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基于WGCNA联合网络药理学探讨益髓生血胶囊治疗肝细胞癌的分子机制
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作者 李高勤 张志明 +6 位作者 颉志英 苏欢 张欣 张卫强 黄达 李娟 雍文兴 《西部中医药》 2024年第10期56-63,共8页
目的:基于加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)联合网络药理学方法探讨益髓生血胶囊治疗肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的分子机制,筛选肝细胞癌潜在预后标志物。方法:采用中药系统... 目的:基于加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)联合网络药理学方法探讨益髓生血胶囊治疗肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的分子机制,筛选肝细胞癌潜在预后标志物。方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选益髓生血胶囊有效成分对应靶点;从TCGA数据库下载HCC及癌旁组织基因芯片,通过“Limma”包筛选差异基因;使用WGCNA包通过TCGA数据库中HCC的基因表达数据图谱构建基因共表达网络,筛选与临床性状相关基因模块;对益髓生血胶囊调控基因、HCC差异基因、模块基因取交集;使用Cytoscape构建药物-靶点-疾病网络,对交集基因进行基因本体论(gene ontology,Go)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;使用STRING数据库构建交集基因间的蛋白-蛋白互作(protein-protein interactions,PPI)网络;根据最大团中心性(maximal clique centrality,MCC)评分对前10个基因与HCC的预后进行探索,进一步分析以获得HCC潜在标志物。结果:共获得益髓生血胶囊438个有效成分对应靶点;从TCGA数据库共获得374个肿瘤样本和50个正常样本,Limma包共筛选出2703个差异基因;WGCNA筛选出1922个与正常组织相关的基因,交集基因共26个,主要富集于细胞衰老、细胞周期、乙肝、p53信号通路、多种癌症、IL-17等信号通路;26个交集基因中,7个基因的高表达与肝癌患者的较差总生存率(overall survival,OS)/无病生存率(disease free survival,DFS)具有显著差异(P<0.05)。结论:益髓生血胶囊治疗HCC的作用机制复杂,主要涉及细胞衰老、细胞周期、乙肝、p53信号通路、多种癌症、IL-17等信号通路,其主要作用成分可能与榭皮素、木草素、芦荟大黄素、芒柄花素等有关。BIRC5、CCNA2、CCNB1、CDK1、CHEK1、E2F1、TOP2A等7个基因可能为HCC的潜在预后生物标志物。 展开更多
关键词 肝细胞癌 网络药理学 WGCNA 益髓生血胶囊
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生髓健骨胶囊对酒精性骨质疏松大鼠骨密度、骨矿含量影响的研究 被引量:12
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作者 任树军 梁彦林 +5 位作者 姜磊 任明辉 王墉琦 耿慧春 于雪峰 谭福柱 《中国骨质疏松杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期638-641,共4页
目的从基因分子水平探讨酒精性骨质疏松(alcoholic osteoporosis,AOP)大鼠的发病机制,观察生髓健骨胶囊对AOP大鼠骨密度(bone mineral density,BMD)、骨矿含量(bone mineral content,BMC)表达的影响,探讨生髓健骨胶囊对AOP大鼠模型的中... 目的从基因分子水平探讨酒精性骨质疏松(alcoholic osteoporosis,AOP)大鼠的发病机制,观察生髓健骨胶囊对AOP大鼠骨密度(bone mineral density,BMD)、骨矿含量(bone mineral content,BMC)表达的影响,探讨生髓健骨胶囊对AOP大鼠模型的中药防治作用机理。方法选取成年雄性(清洁级)SD大鼠120只,称体重,随机分为4组,每组各30只,用白酒灌胃法造模,同时分别给予生理盐水、碳酸钙阿法D3、生髓健骨胶囊灌胃给药。于造模8、12、16周末取材,检测股骨上端BMD、BMC指标。结果检测造模干预8、12、16周后BMD、BMC指标变化,模型组BMD、BMC与正常组比较明显降低,且差异有统计学意义(P<0.01),结果表明饮酒大鼠确实存在骨量减少,BMD、BMC降低;中药干预组BMD、BMC与模型组相比显著升高(P<0.01);中药干预组BMD、BMC与西药对照组相比,明显升高(P<0.05)。结论通过观察生髓健骨胶囊对AOP大鼠的实验指标,证明了生髓健骨胶囊能够提高AOP大鼠骨密度,增加骨矿含量,抑制矿物质丢失,改善大鼠的骨代谢。 展开更多
关键词 中医中药 酒精性骨质疏松 生髓健骨胶囊 骨密度 骨矿含量
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