不同方法研究微溶剂化尿嘧啶激发能

采用基于两体片段分子轨道法的含时密度泛函理论方法(FMO2-TDDFT)研究包含4个和13个水分子微溶剂化的尿嘧啶分子激发态能。研究表明,FMO2-TDDFT和TDDFT的计算结果基本一致;在LC-BLYP泛函下考察了两种不同方法、不同基组对计算激发能的影响。结果显示,随着基组增大,FMO2-TDDFT方法计算的第一激发能增大,第二激发态能量减小。通过两种方法比较,FMO2-TDDFT方法在处理较大体系时具有一定优势。

一种生物大分子自动分片程序设计技术

为了解决蛋白质等大分子无法使用量子化学的方法精确计算的难题,化学工作者们提出了多种解决方案,其中一个就是分子划片。基于已有的分子划片方法的分片原理,我们实现了一种通用的自动划片技术,能够对分子进行不同划分。这一方法不仅提高了分片的效率和准确性,满足了用户不同的分片需求,还有利于量化计算中利用大规模的并行计算机,提高计算效率。