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Gene-gene,gene-environment,gene-nutrient interactions and single nucleotide polymorphisms of inflammatory cytokines 被引量:4
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作者 Amina Nadeem Sadaf Mumtaz +4 位作者 Abdul Khaliq Naveed Muhammad Aslam Arif Siddiqui Ghulam Mustafa Lodhi Tausif Ahmad 《World Journal of Diabetes》 SCIE CAS 2015年第4期642-647,共6页
Inflammation plays a significant role in the etiology of type 2 diabetes mellitus(T2DM).The rise in the pro-inflammatory cytokines is the essential step in glucotoxicity and lipotoxicity induced mitochondrial injury,o... Inflammation plays a significant role in the etiology of type 2 diabetes mellitus(T2DM).The rise in the pro-inflammatory cytokines is the essential step in glucotoxicity and lipotoxicity induced mitochondrial injury,oxidative stress and beta cell apoptosis in T2 DM.Among the recognized markers are interleukin(IL)-6,IL-1,IL-10,IL-18,tissue necrosis factor-alpha(TNF-α),C-reactive protein,resistin,adiponectin,tissue plasminogen activator,fibrinogen and heptoglobins.Diabetes mellitus has firm genetic and very strong environmental influence; exhibiting a polygenic mode of inheritance.Many single nucleotide polymorphisms(SNPs) in various genes including those of pro and antiinflammatory cytokines have been reported as a risk for T2 DM.Not all the SNPs have been confirmed by unifying results in different studies and wide variations have been reported in various ethnic groups.The inter-ethnic variations can be explained by the fact that gene expression may be regulated by gene-gene,gene-environment and gene-nutrient interactions.This review highlights the impact of these interactions on determining the role of single nucleotide polymorphism of IL-6,TNF-α,resistin and adiponectin in pathogenesis of T2 DM. 展开更多
关键词 Cytokines gene-environment INTERACTION Diabetes MELLITUS Single NUCLEOTIDE polymorphism Gene-gene INTERACTION
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左氧氟沙星在水环境中的赋存、风险及降解技术研究进展
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作者 卢洪斌 卢少勇 +1 位作者 曾泽泉 黄张根 《环境污染与防治》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期392-399,共8页
水环境中的抗生素不仅诱导微生物产生抗性基因(ARGs)及耐药细菌,而且危害生物安全,对人类生命健康产生严重威胁。氟喹诺酮类抗生素(FQs)及其引发的ARGs问题已引起国内外学者广泛关注。左氧氟沙星(LVFX)是使用最广泛的FQs之一,因生物体... 水环境中的抗生素不仅诱导微生物产生抗性基因(ARGs)及耐药细菌,而且危害生物安全,对人类生命健康产生严重威胁。氟喹诺酮类抗生素(FQs)及其引发的ARGs问题已引起国内外学者广泛关注。左氧氟沙星(LVFX)是使用最广泛的FQs之一,因生物体代谢率低且化学结构稳定,在环境中被广泛检出。因此亟需掌握LVFX在水环境中的赋存特征,厘清其对生态环境的危害,并比较分析现有技术对其去除效果。在现有研究基础上综述了LVFX在水环境中的赋存特征,从诱导微生物产生ARGs和耐药细菌及威胁水生态安全两个方面阐述了LVFX的生态风险,系统阐述了物理法、化学法和生物法去除LVFX的效果及研究进展,分析了这些技术的优缺点,以期为高效低耗降解LVFX并抑制ARGs的传播提供一定的参考。 展开更多
关键词 左氧氟沙星 抗性基因 环境风险 处理技术
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城镇污水处理厂抗生素抗性基因的环境传播途径与机制
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作者 李俊谊 孙喆 +1 位作者 强志民 贲伟伟 《给水排水》 CSCD 北大核心 2024年第5期153-160,共8页
城镇污水处理厂是抗生素抗性基因(ARGs)发生转移、传播的重要场所,同时也是环境中ARGs污染的主要来源。对城镇污水处理厂中ARGs向环境介质中的传播途径、影响因素与传播机制进行了综述。结果表明,ARGs可通过出水排放、污泥土地施用、再... 城镇污水处理厂是抗生素抗性基因(ARGs)发生转移、传播的重要场所,同时也是环境中ARGs污染的主要来源。对城镇污水处理厂中ARGs向环境介质中的传播途径、影响因素与传播机制进行了综述。结果表明,ARGs可通过出水排放、污泥土地施用、再生水灌溉、气溶胶逸散等途径迁移至环境介质(如受纳水体、土壤、空气)中;ARGs在环境介质中的扩散和存留行为受介质理化性质影响;ARGs在环境介质中主要通过可移动遗传元件(MGEs)介导的水平基因转移(HGT)传播耐药性。 展开更多
关键词 城镇污水处理厂 抗生素抗性基因 环境介质 传播途径 传播机制
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产甘油假丝酵母25S rRNA甲基转移酶BMT5对乙酸胁迫耐受的影响及应用
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作者 周柳 陆信曜 +1 位作者 宗红 诸葛斌 《食品与发酵工业》 CSCD 北大核心 2024年第1期1-6,共6页
挖掘功能基因,提升菌株环境胁迫耐受性,对高效利用纤维素水解液产乙醇至关重要。产甘油假丝酵母(Candida glycerinogenes)是具有多重抗逆性的工业菌株,经基因组文库筛选,获得能够提高酵母乙酸耐受性的rRNA甲基转移酶基因CgBmt5。在酿酒... 挖掘功能基因,提升菌株环境胁迫耐受性,对高效利用纤维素水解液产乙醇至关重要。产甘油假丝酵母(Candida glycerinogenes)是具有多重抗逆性的工业菌株,经基因组文库筛选,获得能够提高酵母乙酸耐受性的rRNA甲基转移酶基因CgBmt5。在酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)中表达CgBmt5提高了乙酸耐受性,重组菌在胁迫下乙醇产量为60.5 g/L,提高17.7%。在C.glycerinogenes中过表达CgBmt5后,乙酸胁迫下乙醇产量提高17.6%,2种过表达的单位菌体产量、底物转化率、生产强度均有提高。进一步将C.glycerinogenes过表达菌应用于纤维素水解液发酵,乙醇产量提高71.7%,转化率提高65.0%,生产强度提高155.7%。乙酸胁迫下,过表达菌中脂质过氧化水平降低,且过氧化氢酶(catalase,CAT)和超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)活性增加;转录分析发现,Pfk1和Arg3基因上调,Gpd1和Cox3下调,表明CgBmt5可能通过降低脂质过氧化水平、提高SOD和CAT活性及影响糖代谢和精氨酸合成促进菌株的乙酸耐受和胁迫下的发酵能力。该研究为酵母的胁迫耐受机制和纤维素乙醇技术发展提供了新的生物材料。 展开更多
关键词 产甘油假丝酵母 基因筛选 环境胁迫 纤维素水解液 rRNA甲基转移酶
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氧化石墨烯应用于农林种植业中的研究进展
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作者 葛赛 韩亚梅 +2 位作者 孙曼銮 赵建国 张晓 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期395-403,共9页
氧化石墨烯(Graphene oxide,GO)是石墨烯的氧化物,其特殊的sp2-sp3杂化结构使其具有很多优异性能,在纳米电子、生物医学和能源储存等多个领域的应用研究较广、较深。近年来,氧化石墨烯又被发现能够促进植物的生长发育,因此,进一步引起... 氧化石墨烯(Graphene oxide,GO)是石墨烯的氧化物,其特殊的sp2-sp3杂化结构使其具有很多优异性能,在纳米电子、生物医学和能源储存等多个领域的应用研究较广、较深。近年来,氧化石墨烯又被发现能够促进植物的生长发育,因此,进一步引起了研究人员的广泛关注。本文系统总结了氧化石墨烯对不同植物生长发育的影响,分析了氧化石墨烯的作用机制,探讨了应用过程中可能存在的问题,以期为氧化石墨烯在农林业领域的应用研究提供借鉴,拓宽氧化石墨烯的综合利用途径,促进粮食生产和环境保护的可持续发展。 展开更多
关键词 氧化石墨烯 植物生长 基因表达 土壤微生物 环境安全
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广州市环境污水中沙门菌耐药性及携带耐药基因分析
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作者 苏碧慧 杜广泓 +3 位作者 伍小英 何刚 袁俊 谢朝军 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期442-447,共6页
目的 探讨广州市环境污水中沙门菌的耐药性及耐药基因携带情况。方法 收集广州市2022年3月1日至2022年11月30日环境污水中分离培养的140株沙门菌作为研究对象,开展药物敏感性检测及全基因组测序,通过CARD耐药数据库分析全基因组测序结果... 目的 探讨广州市环境污水中沙门菌的耐药性及耐药基因携带情况。方法 收集广州市2022年3月1日至2022年11月30日环境污水中分离培养的140株沙门菌作为研究对象,开展药物敏感性检测及全基因组测序,通过CARD耐药数据库分析全基因组测序结果,获取相应的耐药基因。结果 试验菌株对氨苄西林、四环素、链霉素、氯霉素、复方新诺明的耐药率较高,均达80%以上。多粘菌素E、环丙沙星的中介率较高,达60%以上。多重耐药现象严重,多重耐药率高达92.86%。菌株携带多种类型的耐药基因,特别是氨基糖苷类,携带率高达92.68%。结论 广州市环境污水中沙门菌的耐药以及多重耐药情况严重,多重耐药率整体呈逐渐上升的时间趋势,耐药谱具有多样性,耐药基因等可移动遗传元件介导的耐药机制为耐药和多重耐药产生的主要原因。 展开更多
关键词 环境污水 沙门菌 耐药性 耐药基因
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一株猪源德尔卑沙门氏菌的分离鉴定、生物学特性以及全基因组序列分析
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作者 蔡秋慧 龚莹婷 +4 位作者 李港回 彭钢 孟静南 王俊颖 翟立公 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期18-26,共9页
沙门氏菌作为人畜共患的致病菌,更是极易产生耐药性,严重影响了人类与动物的健康。为了更好的了解动物源性沙门氏菌的生物学和分子特性。对安徽凤阳县某市场猪肉样本进行细菌分离纯化、血清型鉴定、药敏实验和毒力基因检测,同时通过全... 沙门氏菌作为人畜共患的致病菌,更是极易产生耐药性,严重影响了人类与动物的健康。为了更好的了解动物源性沙门氏菌的生物学和分子特性。对安徽凤阳县某市场猪肉样本进行细菌分离纯化、血清型鉴定、药敏实验和毒力基因检测,同时通过全基因组测序结果进行毒力、耐药基因注释等分子生物学信息分析,并通过qPCR对毒力基因进行验证。分离鉴定出1株德尔卑沙门氏菌,分子分型为ST1498型,将其命名为G-1B,该菌株对环丙沙星、卡那霉素和复方新诺明敏感。全基因组长度为4 805 494 bp,预测出4 660个基因,其中包含559个毒力基因与37个耐药基因。该研究为了解猪源德尔卑沙门氏菌的遗传背景和生物学特性奠定了基础,为进一步探讨德尔卑沙门氏菌致病性、耐药机制和分子进化规律提供参考依据。 展开更多
关键词 德尔卑沙门氏菌 环境胁迫 全基因组测序 基因功能注释 生物信息学分析
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基于eDNA技术的舟山近海中国团扇鳐定性与定量分析 被引量:1
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作者 高天翔 张浩博 +1 位作者 王晓艳 陈治 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期116-125,共10页
为探讨环境DNA (environmental DNA, eDNA)技术用于中国团扇鳐监测方面的可行性,同时开展基于eDNA技术的舟山近海中国团扇鳐定性与定量分析。本实验将中国团扇鳐与其同属汤氏团扇鳐COI基因片段序列进行比较分析,使用Primer Express 3.0... 为探讨环境DNA (environmental DNA, eDNA)技术用于中国团扇鳐监测方面的可行性,同时开展基于eDNA技术的舟山近海中国团扇鳐定性与定量分析。本实验将中国团扇鳐与其同属汤氏团扇鳐COI基因片段序列进行比较分析,使用Primer Express 3.0软件设计中国团扇鳐特异性引物与Taq Man探针。在舟山朱家尖近海设计了A、B、C共3个定置网调查站位,定期收集中国团扇鳐样品。于2017年12月19日、2018年4月13日和2018年7月14日分别采集水样(站位A、B1、B2、C1、C2、D),开展eDNA微滴式数字PCR(droplet digital PCR, ddPCR)检测,并将检测结果与水温和采样点进行差异显著性分析。结果显示,不同站位、不同时间的中国团扇鳐eDNA浓度不同,水样采集点对中国团扇鳐eDNA浓度的影响极显著,不同采样点eDNA在不同季节存在极显著差异。研究表明,eDNA检测技术灵敏度高,水温、底质和水深对中国团扇鳐的分布皆有影响。研究结果为其他海域的中国团扇鳐e DNA追踪监测奠定了基础。 展开更多
关键词 中国团扇鳐 环境DNA EDNA 细胞色素c氧化酶亚基I(COI)基因 TAQMAN 微滴式数字PCR
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海洋环境中抗生素存在与环境行为研究进展 被引量:2
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作者 高会 李冰 姚子伟 《环境化学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期779-791,共13页
由于抗生素的频繁使用和排放,抗生素不断排放进入水环境,表现为“持续存在”的状态,对生态环境系统造成长期、持续的环境风险,由此导致的环境污染和细菌耐药性是我国及全球都亟待解决的重大环境问题.抗生素持久性的选择压力会产生抗生... 由于抗生素的频繁使用和排放,抗生素不断排放进入水环境,表现为“持续存在”的状态,对生态环境系统造成长期、持续的环境风险,由此导致的环境污染和细菌耐药性是我国及全球都亟待解决的重大环境问题.抗生素持久性的选择压力会产生抗生素抗性基因(antibiotic resistant genes,ARGs),其在环境中的持久性残留,在菌群间的迁移、传播和扩增,比抗生素残留本身对生态环境的危害更大.随着海洋资源与环境的持续开发与利用,海洋正逐步成为抗生素和ARGs的重要储存库,海洋环境中的抗生素和ARGs对海洋生态环境和公众健康的威胁同样不容忽视.本文对海洋环境中抗生素的来源、赋存、迁移转化和生态风险等研究进行分析梳理,对海洋环境中ARGs的环境行为进行综述,以期为海洋环境中抗生素和ARGs环境行为和风险评估研究提供参考,最后对相关研究的发展趋势进行了展望. 展开更多
关键词 海洋环境 抗生素 抗生素抗性基因 浓度水平 环境行为
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四环素抗性基因tet(A)荧光RAA检测方法的建立及应用 被引量:1
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作者 周志祥 赵子杰 +4 位作者 李疆帅 薛姗 洪启浩 侯潇楠 任阵海 《北京工业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期227-234,共8页
为了实现快捷、准确检测抗生素抗性基因,提高环境监测与治理能力,建立了一种基于重组酶介导等温核酸扩增技术(recombinase-aided amplification,RAA)的四环素抗性基因tet(A)的快速检测方法.该检测方法以tet(A)基因序列保守区为靶序列,... 为了实现快捷、准确检测抗生素抗性基因,提高环境监测与治理能力,建立了一种基于重组酶介导等温核酸扩增技术(recombinase-aided amplification,RAA)的四环素抗性基因tet(A)的快速检测方法.该检测方法以tet(A)基因序列保守区为靶序列,设计其RAA引物,筛选并优化RAA引物探针,建立荧光tet(A)-RAA快速检测方法.结果表明,该tet(A)-RAA法在39℃恒温条件下30 min内即可特异性实现对tet(A)基因片段的有效扩增,与无抗性细菌均无交叉反应.且采用该方法对18个环境样品进行检测,阳性率为100%,与qPCR方法检测结果一致.该四环素抗性基因tet(A)的检测方法灵敏度高、特异性强、反应时间短、操作简便,可用于对抗性基因tet(A)的快速检测,也为开发其他抗生素抗性基因快速检测方法提供了参考. 展开更多
关键词 抗性基因tet(A) 四环素 重组酶 等温扩增 快速检测 环境检测
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UV-PAC-UF对二级出水中抗生素抗性基因的去除效能及影响因素
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作者 孙丽华 马瑶 +1 位作者 史鹏飞 冯萃敏 《安全与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期874-881,共8页
针对污水处理厂二级出水中的抗生素抗性基因(Antibiotic Resistance Genes,ARGs)进行深入研究。采用紫外线(Ultraviolet,UV)结合粉末活性炭(Powdered Activated Carbon,PAC)与超滤(Ultrafiltration,UF)组合工艺对二级出水中的ARGs和有... 针对污水处理厂二级出水中的抗生素抗性基因(Antibiotic Resistance Genes,ARGs)进行深入研究。采用紫外线(Ultraviolet,UV)结合粉末活性炭(Powdered Activated Carbon,PAC)与超滤(Ultrafiltration,UF)组合工艺对二级出水中的ARGs和有机物进行去除,评价其去除效能并对其影响因素进行分析。结果表明,ARGs经过UV氧化失活后,经过PAC吸附与UF膜的过滤能够得到更为有效的去除;在UV最佳紫外线剂量(40 mJ/cm^(2))条件下,组合工艺对二级出水中不同类型ARGs(tetA、tetC、tetG、sulI、sulII)的去除量为102.72~103.08 copies/mL,对ARGs去除效果明显增强;浊度和pH值的降低能够使组合工艺更有效的去除二级出水中的ARGs;且组合工艺对各类有机物去除率更高,从而加强对ARGs的去除效果。 展开更多
关键词 环境工程学 抗生素抗性基因 超滤 紫外线 粉末活性炭 二级出水
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作物分蘖影响因素研究进展 被引量:2
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作者 廖澳 付虹雨 +4 位作者 焦鑫伟 龚喜红 杨瑞芳 佘玮 崔国贤 《现代农业科技》 2023年第10期15-18,22,共5页
分蘖作为禾本科作物的重要农艺性状,是评估作物生产潜力的关键指标,并对作物高产目标的实现有重要意义。本文从植物激素、遗传基因及外界环境因素3个方面阐述了作物分蘖发生的主要影响因素,以期为作物分蘖研究提供一定的理论参考。
关键词 作物 分蘖 植物激素 遗传基因 外界环境因素
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慢滤-低压纳滤对二级出水中有机物和抗生素抗性基因的去除效能研究
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作者 孙丽华 张钼晞 +1 位作者 丁宇 郗梓瑄 《安全与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期2875-2884,共10页
抗生素抗性基因(Antibiotic Resistance Genes,ARGs)作为新型环境污染物,在污水处理厂二级出水中被频繁检出,成为人类健康和生态安全的潜在威胁。本文采用慢滤-低压纳滤(Nanofiltration,NF)组合工艺去除二级出水中ARGs和溶解性有机物(Di... 抗生素抗性基因(Antibiotic Resistance Genes,ARGs)作为新型环境污染物,在污水处理厂二级出水中被频繁检出,成为人类健康和生态安全的潜在威胁。本文采用慢滤-低压纳滤(Nanofiltration,NF)组合工艺去除二级出水中ARGs和溶解性有机物(Dissolved Organic Carbon,DOC),探讨该工艺对ARGs和DOC的去除机制及效能。结果表明,生物膜慢滤-NF组合工艺对二级出水中ARGs和DOC的去除效果最好,对DOC的去除率为82.5%,质量浓度降为2.0 mg/L;对富里酸类有机物和腐殖酸类有机物的去除率分别达到87.2%、85.8%,对不同分子质量区间有机物的去除率均在90%以上,其中,对>100 kDa、50~100 kDa以及10~<50 kDa区间有机物的去除率均在95%以上,出水中几乎不含有这类物质;组合工艺对4种ARGs(tet A、tet W、sulⅠ、sulⅡ)的去除量为10^(4.83)~10^(5.67)copies/mL;生物膜慢滤对水中细胞态和游离态ARGs的去除效果优于慢滤,其对细胞态和游离态ARG的削减量分别为10^(1.06)~10^(3.52)copies/mL和10^(1.73)~10^(3.07)copies/mL;水中DOC与不同类型ARGs均具有显著正相关性;生物膜表面生长的变形菌门、放线菌门、假单胞菌属及蛭弧菌属等微生物可以加强对水中ARGs和DOC的去除。综上,慢滤-NF组合工艺可以有效去除二级出水中的ARGs和DOC,可以作为二级出水深度处理的有效方式。 展开更多
关键词 环境工程学 抗生素抗性基因 有机物 慢滤 低压纳滤 二级出水
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特色村镇地区空间基因识别、表达与演进过程初探——以川东平行岭谷明月山脉河源台地区为例 被引量:3
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作者 杨柳 谢心意 徐梓雅 《小城镇建设》 2023年第1期32-40,共9页
本研究是在空间基因内涵及作用机制的实证研究基础上,对关键过程的深度延展。按照“场景—特征—基因”技术路径,逆向解码特色关联的空间基因组,聚焦空间基因的层级表达和代际演化两个关键过程与机制,从共时性与历时性维度,探索空间基... 本研究是在空间基因内涵及作用机制的实证研究基础上,对关键过程的深度延展。按照“场景—特征—基因”技术路径,逆向解码特色关联的空间基因组,聚焦空间基因的层级表达和代际演化两个关键过程与机制,从共时性与历时性维度,探索空间基因及特征因子的谱系代际划分,提出演进的双特征、双路径、双机制,为特色基因的传承与保护、多元维系村镇地区特色提供理论与技术支撑。 展开更多
关键词 空间基因 特色村镇 特征因子 代际演化 文化惯性 环境选择
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西北内陆河抗生素抗性基因赋存特征及其影响因素 被引量:4
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作者 邢月 张雯 +2 位作者 程艳 程刚 胡海洋 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第6期3077-3086,共10页
基于宏基因组学方法对Y河流域表层水中抗生素抗性基因(ARGs)分布特征及细菌群落结构进行分析,探究了ARGs与环境因子、细菌群落间的关系.结果表明,Y河流域表层水中检测到21种ARGs类型和1295种ARGs亚型,6种抗性机制,其中多重耐药类为主要A... 基于宏基因组学方法对Y河流域表层水中抗生素抗性基因(ARGs)分布特征及细菌群落结构进行分析,探究了ARGs与环境因子、细菌群落间的关系.结果表明,Y河流域表层水中检测到21种ARGs类型和1295种ARGs亚型,6种抗性机制,其中多重耐药类为主要ARGs类型,macB为优势ARGs亚型,抗生素外排为主要抗性机制;分别检测到160个门水平和4149个属水平细菌.其中变形菌门(Proteobacteria)是优势细菌门,Liminohabitans等为优势细菌属.相关性分析结果表明TOC、DOC和COD_(Mn)等与多种ARGs亚型呈显著相关性(P<0.05);黄杆菌属(Flavobacterium)、极地单胞菌属(Polaromonas)和类诺卡氏属(Nocardioides)等部分菌属与多种ARGs显著相关(P<0.05),且涉及多种ARGs类型和抗性机制.本研究以期为西北干旱区典型内陆河水环境ARGs分布特征提供数据支撑. 展开更多
关键词 抗生素抗性基因 细菌群落 环境因子 宏基因组学 西北内陆河
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环境因子对茶树类黄酮合成调控的研究进展 被引量:1
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作者 周菲菲 戴彬炜 +5 位作者 陈玮璇 刘俊生 李博 何普明 屠幼英 吴媛媛 《中国茶叶》 2023年第3期8-18,共11页
类黄酮化合物是茶树中重要的次级代谢产物,不仅对茶树具有重要的生理学意义,还具有抗氧化、降脂减肥、保护肝脏等多种健康功能,是茶叶重要的功能成分。茶树类黄酮组成及含量受环境因素影响显著,并与结构基因及转录因子密切相关。本文围... 类黄酮化合物是茶树中重要的次级代谢产物,不仅对茶树具有重要的生理学意义,还具有抗氧化、降脂减肥、保护肝脏等多种健康功能,是茶叶重要的功能成分。茶树类黄酮组成及含量受环境因素影响显著,并与结构基因及转录因子密切相关。本文围绕茶树类黄酮的生物合成过程中涉及的光照、温度和干旱这3个重要环境因子,从3个层次系统探讨了其对茶树类黄酮物质合成的影响及分子调控机制,为高效利用茶树类黄酮物质提供了理论和试验依据。 展开更多
关键词 类黄酮 茶树 环境因子 结构基因 转录因子
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单增李斯特菌谷氧还蛋白调控氧化应激相关基因转录的研究 被引量:3
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作者 张念琦 孙静 +3 位作者 宋厚辉 卫芳芳 陈绵绵 程昌勇 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期459-465,501,共8页
本实验室前期对单增李斯特菌(LM)谷氧还蛋白(Grx)转录组数据进行了分析,在此基础上为了对Grx调控细胞色素氧化酶等应激相关基因(lmo0722、qox A、qox B、gr)的转录及其作用机制研究,本研究将Δgrx与野生株EGD-e经4 mmol/L肼应激后,分别... 本实验室前期对单增李斯特菌(LM)谷氧还蛋白(Grx)转录组数据进行了分析,在此基础上为了对Grx调控细胞色素氧化酶等应激相关基因(lmo0722、qox A、qox B、gr)的转录及其作用机制研究,本研究将Δgrx与野生株EGD-e经4 mmol/L肼应激后,分别提取总RNA并反转录为cDNA作为模板,利用RT-q PCR检测Grx调控细胞色素氧化酶等应激相关基因转录情况,结果显示,Δgrx与野生株EGD-e相比,grx基因缺失引起qox B、qox A、gr、lmo0722等基因的转录水平显著上调(分别上调30、29、17和5.6倍)。利用李斯特菌穿梭质粒构建携带调控基因启动子序列的gfp报告质粒,电转化至野生株EGD-e和缺失株Δgrx感受态细胞中,获得含GFP的重组报告菌株。将这两种含GFP的重组报告菌液分别加入4 mmol/L肼后检测荧光强度,结果显示,EGD-e携带的GFP荧光数值显著低于缺失株Δgrx(P<0.01),进一步表明Grx参与调控上述应激相关基因的转录。将扩增的lmo0722、qox A、qox B和gr基因的启动子和Grx、Prf A和GAPDH重组蛋白混合,37℃孵育60 min后进行凝胶迁移试验(EMSA),结果显示,Grx和上述调控基因启动子不直接结合,提示Grx可能通过间接方式参与该调控过程。本研究首次证实LM Grx通过对氧化应激相关基因的转录调控进而在细菌抗氧化应激环境适应过程中发挥重要作用,为系统阐述重要食源性病原菌在环境适应中发挥作用的调控机制提供了科学参考。 展开更多
关键词 单增李斯特菌 谷氧还蛋白 氧化应激相关基因 调控机制 环境适应
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蠋蝽热激蛋白基因AcHsp83a和AcHsp83b的克隆、表达谱及对高低温和UV-B胁迫的响应
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作者 孟建玉 金鑫 +3 位作者 何龙春 张雪霞 杨昌利 张长禹 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期1425-1434,共10页
【目的】探索天敌昆虫蠋蝽Arma chinensis响应高低温和UV-B胁迫的分子机制。【方法】利用RT-PCR克隆蠋蝽热激蛋白基因Hsp83a和Hsp83b,并利用生物信息学分析其序列特征;利用RT-qPCR检测Hsp83a和Hsp83b在蠋蝽不同发育阶段(卵、1-5龄若虫... 【目的】探索天敌昆虫蠋蝽Arma chinensis响应高低温和UV-B胁迫的分子机制。【方法】利用RT-PCR克隆蠋蝽热激蛋白基因Hsp83a和Hsp83b,并利用生物信息学分析其序列特征;利用RT-qPCR检测Hsp83a和Hsp83b在蠋蝽不同发育阶段(卵、1-5龄若虫、雌成虫和雄成虫)、成虫不同组织(头、胸、腹、翅、触角、脂肪体、足、马氏管、口器、中肠、卵巢和精巢)及38℃高温、4℃低温0(CK),6和24 h时和UV-B胁迫0(CK),6和12 h时雌成虫和雄成虫中的表达量。【结果】克隆获得蠋蝽2个Hsp90基因,分别命名为AcHsp83a(GenBank登录号:OP791883)和AcHsp83b(GenBank登录号:OP791884),开放阅读框(ORF)分别长2172和2163 bp,分别编码723和720个氨基酸,编码蛋白相对分子量分别为83.12和82.90 kD,等电点(pI)分别为4.94和4.97,C末端序列都含保守基序EEVD,均为胞质型热激蛋白。AcHsp83a和AcHsp83b高度保守。AcHsp83a在卵中表达量最高,AcHsp83b在成虫中表达量最高;AcHsp83a在雄成虫精巢中表达量最高,AcHsp83b在雌成虫中肠中表达量最高。对于雌成虫,随着38℃,4℃和UV-B处理时间的延长,AcHsp83a和AcHsp83b的表达量均先上升后下降,在6 h时达到最高。对于雄成虫,随着38℃和UV-B处理时间的延长,AcHsp83a的表达量均先上升后下降,在6 h时达到最高;随着4℃处理时间的延长,AcHsp83a的表达量在雄成虫中先下降后上升,在24 h时达到最高;在3种胁迫条件下,雄成虫体内AcHsp83b的表达量均较对照显著降低。【结论】蠋蝽AcHsp83a和AcHsp83b的差异表达说明其在蠋蝽的生长发育及适应极端温度和UV-B胁迫过程中发挥重要作用。 展开更多
关键词 蠋蝽 HSP90 基因克隆 表达谱分析 环境胁迫
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西藏东北部热泉水中硫氧化菌的多样性及分布特征
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作者 寇祝 卿纯 +1 位作者 袁昌果 李平 《生态环境学报》 CSCD 北大核心 2023年第5期989-1000,共12页
热泉中存在大量的硫氧化菌,而西藏东北部丰富的热泉资源中硫氧化菌的相关研究较少。为探究西藏东北部热泉水中不同类型硫氧化菌(Sulfur-Oxidizing Bacteria,SOB)的多样性、群落结构及其分布特征,采集西藏东北部5个地热区总共13个热泉的... 热泉中存在大量的硫氧化菌,而西藏东北部丰富的热泉资源中硫氧化菌的相关研究较少。为探究西藏东北部热泉水中不同类型硫氧化菌(Sulfur-Oxidizing Bacteria,SOB)的多样性、群落结构及其分布特征,采集西藏东北部5个地热区总共13个热泉的地球化学及微生物样品,构建硫氧化基因dsrA和soxB的功能基因克隆文库、q PCR定量分析dsr A和soxB基因丰度,结合水化参数对比分析热泉水中dsrA型SOB和soxB型SOB的群落结构及其分布特征的差异。结果表明,西藏东北部热泉水中的硫氧化菌主要为β变形菌纲(Betaproteobacteria)、α变形菌纲(Alphaproteobacteria)、γ变形菌纲(Gammaproteobacteria)和嗜氢菌纲(Hydrogenophilalia),其中dsr A型SOB和soxB型SOB的优势类群在纲水平上均为Betaproteobacteria,但目水平上则存在差异,即soxB型SOB优势菌目为亚硝化单胞菌目(Nitrosomonadales)(30.0%-91.7%);dsr A型SOB优势菌目为红环菌目(Rhodocyclales)(33.3%-96.0%)。冗余分析(redundancy analysis,RDA)表明,SO_4^(2-)、S^(2-)、HCO_(3)~-、pH、温度等是影响硫氧化菌群落分布的关键环境因子。soxB基因相对丰度主要与SO_4^(2-)浓度、氧化还原电位(Oxidation-Reduction Potential,ORP)以及S^(2-)浓度相关,dsr A基因相对丰度受总砷(As~T)浓度和HCO_(3)~-浓度影响较大。这些结果表明,soxB基因型SOB主要分布于偏氧化环境,而dsr A基因型SOB主要分布于砷浓度、碱度相对偏高的热泉。该研究进一步完善了关于西藏热泉水环境中SOB多样性和分布规律的认识,促进了对热泉硫的生物地球化学循环的理解。 展开更多
关键词 西藏 热泉 硫氧化菌 soxB基因 dsr A基因 群落结构 环境因子
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湖湘红色基因融入高职环境艺术设计类课程教学的实施路径 被引量:2
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作者 欧阳海燕 《岳阳职业技术学院学报》 2023年第4期43-46,共4页
湖湘红色基因包括“心忧天下”的革命精神、“敢为人先”的开拓精神和“百折不挠”的奋斗精神。在高职环境艺术设计类课程教学中,从师资队伍建设、课程建设、第二课堂建设、校园文化景观建设、教材建设等方面构建湖湘红色基因融入高职... 湖湘红色基因包括“心忧天下”的革命精神、“敢为人先”的开拓精神和“百折不挠”的奋斗精神。在高职环境艺术设计类课程教学中,从师资队伍建设、课程建设、第二课堂建设、校园文化景观建设、教材建设等方面构建湖湘红色基因融入高职环境艺术设计类课程教学体系,有助于提升高职生的德育素养和综合竞争力,增强学生的爱国情怀。 展开更多
关键词 湖湘红色基因 高职环境艺术设计类课 课程思政 教学体系
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