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39种动物HMGB1氨基酸序列比对分析

目的:确定不同动物高迁移率族蛋白B1在物种进化中的关系。方法:运用分子生物学工具软件Generous检索NCBI数据库HMGB1氨基酸序列,比对分析和构建进化树。结果:获得39种动物HMGB1序列,39种动物HMGB1氨基酸序列同源性45.7%,其中哺乳动物序列同源性99.3%。哺乳动物与血吸虫、丝虫、蚊、蜱以及原虫序列同源性分别为:80.2%、80.9%、81.8%、73.3%和53.6%。进化树基本反映了HMGB1与动物物种进化的关系。结论:动物物种间HMGB1具有保守性和高度同源性,在寄生虫与宿主关系中,寄生虫的HMGB1可能是促进宿主炎症反应的一个因素。

人与十种寄生虫HMGB1序列比对分析

目的:确定人与寄生虫高迁移率族蛋白B1(HMGB1)的相似性关系。方法:运用分子生物学工具软件Generous检索NCBI数据库HMGBl氨基酸序列,比对分析寄生原虫、寄生丝虫和寄生吸虫的序列相似性以及氨基酸组成,比对分析人HMGB1炎症相关序列与10种寄生虫HMGB1的相似性。结果:3种寄生原虫、3种丝虫和4种吸虫的HMGBl序列位点一致性分别为69.2%、93.1%、68.3%;人HMGB1炎症相关序列与寄生虫HMGBl序列位点一致性50.7%。结论:人与寄生虫HMGBl序列同源,炎症相关序列与寄生虫HMGBl序列一致,人与寄生虫HMGBl促炎症作用可能存在构象和通路差异。