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A Universal Real-Time Fluorescence qPCR Method for Identifying Epidemic Strains of African Swine Fever Virus
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作者 Meihui Lv Qiuyue Zheng +4 位作者 Lili Yang Lin Wang Lili Chen Aifu Yang Jijuan Cao 《Open Journal of Genetics》 2021年第4期102-119,共18页
Objective Establishing a highly sensitive real-time fluorescence quantitative PCR (qPCR) method for universal testing of epidemic African swine fever virus (ASFV) strains. Methods The ASFV p72 gene was targeted to des... Objective Establishing a highly sensitive real-time fluorescence quantitative PCR (qPCR) method for universal testing of epidemic African swine fever virus (ASFV) strains. Methods The ASFV p72 gene was targeted to design primer probes covering 24 p72 genotypes. The optimal amount of dimethylsulphoxide (DMSO) for qPCR amplification was determined, Various sensitivity and limit of detection (LOD) tests were performed, and clinical samples from China and imported goods were tested. Results The optimal primer-probe combination could specifically detect ASFV, 1.5% DMSO was optimal for qPCR, and LOD reached 3.2 copies/μL with good reproducibility (n = 20, p = 0.369). The method was employed to test 142 clinically suspected samples, of which 30 pig blood and 37 pig tissue samples were ASFV-positive. Moreover, the positive testing rate for ASFV was higher than for the standard qPCR method recommended by the Office International Des Epizooties (OIE), and for the commercially available kit. Thus, our method is superior for testing weakly positive samples with low virus titre, and epidemic strains present in imported goods. Conclusion Our method could be employed for universal testing of epidemic ASFV strains worldwide, ensuring wider coverage of hosts and ASFV strains/endemic strains, reducing false<span style="font-family:;" "=""> </span><span style="font-family:Verdana;">negatives, and benefitting early diagnosis.</span> 展开更多
关键词 African Swine fever Virus Real-time Fluorescence qPCR Epidemic Strain Virus Detection DMSO ASFV Testing
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非洲猪瘟病毒常规PCR及Real-time PCR检测方法的建立 被引量:22
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作者 张泉 朱鸿飞 孙怀昌 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期458-461,共4页
根据非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)P72基因的核苷酸序列,设计并合成引物以及荧光标记的TaqMan探针,以含P72基因的重组质粒作为阳性模板,用于常规PCR和Real-time PCR方法的建立,结果表明常规PCR的检测灵敏度是600个拷贝... 根据非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)P72基因的核苷酸序列,设计并合成引物以及荧光标记的TaqMan探针,以含P72基因的重组质粒作为阳性模板,用于常规PCR和Real-time PCR方法的建立,结果表明常规PCR的检测灵敏度是600个拷贝的病毒核酸分子,Real-time PCR的检测灵敏度是20个拷贝的病毒核酸分子,两种PCR检测方法均具有特异性强、简单快速的优点。可以用于出入境检验检疫部门对非洲猪瘟病毒的快速检测。 展开更多
关键词 非洲猪瘟 常规PCR REAL-time PCR
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AllGlo探针Real-time RT-PCR检测发热伴血小板减少综合征病毒 被引量:6
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作者 李志锋 胡建利 +2 位作者 鲍倡俊 王笑辰 祁贤 《江苏预防医学》 CAS 2016年第5期516-519,共4页
目的建立基于AllGlo探针Real—time RT—PCR技术检测发热伴血小板减少综合征病毒(SFTSV)的方法。方法根据SFTSV基因组S片段的相对保守序列设计引物和AllGlo探针,建立和优化Real—time RT—PCR反应体系,对其敏感性、特异性和稳定性... 目的建立基于AllGlo探针Real—time RT—PCR技术检测发热伴血小板减少综合征病毒(SFTSV)的方法。方法根据SFTSV基因组S片段的相对保守序列设计引物和AllGlo探针,建立和优化Real—time RT—PCR反应体系,对其敏感性、特异性和稳定性进行评价,并检测临床疑似SFTSV病例标本,与普通RT—PCR法、病毒分离法和抗体检测法进行比较。结果 所建立AllGlo探针Real—time RT—PCR法检测SFTSV核酸,标准曲线方程为Y=3.38x+46.03(Y为ct值,z为核酸拷贝数log值),r2〉O.998,扩增效率为97.6%,Ct值变异系数(CV)均〈1.2%,检测限为1.00×10^3copy/mL。与汉坦病毒、H1N1、H3N2、登革病毒1~4型均无交叉。检测362份疑似病例标本,SFTSV核酸阳性检出率11.9%,高于普通RT-PCR法、病毒分离法和抗体检测法(P值均d0.05)。结论建立的AllGlo探针Real—time RT-PCR法,操作简单、快速,灵敏性、特异性较高,可用于SFTSV核酸检测。 展开更多
关键词 发热伴血小板减少综合征病毒 AllGlo探针 Real-timeRT-PCR 病毒分离 抗体检测 RT-PCR
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综合洗消体系对阻断非洲猪瘟病毒传入猪场的作用 被引量:1
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作者 张韵 金睿妍 +2 位作者 何佳蔚 程光胜 丁红雷 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2024年第2期152-156,F0003,共6页
切断非洲猪瘟病毒(ASFV)传播途径是防控非洲猪瘟的有效手段。本试验旨在通过在某种猪场建立综合洗消体系以阻断ASFV传入。对拟进入猪场的车辆在出发前和距猪场1 km处清洗和消毒,在猪场门口进行第3次消毒;人员进入猪场前洗澡和隔离,并将... 切断非洲猪瘟病毒(ASFV)传播途径是防控非洲猪瘟的有效手段。本试验旨在通过在某种猪场建立综合洗消体系以阻断ASFV传入。对拟进入猪场的车辆在出发前和距猪场1 km处清洗和消毒,在猪场门口进行第3次消毒;人员进入猪场前洗澡和隔离,并将其衣物消毒;输入物资进场前消毒。通过实时荧光定量PCR检测经洗消的车辆、人员、物资和猪场内猪只携带ASFV核酸情况,酶联免疫吸附测定(ELISA)检测猪只的ASFV抗体水平。结果显示,2019、2020、2021和2022年,车辆ASFV检出率分别为2.6%、1.3%、0和0,人员ASFV检出率分别为3.0%、1.1%、0和0.9%,物资ASFV检出率分别为12.5%、0、5.9%和0;4年间,猪场内猪只的ASFV核酸和抗体检测均为阴性。结果表明,通过建立完善的洗消体系并开展ASFV检测,能有效阻断ASFV传入猪场。 展开更多
关键词 非洲猪瘟病毒 实时荧光定量PCR 酶联免疫吸附测定(ELISA) 车辆 人员 物资
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针对非洲猪瘟病毒K205R基因实时荧光定量PCR检测方法的建立与应用
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作者 乔思娜 李丽薇 +8 位作者 赵款 高飞 周艳君 姜一峰 童武 赵冉 童光志 李国新 董世山 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2024年第4期67-72,共6页
为了快速、准确检测非洲猪瘟病毒(African swin fever virus,ASFV),本文根据我国流行毒株ASFV SY18(GenBank ID:MH766894.1)已公布的K205R基因序列设计并合成特异性引物及探针,建立针对K205R基因的TaqMan荧光定量PCR检测方法。经过特异... 为了快速、准确检测非洲猪瘟病毒(African swin fever virus,ASFV),本文根据我国流行毒株ASFV SY18(GenBank ID:MH766894.1)已公布的K205R基因序列设计并合成特异性引物及探针,建立针对K205R基因的TaqMan荧光定量PCR检测方法。经过特异性试验、敏感性试验、重复性试验和临床样品检测试验分析显示,本文建立的TaqMan荧光定量PCR检测方法Ct值与标准品在1×10^(11)~1×10^(2)copies/μL范围内具有很好的线性关系,相关系数为0.998,斜率为-2.797,检测下限为10^(2)copies/μL,与其他能引起相似临床症状的猪源病毒无交叉反应。重复性试验结果显示,组间与组内变异系数均小于1.53774%,重复性好。本方法适用于临床样品及本实验室构建的表达ASFV K205R基因的重组猪繁殖与呼吸综合征病毒的鉴定及检测,对ASFV快速检测及ASF早期诊断有重要意义。 展开更多
关键词 非洲猪瘟病毒(ASFV) K205R基因 荧光定量PCR 检测方法
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2018—2023年吉林省肾综合征出血热流行特征及宿主动物监测分析
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作者 王俊锋 吴昊 +1 位作者 李美娜 赵庆龙 《热带病与寄生虫学》 CAS 2024年第3期133-139,共7页
目的分析吉林省肾综合征出血热(hemorrhagic fever with renal syndrome,HFRS)流行病学特征并对2024年吉林省HFRS发病趋势进行预测,为该病的防控提供参考。方法收集2018—2023年中国疾病预防控制信息系统中吉林省HFRS的发病数据及吉林... 目的分析吉林省肾综合征出血热(hemorrhagic fever with renal syndrome,HFRS)流行病学特征并对2024年吉林省HFRS发病趋势进行预测,为该病的防控提供参考。方法收集2018—2023年中国疾病预防控制信息系统中吉林省HFRS的发病数据及吉林省各监测点的宿主动物监测数据,采用描述流行病学方法对其进行分析。通过建立自回归移动平均(autoregressive integrated moving average,ARIMA)模型,对2018—2023年吉林省HFRS病例数进行拟合并预测2024年发病情况。结果2018—2023年吉林省共报告HFRS病例1993例,其中2018年病例数和发病率均为最高(578例,2.13/10万),之后总体呈下降趋势,2023年病例数和发病率最低(158例,0.67/10万)。发病高峰为4—6月(635例,占31.86%)和10—12月(724例,占36.33%)。共报告男性1511例,女性482例,性别比为3.13∶1;各年龄组人群均有病例报告,以30~64岁年龄组为主(1464例,占73.46%);职业分布以农民为主(1242例,占62.32%)。各市(州)均有病例报告,累计报告病例数前3位的地区为通化市(440例,占22.08%)、白城市(357例,占17.91%)和延边朝鲜族自治州(335例,占16.81%)。春季居民区累计鼠密度前3位的监测点分别为珲春市(5.26%)、梨树县(4.36%)、双阳区(3.81%);野外累计鼠密度前3位的监测点分别为珲春市(5.55%)、磐石市(4.00%)、双阳区(3.47%)。秋季居民区累计鼠密度前3位的监测点分别为珲春市(4.43%)、双阳区(4.09%)、抚松县(3.84%);野外累计鼠密度前3位的监测点分别为珲春市(6.84%)、双阳区(4.21%)、磐石市(4.00%)。捕获鼠类以褐家鼠和黑线姬鼠为主。时间序列分析结果显示ARIMA(0,0,1)(0,1,1)_(12)能够较好地拟合和预测吉林省HFRS发病情况(MAE=6.56,MRE=-0.16%),2024年预测月均发病数为7例。结论吉林省HFRS发病率总体呈下降趋势,优势鼠种为褐家鼠和黑线姬鼠,2024年发病数预计低于2023年。有关部门今后应持续做好HFRS常规监测及预警工作。 展开更多
关键词 肾综合征出血热 ARIMA模型 时间序列分析 宿主动物 吉林省
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静脉注射人免疫球蛋白治疗对川崎病患者冠状动脉病变发生的影响
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作者 李丹 吕兴 《岭南心血管病杂志》 CAS 2024年第4期380-385,共6页
目的探讨静脉注射人免疫球蛋白(intravenous infusion of human immunoglobulin,IVIG)对川崎病(Kawasaki disease,KD)患儿冠状动脉(冠脉)病变发生的影响。方法选择2019年1月至2022年5月在东莞市妇幼保健院住院确诊并治疗的KD患儿,根据... 目的探讨静脉注射人免疫球蛋白(intravenous infusion of human immunoglobulin,IVIG)对川崎病(Kawasaki disease,KD)患儿冠状动脉(冠脉)病变发生的影响。方法选择2019年1月至2022年5月在东莞市妇幼保健院住院确诊并治疗的KD患儿,根据有无冠脉病变将患儿分为无冠脉病变组和冠脉病变组。对两组患者的发热时间、IVIG治疗时的病程时间、白细胞、血红蛋白、血小板、C反应蛋白、降钙素原、离子、肝及肾功能等临床资料进行分析。结果KD合并冠脉病变组患者血白细胞、血小板计数高于无冠脉病变组,而白蛋白、羟基酸脱氢酶浓度低于无冠脉病变组,差异均有统计学意义(P<0.05)。KD发热时间<8 d患儿的冠脉病变发生率低于发热时间>10 d的患儿,差异有统计学意义(P<0.05)。病程第5天前应用IVIG治疗患者冠脉病变发生率与病程第7天、第8天及10天后治疗患者比较,差异有统计学意义(P<0.05)。病程第5天及第6天应用IVIG治疗患者的冠脉病变发生率低于病程第10天后应用的患者,差异有统计学意义(P<0.05)。结论应用IVIG时间过晚,白细胞、血小板计数升高,发热时间较长是KD患儿并发冠脉病变的危险因素,而白蛋白、羟基酸脱氢酶浓度的降低也可作为KD并发冠脉病变的预测指标。热程少于8 d,病程7 d内应用IVIG治疗,可减少冠脉病变发生率。 展开更多
关键词 川崎病 冠状动脉病变 发热时间 治疗时间 静脉输注人免疫球蛋白
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从刘渡舟“古今接轨论”谈小柴胡汤在发热疾病中的应用
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作者 邢洪霞 董利洋 +2 位作者 李长香 孔慧 赵琰 《现代中医药》 CAS 2024年第3期17-22,共6页
小柴胡汤出自《伤寒杂病论》,具有调和枢机、祛邪透热的功效,仲景用其治疗少阳发热、三阳合病发热、妇人经期发热等多种外感热病。经过后代医家的临床拓展,该方也可以治疗当今常见的发热疾病,如癌性发热、术后发热、不明原因高热等。“... 小柴胡汤出自《伤寒杂病论》,具有调和枢机、祛邪透热的功效,仲景用其治疗少阳发热、三阳合病发热、妇人经期发热等多种外感热病。经过后代医家的临床拓展,该方也可以治疗当今常见的发热疾病,如癌性发热、术后发热、不明原因高热等。“古今接轨论”是经方大家刘渡舟首先提出的,是将经方与时方合用的一种理论,文章以小柴胡汤为桥梁,对古今发热疾病进行联系接轨,这不仅丰富了“古今接轨论”的内涵,也拓宽了经方的现代应用。 展开更多
关键词 小柴胡汤 发热疾病 古今接轨 机制研究
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Stochastic Model of Dengue: Analysing the Probability of Extinction and LLN
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作者 Ragnimwendé Sawadogo Fourtoua Victorien Konané Wahabo Baguian 《Applied Mathematics》 2024年第9期594-613,共20页
In this article, we develop and analyze a continuous-time Markov chain (CTMC) model to study the resurgence of dengue. We also explore the large population asymptotic behavior of probabilistic model of dengue using th... In this article, we develop and analyze a continuous-time Markov chain (CTMC) model to study the resurgence of dengue. We also explore the large population asymptotic behavior of probabilistic model of dengue using the law of large numbers (LLN). Initially, we calculate and estimate the probabilities of dengue extinction and major outbreak occurrence using multi-type Galton-Watson branching processes. Subsequently, we apply the LLN to examine the convergence of the stochastic model towards the deterministic model. Finally, theoretical numerical simulations are conducted exploration to validate our findings. Under identical conditions, our numerical results demonstrate that dengue could vanish in the stochastic model while persisting in the deterministic model. The highlighting of the law of large numbers through numerical simulations indicates from what population size a deterministic model should be considered preferable. 展开更多
关键词 Dengue fever Continuous-time Markov Chain Multitype Branching Process Probability of Disease Extinction Law of Large Numbers
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新型布尼亚病毒载量联合血小板计数、凝血酶时间对发热伴血小板减少综合征患者预后的临床价值研究
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作者 郭骥 吕勇 《实用临床医药杂志》 CAS 2024年第15期9-13,共5页
目的探讨新型布尼亚病毒(SFTSV)载量联合血小板计数(PLT)、凝血酶时间(TT)在发热伴血小板减少综合征(SFTS)患者预后中的临床价值。方法选取SFTS患者100例,根据预后情况分为生存组(n=77)和死亡组(n=23),比较生存组和死亡组患者临床一般... 目的探讨新型布尼亚病毒(SFTSV)载量联合血小板计数(PLT)、凝血酶时间(TT)在发热伴血小板减少综合征(SFTS)患者预后中的临床价值。方法选取SFTS患者100例,根据预后情况分为生存组(n=77)和死亡组(n=23),比较生存组和死亡组患者临床一般资料、症状、PLT、凝血指标及SFTSV载量差异,并分析其对患者预后的影响。结果死亡组发热持续时间长于生存组,差异有统计学意义(P<0.05);死亡组发生消化道出血、神志改变、肾功能损害、心脏功能损害和弥散性血管内凝血(DIC)患者占比高于生存组,差异有统计学意义(P<0.05);死亡组PLT低于生存组,而TT和活化部分凝血活酶时间(APTT)长于生存组,差异有统计学意义(P<0.05);死亡组SFTSV载量的拷贝数对数值≥5的患者占比高于生存组,差异有统计学意义(P<0.05)。Logistic回归分析显示,消化道出血、肾功能损害、心脏功能损害、DIC、PLT、TT和SFTSV载量是患者死亡的影响因素(P<0.05),基于此构建的方程预测患者死亡的受试者工作特征(ROC)曲线的曲线下面积为0.919(95%CI:0.860~0.977),灵敏度和特异度分别为95.70%和81.80%。结论SFTS患者预后受消化道出血、肾功能损害、心脏功能损害、DIC、PLT、TT和病毒载量因素的影响,且基于影响因素构建的方程在预测患者预后方面有一定价值。 展开更多
关键词 发热伴血小板减少综合征 预后 新型布尼亚病毒 载量 血小板计数 凝血酶时间
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基于灰色模型和ARMA模型的猪瘟月新发生次数预测比较 被引量:13
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作者 栾培贤 肖建华 +2 位作者 陈欣 徐强 王洪斌 《农业工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第12期223-226,共4页
对猪瘟月新发生次数(每个月的新发生次数)的定量预测可以为当地动物疫病防控部门提供依据,使其针对猪瘟发病风险有选择性地采取防控措施。该文分别选用灰色预测模型和ARMA预测模型对贵州省猪瘟月新发生次数进行了预测。灰色模型和ARMA... 对猪瘟月新发生次数(每个月的新发生次数)的定量预测可以为当地动物疫病防控部门提供依据,使其针对猪瘟发病风险有选择性地采取防控措施。该文分别选用灰色预测模型和ARMA预测模型对贵州省猪瘟月新发生次数进行了预测。灰色模型和ARMA模型以2005-2008年兽医公报中统计的贵州省猪瘟发病数据为预测依据,以2009年的统计数据评价比较预测效果。灰色模型和ARMA模型预测平均绝对误差分别为1.84和1.48,平均绝对百分误差为0.272和0.229。预测结果表明,ARMA预测模型的预测精度更高,对贵州省猪瘟发病的预测是可行有效的。 展开更多
关键词 动物 疾病 模型 灰色模型 ARMA模型 预测 时间序列
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非洲猪瘟病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用 被引量:33
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作者 李洪利 曹金山 +1 位作者 王君玮 张维 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2012年第6期37-40,共4页
本研究为了建立一套检测非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)的实时荧光定量PCR检测方法,根据GenBank公布的23株编码ASFV结构蛋白p72的基因序列,设计引物和探针,优化退火温度、Mg2+浓度和引物、探针浓度,生成标准曲线,进行重... 本研究为了建立一套检测非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)的实时荧光定量PCR检测方法,根据GenBank公布的23株编码ASFV结构蛋白p72的基因序列,设计引物和探针,优化退火温度、Mg2+浓度和引物、探针浓度,生成标准曲线,进行重复性、敏感性、特异性试验,并检测样品。结果显示,优化的退火温度为60℃,Mg2+终浓度为4mmol/L,引物、探针终浓度分别为0.8、0.3μmol/L。重复性试验变异系数均小于1.3%,敏感性试验最低能够检测到10拷贝/μL的质粒,以其他5种猪病病毒和ASFV质粒为模板进行特异性试验,只有ASFV质粒出现扩增曲线。结果表明,建立的实时荧光定量PCR方法是快速、灵敏、特异的检测ASFV的方法。 展开更多
关键词 非洲猪瘟 ASFV 荧光定量PCR
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时间序列模型在广州市登革热发病趋势预测的应用 被引量:5
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作者 方钦 王颖 +2 位作者 刘仲明 王锟 郭钜旋 《江苏预防医学》 CAS 2020年第1期23-25,共3页
目的利用ARIMA模型对广州市登革热发病趋势进行时间序列分析和预测。方法收集广州市2015-2018年登革热每周发病数,采用2015-2017年登革热每周发病数构建ARIMA模型,通过2018年登革热发病预测值与实际值的拟合情况,评价模型预测效果。结... 目的利用ARIMA模型对广州市登革热发病趋势进行时间序列分析和预测。方法收集广州市2015-2018年登革热每周发病数,采用2015-2017年登革热每周发病数构建ARIMA模型,通过2018年登革热发病预测值与实际值的拟合情况,评价模型预测效果。结果拟合模型ARIMA(4,1,9),残差序列为白噪声,预测值与实际值平均绝对误差为4.03,均方根误差为8.13。2018年登革热预测发病趋势与实际发病趋势较吻合。结论 ARIMA模型能较好地模拟广州市登革热的短期发病趋势,可作为预测工具。 展开更多
关键词 登革热 时间序列分析 ARIMA模型 预测
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非洲猪瘟病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:19
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作者 董志珍 侯艳梅 +5 位作者 赵祥平 李琳 肖妍 王玉玲 黄金海 霍蕾 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2009年第9期3-6,共4页
非洲猪瘟病毒p54蛋白在病毒感染与增殖过程中起重要作用。根据p54基因的核苷酸序列,设计并合成引物和用6-carboxy-fluorescein(6-FAM)和tetramethyl-6-carboxyrhodamine(TAMRA)荧光素标记TaqMan双水解探针,以构建的含p54基因的pET-p54... 非洲猪瘟病毒p54蛋白在病毒感染与增殖过程中起重要作用。根据p54基因的核苷酸序列,设计并合成引物和用6-carboxy-fluorescein(6-FAM)和tetramethyl-6-carboxyrhodamine(TAMRA)荧光素标记TaqMan双水解探针,以构建的含p54基因的pET-p54重组质粒作为阳性模板,建立了ASFV检测的荧光定量PCR方法(已申请专利,专利号200910067620.6)。结果表明,所建立的方法与含p54基因的模板质粒数呈现很好的相关性(R2=0.991),可检测出低于15个拷贝/μL的样品,灵敏度和特异性高,可作为出入境检验检疫部门对非洲猪瘟病毒的快速检测方法。 展开更多
关键词 非洲猪瘟病毒 p54基因 荧光定量PCR
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猪瘟病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立与应用 被引量:13
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作者 王淑娟 刘梅芬 +6 位作者 闫若潜 班付国 赵雪丽 马震原 王华俊 王翠 赵明军 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第7期2112-2118,共7页
为建立一种快速、敏感、特异的猪瘟病毒(classical swine fever virus,CSFV)实时荧光定量PCR检测方法,本研究根据GenBank中CSFV E2基因保守区域序列,设计了一对特异性引物和一条特异性探针,以CSFV总RNA为反转录模板,经优化反应条件,建立... 为建立一种快速、敏感、特异的猪瘟病毒(classical swine fever virus,CSFV)实时荧光定量PCR检测方法,本研究根据GenBank中CSFV E2基因保守区域序列,设计了一对特异性引物和一条特异性探针,以CSFV总RNA为反转录模板,经优化反应条件,建立CSFV实时荧光定量PCR检测方法,并对其进行了特异性、敏感性、重复性试验;利用所建立的方法对35份临床疑似CSFV感染样品进行了检测。结果表明,本研究建立的CSFV实时荧光定量PCR检测方法在101~106拷贝/μL范围内有很好的线性关系,相关系数为0.999;CSFV细胞培养物出现阳性扩增信号,但ST正常细胞对照和其他8种病原对照未出现扩增,特异性良好;该方法重复性好、敏感性高,最低检测模板浓度为10拷贝/μL,并且CSFV的最低检测限为1TCID50/mL;自35份疑似CSFV感染样品中检出19份阳性样品,与本课题组建立的CSFV Nested RT-PCR检测结果和克隆测序结果一致。本研究成功建立了CSFV实时荧光定量PCR检测方法,可用于CSFV的快速检测。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 实时荧光定量PCR 特异性 重复性 敏感性 应用
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应用ARIMA-GRNN模型对肾综合征出血热发病率时间序列数据的预测研究 被引量:9
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作者 吴伟 郭军巧 +2 位作者 安淑一 关鹏 周宝森 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2015年第2期211-213,共3页
目的阐述ARIMA-GRNN模型预测肾综合征出血热发病率的方法和步骤,探讨其在综合征出血热发病率预测中的应用。方法利用辽宁省1962-2008年的肾综合征出血热发病率时间序列数据作为训练集,建立ARIMA模型和ARIMA-GRNN模型,选取2009-2011年的... 目的阐述ARIMA-GRNN模型预测肾综合征出血热发病率的方法和步骤,探讨其在综合征出血热发病率预测中的应用。方法利用辽宁省1962-2008年的肾综合征出血热发病率时间序列数据作为训练集,建立ARIMA模型和ARIMA-GRNN模型,选取2009-2011年的数据作为检验集,评价模型的拟合和预测效果。结果 ARIMA(2,1,1)模型和ARIMA-GRNN模型拟合值的平均误差绝对值分别为1.14和0.77;预测值的平均误差绝对值分别为0.53和0.20。ARIMA-GRNN模型的拟合和预测效果均优于ARIMA模型。结论 ARIMA-GRNN模型能有效模拟、预测肾综合征出血热的发病疫情,具有较强的推广应用价值。 展开更多
关键词 肾综合征出血热 时间序列 发病率 预测
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非洲猪瘟病毒实时荧光定量PCR检测技术的研究与评价 被引量:23
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作者 郭少平 刘建 吴绍强 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2010年第4期76-80,共5页
根据非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)K205R基因序列设计合成引物及TaqMan探针,通过优化引物浓度、退火温度和Mg2+浓度,建立基于K205R基因的ASFV实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,qPCR)检测方法。对在猪肝脏组... 根据非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)K205R基因序列设计合成引物及TaqMan探针,通过优化引物浓度、退火温度和Mg2+浓度,建立基于K205R基因的ASFV实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,qPCR)检测方法。对在猪肝脏组织DNA中掺入重组质粒制备的模拟样品进行扩增来确定所建方法的实际检测效率,并将OIE推荐的基于p72的qPCR调整后作为评价该方法检测效果的对照。试验结果表明,基于K205R基因的检测方法在检测模拟样品时扩增效率要优于基于p72的方法,而且敏感性和特异性强,适用于非洲猪瘟的快速检测、监测。 展开更多
关键词 非洲猪瘟病毒 实时荧光定量PCR K205R 检测 研究 评价
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用荧光定量RT-PCR方法检测猪瘟病毒 被引量:21
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作者 史子学 徐兴然 涂长春 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期467-470,共4页
为了建立能特异检测不同基因型猪瘟病毒(Classical swine fever virus,CSFV),同时又能区分其他瘟病毒的基因检测方法,本实验针对CSFV基因组5′端非编码区设计并合成了简并引物和TaqMan探针,在优化反应条件的基础上,成功地建立了特异检测... 为了建立能特异检测不同基因型猪瘟病毒(Classical swine fever virus,CSFV),同时又能区分其他瘟病毒的基因检测方法,本实验针对CSFV基因组5′端非编码区设计并合成了简并引物和TaqMan探针,在优化反应条件的基础上,成功地建立了特异检测CSFV的荧光定量RT-PCR检测方法。再以已知滴度的CSFV石门株血毒总RNA反转录产物建立标准品,该标准品可以用于定量临床样品中的CSFV滴度,所建立的荧光定量PCR方法可以灵敏地检测出10^(-0.82)个TCID_(50)病毒含量。最后用建立的方法对108份临床样品进行检测并同时进行病毒分离,荧光定量PCR方法检测出73份阳性样品且与病毒分离的符合率为100%,而常规RT-PCR只检测出54份阳性样品,表明本荧光定量RT-PCR法在检测猪瘟病料上具有潜在的应用价值。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 荧光定量RT-PCR 标准曲线 病毒总RNA
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非洲猪瘟病毒TaqMan探针实时荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:18
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作者 李维彬 蒋正军 +4 位作者 王玉炯 龚振华 许崇波 郭福生 郑增忍 《宁夏大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2007年第1期56-59,共4页
为建立一种快速、准确、特异的非洲猪瘟病毒(African Swine Fever Virus,ASFV)定量检测方法,根据TaqMan探针荧光定量分析原理,对ASFV核酸进行了实时荧光定量PCR分析.借助计算机软件辅助,对ASFV基因序列及检测引物和探针进行了优化筛选,... 为建立一种快速、准确、特异的非洲猪瘟病毒(African Swine Fever Virus,ASFV)定量检测方法,根据TaqMan探针荧光定量分析原理,对ASFV核酸进行了实时荧光定量PCR分析.借助计算机软件辅助,对ASFV基因序列及检测引物和探针进行了优化筛选,利用pET-ASFVP72质粒作为参比模板对PCR反应的Mg2+、引物、探针浓度等参数进行了优化,其最佳浓度分别为4.5 mmol/L,400 nmol/L和500 nmol/L.同时,对灵敏度、特异性、定量线性关系、精确度等进行了评估,最低检出量为102个拷贝数的质粒,特异性为100%,CT(Cycle Threshold)值的变异系数CV小于5%.对送检的15份(是否感染ASFV不确定)猪肉样品进行检测,结果全为阴性.试验表明,所建立的实时荧光定量PCR检测方法能够快速、准确、特异、灵敏地对ASFV核酸进行定量分析,从而为非洲猪瘟的检测提供了一个新的、可靠的方法. 展开更多
关键词 非洲猪瘟 TagMan探针 实时荧光定量PCR
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北京市平谷区65例布鲁氏菌病患者临床特征分析 被引量:2
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作者 张鑫 王慧敏 +3 位作者 李伟健 熊凤国 郭阳春 刘玉英 《传染病信息》 2021年第1期79-82,共4页
目的通过对北京市平谷区65例布鲁氏菌病患者流行病学调查,了解本区布鲁氏菌病疫情动态及患者临床特征,为疫情防控提供参考依据。方法选取2015年1月—2019年12月北京市平谷区医院收治的65例布鲁氏菌病患者作为研究对象,对发病时间、发病... 目的通过对北京市平谷区65例布鲁氏菌病患者流行病学调查,了解本区布鲁氏菌病疫情动态及患者临床特征,为疫情防控提供参考依据。方法选取2015年1月—2019年12月北京市平谷区医院收治的65例布鲁氏菌病患者作为研究对象,对发病时间、发病区域、年龄与性别构成、初步诊断、临床表现、病原学检查及诊治等情况进行统计与分析。结果患者年龄主要集中在18~59岁,性别比为4.42∶1;以畜牧饲养者居多,约占64.62%,有明确动物或动物制品接触史63例,占96.92%,均为散发,无明显聚集性;全年中以4—6月发病率最高,占发病总数的53.85%;临床症状以发热(52例,80.00%)、乏力(34例,52.31%)、腰痛(26例,40.00%)为主;其中并发症发生率为47.69%,排名较高的前3位分别是脊柱炎、关节炎、腰椎病变。65例患者首诊确诊49例,误诊16例,误诊率为24.62%。病原学检查结果显示,试管凝集试验阳性35例,虎红平板凝集试验阳性30例。结论布鲁氏菌病高发季节为4—6月,男性患病率明显高于女性,且从事畜牧业及相关产业人员为主要发病人群,以散发为主;布鲁氏菌病首诊误诊率较高,临床医师应提高对该传染病的关注,不断加强疫情防控。 展开更多
关键词 布鲁氏菌病 流行病学 临床特征 分析 发热 时间分布 地区分布 人群分布
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