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EFFECTS OF CALM /AF10 ANTISENSES ON PRIMARY LEUKEMIC CELLS WITH CALM /AF10 FUSION TRANSCRIPTS IN VITRO
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作者 刘革修 《Chinese Journal of Cancer Research》 SCIE CAS CSCD 2005年第1期35-39,共5页
Objectives: To define the involvement of CALM and AF10 fusion transcripts in primary leukaemias with t(10; 11). Methods: The AF10 and CALM fusion in five t(10; 11) leukemia samples were checked by reverse transcriptas... Objectives: To define the involvement of CALM and AF10 fusion transcripts in primary leukaemias with t(10; 11). Methods: The AF10 and CALM fusion in five t(10; 11) leukemia samples were checked by reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR), and effects of CALM/AF10 antisense phosphorothioate oligodeoxynucleotides (AS PS-ODNs) on chemotherapy sensitivity and apoptosis of leukemia cells in vitro were observed. Results: Five different-sized AF10-CALM products and four different-sized CALM/AF10 products were detected by RT-PCR. The chemotherapy sensitivity of leukemic cells with t(10; 11) to drugs in vitro was lower than that of leukemic cells without t(10; 11). AS PS-ODNs increased the chemotherapy sensitivity and apoptotic rate. There were 4 cases positive at 5 μmol/L concentration, all cases positive at 10 μmol/L and 20 μmol/L concentration, P<0.01 vs only chemotherapeutic drugs (3 cases positive), and chemotherapeutic drugs + S-PS-ODNs (10 μmol/L) (3 cases positive). After cells were treated with 10 μmol/L AS-PS-ODNs + chemotherapeutic drugs for 48 h, 72 h, 96 h, the apoptotic indexes were 14.22±2.86, 29.39±3.57, and 41.26±4.52, respectively. These were significantly higher than those of only chemotherapeutic drugs-treated cells and chemotherapeutic drugs + S-PS-ODNs-treated cells at corresponding time (P<0.01). There was no difference between only drugs group and S-PS-ODNs group at corresponding time (P>0.05). Conclusion: The CALM and AF10 fusion transcripts are involved in the pathogenesis of haematological malignancies with t(10, 11), and is associated with a poor prognosis. AS-PS-ODNs might be useful in therapy of t(10, 11) leukemia. Key words AF10 - CALM - Fusion transcript - Primary leukemia cell - In vitro sensitivity - Antisense oligodeoxynucleotide CLC number R733.7 Biography: LIU Ge-xiu (1968–), male, associate professor, Institute of Hematology, Medical College, Jinan University, majors in hematology. 展开更多
关键词 AF10 CALM fusion transcript Primary leukemia cell In vitro sensitivity Antisense oligodeoxynucleotide
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四种技术平台检测甲状腺癌NTRK融合变异的比较
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作者 陈灵锋 林洁 +3 位作者 俞训彬 吴义娟 游治杰 陈小岩 《临床与实验病理学杂志》 CAS 北大核心 2023年第12期1470-1475,共6页
目的探讨免疫组化、DNA-based NGS、FISH和qRT-PCR四种技术平台检测甲状腺癌NTRK融合变异的一致性。方法对40例临床组织样本(其中31例为甲状腺癌样本)同时行FISH、免疫组化、DNA-based NGS和qRT-PCR法检测NTRK融合基因。结果四种技术平... 目的探讨免疫组化、DNA-based NGS、FISH和qRT-PCR四种技术平台检测甲状腺癌NTRK融合变异的一致性。方法对40例临床组织样本(其中31例为甲状腺癌样本)同时行FISH、免疫组化、DNA-based NGS和qRT-PCR法检测NTRK融合基因。结果四种技术平台均检测的31例甲状腺癌样本中,与FISH技术相比,免疫组化的敏感性、特异性、阳性预测值(positive predictive value,PPV)、阴性预测值(negative predictive value,NPV)和总符合率(total coincidence rate,TCR)分别为100%(9/9)、90.9%(20/22)、81.8%(9/11)、100%(20/20)、93.5%(29/31),其PPV较差;DNA-based NGS的敏感性、特异性、PPV、NPV和TCR分别为44.4%(4/9)、100%(22/22)、100%(4/4)、81.5%(22/27)、83.9%(26/31),其敏感性较差;qRT-PCR和FISH技术检测的一致性为100%(31/31)。与FISH技术相比,免疫组化、DNA-based NGS和qRT-PCR的Kappa值分别为0.853、0.532和1.000。在40例临床组织样本中,39例与FISH结果一致,仅1例(脂肪纤维瘤病样神经肿瘤)因检测范围未覆盖NTRK的少见融合类型(LMNA:exon4-NTRK1:exon10)qRT-PCR法未检出,基于RNA检测融合的qRT-PCR与FISH技术的符合率最高。结论基于RNA的qRT-PCR技术具有敏感性高、特异性高,操作便捷、判读简易的特性,可能是适用于病理科常规临床检测甲状腺癌NTRK融合变异的优选方案。 展开更多
关键词 甲状腺肿瘤 NTRK 基因融合 QRT-PCR
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重组人源肿瘤坏死因子受体融合蛋白对大鼠下颌骨缺损的干预效果 被引量:1
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作者 康献刚 牛军强 +1 位作者 赵冬霞 霍霁 《口腔颌面外科杂志》 CAS 2023年第2期83-88,共6页
目的:通过大鼠下颌骨缺损再植的实验动物模型,基于Janus激酶-信号转导与转录激活因子(Janus kinase-signal transducers and activators of transcription,JAK-STAT)通路探讨注射重组人源肿瘤坏死因子受体融合蛋白(recombinant human tu... 目的:通过大鼠下颌骨缺损再植的实验动物模型,基于Janus激酶-信号转导与转录激活因子(Janus kinase-signal transducers and activators of transcription,JAK-STAT)通路探讨注射重组人源肿瘤坏死因子受体融合蛋白(recombinant human tumor necrosis factor receptor:Fc fusion protein,rhTNFR:Fc)对下颌骨缺损大鼠的干预效果。方法:将70只(雌雄各半)7~8周龄的健康SD大鼠随机分为3组,分别为空白组(10只)、对照组(30只)和实验组(30只)。实验组:于大鼠骨缺损处注入含有Rh TNFR:Fc(45 mg/kg)的Bio-Oss骨颗粒,其上覆盖Bio-Gide胶原膜;对照组:于大鼠缺损处注入含25μL 0.9%氯化钠溶液的Bio-Oss骨颗粒,同样覆盖Bio-Gide胶原膜;空白对照组为健康大鼠。取所有大鼠下颌骨组织,观察其形态学变化,行组织形态计量学测定。实验组和对照组大鼠于术后3、6、9周时被分批处死,取其左侧下颌骨进行炎症因子白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)和肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)表达水平的检测,同时检测组织中凋亡相关分子Bax、Bcl-2、p-JAK2和p-STAT3蛋白的表达。结果:与对照组比较,实验组的缺损面积显著减少,IL-6和TNF-α的浓度显著下降,而凋亡相关分子Bax、p-JAK2和p-STAT3的表达显著下降,Bcl-2表达显著升高(P<0.05);与空白组比较,对照组和实验组缺损面积显著增加,缺损模型建立成功。结论:局部注射rh TNFR:Fc与Bio-Oss骨颗粒能够有效地促进下颌骨缺损修复,并且效果显著优于只使用Bio-Oss骨颗粒的组别,其修复作用与抑制细胞凋亡的能力相关,通过实验我们发现JAK2-STAT3细胞信号通路在其中发挥了重要作用。 展开更多
关键词 重组人源肿瘤坏死因子受体融合蛋白 下颌骨缺损 Janus激酶-信号转导与转录激活因子通路
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IRF2BP2及融合基因在实体肿瘤发生发展中作用的研究进展
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作者 章晴怡 胡浩 +1 位作者 赵林 陈鸿 《老年医学研究》 2023年第2期69-73,共5页
干扰素调节因子2结合蛋白2(IRF2BP2)作为新型转录调节因子,是干扰素调节因子2结合蛋白(IRF2BP)转录调节家族中的重要成员之一。IRF2BP2广泛存在于不同生物体中,充当着正负反馈调节器的角色,参与细胞功能的调节,如细胞凋亡、细胞增殖、... 干扰素调节因子2结合蛋白2(IRF2BP2)作为新型转录调节因子,是干扰素调节因子2结合蛋白(IRF2BP)转录调节家族中的重要成员之一。IRF2BP2广泛存在于不同生物体中,充当着正负反馈调节器的角色,参与细胞功能的调节,如细胞凋亡、细胞增殖、细胞免疫等,从而调节肿瘤微环境,影响着肿瘤的发生发展。同时,IRF2BP2基因还可以和其他类型基因发生基因融合,成为IRF2BP2/NTRK1、IRF2BP2/CDX1、IRF2BP2/RARA等,共同影响肿瘤的发生发展。 展开更多
关键词 干扰素调节因子2结合蛋白2 融合基因 转录调节因子 肿瘤微环境 信号转导 肿瘤免疫
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慢性髓性白血病异基因造血干细胞移植后M-bcr/abl及m-bcr/abl融合转录子追踪观察 被引量:4
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作者 秦亚溱 刘艳荣 +7 位作者 李金兰 付家瑜 常艳 阮国瑞 王卉 丘镜滢 陆道培 陈珊珊 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2003年第4期368-371,共4页
为研究慢性髓性白血病 (CML)异基因造血干细胞移植 (SCT)后M bcr/abl及m bcr/abl融合转录子表达特征 ,采用逆转录 聚合酶链反应 (RT PCR)技术测定 72例CML患者SCT后不同时间骨髓M bcr/abl及m bcr/abl融合转录子的表达。结果显示 ,CML患... 为研究慢性髓性白血病 (CML)异基因造血干细胞移植 (SCT)后M bcr/abl及m bcr/abl融合转录子表达特征 ,采用逆转录 聚合酶链反应 (RT PCR)技术测定 72例CML患者SCT后不同时间骨髓M bcr/abl及m bcr/abl融合转录子的表达。结果显示 ,CML患者移植后 <6个月M bcr/abl阳性率 (79.2 % ,4 2 /5 3)显著高于 6 - 12个月(34.3% ,11/32 )及≥ 12个月 (35 .1% ,13/37) (P <0 .0 0 1) ,各时间段M bcr/abl阳性患者的临床复发率分别为1 9% (1/5 3) ,0 (0 /32 )及 16 .2 % (6 /37) ;6例临床复发患者中有 5例复发时M bcr/abl与m bcr/abl同时阳性。 14例遗传学缓解患者移植 6个月后M bcr/abl阳性的 17份标本无 1例m bcr/abl阳性。结论 :多数CML患者移植后M bcr/abl仍为阳性 ,一般在 6个月内转阴 ,移植后M bcr/abl阳性的患者不一定复发 ,同时追踪观察M bcr/abl及m bcr/abl融合转录子可能会有助于监测残存白血病。 展开更多
关键词 慢性髓性白血病 异基因造血干细胞移植 M—bcr/abl融合转录子 m—bcr/abl融合转录子
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bcr/abl融合转录子阳性的B细胞型急性淋巴细胞白血病免疫表型特点 被引量:2
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作者 李金兰 刘艳荣 +5 位作者 秦亚溱 常艳 付家瑜 王卉 阮国瑞 陈珊珊 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2003年第2期142-145,共4页
为探讨B细胞型急性淋巴细胞白血病 (B ALL)中bcr/abl融合转录子阳性白血病细胞的生物学特征 ,用流式细胞术检测 2 6例bcr/abl阳性及 32例bcr/abl阴性B ALL病例的免疫表型 ,用PCR法检测免疫球蛋白重链(IgH)基因重排。结果表明 :所有的病... 为探讨B细胞型急性淋巴细胞白血病 (B ALL)中bcr/abl融合转录子阳性白血病细胞的生物学特征 ,用流式细胞术检测 2 6例bcr/abl阳性及 32例bcr/abl阴性B ALL病例的免疫表型 ,用PCR法检测免疫球蛋白重链(IgH)基因重排。结果表明 :所有的病例均为CD19阳性。bcr/abl阳性与bcr/abl阴性B ALL表面分子有显著统计学差异 (P <0 .0 5 )的是CD34(96 .2 %与 6 5 .6 % ) ,CD10 (96 .2 %与 71.8% )及CD38(43.8%与 95 .4 % )。在 2 6例bcr/abl阳性病例中 ,原始细胞共表达CD10 + /CD19+ /CD34+ ,CD10 + /CD34+ /HLA DR+ 和CD10 + /CD34+ /CD38-分别为 92 .3% (2 4 / 2 6 ) ,73 1% (19/ 2 6 )和 5 6 .2 % (9/ 16 )。对bcr/abl阳性组的 17例进行了IgH基因重排检测 ,10例阳性 (5 8.8% )。 14例bcr/abl阴性组中 12例 (85 .7% )阳性。在 32例bcr/abl阴性病例中 ,原始细胞共表达CD10 + /CD19+ /CD34+ 和CD10 + /CD34+ /HLA DR+ 分别为 4 3.8% (14 / 32 )和 37.5 % (12 / 32 ) ,无 1例表型为CD10 + /CD34+ /CD38-。结论 :bcr/abl阳性B ALL患者CD34和CD10阳性率较高 ,而CD38阳性率较低 ,且IgH基因重排检出率较低 ,其独特的免疫表型特征是CD10 + /CD34+ /CD38-。 展开更多
关键词 B细胞型急性淋巴细胞白血病 bcr/abl融合转录子阳性 生物学特征 流式细胞术 检测 免疫表型
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真核生物基因组转录诱导融合基因的研究进展 被引量:2
7
作者 吕聪颖 赵刚彬 吕贯廷 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第12期1255-1259,共5页
真核生物的基因组由基因和基因间区组成.基因转录时,从转录起始点开始到该基因的转录终止点结束,形成独立的转录单元.然而有少量的文献表明,转录有时会通读基因间区,产生包含上游基因、基因间区和下游基因的融合基因转录本.融合转录本... 真核生物的基因组由基因和基因间区组成.基因转录时,从转录起始点开始到该基因的转录终止点结束,形成独立的转录单元.然而有少量的文献表明,转录有时会通读基因间区,产生包含上游基因、基因间区和下游基因的融合基因转录本.融合转录本经基因间剪接而成为有功能的成熟转录本.对真核生物转录诱导融合基因的基因间剪接方式、产生机制和意义进行了综述. 展开更多
关键词 基因间区 转录 融合转录本
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E2A-PBX1融合基因阳性的儿童急性淋巴细胞白血病携带变异型融合转录本 被引量:2
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作者 李志刚 赵玮 +1 位作者 吴敏媛 胡亚美 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2006年第3期516-520,共5页
为了研究儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)中E2A-PBX1融合基因的表达,采用位于E2A基因不同位置的上游引物与下游PBX1引物,检测了410例儿童ALL,包括362例B细胞ALL和48例T细胞ALL。结果发现:17例患儿携带E2A-PBX1融合基因,检出率4.1%,且全部为... 为了研究儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)中E2A-PBX1融合基因的表达,采用位于E2A基因不同位置的上游引物与下游PBX1引物,检测了410例儿童ALL,包括362例B细胞ALL和48例T细胞ALL。结果发现:17例患儿携带E2A-PBX1融合基因,检出率4.1%,且全部为B细胞ALL,而且所有阳性病例均表达一种变异型融合转录本,后者是由E2A基因的第13外显子(159bp)被差异剪切形成的。经BLASTn比对分析,这种转录本保持了原来的开放阅读框,但导致53个氨基酸残基的丢失。这53个氨基酸残基位于活化区2,会导致融合蛋白中部分环-螺旋结构以及全部七聚体亮氨酸重复序列的丢失。结论:携带E2A-PBX1融合基因的儿童ALL表达典型和变异型2种融合转录本,后者是由E2A基因第13外显子被差异剪切而形成的,它将导致融合蛋白中53个氨基酸残基及其所构成的部分环-螺旋结构以及全部七聚体亮氨酸重复序列的丢失。 展开更多
关键词 急性淋巴细胞白血病 E2A-PBX1融合基因 变异型融合转录本 活化区2
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bcr/abl融合基因阳性急性淋巴细胞白血病的临床特点 被引量:4
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作者 王彬 吴敏媛 +2 位作者 李志刚 周翾 谢静 《实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第15期977-978,共2页
目的总结bcr/abl融合基因阳性急性淋巴细胞白血病(ALL)患儿临床特点,探讨其治疗及预后的相关因素。方法对经巢式逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测bcr/abl融合基因阳性ALL患儿临床表现、治疗、预后进行回顾性分析。结果bcr/abl融合基... 目的总结bcr/abl融合基因阳性急性淋巴细胞白血病(ALL)患儿临床特点,探讨其治疗及预后的相关因素。方法对经巢式逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测bcr/abl融合基因阳性ALL患儿临床表现、治疗、预后进行回顾性分析。结果bcr/abl融合基因阳性ALL患儿20例。中位年龄9岁,普通B细胞型ALL 19例(95%);治疗d33骨髓完全缓解率为66.7%,16例中7例复发(45%),持续缓解时间2年以上6例;5例接受造血干细胞移植(HSCT),均骨髓复发;6例存活患者中均为单纯化疗,bcr/abl融合基因已转阴。1例T细胞表型患儿于化疗缓解3个月骨髓复发,接受移植术后1个月骨髓再次复发。结论bcr/abl融合基因阳性ALL患儿化疗效果差,难缓解,复发率高,预后差,T细胞表型预后更差。部分对化疗敏感的患儿bcr/abl融合基因持续阴性。异基因HSCT复发率也较高。 展开更多
关键词 BCR/ABL融合基因 白血病 淋巴细胞 急性 儿童 临床表现 治疗 预后
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成人Xp11.2易位/TFE3基因融合相关性肾癌超声表现 被引量:4
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作者 刘阳 林军 +4 位作者 胡文洁 于洁 吴蓉 杜联芳 李凡 《中国医学影像技术》 CSCD 北大核心 2020年第7期1112-1114,共3页
Xpl1.2易位/转录因子E3基因融合相关性肾癌(renal cell carcinoma associated with Xpl1.2 translocation/transcription factor E3 gene fusions,TRCC Xp11.2)于1991年由TOMLINSON等[1]首次报道,2013年世界泌尿病理学会(International ... Xpl1.2易位/转录因子E3基因融合相关性肾癌(renal cell carcinoma associated with Xpl1.2 translocation/transcription factor E3 gene fusions,TRCC Xp11.2)于1991年由TOMLINSON等[1]首次报道,2013年世界泌尿病理学会(International Society of Urological Pathology,ISUP)将其归入小眼畸形相关转录因子(microphthalmia-associated transcription factor,MITF)家族易位相关性肾细胞癌[2-3]。本研究回顾性分析经术后病理证实的3例成人TRCC Xp11.2的常规超声及超声造影(contrast-enhanced ultrasound,CEUS)表现。 展开更多
关键词 肾细胞 基因融合 超声检查 转录因子E3
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实时定量逆转录PCR在白血病标志物检测中的应用 被引量:1
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作者 姚利 陈子兴 +4 位作者 岑建农 何军 邱桥成 鲍晓晶 袁晓妮 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期212-214,共3页
目的 建立实时定量逆转录PCR(RQ-RT-PCR)检测各种急慢性白血病的特征性分子生物学标志物,评价其在疾病诊断和微小残留病(MRD)监测中的意义.方法 设计TaqMan探针和引物,建立RQ-RT-PCR法对各种融合基因转录本和ABL阳性模板进行扩增,... 目的 建立实时定量逆转录PCR(RQ-RT-PCR)检测各种急慢性白血病的特征性分子生物学标志物,评价其在疾病诊断和微小残留病(MRD)监测中的意义.方法 设计TaqMan探针和引物,建立RQ-RT-PCR法对各种融合基因转录本和ABL阳性模板进行扩增,并检测177份白血病标本的转录本含量,同时做细胞遗传学检查.结果 RQ-RT-PCR法最低可检测到10个拷贝/μl的阳性模板,但重复性较差,而(10^8~10^2)拷贝/μl的重复性良好,正常对照无扩增信号.与细胞遗传学相比,RQRT-PCR的敏感性和特异性更强,对白血病标志物的阳性检出率更高.对12例不同类型白血病患者的MRD随访监测表明:患者体内融合基因转录本的含量随病情进展逐渐升高,随病情好转逐渐下降,并且早于细胞遗传学预测疾病复发.结论 RQ-RT-PCR方法更敏感、可靠,与疾病的关系更密切,可用于白血病的诊断和MRD随访. 展开更多
关键词 实时定量RT-PCR 白血病 融合基因转录本
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粘液样脂肪肉瘤TLS/FUS-CHOP融合基因的检测 被引量:4
12
作者 王华 杨郁 +1 位作者 王玉萍 郑杰 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期101-104,共4页
目的:探讨在粘液样脂肪肉瘤石蜡包埋组织中检测TLS/FUS-CHOP特异性融合基因的可行性及TLS/FUS-CHOP融合基因表达在粘液样脂肪肉瘤诊断中的价值。方法:收集粘液样脂肪肉瘤石蜡包埋组织标本6例,以粘液样脂肪瘤、脂肪母细胞瘤、粘液瘤、骨... 目的:探讨在粘液样脂肪肉瘤石蜡包埋组织中检测TLS/FUS-CHOP特异性融合基因的可行性及TLS/FUS-CHOP融合基因表达在粘液样脂肪肉瘤诊断中的价值。方法:收集粘液样脂肪肉瘤石蜡包埋组织标本6例,以粘液样脂肪瘤、脂肪母细胞瘤、粘液瘤、骨外粘液样软骨肉瘤、粘液纤维肉瘤作为阴性对照,茁-肌动蛋白和茁2-微球蛋白作为内对照,用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)和巢式PCR检测TLS/FUS-CHOP融合基因的表达。结果:6例粘液样脂肪肉瘤中4例检出茁-肌动蛋白mRNA表达,5例检出茁2-微球蛋白mRNA表达,其中3例检出II型TLS/FUS-CHOP融合基因mRNA表达。对照组均未检出TLS/FUS-CHOP融合基因的表达。结论:运用RT-PCR方法检测石蜡包埋组织中TLS/FUS-CHOP融合基因mRNA的表达可行,有助于粘液样脂肪肉瘤的诊断和鉴别诊断。 展开更多
关键词 粘液样脂肪肉瘤 基因融合诊断 逆转录聚合酶链反应
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肺炎克氏杆菌NifA对巴西固氮螺菌nifH启动子的转录激活作用 被引量:2
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作者 阎大来 何路红 +1 位作者 马旅雁 李季伦 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 1995年第3期205-210,共6页
用PCR方法克隆了巴西固氮螺菌Yu62nifH的启动子片段,DNA序列分析表明菌株Yu62与标准菌株Sp7之间的DNA序列差异很小。利用启动子探针质粒载体pCB182,构建了3个不同的nifH::lacZ转录融合质粒,在大肠杆菌中分别测定肺炎克氏杆菌NifA对它们... 用PCR方法克隆了巴西固氮螺菌Yu62nifH的启动子片段,DNA序列分析表明菌株Yu62与标准菌株Sp7之间的DNA序列差异很小。利用启动子探针质粒载体pCB182,构建了3个不同的nifH::lacZ转录融合质粒,在大肠杆菌中分别测定肺炎克氏杆菌NifA对它们的转录激活作用。结果表明巴西固氮螺菌nifH启动子的转录是依赖于NifA的,缺失了上游激活序列的启动子不能被NifA激活转录,肺炎克氏杆菌NifA对其自身nifH及巴西固氮螺菌nifH启动子的转录激活作用并无很大差异。 展开更多
关键词 巴西固氮螺菌 nifH启动子 NIFA 肺炎克氏杆菌
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巴西固氮螺菌 Yu62 draTG 基因启动子区域的核苷酸序列及其功能分析 被引量:6
14
作者 马旅雁 李季伦 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 1997年第4期343-349,共7页
对巴西固氮螺菌draTG上游区域进行了全序列分析,结果表明该区域除了编码部分nifH基因外(nifH与draTG转录方向相反),不编码任何其它已知的基因。但在该区域发现了一些可能的调控序列,它们包括上游激活序列(UA... 对巴西固氮螺菌draTG上游区域进行了全序列分析,结果表明该区域除了编码部分nifH基因外(nifH与draTG转录方向相反),不编码任何其它已知的基因。但在该区域发现了一些可能的调控序列,它们包括上游激活序列(UAS)、下游启动子组份(DPE)和富A+T区。这说明:nifH与draT间的区域可能主要起调控功能而非编码功能;dra操纵元(operon)的启动子很可能是RpoN-依赖型。用pAF300做载体,构建了draT∷cam转录融合质粒pAT1,并通过检测Cmr以检测draT在大肠杆菌和巴西固氮螺菌中的表达,结果表明draT在LD丰富培养基上,好氧条件下,只在巴西固氮螺菌中才表达。这说明,draT的转录需要某种大肠杆菌中没有的因子,同时也表明draTG上游区域有启动子功能。利用启动子探针质粒载体pCB182,构建了draT∷lacZ转录融合质粒pCT1。在大肠杆菌中测定肺炎克氏杆菌NifA对draT∷lacZ的转录激活作用。结果表明nifA并不参与draT的转录调控。 展开更多
关键词 巴西固氮螺菌 draTG启动子 核苷酸序列 基因
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初发慢性髓系白血病bcr/abl融合基因转录子与临床关系的观察 被引量:1
15
作者 孟文彤 刘霆 +5 位作者 李建军 史青 向兵 崔旭 徐才刚 黄杰 《四川医学》 CAS 2004年第3期260-262,共3页
目的 研究初发慢性髓系白血病bcr/abl融合基因转录子类型与临床关系。方法 使用RT PCR对 5 1例初发CML患者进行bcr/abl融合基因转录子检测。结果 b3a2型患者血小板数高于b2a2型患者 ,但b3a2型患者WBC数低于b2a2型患者 (P <0 .0 5 ... 目的 研究初发慢性髓系白血病bcr/abl融合基因转录子类型与临床关系。方法 使用RT PCR对 5 1例初发CML患者进行bcr/abl融合基因转录子检测。结果 b3a2型患者血小板数高于b2a2型患者 ,但b3a2型患者WBC数低于b2a2型患者 (P <0 .0 5 ) ;血红蛋白浓度与b2a2型患者比较无差异 (P >0 .0 5 ) ;b3a2型和b2a2型患者比较AKP和Ph1染色体比例无差异 (P >0 .0 5 ) ;M bcr/abl阳性患者伴m bcr/abl阳性率为 47 0 % ,其中b3a2型患者有m bcr/abl融合基因转录子 14例 ,b2a2型患者有 10例。结论 b3a2型CML患者初发时更易有血小板升高表现 ,但b2a2型患者更易有WBC数升高的表现 ,较多的初发CML患者同时伴有m bcr/abl阳性。 展开更多
关键词 慢性粒细胞白血病 BCR/ABL融合基因 转录子
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应用实时定量PCR技术检测慢性粒细胞白血病患者bcr/abl^(P190)融合基因转录本 被引量:1
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作者 林江 钱军 +5 位作者 陈子兴 岑建农 王玮 王法春 费霞 张永宁 《江苏医药》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期204-206,共3页
目的研究bcr/ablP190融合基因转录本在慢性粒细胞白血病(CML)中表达水平及其临床相关性。方法应用实时定量聚合酶链反应(RQ-PCR)检测74例CML患者骨髓单个核细胞中的bcr/ablP190转录本。结果bcr/ablP190转录本阳性54例(77.1%),中位含量2.... 目的研究bcr/ablP190融合基因转录本在慢性粒细胞白血病(CML)中表达水平及其临床相关性。方法应用实时定量聚合酶链反应(RQ-PCR)检测74例CML患者骨髓单个核细胞中的bcr/ablP190转录本。结果bcr/ablP190转录本阳性54例(77.1%),中位含量2.60(1.08~8.58)×10-3,与性别、年龄、白细胞总数、血红蛋白含量、血小板计数、bcr/ablP210转录本类型和表达水平均不相关,但bcr/ablP190阳性患者的白细胞总数和血小板计数较阴性者明显降低。bcr/ablP190转录本水平在急变期与慢性期患者以及不同类型急变患者中都无差异,而细胞遗传学完全缓解患者的bcr/ablP190水平较慢性期患者、干扰素无效患者和急变期患者则明显下降。结论不同阶段CML患者体内大都存在着不同的bcr/abl剪切型转录本,不同剪切型的存在具有一定的血液学相关性。 展开更多
关键词 慢性粒细胞白血病 实时定量聚合酶链反应 bcr/abl^p190 融合基因 转录本
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AOC-ipt转录融合基因转化热研5号柱花草 被引量:1
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作者 符少萍 郭建春 +2 位作者 李瑞梅 刘姣 段瑞军 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2012年第8期1456-1459,共4页
以无菌热研5号柱花草子叶为材料,采用农杆菌介导把AOC-ipt基因转录融合转化热研5号柱花草,通过10 mg/L的潮霉素筛选,获得约500余株抗性苗,通过PCR检测获得23株阳性苗,对这23株阳性苗进行RT-PCR检测,其中14株为阳性。对这14株转基因苗进... 以无菌热研5号柱花草子叶为材料,采用农杆菌介导把AOC-ipt基因转录融合转化热研5号柱花草,通过10 mg/L的潮霉素筛选,获得约500余株抗性苗,通过PCR检测获得23株阳性苗,对这23株阳性苗进行RT-PCR检测,其中14株为阳性。对这14株转基因苗进行了抗盐性初步观察,转基因苗并没有明显地提高热研5号柱花草的抗盐能力。 展开更多
关键词 热研5号柱花草 转基因 AOC—ipt转录融合基因
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应用RT/PCR技术检测急性粒细胞白血病M2型AML1/ETO融合基因转录本的研究 被引量:2
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作者 雷平冲 刘慧娟 瞿亚萍 《中国优生与遗传杂志》 2000年第2期18-20,共3页
目的 :探讨检测AML1 ETO融合转录本在t( 8;2 1)急性粒细胞白血病M 2型 [M 2 /t( 8;2 1]的临床诊断和预后判断中的意义。方法 :用半筑巢式逆转录聚合酶链反应 (RT/PCR)技术检测AML1/ETO融合基因转录本 ,应用Southernblot技术及限制性内... 目的 :探讨检测AML1 ETO融合转录本在t( 8;2 1)急性粒细胞白血病M 2型 [M 2 /t( 8;2 1]的临床诊断和预后判断中的意义。方法 :用半筑巢式逆转录聚合酶链反应 (RT/PCR)技术检测AML1/ETO融合基因转录本 ,应用Southernblot技术及限制性内切酶技术检测PCR产物的特异性。结果 :在 19例AML M 2中共检出 10例存在AML1/ETO融合基因转录本 ,阳性率为 5 2 .6 % ,2例MDS中 1例为阳性 ,其余病例包括 3例M4均为阴性 ,第一轮PCR的检测水平为 1/ 10 3 10 4 个细胞 ,第二轮PCR的敏感性达 1/ 10 4 10 5个细胞 ,说明该技术的敏感性很高。结论 :半筑巢式RT/PCR技术是一种快速、简便、灵敏、可靠的检测AML1/ETO融合转录本的方法 ,对M2 /t( 8;2 1) 展开更多
关键词 急性白血病 融合转录本 AML1/ETO PCR
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应用多重套式RT-PCR检测儿童急性淋巴细胞白血病的融合基因 被引量:1
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作者 何军 陈子兴 +4 位作者 薛永权 李建琴 何海龙 黄益萍 朱伶俐 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期91-94,共4页
目的 研究染色体结构易位所致的融合基因在儿童急性淋巴细胞白血病 (ALL)的表达。方法 采用多重套式RT PCR结合染色体R带或G带核型分析、流式细胞仪细胞免疫表型检测对 64例儿童ALL进行分析。结果 64例ALL患儿中 23例(36. 0% )具有 1... 目的 研究染色体结构易位所致的融合基因在儿童急性淋巴细胞白血病 (ALL)的表达。方法 采用多重套式RT PCR结合染色体R带或G带核型分析、流式细胞仪细胞免疫表型检测对 64例儿童ALL进行分析。结果 64例ALL患儿中 23例(36. 0% )具有 13种染色体畸变产生的融合基因,包括E2A/PBX1,E2A/HLF,TEL/AML1,TLS/ERG,MLL/AF4,MLL/AF9,MLL/AF10,MLL/AFX,MLL/AF6,MLL/ELL,dupMLL,TAL1D,HOX11。ALL患儿融合基因和染色体总畸变率为 67. 2%(43 /64)。结论 多重套式RT PCR结合染色体核型、免疫表型是儿童ALL临床诊断、治疗和预后判断的重要依据。 展开更多
关键词 融合基因 儿童急性淋巴细胞白血病 套式RT-PCR 治疗 RT—PCR 患儿 细胞免疫表型 染色体 畸变率 核型分析
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成人和儿童ALL7种常见融合基因表达的比较 被引量:8
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作者 龚泉 吴颖 +4 位作者 黄亮 熊婕 曹阳 周剑峰 李春蕊 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2011年第16期2897-2899,共3页
目的:比较成人和儿童ALL7种常见融合基因表达的差异。方法:利用RT-PCR技术检测7种常见融合基因。结果:在233例成人ALL中62例融合基因检测阳性,其中BCR/ABL31例,MLL相关19例,E2A/PBX1、SIL/TAL1各5例,SET/CAN、TLS/ERG各1例,未检出TEL/A... 目的:比较成人和儿童ALL7种常见融合基因表达的差异。方法:利用RT-PCR技术检测7种常见融合基因。结果:在233例成人ALL中62例融合基因检测阳性,其中BCR/ABL31例,MLL相关19例,E2A/PBX1、SIL/TAL1各5例,SET/CAN、TLS/ERG各1例,未检出TEL/AML1阳性病例;在215例初诊儿童ALL中35例检测阳性,其中BCR/ABL3例,E2A/PBX18例,MLL相关11例,SIL/TAL15例,TEL/AML16例,TLS/ERG2例,未检出SET/CAN阳性病例。成人ALL中BCR/ABL最为常见,而在儿童ALL中表达较低,差异有统计学意义(P<0.01),MLL相关融合基因、E2A/PBX1、SIL/TAL1、TEL/AML1、SET/CAN、TLS/ERG等在成人和儿童表达差异不显著。结论:成人和儿童ALL融合基因表达各有侧重,在初诊时进行快速检测可进行较为准确的分型。 展开更多
关键词 前体细胞淋巴母细胞白血病淋巴瘤 逆转录聚合酶链式反应 融合基因
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