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Non-invasive Prenatal Gene Diagnosis: Progress through Cell-free Fetal DNA and RNA in Maternal Plasma and Urine
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作者 GUO Xun-yang, GUO Yi-bin ( Department of Medical Genetics, Zhongshan School of Medicine, SUN Yat-Sen University, Guangzhou 510080, China ) 《中山大学学报(医学科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第S2期140-142,共3页
Non-invasive prenatal gene diagnosis has been developed rapidly in the recent years, and numerous medical researchers are focusing on it. Such techniques could not only achieve prenatal diagnosis accurately, but also ... Non-invasive prenatal gene diagnosis has been developed rapidly in the recent years, and numerous medical researchers are focusing on it. Such techniques could not only achieve prenatal diagnosis accurately, but also prevent tangential illness in fetuses and thus, reduce the incidence of diseases. Moreover, it is non-invasive prenatal gene diagnosis that prevents potential threaten and danger to both mothers and fetuses. Therefore, it is welcomed by clinical gynecologist and obstetrian, researchers of medical genetics, and especially, pregnancies. This review article touches briefly on the advanced development of using cell-free DNA, RNA in maternal plasma and urine for non-invasive prenatal gene diagnosis. 展开更多
关键词 NON-INVASIVE prenatal gene diagnosis cell-free fetal dna and RNA dna and RNA detection maternal URINE maternal plasma
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Quick recovery and characterization of cell-free DNA in seminal plasma of normozoospermia and azoospermia: implications for non-invasive genetic utilities 被引量:3
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作者 Hong-Gang Li Shi-Yun Huang Hui Zhou Ai-Hua Liao Cheng-Liang Xiong 《Asian Journal of Andrology》 SCIE CAS CSCD 2009年第6期703-709,共7页
We established a quick and reliable method for recovering cell-free seminal DNA (cfsDNA), by using the binding-washing-elution procedure on the DNA purification column. Low variations (below 15%) among the triplic... We established a quick and reliable method for recovering cell-free seminal DNA (cfsDNA), by using the binding-washing-elution procedure on the DNA purification column. Low variations (below 15%) among the triplicate values of cfsDNA quantity verified the reproducibility of our cfsDNA recovery method. Similar cfsDNA yield and size distribution between seminal plasma acquired by filtration and centrifugation confirmed the presence of cfsDNA. To investigate the general characterization of cfsDNA, the quantitation and size distribution of cfsDNA from normozoospermic and azoospermic semen were analyzed by real-time PCR and electrophoresis, respectively. CfsDNA concentration in semen with normozoospermia (n = 11) was 1.34 ± 0.65 μg ·mL^-1, whereas a higher cfsDNA concentration was observed in azoospermia (2.56 ± 1.43 μg ·mL^-1, n = 9). The continuous distribution of DNA fragments ranging from -1 kb to 15 kb and a spectrum of multiples of 180-bp fragments were observed in each normozoospermic and azoospermic sample. Distinct characteristic DNA ladder fragmentations in some azoospermic samples implicated that cfsDNA originate partly from apoptotic cells. CfsDNAs of 36 selected azoospermic patients with known information of Y chromosome microdeletion were subjected to the same microdeletion analysis by multiplex PCR and PCR amplification of sY114 (1 450 bp). All multiplex PCR reactions with cfsDNA amplified successfully and provided the same result as leukocyte DNA. PCR amplification of sY114 gave a 1 450-bp amplicon as expected. Our data suggested the potential use of cfsDNA in search of biomarker or diagnostic procedures. 展开更多
关键词 AZOOSPERMIA cell-free dna normozoospermia seminal plasma Y chromosome microdeletion
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Detection of fusion gene in cell-free DNA of a gastric synovial sarcoma 被引量:5
3
作者 Shinpei Ogino Hirotaka Konishi +10 位作者 Daisuke Ichikawa Junichi Hamada Katsutoshi Shoda Tomohiro Arita Shuhei Komatsu Atsushi Shiozaki Kazuma Okamoto Sanae Yamazaki Satoru Yasukawa Eiichi Konishi Eigo Otsuji 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2018年第8期949-956,共8页
Synovial sarcoma(SS) is genetically characterized by chromosomal translocation, which generates SYT-SSX fusion transcripts. Although SS can occur in any body part, primary gastric SS is substantially rare. Here we des... Synovial sarcoma(SS) is genetically characterized by chromosomal translocation, which generates SYT-SSX fusion transcripts. Although SS can occur in any body part, primary gastric SS is substantially rare. Here we describe a detection of the fusion gene sequence of gastric SS in plasma cell-free DNA(cf DNA). A gastric submucosal tumor was detected in the stomach of a 27-year-old woman and diagnosed as SS. Candidate intronic primers were designed to detect the intronic fusion breakpoint and this fusion sequence was confirmed in intron 10 of SYT and intron 5 of SSX2 by genomic polymerase chain reaction(PCR) and direct sequencing. A locked nucleic acid(LNA) probe specificto the fusion sequence was designed for detecting the fusion sequence in plasma and the fusion sequence was detected in preoperative plasma cfD NA, while not detected in postoperative plasma cfD NA. This technique will be useful for monitoring translocation-derived diseases such as SS. 展开更多
关键词 FUSION GENE GASTRIC SYNOVIAL SARCOMA plasma cell free dna
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血浆cfDNA甲基化联合检测在肝癌诊断中的价值
4
作者 夏娜梅 赵言腾 +4 位作者 杨乾坤 董兰兰 张玮 黄月 臧文巧 《河南医学研究》 CAS 2024年第11期1921-1925,共5页
目的 探讨血浆循环游离DNA(cfDNA)中GNB4、TCF24、Riplet、ACP1和TSPYL5基因甲基化对肝癌诊断的临床价值。方法 利用滑动窗口技术在公共数据库中筛选肝癌和正常组织间的差异甲基化标志物并分析其甲基化水平。从郑州大学第一附属医院收... 目的 探讨血浆循环游离DNA(cfDNA)中GNB4、TCF24、Riplet、ACP1和TSPYL5基因甲基化对肝癌诊断的临床价值。方法 利用滑动窗口技术在公共数据库中筛选肝癌和正常组织间的差异甲基化标志物并分析其甲基化水平。从郑州大学第一附属医院收集肝癌、肝硬化组织和健康人白细胞样本,Sanger测序检测筛选出的标志物的甲基化水平,选出敏感度和特异度较好的标志物。收集24例肝癌、23例肝硬化和99例健康人血浆,通过甲基化特异性PCR检测上述标志物单独和组合时对肝癌的诊断性能。结果 5个标志物(GNB4、TCF24、Riplet、ACP1和TSPYL5)在肝癌样本中显著高甲基化。组织测序结果显示除TCF24外,其他标志物在肝硬化组织中的甲基化阴性率均大于80.0%。在血浆样本验证中,GNB4单独诊断肝癌的曲线下面积(AUC)最大,为0.765,敏感度为66.7%,特异度为91.8%。在多基因组合中,GNB4+TSPYL5的诊断性能最佳,AUC值为0.893,敏感度为83.3%,特异度为90.2%。结论 GNB4、Riplet、ACP1和TSPYL5甲基化可用于肝癌诊断,且联合诊断性能优于单一基因。 展开更多
关键词 肝癌 循环游离dna 甲基化 血浆诊断
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血浆游离胎儿DNA浓度联合血清妊娠相关血浆蛋白-A、β-人绒毛膜促性腺激素检测对孕妇不良妊娠结局的预测价值
5
作者 劳力 梁娇 +2 位作者 蒙浣婷 艾文 杨仪心 《中国性科学》 2024年第3期91-95,共5页
目的探讨血浆游离胎儿DNA(cff-DNA)浓度联合血清妊娠相关血浆蛋白-A(PAPP-A)和β-人绒毛膜促性腺激素(β-hCG)检测对孕妇不良妊娠结局的预测价值。方法选取2022年8月至2023年2月佛山复星禅诚医院收治的进行产检、唐氏筛查和无创产前DNA... 目的探讨血浆游离胎儿DNA(cff-DNA)浓度联合血清妊娠相关血浆蛋白-A(PAPP-A)和β-人绒毛膜促性腺激素(β-hCG)检测对孕妇不良妊娠结局的预测价值。方法选取2022年8月至2023年2月佛山复星禅诚医院收治的进行产检、唐氏筛查和无创产前DNA检查(NIPT)的195例孕妇作为研究对象。将发生不良妊娠结局的孕妇设为研究组(n=36),无不良妊娠结局的孕妇设为对照组(n=159)。检测两组血浆cff-DNA浓度、血清PAPP-A和β-hCG水平;采用Spearman分析血浆cff-DNA浓度、血清PAPP-A和β-hCG水平与不良妊娠结局的相关性;采用受试者工作特征(ROC)曲线分析血浆cff-DNA浓度、血清PAPP-A和β-hCG水平对不良妊娠结局的预测价值。结果与对照组比较,研究组血浆cff-DNA浓度和血清PAPP-A水平显著更低,血清β-hCG水平显著更高,差异具有统计学意义(P<0.05);Spearman分析结果显示,血浆cff-DNA浓度、血清PAPP-A和β-hCG水平与妊娠期高血压、子痫前期、早产、死胎、新生儿窒息和胎儿生长受限不良妊娠结局具有显著相关性(P<0.05);ROC曲线结果显示,血浆cff-DNA浓度单独预测孕妇不良妊娠结局的曲线下面积为0.807,截断值为11.82%;血清PAPP-A单独预测孕妇不良妊娠结局的曲线下面积为0.804,截断值为0.41;血清β-hCG单独预测孕妇不良妊娠结局的曲线下面积为0.815,截断值为2.56;预测效能比较结果显示,血浆cff-DNA浓度、血清PAPP-A和β-hCG水平联合预测孕妇不良妊娠结局的特异度(97.48%)和准确度(96.41%)均显著高于三者单独预测(P<0.05),误诊率(2.52%)显著低于三者单独预测(P<0.05)。结论血浆cff-DNA浓度联合血清PAPP-A、β-hCG检测对孕妇不良妊娠结局具有较高的预测价值。 展开更多
关键词 血浆游离胎儿dna浓度 妊娠相关血浆蛋白-A Β-人绒毛膜促性腺激素 不良妊娠结局 预测价值
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母体循环中胎儿游离DNA在单基因病产前诊断的研究进展
6
作者 何素娜 周俏苗 《医学综述》 CAS 2024年第18期2288-2292,2299,共6页
单基因病是引起胎儿出生缺陷的主要原因之一,其种类多,病情复杂,缺乏有效治疗方法,且预后差。目前,无创产前检测(NIPT)已成为筛查胎儿非整倍体的主要手段,在临床上广泛应用。基于母体循环中胎儿游离DNA(cffDNA)的发现及高通量测序技术... 单基因病是引起胎儿出生缺陷的主要原因之一,其种类多,病情复杂,缺乏有效治疗方法,且预后差。目前,无创产前检测(NIPT)已成为筛查胎儿非整倍体的主要手段,在临床上广泛应用。基于母体循环中胎儿游离DNA(cffDNA)的发现及高通量测序技术的发展,单基因病的NIPT成为研究热点,且检测技术及其检测的疾病种类也在不断增加,但是单基因病的检测存在难度大、成本高等问题。目前胎儿单基因病的NIPT仍然处于研究阶段,尚未在临床应用。因此,深入研究母体循环中cffDNA的NIPT对单基因病产前诊断具有重要意义。 展开更多
关键词 单基因病 胎儿游离dna 无创产前检测 产前诊断
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基于胎儿游离DNA的地中海贫血无创产前诊断的研究进展 被引量:2
7
作者 许桂丹(综述) 邓益斌(审校) 《医学研究与战创伤救治》 CAS 北大核心 2023年第7期771-774,共4页
重型地中海贫血(地贫)目前尚无有效治疗措施,通过产前诊断阻止重型患儿出生是国内外公认的首选预防措施。目前,地贫的产前诊断仍依赖于有创的方法,即绒毛活检、羊水穿刺和脐静脉血穿刺,存在一定的宫内感染和流产风险,安全、无创、快速... 重型地中海贫血(地贫)目前尚无有效治疗措施,通过产前诊断阻止重型患儿出生是国内外公认的首选预防措施。目前,地贫的产前诊断仍依赖于有创的方法,即绒毛活检、羊水穿刺和脐静脉血穿刺,存在一定的宫内感染和流产风险,安全、无创、快速和准确的地贫产前诊断方法对高发区意义重大。孕妇外周血胎儿游离DNA(cffDNA)的发现,下一代测序(NGS)的快速发展与应用,使无创产前DNA检测(NIPT)成为现实。目前,利用cffDNA检测胎儿13、18和21号染色体非整倍体的NIPT技术已经成熟应用于临床,但地贫的NIPT仍处于研究探索阶段。文章主要基于cffDNA和NGS的地贫NIPT研究进展进行综述。 展开更多
关键词 地中海贫血 cffdna 无创产前检测 高通量测序
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母体外周血胎儿游离DNA浓度与不良围产结局的相关性探究
8
作者 李佳欣 宫晓丽 +4 位作者 石慧峰 原鹏波 陈练 魏瑗 赵扬玉 《中国生育健康杂志》 2023年第5期409-415,422,共8页
目的探究母体外周血中胎儿游离DNA(cffDNA)浓度与不良围产结局的相关性。方法纳入2017年4月-2021年4月孕12^(+0)~26^(+6)周在本院行cffDNA无创产前筛查的单胎妊娠孕妇9917例。Logistic回归和ROC曲线评估不同cffDNA浓度梯度与不良围产结... 目的探究母体外周血中胎儿游离DNA(cffDNA)浓度与不良围产结局的相关性。方法纳入2017年4月-2021年4月孕12^(+0)~26^(+6)周在本院行cffDNA无创产前筛查的单胎妊娠孕妇9917例。Logistic回归和ROC曲线评估不同cffDNA浓度梯度与不良围产结局的相关性。结果与cffDNA浓度高于75^(th)百分位相比,当cffDNA浓度低于25^(th)百分位时,孕妇发生妊娠期高血压(OR=1.5,95%CI:1.1~2.0)、子痫前期(OR=1.5,95%CI:1.1~1.9)、妊娠期糖尿病(OR=1.2,95%CI:1.1~1.4)、胎儿宫内生长受限(OR=1.8,95%CI:1.3~2.6)的风险增加。另外,子痫前期亚组分析显示,cffDNA%低于25^(th)百分位显著增加子痫前期并发胎儿宫内生长受限(OR=2.2,95%CI:1.0~4.7)、早发型子痫前期(OR=3.5,95%CI:1.7~7.4)、重度子痫前期(OR=1.4,95%CI:1.0~2.0)风险。cffDNA浓度联合孕妇年龄、BMI、受孕方式、产次预测早发型子痫前期的效果最佳,ROC曲线下面积为0.9,敏感性93.6%,特异性89.2%。结论cffDNA低浓度与妊娠期高血压、子痫前期、妊娠期糖尿病、胎儿宫内生长受限的风险增加有关,且与子痫前期的严重程度有关。 展开更多
关键词 胎儿游离dna浓度 不良围产结局 早期筛查
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结直肠癌筛查人群血浆游离DNA浓度及其对甲基化筛检技术的影响
9
作者 郑卫方 柴晓银 +5 位作者 潘富珍 徐美慧 章喆 蓝柳豪 黄彦钦 郑树 《浙江临床医学》 2023年第10期1438-1441,1444,共5页
目的明确结直肠癌筛查人群血浆中游离DNA(cfDNA)浓度的特点,试验cfDNA定量能否提高血浆甲基化标志物筛查结直肠癌的性能。方法一项基于人群研究从社区招募40~74岁个体。结肠镜检查前进行问卷调查和抽血,纯化血浆cfDNA进行浓度测定,然后... 目的明确结直肠癌筛查人群血浆中游离DNA(cfDNA)浓度的特点,试验cfDNA定量能否提高血浆甲基化标志物筛查结直肠癌的性能。方法一项基于人群研究从社区招募40~74岁个体。结肠镜检查前进行问卷调查和抽血,纯化血浆cfDNA进行浓度测定,然后用MethyLight检测两种甲基化标志物(SEPT9和C9ORF50)。构建加或不加cfDNA浓度因素的多因素风险预测模型,生成接收操作曲线,比较诊断性能。结果最终纳入479例,其中进展期肿瘤58例。血浆cfDNA浓度最高的前10位个体平均(139.96±183.10),cfDNA浓度是其余个体(7.82±4.42)的18倍。cfDNA浓度升高者特征多样,仅与腹痛、高脂血症统计学相关。加或不加血浆cfDNA浓度的风险模型预测进展期肿瘤无显著差异(AUC=0.579和0.591,P=0.466)。对样本设置cfDNA浓度阳性阈值后,甲基化检测对进展期肿瘤敏感性(19.0%,95%CI:8.9~29.1)和特异性(89.1%,95%CI:86.1~92.1)并未提高。结论社区人群中少数看似正常的个体,由于未知原因,其血浆中cfDNA浓度较高。血浆cfDNA定量可能无助于大肠癌筛查。 展开更多
关键词 结直肠肿瘤 血浆游离dna 甲基化
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基于孕妇血浆cffDNA高通量测序对巴氏胎儿水肿综合征进行产前检测的研究
10
作者 陈宏健 周俏苗 +2 位作者 王游声 李雅璇 符免艾 《陆军军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第24期2563-2569,共7页
目的通过对孕妇血浆中胎儿游离DNA(cell-free fetal DNA,cffDNA)的深度测序实现无创性α-地中海贫血(--SEA型)的基因分型。方法对cffDNA进行α-地中海贫血基因分型。于2021年11月至2022年11月通过分离来自海口市妇幼保健院、海南省妇女... 目的通过对孕妇血浆中胎儿游离DNA(cell-free fetal DNA,cffDNA)的深度测序实现无创性α-地中海贫血(--SEA型)的基因分型。方法对cffDNA进行α-地中海贫血基因分型。于2021年11月至2022年11月通过分离来自海口市妇幼保健院、海南省妇女儿童医学中心、海南医学院第一附属医院因夫妻双方为东南亚型α-地中海贫血(--^(SEA)/αα)而需要进行产前诊断的34例孕妇(孕12~24周,均为单胎妊娠)血浆,历经cffDNA的提取、文库构建与杂交、模板制备与富集、上机测序等一系列基于Ion Proton平台的高通量测序操作,采用多维贝叶斯概率模型方法评估胎儿患巴氏胎儿水肿综合征的概率。随后从孕妇羊水中提取DNA,利用Gap-PCR对α-地中海贫血进行基因分型,并比较cffDNA与胎儿羊水DNAα-地中海贫血基因分型的符合率。结果34例孕妇血浆的cffDNA分型结果与对应的羊水DNA分型结果进行比较,28例的分型结果一致,4例不一致,2例因孕妇未行产前诊断无法比较,最终结果相符率为87.5%。结论利用孕妇血浆cffDNA进行巴氏胎儿水肿综合征(--^(SEA)/--^(SEA))的鉴定获得成功,其与羊水DNA分型结果具有高水平的符合率。 展开更多
关键词 巴氏胎儿水肿综合征 胎儿游离dna 高通量测序
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孕期血浆游离DNA相关指标对不良妊娠结局预测价值的研究进展
11
作者 梅凤琦 刘彦慧 《生殖医学杂志》 CAS 2023年第11期1766-1770,共5页
不良妊娠结局会影响胎儿的生长发育,并威胁母婴生命安全。因此,不良妊娠结局的早筛查、早发现、早预防对母婴健康尤为重要。孕期血浆游离DNA(cfDNA)主要来自母体髓系/淋巴系细胞和胎盘滋养细胞,其中cfDNA浓度、游离胎儿DNA分数、线粒体... 不良妊娠结局会影响胎儿的生长发育,并威胁母婴生命安全。因此,不良妊娠结局的早筛查、早发现、早预防对母婴健康尤为重要。孕期血浆游离DNA(cfDNA)主要来自母体髓系/淋巴系细胞和胎盘滋养细胞,其中cfDNA浓度、游离胎儿DNA分数、线粒体DNA、核小体启动子等cfDNA相关指标对不良妊娠结局的预测价值各不相同,本文就近年来各cfDNA相关指标预测常见不良妊娠结局的研究进展进行综述。 展开更多
关键词 血浆游离dna 游离胎儿dna分数 线粒体dna 核小体启动子 不良妊娠结局
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血浆游离DNA含量和完整性的动态变化在食管癌中的临床价值
12
作者 马春芳 李翔翔 杨鸿林 《安徽医药》 CAS 2023年第10期1986-1990,共5页
目的探讨食管癌病人血浆游离DNA(cf-DNA)的含量和完整性(以cf-DNA长片段ALU247与短片段ALU115含量的比值表示)在食管癌诊治中的临床意义。方法选择2020年6月至2022年5月苏州市第九人民医院收治的50例食管癌病人、50例食管良性肿瘤病人... 目的探讨食管癌病人血浆游离DNA(cf-DNA)的含量和完整性(以cf-DNA长片段ALU247与短片段ALU115含量的比值表示)在食管癌诊治中的临床意义。方法选择2020年6月至2022年5月苏州市第九人民医院收治的50例食管癌病人、50例食管良性肿瘤病人、50例健康对照者为前瞻性研究的研究对象,分别纳入食管癌组、食管良性病变组以及健康对照组,用微量血液基因组提取试剂盒(Qiagen)提取血浆cf-DNA,并以实时荧光定量PCR法检测cf-DNA含量,收集其中25例食管癌病人术后血浆并检测cf-DNA含量,动态监测cf-DNA在术前术后的变化。检测食管癌病人糖类抗原199(CA199)、癌胚抗原(CEA)、鳞状上皮细胞癌抗原(SCC)含量,比较cf-DNA和肿瘤标志物在食管癌中的诊断价值。结果食管癌组、良性病变组、健康对照组术前食管癌血浆ALU115含量[4.30(2.06,8.36)μg/L,1.98(1.38,3.02)μg/L,1.63(0.87,2.66)μg/L];ALU247含量[1.40(0.91,4.10)μg/L,0.63(0.37,1.27)μg/L,0.26(0.15,0.43)μg/L];cf-DNA完整性[0.41(0.29,0.69),0.33(0.25,0.50),0.18(0.11,0.28)](均P<0.05);ALU115[术前4.41(2.04,8.87)μg/L,术后1.05(0.66,1.75)μg/L]以及完整性[术前0.49(0.27,0.77),术后0.30(0.17,0.37)]在术前术后相比差异有统计学意义(P<0.05);在食管癌分期、分化程度、是否有远处转移上血浆cf-DNA差异有统计学意义(P<0.05);相比传统肿瘤标志物,血浆cf-DNA的诊断效能更高,当ALU247含量取0.65μg/L时,受试者操作特征(ROC)曲线下面积最大,为0.95。结论血浆cf-DNA检测在食管癌诊治、预后中有一定的临床价值。 展开更多
关键词 食管肿瘤 血浆游离dna 糖类抗原199(CA199) 癌胚抗原(CEA) 鳞状上皮细胞癌抗原(SCC)
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无创产前检测:迈向下一个十年 被引量:2
13
作者 王彦林 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期15-19,共5页
无创产前基因检测(NIPT)是过去10余年来产前筛查领域的重大突破,是围产医学领域的引领技术。通过低深度全基因组测序分析孕妇外周血胎儿游离DNA(cffDNA),实现了高效的唐氏综合征产前筛查,同时可扩展应用于其他染色体非整倍体、拷贝数变... 无创产前基因检测(NIPT)是过去10余年来产前筛查领域的重大突破,是围产医学领域的引领技术。通过低深度全基因组测序分析孕妇外周血胎儿游离DNA(cffDNA),实现了高效的唐氏综合征产前筛查,同时可扩展应用于其他染色体非整倍体、拷贝数变异等常见胎儿基因组问题的筛查,实现胎儿疾病的早期无创检测。但是,NIPT依然需要更多循证医学证据支持,以迈向更为广阔的应用空间。文章从NIPT适应证选择、NIPT异常结果分析、NIPT结果报道与解读中的伦理学问题、NIPT在胎儿基因变异筛查中的应用以及非cffDNA来源NIPT技术开发等角度,探讨了NIPT目前面临的问题与未来的发展趋势。 展开更多
关键词 无创产前筛查 游离胎儿dna 基因组测序 外显组测序
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孕妇血样采集后体外存放对血浆中胎儿游离DNA水平的影响 被引量:8
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作者 李勤 张毅 +3 位作者 丁宇烽 胡振林 孙树汉 惠宁 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期1042-1045,共4页
目的:探讨孕妇血样采集后体外存放过程中血浆游离DNA水平的影响因素。方法:采集孕妇血样,体外4℃存放6、36h后,实时定量PCR检测孕妇外周游离DNA水平,Annexin Ⅴ/PI双染色法流式分析血样白细胞死亡情况,速率法检测血浆乳酸脱氢酶(LDH)活... 目的:探讨孕妇血样采集后体外存放过程中血浆游离DNA水平的影响因素。方法:采集孕妇血样,体外4℃存放6、36h后,实时定量PCR检测孕妇外周游离DNA水平,Annexin Ⅴ/PI双染色法流式分析血样白细胞死亡情况,速率法检测血浆乳酸脱氢酶(LDH)活性,单相酶扩散法测定血浆DNA酶活性。结果:血样体外存放36h后,血浆中β-globin基因的拷贝数较存放6h的样品显著增加,而SRY基因拷贝数明显减少;4℃存放条件下,妊娠晚期孕妇外周血中胎儿DNA占总DNA百分比从6h的(10.3±5.6)%下降到36h的(3.0±2.1)%,差异有统计学意义(P<0.05)。体外存放6h的血样中基本未检出死亡细胞,而存放36h的血样中分别检出了坏死和凋亡的白细胞;36h样品血浆中LDH活性较6h样品显著升高(P<0.05)。单相酶扩散法结果表明,血浆DNA酶在4℃时虽然活性显著减弱,但仍然保持降解DNA的能力。结论:血样采集后体外存放时间过长会导致血浆总游离DNA增多,而胎儿DNA减少,这种变化可能与血样体外存放过程中白细胞死亡和血浆DNA酶对胎儿DNA的降解作用有关;胎儿DNA抽提应在血样采集后尽早(6h内)进行。 展开更多
关键词 孕妇 血浆 胎儿游离dna dnaSE 乳酸脱氢酶
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利用孕妇血浆中的胎儿DNA进行β-地中海贫血的产前诊断 被引量:12
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作者 李广华 荣卡彬 +5 位作者 罗燕飞 陈冬 龚彩平 吴劲 邸玉玮 葛艳芬 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期1437-1439,共3页
目的利用孕妇血浆中游离胎儿DNA(cffDNA)对广东省最常见17种β地中海贫血的突变基因进行扩增,探讨非创引个伤常性物见产,对位前c点诊ffD和断Nβ9A-个地进少中行见海二位贫次点血P突C的R变可,反的行向共性斑。17点方种杂法β地交贫技①... 目的利用孕妇血浆中游离胎儿DNA(cffDNA)对广东省最常见17种β地中海贫血的突变基因进行扩增,探讨非创引个伤常性物见产,对位前c点诊ffD和断Nβ9A-个地进少中行见海二位贫次点血P突C的R变可,反的行向共性斑。17点方种杂法β地交贫技①基术羊因检水;测途②β径抽地:取中抽孕海取妇贫孕外血妇周的羊血突水,变共柱基9分例因离,。采法结用提果反取向及9例斑凝孕点胶妇杂回中交收有技纯5术化例检D经N测羊A中,水设国检计人测群3对证8实胎儿有父系的β地贫基因,有2例孕妇外周血中检测到胎儿(父系)β地贫基因,与羊水检测相符。结论利用cffDNA进行β-地中海贫血的检测方法可行,但由于母源性DNA背景的污染,以及胎儿DNA因含量而导致检出率低,希望进一步改进该技术后有望可用于β-地中海贫血的诊断。 展开更多
关键词 Β地中海贫血 游离胎儿dna 反向斑点杂交
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孕妇外周血中胎儿游离DNA在产前诊断中的应用 被引量:12
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作者 王文博 张毅 孙树汉 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期442-446,共5页
孕妇外周血中胎儿游离DNA的发现,为无创性产前诊断开辟了一条新途径。检测孕妇血浆中特异的胎儿DNA序列已被用于胎儿性连锁疾病鉴定、RhD血型检查和多种单基因遗传病的产前诊断;游离DNA水平的变化还可被用作某些妊娠相关疾病如先兆子、... 孕妇外周血中胎儿游离DNA的发现,为无创性产前诊断开辟了一条新途径。检测孕妇血浆中特异的胎儿DNA序列已被用于胎儿性连锁疾病鉴定、RhD血型检查和多种单基因遗传病的产前诊断;游离DNA水平的变化还可被用作某些妊娠相关疾病如先兆子、早产和胎儿染色体疾病的临床诊断新指标。本文对母体外周血中胎儿游离DNA的生化特征及其临床应用研究,进行了总结和分析。 展开更多
关键词 胎儿游离dna 游离核酸 无创性产前诊断 基因诊断 孕妇血浆
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孕妇血浆游离DNA高通量测序用于胎儿性染色体非整倍体检测的初步探讨 被引量:13
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作者 林颖 蒋馥蔓 +9 位作者 秦岭 马定远 刘立夫 陈芳 张红云 王威 季修庆 孟露露 胡平 许争峰 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期406-408,共3页
目的初步探讨孕妇血浆游离DNA高通量测序用于产前胎儿性染色体非整倍体检测的效果及临床可行性。方法2011年至2012年收集早、中孕期单胎孕妇5 540例,在知情同意的原则下采集外周血血浆进行游离DNA的高通量测序检测,通过生物信息学分析,... 目的初步探讨孕妇血浆游离DNA高通量测序用于产前胎儿性染色体非整倍体检测的效果及临床可行性。方法2011年至2012年收集早、中孕期单胎孕妇5 540例,在知情同意的原则下采集外周血血浆进行游离DNA的高通量测序检测,通过生物信息学分析,获得测序结果;对测序检出的性染色体非整倍体患者行羊水穿刺,进行染色体G显带分析。结果5 540例样本中测序方法共检出10例性染色体非整倍体,其中6例与G带核型分析结果一致,包括3例45,X,1例47,XXY,2例47,XYY,其余4例G带核型正常。结论孕母血浆游离DNA高通量测序可对性染色体非整倍体胎儿进行无创性产前检测,但存在假阳性,还需进一步完善实验方案以提高检测效果。 展开更多
关键词 高通量测序 无创性产前诊断 胎儿游离dna 性染色体非整倍体
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QPCR技术检测孕妇外周血中胎儿DNA方法的建立 被引量:1
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作者 凌奕 金松 +5 位作者 易国辉 袁媛 陈芳 黄振兰 黄垂灿 黄元华 《海南医学院学报》 CAS 2013年第9期1171-1174,共4页
目的:建立QPCR技术检测孕妇外周血中胎儿DNA的方法,并探讨其方法的稳定性、灵敏性与可靠性。方法:通过prime5.0设计出SRY与β-globin的TapMan探针,并对其QPCR反应体系进行优化。结果:分别得到了SRY与β-globin的引物及探针的反应最适浓... 目的:建立QPCR技术检测孕妇外周血中胎儿DNA的方法,并探讨其方法的稳定性、灵敏性与可靠性。方法:通过prime5.0设计出SRY与β-globin的TapMan探针,并对其QPCR反应体系进行优化。结果:分别得到了SRY与β-globin的引物及探针的反应最适浓度比,建立了其最佳QPCR反应体系,并得出所需外周血的最少量。结论:成功建立了QPCR技术检测孕妇外周血中胎儿DNA的方法,该方法将可用于无创性相关产前诊断。 展开更多
关键词 QPCR SRY基因 β-globin基因 cell free fetal dna
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应用孕妇血浆中胎儿游离DNA进行产前筛查的临床研究进展 被引量:7
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作者 李晓洲 史云芳 +2 位作者 琚端 李岩 张颖 《天津医药》 CAS 北大核心 2020年第8期796-800,共5页
无创产前检测(NIPT)是采用二代测序技术对孕妇血浆中胎儿游离DNA(cffDNA)片段进行检测,通过生物信息学分析进行常见的胎儿染色体非整倍体异常的筛查。因其具有较高的检出率、敏感度和特异度以及较低的假阳性率,成为目前广泛应用的染色... 无创产前检测(NIPT)是采用二代测序技术对孕妇血浆中胎儿游离DNA(cffDNA)片段进行检测,通过生物信息学分析进行常见的胎儿染色体非整倍体异常的筛查。因其具有较高的检出率、敏感度和特异度以及较低的假阳性率,成为目前广泛应用的染色体非整倍体的产前筛查技术。通过NIPT筛查高风险孕妇选择性进行有创产前诊断,可避免大量不必要的有创性产前诊断。母体及胎儿因素可影响NIPT检测结果。临床应用时应充分考虑不同孕妇的个体情况。本文就应用孕妇血浆中cffDNA进行NIPT的临床研究进展及其影响因素进行综述,为个体化、规范化应用NIPT技术提供参考。 展开更多
关键词 产前诊断 染色体障碍 染色体畸变 胎儿游离dna 无创产前检测
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孕妇外周血中游离胎儿DNA浓度与不良妊娠结局的关系 被引量:8
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作者 白小艺 冯俏丽 +1 位作者 韩振艳 侯红瑛 《中山大学学报(医学科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期917-923,共7页
【目的】探讨游离胎儿DNA浓度(FF)与不良妊娠结局的关系。【方法】对2017年1月至2018年10月在中山大学附属第三医院产科行无创产前检测并住院分娩的中国籍产妇1231例进行回顾性分析,其中妊娠期高血压病(HDP)组、胎儿生长受限(FGR)组及... 【目的】探讨游离胎儿DNA浓度(FF)与不良妊娠结局的关系。【方法】对2017年1月至2018年10月在中山大学附属第三医院产科行无创产前检测并住院分娩的中国籍产妇1231例进行回顾性分析,其中妊娠期高血压病(HDP)组、胎儿生长受限(FGR)组及早产组分别为84、57和59例作为病例组;将无妊娠并发症的孕妇1031例作为对照组。分析FF与年龄、采血孕周、体质量指数(BMI)的相关性,比较病例组与对照组FF的差异。【结果】行NIPT的1031例正常孕妇中,外周血的游离胎儿DNA浓度(FF)为(12.03±3.64)%,FF与孕妇BMI存在负相关(rs=-0.079,P<0.05)。HDP组(84例)、FGR组(57例)及早产组(59例)的FF分别为(11.21±2.60)%、(12.48±3.92)%和(11.66±3.34)%。HDP组与对照组相比,FF的差异具有统计学意义,OR=0.926(95%置信区间:0.859~0.997;P=0.043)。FGR组、早产组的FF与对照组相比,差异均无统计学意义。【结论】HDP的孕妇血浆中游离胎儿DNA的浓度降低,低FF是HDP发生的危险因素;尚未发现FF与胎儿生长受限、早产的发病有关。 展开更多
关键词 游离胎儿dna浓度 妊娠期高血压疾病 胎儿生长受限 早产
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