草菇芳香醇氧化酶基因vvaao1的序列特征与差异表达

对芳香醇氧化酶编码基因vvaao1序列特征及差异表达进行分析,以期为研究vvaao1在草菇基质降解与子实体发育中的生物学功能提供依据。应用ZOOM软件分析基因结构与序列准确性;通过生物信息分析网站预测氨基酸序列的信号肽、亚细胞定位及三级结构;采用MEGA 5.1构建系统发育树;结合数字基因表达谱(DGE)、荧光定量PCR(RT-q PCR)、蛋白质组(i TRAQ)分析进行差异表达分析。结果显示,vvaao1全长3 091 bp,含有9个外显子、8个内含子,开放阅读框长1 803 bp,编码600个氨基酸;生物信息分析结果显示:Vv AAO1具备信号肽,为分泌蛋白;其三级结构由20个α-螺旋和19个β-折叠组成,与模式蛋白3FIM的一致性(Identity)达到48%。进化树结果显示,Vv AAO1属于AAO家族,与侧耳属菌株Pleurotus.eryngii和P.pulmonarius的AAO序列最为接近。DGE、RT-q PCR及i TRAQ的分析结果表明,vvaao1在可孕异核体菌丝上的表达量分别是两个同核体菌株之和的51.0、49.8和2.13倍;进一步对不同发育阶段的子实体样品进行RT-q PCR检测,结果显示vvaao1在原基时期的表达量均显著高于其他时期的样品。Vv AAO1具备信号肽,为分泌蛋白,其编码基因在异核体菌株H1521的表达水平显著高于两个同核体菌株之和,存在协同增效表达,且在原基时期表达量最高,vvaao1的高表达可能有利于草菇子实体的形成。

外源基因在巴斯德毕赤酵母中的表达

酵母是单细胞真核生物 ,既具有类似原核生物的生长特性 ,又具有一般真核生物的细胞生物学特性。巴斯德毕赤酵母是新近发展起来的新型表达系统 ,许多有应用价值的外源基因成功地在其中表达 ,使其日益受到关注。本文就毕赤酵母的生物学特性。

Candida cloacae源脂肪酸醇氧化酶基因的植物表达质粒构建及农杆菌转化研究

目的构建表达Candidacloacae源脂肪酸醇氧化酶基因的植物表达质粒及对农杆菌转化。方法脂肪酸醇氧化酶基因经RT-PCR扩增后直接克隆pET-17b载体,双酶切目的片断和植物表达载体,以T4连接酶将目的片断与载体相连接,电转化方式将重组质粒转入农杆菌。结果成功地将目的基因定向克隆到表达载体,并转入到农杆菌中。结论pET-17b载体可直接进行PCR扩增产物克隆;大分子量质粒(>12kb)可通过电转化方式有效导入农杆菌中。

长链脂肪酸醇氧化酶基因在油菜不同组织中的表达

目的 研究长链脂肪酸醇氧化酶基因在油菜不同组织中的表达水平。方法 利用RT PCR方法从油菜RNA中扩增长链脂肪酸醇氧化酶基因的cDNA ,并用 [α 3 2 P]dCTP标记该cDNA作为探针 ,应用Northernblot杂交技术分析长链脂肪酸醇氧化酶基因在油菜根、茎、叶及花等组织中的表达水平。结果 Northernblot杂交所检测的油菜根、茎、叶及花组织中均有位于 2 .4kb处的杂交带 ,但表达水平有差异 ,在油菜叶中表达量最高。结论 长链脂肪酸醇氧化酶基因表达于所有被检测的油菜组织中 ,可能为一种组成性表达的基因。

脂肪醇氧化酶基因缺失对热带假丝酵母生理功能的影响

为考察热带假丝酵母(Candida tropicalis)脂肪醇氧化酶(FAO)基因缺失对菌株自身的影响,利用同源重组的方法敲除或回补FAO1和FAO2基因,研究突变株的生长情况和胞内脂肪醇氧化酶活性变化,并进一步评价细胞利用烷烃合成脂肪醇的能力。结果表明:成功构建了基因缺失突变株FTYT(ΔFAO11/ΔFAO12)、2aT2bT(ΔFAO2a/ΔFAO2b)、F3YT(ΔFAO11/ΔFAO12ΔFAO2a/ΔFAO2b)和基因回补菌株UCF1和UCF2。在以葡萄糖为碳源的培养基中,各菌株的生长情况没有显著差异;在以烷烃(C12~C14)为碳源的培养基中,FTYT菌株生长速度快于其他菌株,F3YT菌株的生长速度显著受到抑制,表明组合删除FAO1和FAO2基因降低了细胞对烷烃的利用,影响了细胞生长。与出发菌株相比,同时删除FAO1和FAO2基因后突变株能够转化烷烃合成正十二烷醇,摇瓶发酵水平达到59.63 mg/L,是出发菌株的近460倍。FAO1和FAO2基因在细胞利用烷烃中有重要作用且功能存在差异,并且可以作为代谢工程改造热带假丝酵母生产脂肪醇的潜在靶点。

水稻长链脂肪醇氧化酶基因OsFAO结构分析及其进化研究

我们通过多年来的研究已证实在高等植物中也存在编码类似于工业酵母中长链脂肪醇氧化酶(FAO)的基因。本文对单子叶植物水稻FAO基因的结构、起源和进化进行了分析。利用拟南芥中FAO蛋白的氨基酸序列对水稻基因组进行tblastn及blastp搜索,结果显示在水稻基因组中存在4个FAO基因,1个位于2号染色体,命名为OsFAO1;另外3个在10号染色体上,分别命名为OsFAO2、OsFAO3和OsFAO4。其中位于2号染色体上的OsFAO1基因由3个外显子和2个内含子组成;10号染色体上的3个FAO基因中,OsFAO3和OsFAO4为2个外显子和1个内含子组成,OsFAO2是由4个外显子和3个内含子组成。序列预测结果显示,OsFAO1编码跨膜蛋白的可能性更大。我们进一步对已知序列的各类原核(874种)和各类真核(包括20种真菌)的基因组进行了分析,发现FAO基因主要存在于真菌和陆生植物基因组中,而不存在于原核和藻类的基因组中。对陆生植物基因组中的FAO基因的分析结果表明水稻中OsFAO1基因序列相对原始。

醇氧化酶aox1基因缺失对毕赤酵母菌产植酸酶的影响

研究通过同源重组的方法,敲除产植酸酶毕赤酵母菌株的醇氧化酶aox1基因,以改变菌株利用甲醇的速度,降低甲醇用量。试验得到一株甲醇利用慢型毕赤酵母,能降低发酵成本。在实际发酵生产中,aox1基因缺失的菌株发酵能力与原有菌株接近,生产能耗大幅降低,甲醇用量降低,最终单罐发酵成本降低约20%~24%。