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题名植物F3'H基因的序列与进化分析
被引量:4
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作者
胡利宗
张佳慧
王秋霞
李俐俐
王红星
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机构
周口师范学院生命科学与农学学院
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出处
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第3期41-49,共9页
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基金
周口师范学院2014年高层次人才科研启动经费资助项目(ZKNU2014109)
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文摘
类黄酮-3'-羟化酶(F3'H)催化二氢堪非醇生成二氢栎皮黄酮,是花青素合成途径关键酶之一,主要参与决定植物花色、种皮和茎叶着色等性状。利用生物信息学手段对植物类黄酮-3'-羟化酶基因的序列和进化特征进行系统性分析。基因结构分析表明,植物F3'H基因外显子数变异范围为2~7,单子叶植物包括2个外显子,绝大多数双子叶与陆生低等植物具有3或4个外显子。蛋白序列分析显示,植物F3'H蛋白具有13个保守基序,其中10个保守基序与结构域p450相互重叠,其他3个保守基序具有种属特异性。进化分析表明,植物F3'H蛋白具有4个类群,在GroupⅠ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ亚群中分别检测到4、6、1、7个正选择位点(P〉0.05),这些位点主要分布在F3'H蛋白不规则卷曲区,说明植物F3'H蛋白主要受控于纯净选择。利用滑动窗口方法发现,5对直系同源基因受到负选择作用,但4对旁系同源基因受到正选择作用,发生适应性进化。试验结果可为进一步研究植物F3'H基因功能及其关键氨基酸位点提供参考。
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关键词
植物
花青素
类黄酮-3'-羟化酶
序列特征
进化
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Keywords
plant
anthocyanin
flavonoid 3&#39
-hydroxylase
sequence feature
evolution
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分类号
S641.2
[农业科学—蔬菜学]
Q78
[生物学—分子生物学]
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