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题名具有遗传性疾病和性状的遗传位点分析
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作者
方兴
毕嘉琳
邢传智
张承进
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机构
山东大学(威海)机电与信息工程学院
山东大学(威海)数学与统计学院
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出处
《数学建模及其应用》
2017年第4期50-60,共11页
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文摘
为便于进行数据分析,首先将数据中的位点信息由原来字母编码方式转换为数值编码的方式,根据位点的编码信息和患病信息,采用Logistic回归的方法,找出某种疾病最有可能的一个或几个致病位点,同时采用显著性检验进一步对建立的模型进行检验,证明了建立结果的合理性。此外,通过主成分分析,从原有的300个主成分中取出了225个主成分尽可能多地反映原来基因变量的信息,再通过主成分Logistic回归分析找出与疾病最有可能相关的一个或几个基因。最后,采用典型相关分析找出与相关性状有关联的基因位点。
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关键词
LOGISTIC回归分析
主成分分析
典型相关分析
遗传统计学
全基因组关联性分析(gwas)
位点(snps)
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Keywords
Logistic regression analysis
principal component analysis
canonical correlation analysis
genetic statisticsgenome wide association analysis(gwas)~single nucleotide polymorphisms(snps)
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分类号
O212.4
[理学—概率论与数理统计]
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