香蕉枯萎病菌fow2基因的克隆及其序列分析

为了解fow2基因在尖镰刀菌古巴专化型(Fusarium oxysporum f.sp.Cubense,Foc)侵染香蕉过程中的作用,同时比较Foc的1号和4号生理小种中fow2基因的差异,采用PCR和RT-PCR方法,分别扩增了这2个生理小种的fow2基因,并对测序结果进行生物信息学分析。测序结果显示,以Foc1、Foc4的gDNA为模板,这两个生理小种的PCR扩增产物大小分别为2 439、2 440 bp;而以cDNA为模板,PCR扩增产物大小分别为1 992、1 986 bp。分析结果表明,两个基因都含有6个外显子和5个内含子;没有信号肽,也没有跨膜结构;但根据PROSITE蛋白位点分析,2个生理小种的fow2基因存在一些差异。