制剂。 展开更多
关键词 RNASE P 外部引导序列 人巨细胞病毒 UL54 MRNA
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人类核糖核酸酶P的研究进展
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作者 宁容 张文军 李红枝 《国际药学研究杂志》 CAS 2008年第4期251-255,共5页
人类核糖核酸酶P是具有酶活性的核糖核蛋白复合体。根据靶RNA设计的外部引导序列(EGS)能与靶RNA碱基互补结合,形成类似前体tRNA的二级结构,从而引导人类核糖核酸酶P对靶RNA进行特异切割。因此,基于人类核糖核酸酶P的EGS技术能在mRNA水... 人类核糖核酸酶P是具有酶活性的核糖核蛋白复合体。根据靶RNA设计的外部引导序列(EGS)能与靶RNA碱基互补结合,形成类似前体tRNA的二级结构,从而引导人类核糖核酸酶P对靶RNA进行特异切割。因此,基于人类核糖核酸酶P的EGS技术能在mRNA水平抑制病毒及肿瘤靶基因的表达,在抗肿瘤、抗病毒等基因治疗领域具有广阔的应用前景。 展开更多
关键词 人类核糖核酸酶P 外部引导序列 基因治疗
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Gene therapeutic approaches to inhibit hepatitis B virus replication 被引量:2
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作者 Maren Gebbing Thorsten Bergmann +1 位作者 Eric Schulz Anja Ehrhardt 《World Journal of Hepatology》 2015年第2期150-164,共15页
Acute and chronic hepatitis B virus(HBV) infections remain to present a major global health problem. The infection can be associated with acute symptomatic or asymptomatic hepatitis which can cause chronic inflammatio... Acute and chronic hepatitis B virus(HBV) infections remain to present a major global health problem. The infection can be associated with acute symptomatic or asymptomatic hepatitis which can cause chronic inflammation of the liver and over years this can lead to cirrhosis and the development of hepatocellularcarcinomas. Currently available therapeutics for chronically infected individuals aim at reducing viral replication and to slow down or stop the progression of the disease. Therefore, novel treatment options are needed to efficiently combat and eradicate this disease. Here we provide a state of the art overview of gene therapeutic approaches to inhibit HBV replication. We discuss non-viral and viral approaches which were explored to deliver therapeutic nucleic acids aiming at reducing HBV replication. Types of delivered therapeutic nucleic acids which were studied since many years include antisense oligodeoxynucleotides and antisense RNA, ribozymes and DNAzymes, RNA interference, and external guide sequences. More recently designer nucleases gained increased attention and were exploited to destroy the HBV genome. In addition we mention other strategies to reduce HBV replication based on delivery of DNA encoding dominant negative mutants and DNA vaccination. In combination with available cell culture and animal models for HBV infection, in vitro and in vivo studies can be performed to test efficacy of gene therapeutic approaches. Recent progress but also challenges will be specified and future perspectives will be discussed. This is an exciting time to explore such approaches because recent successes of gene therapeutic strategies in the clinic to treat genetic diseases raise hope to find alternative treatment options for patients chronically infected with HBV. 展开更多
关键词 Gene therapy Hepatitis B virus Antisense nucleic acid RNA interference Designer nuclease RIBOZYME DNAZYME Dominant negative mutant external guide sequence DNA vaccination
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外源性指导序列体外转换临床大肠杆菌氯霉素抗性表型的实验研究 被引量:2
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作者 高美英 陈如 +1 位作者 刘守桂 封江南 《中华医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第15期1294-1298,共5页
目的 研究外源性指导序列(EGS)体外逆转临床分离大肠杆菌氯霉素抗性的能力。方法 构建针对氯霉素(Cm)乙酰转移酶(cat)并含卡那霉素(Km)抗性基因筛选指标的EGS重组质粒以及只含Km抗性基因但不含EGS的对照质粒。采用CaCl2方法将重组质粒... 目的 研究外源性指导序列(EGS)体外逆转临床分离大肠杆菌氯霉素抗性的能力。方法 构建针对氯霉素(Cm)乙酰转移酶(cat)并含卡那霉素(Km)抗性基因筛选指标的EGS重组质粒以及只含Km抗性基因但不含EGS的对照质粒。采用CaCl2方法将重组质粒导入临床分离的耐Cm大肠杆菌株中。通过质粒抽提、菌落PCR鉴定EGS阳性克隆子,分光光度计A600检测导入EGS质粒后耐Cm菌株在液体培养基中的生长率以及KB法检测在固体培养基中的药物敏感试验,探讨EGS分子逆转耐药菌的逆转效应。结果 以pEGFP-C1-EGS cat1+cat2重组质粒对16株临床分离的CmR大肠杆菌供试菌进行转化试验,EGS转化子在含Km的培养基上筛选。其中4株转化菌在Cm 100—200 μg/ml的液体培养基中生长受抑;在Cm 100-200μg/ml的固体培养基中药敏试验对Cm敏感;转化菌质粒抽提检测出特异EGS条带;菌落PCR扩增鉴定存在EGS。表明16株供试菌中4株临床分离株获得了耐药菌型的表型转换、耐Cm的大肠杆菌临床分离株恢复了对Cm的敏感性。结论EGS分子具有逆转临床耐药菌为敏感菌的能力。 展开更多
关键词 外源性指导序列 egs 体外转换 大肠杆菌 氯霉素 抗性表型 抗性逆转
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应用外部引导序列切割人巨细胞病毒UL148 RNA的研究
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作者 胡兢晶 王波 +6 位作者 苏海浩 丁俊彩 郭媛媛 谢斌华 伍苑宾 蔡丽君 郭梦杰 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2017年第3期185-188,共4页
目的 研究人巨细胞病毒(Human cytomegalovirus,HCMV)临床病毒株UL/b&#39;区域UL148基因功能及抗HCMV治疗新策略,应用DNA性质外部引导序列(External guide sequences,EGS)在体外抑制UL148 RNA的表达.方法 应用RNA structure生物软... 目的 研究人巨细胞病毒(Human cytomegalovirus,HCMV)临床病毒株UL/b&#39;区域UL148基因功能及抗HCMV治疗新策略,应用DNA性质外部引导序列(External guide sequences,EGS)在体外抑制UL148 RNA的表达.方法 应用RNA structure生物软件模拟UL148 RNA二级结构,选择二级结构相对简单的区域设计EGS,并合成EGS核苷酸序列.应用PCR方法分别扩增UL148及M1RNA基因,克隆至T7启动子下游,在T7 RNA聚合酶的作用下,体外转录UL148 RNA及M1RNA,其中UL148以32p标记并进行体外转录.混合EGS、M1RNA及UL148 RNA于切割反应液中,反应1h后,进行尿素变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,Typhoon扫描仪观察结果.结果 根据UL148 RNA二级结构选取第58 ~72位碱基作为EGS结合区域,其切割位点位于57位,针对此区域设计EGS57,并在体外进行EGS57与UL148 RNA结合的二级结构的模拟,可形成M1RNA天然作用底物类似的茎环结构.在T7 RNA聚合酶的作用下,分别在体外转录M1RNA及UL148 RNA,其大小均与预期相符.经切割反应,可获得与预期切割位点相符的切割条带.结论 EGS57可切割UL148RNA,其切割位点准确,与预期相符.该研究为进一步探讨UL148基因功能提供有效基因沉默工具. 展开更多
关键词 人巨细胞病毒 外部引导序列 UL148 临床病毒株
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