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题名草鱼和翘嘴鲌fgfrhl-1基因的克隆和表达分析
被引量:1
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作者
赵威
徐豪芒
郑建波
贾永义
顾志敏
罗琛
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机构
浙江大学生命科学学院
浙江省淡水水产研究所
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出处
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第6期1182-1188,共7页
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基金
浙江省重点研发计划(2016C02055-1)资助~~
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文摘
成纤维细胞生长因子受体同源类似物1(fgfrhl-1)基因是目前仅在鱼类基因组中检测到的fgfr基因家族成员,该序列在鱼类进化过程中高度保守。为研究fgfrhl-1基因的表达情况和具体的功能,在亲缘关系较远的草鱼(Ctenopharyngodon idellus)和翘嘴鲌(Culter alburnus Basilewsky)中克隆了fgfrhl-1的cDNA序列,并通过半定量RT-PCR和冰冻切片原位杂交分析了该基因在成体不同组织中的表达情况。克隆结果的序列分析表明:草鱼fgfrhl-1 cDNA序列全长为1472 bp,5′-UTR长213 bp,3′-UTR长56 bp,开放阅读框长1203 bp;翘嘴鲌fgfrhl-1 cDNA序列全长为1886 bp,5′-UTR长298 bp,3′-UTR长385 bp,开放阅读框长1203 bp。在两种鱼类中该基因都编码400个氨基酸,其预测的氨基酸序列同源性高达95.5%。蛋白二级结构预测表明Fgfrhl-1具有FGFRs家族蛋白的胞内酪氨酸激酶区,跨膜的螺旋区和胞外配体识别结合区,但其胞外区比FGFRs缺少了3个免疫球蛋白样结构域。通过RT-PCR方法在两种鱼类的心脏、鳃、肝、脾、尾鳍以及肌肉组织的肌间隔中均检测到了fgfrhl-1表达,但在肌纤维中均没有检测到其表达。对这两种鱼类的肌肉组织、肝脏和脾脏进行的组织切片原位杂交表明fgfrhl-1只在这些组织和器官的结缔组织及导管中表达,不在间质细胞结构中表达。这些结果说明:fgfrhl-1的成体组织特异性表达模式在不同鱼类中基本一致,fgfrhl-1在鱼类各组织和器官的结缔组织和导管的细胞中表达,不在间质细胞中表达。因此,fgfrhl-1可能在鱼类结缔组织及导管分化调控或功能维持中有独特作用。
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关键词
草鱼
翘嘴鲌
fgfrhl-1
基因克隆
表达
原位杂交
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Keywords
Grass carp
Culter alburnus
fgfrhl-1
Gene cloning
Expression
In situ hybridization
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分类号
Q344.1
[生物学—遗传学]
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