结核分枝杆菌fadA2蛋白的生物信息学分析

目的 应用生物信息学方法分析结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)Rv0243基因编码蛋白fadA2的结构和功能。方法 从NCBI网站中查询Rv0243基因及其编码蛋白的基本信息;使用Protparam、ProtScale、NLStradamus、PSORT预测fadA2蛋白的理化性质、核定位信号、亚细胞定位;使用NetNGlyc、NetPhos 3.1 Servera、SOPMA、SWISS MODEL预测修饰位点、二级结构并构建三级结构模型;使用NCBI-BLAST、MEGA进行同源性分析并构建进化树;使用IEDB、SYFPEITHI预测抗原表位;使用STRING、PubMed数据库预测蛋白相互作用网络及相关功能。结果 Rv0243基因长1 323 bp,其编码的fadA2蛋白包含440个氨基酸,为亲水性蛋白,主要定位在细胞质和线粒体;该蛋白富含磷酸化位点,含有丰富的B细胞及T细胞抗原表位;其互作蛋白主要参与脂质代谢过程。结论 fadA2蛋白为结构稳定的亲水性蛋白,有多个磷酸化位点和多个抗原表位,并与多个脂代谢相关蛋白相互作用,有望成为结核病诊断及治疗的有效靶点。