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基于GEO数据库联合网络药理学研究川芎-赤芍药对治疗动脉粥样硬化的药理过程及分子机制
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作者 陈启庭 林洪 +4 位作者 陈利捷 卓超林 岳双冰 金宇 张淼 《中国医院用药评价与分析》 2024年第6期655-661,共7页
目的:探讨活血化瘀中药药对川芎-赤芍拮抗动脉粥样硬化的潜在分子机制及药理过程。方法:使用R语言Limma包分析GEO数据库GSE43292数据集,对有表达差异的动脉粥样硬化基因进行筛选和提取。川芎-赤芍药对所含的化学活性组分及靶点通过中药... 目的:探讨活血化瘀中药药对川芎-赤芍拮抗动脉粥样硬化的潜在分子机制及药理过程。方法:使用R语言Limma包分析GEO数据库GSE43292数据集,对有表达差异的动脉粥样硬化基因进行筛选和提取。川芎-赤芍药对所含的化学活性组分及靶点通过中药系统药理学数据库与分析平台检索。合并差异基因和药物作用靶点以获得共同的靶点。利用在线分析工具STRING和Cytoscape构建药物和靶点的调控网络以及靶点间的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。然后利用R语言注释靶点基因的基因本体(GO)功能,分析京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路,再进行基因集富集分析(GSEA)以验证KEGG的通路和富集的情况,确定靶点基因的调控功能和参与基因调控功能的信号转导通道。结果:共筛选出动脉粥样硬化差异基因1244个,川芎-赤芍药对含36个生物活性成分,其中靶点为环加氧酶1、肾上腺素受体、过氧化物酶体增殖物激活受体-γ、激酶插入域受体、孕激素受体、基质金属蛋白酶9、CXC趋化因子配体8、蛋白激酶Cβ、白细胞介素6、CD14、二肽基肽酶-4、PIK3CG、肾上腺素受体α1B、微管相关蛋白2、尿激酶纤溶酶原激活剂和单胺氧化酶B。靶点在GO中主要富集在合成DNA过程的调控、DNA生物合成的过程、含胶原的细胞外基质、细胞外基质、蛋白酶结合、细胞迁移、血管形成过程、膜筏结构、转录的调节等与动脉粥样硬化炎症、脂肪代谢及血管生成相关的生物学注释。脂质与动脉粥样硬化通路和核因子κB信号通路与动脉粥样硬化关系最为密切,并且在KEGG信号通路和GSEA均显示出富集。结论:川芎-赤芍药对通过潜在的13个活性成分作用于可能的16个靶点调控相关信号转导通路,通过抗炎、调脂和保护血管等方式产生抗动脉粥样硬化的作用。 展开更多
关键词 川芎-赤芍药对 动脉粥样硬化 geo数据库联合网络药理学 信号通路
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ArcGIS-based evaluation of geo-hazards at Yaozhou County,Shaanxi,China 被引量:2
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作者 Yuxiang Cheng Jun Zhang Jianbing Peng 《Journal of Rock Mechanics and Geotechnical Engineering》 SCIE CSCD 2013年第4期330-334,共5页
In conventional susceptibility evaluation of geo-hazards,there are some limits,such as unreasonable division of evaluated region,difficulty in quantifying evaluation indicators,time-consuming calculation.To address th... In conventional susceptibility evaluation of geo-hazards,there are some limits,such as unreasonable division of evaluated region,difficulty in quantifying evaluation indicators,time-consuming calculation.To address these problems,we try to employ the software ArcGIS to evaluate geo-hazards susceptibility.The study area of Yaozhou County is automatically divided into 3562 units.Based on the spatial overlay analysis function of ArcGIS,quantitative evaluation of geo-hazards susceptibility is implemented in the study area,and the geo-hazards susceptibility zoning is mapped.It is observed that the evaluation results match well with field investigations. 展开更多
关键词 geo-hazards susceptibility ArcGIS Conventional susceptibility evaluation Yaozhou area
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网络药理学联合GEO数据挖掘与分子对接探究桔梗-鱼腥草治疗非小细胞肺癌的作用机制 被引量:2
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作者 李永顺 谢嘉嘉 +3 位作者 周继红 张立 陈树超 欧阳子琛 《新中医》 CAS 2023年第15期138-145,共8页
目的:通过网络药理学联合GEO数据挖掘以及分子对接技术探究桔梗-鱼腥草药对治疗非小细胞肺癌(NSCLC)的作用机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库搜集桔梗-鱼腥草活性成分及其作用靶点,在Gencards、OMIM和GEO数据... 目的:通过网络药理学联合GEO数据挖掘以及分子对接技术探究桔梗-鱼腥草药对治疗非小细胞肺癌(NSCLC)的作用机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库搜集桔梗-鱼腥草活性成分及其作用靶点,在Gencards、OMIM和GEO数据库获取疾病相关靶点,将二者靶点取交集获取桔梗-鱼腥草与NSCLC的共同靶点,并使用Cytoscape3.9.0软件进行药物-活性成分-靶点互作网络构建获取核心成分。通过String网站对药物-疾病共同靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用分析得到核心靶点。使用Metascape平台对共同靶点进行GO及KEGG富集分析。最后运用AutoDock和PyMol软件对核心成分和核心靶点进行分子对接和可视化处理。结果:共获得药物活性成分7个,药物-疾病共同靶点139个。其中核心活性成分3个:槲皮素、木犀草素、山奈酚;核心靶点5个:TP53、AKT1、JUN、TNF、EGFR。GO分析得到2281个相关条目。KEGG分析得到326条信号通路。分子对接显示槲皮素、木犀草素、山奈酚与TP53、AKT1、JUN、TNF、EGFR之间均具有较强亲和力。结论:桔梗-鱼腥草药对可能通过TP53、AKT1、JUN、TNF、EGFR等靶点和癌症通路、PI3K-AKT信号通路等途径发挥抗NSCLC的作用。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 桔梗-鱼腥草 网络药理学 geo数据挖掘 分子对接
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Risk analysis system of geo-hazard based on GIS technique 被引量:11
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作者 ZHU Liangfeng, ZHANG Guirong, YIN Kunlong, ZHANG Liang (1. Faculty of Engineering, China University of Geosciences, Wuhan 430074, China 2. China Research Institute of Land Resources and Economy, Beijing 101149, China) 《Journal of Geographical Sciences》 SCIE CSCD 2002年第3期371-376,共6页
The socio-economic attribute of geo-hazard made us distinguish it from the traditional engineering geology study. It will get more social benefit from the analysis of the geo-hazard in the socio-economic attribute. Th... The socio-economic attribute of geo-hazard made us distinguish it from the traditional engineering geology study. It will get more social benefit from the analysis of the geo-hazard in the socio-economic attribute. The hazard and the vulnerability of the element controls the risk level of the regional geo-hazard. The risk analysis supported by GIS in geo-hazard study is one of the most important directions. Based on the author’s studies in recent years, a risk analysis system of regional geo-hazard (RiskAnly) has been developed on the basis of software MAPGIS. The paper introduces the train of system design, the structure and the workflow of RiskAnly. As a case study, the paper also deals with the risk zonation of the regional landslide hazard of China. 展开更多
关键词 geo-hazard GIS risk analysis LANDSLIDE
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慢性间歇低氧和复氧对大鼠胰岛素抵抗及骨骼肌miR-27a-3p/PPARγ/IRS1/PI3K/AKT表达的影响
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作者 周雪利 李华 +5 位作者 陈青宇 靳美娜 李海波 白炜 贾楚璇 魏翠英 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期1729-1737,共9页
目的探讨慢性间歇低氧(CIH)和复氧对大鼠胰岛素抵抗(IR)及骨骼肌miR-27a-3p/PPARγ/IRS1/PI3K/AKT表达的影响。方法从基因表达数据库(GEO)中下载CIH条件下miRNA数据集,运用DESeq2筛选差异表达最显著的miRNA作为研究对象,使用miRNA walk... 目的探讨慢性间歇低氧(CIH)和复氧对大鼠胰岛素抵抗(IR)及骨骼肌miR-27a-3p/PPARγ/IRS1/PI3K/AKT表达的影响。方法从基因表达数据库(GEO)中下载CIH条件下miRNA数据集,运用DESeq2筛选差异表达最显著的miRNA作为研究对象,使用miRNA walk网站对差异miRNA的靶基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,并Cytoscape软件构建miRNA-mRNA-pathway调控网络。将48只雄性SD大鼠随机分为对照(CON)组和CIH组,24只/组,CON组常氧环境饲养12周,CIH组先予CIH环境饲养8周,再恢复常氧饲养4周。两组均在基线、8周、12周时留取血样和骨骼肌组织,检测空腹血糖(FBG)、空腹胰岛素(FINS)水平,HE染色观察骨骼肌病理改变并计算肌纤维横截面积,实时定量聚合酶链反应(RT-qPCR)和Western blotting法检测骨骼肌miR-27a-3p、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)、葡萄糖转运蛋白4(GLUT4)、胰岛素受体1(IRS1)、p-IRS1、磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)、磷酸激酶B(AKT)、p-AKT表达,比较组间差异。结果生信分析发现,GEO数据库未筛选出CIH状态下肌肉组织相关的miRNA数据集,仅得到肾脏组织差异表达miRNA的GSE202480数据集,从CON组和CIH组样本中筛选出165个差异表达的miRNA,选最显著miR-27a-3p作为研究对象。GO和KEGG分析显示,差异miRNA的靶基因主要参与肌肉调节和胰岛素信号传导。miRNA-mRNA-pathway调控网络显示miR-27a-3p是PPAR信号通路和PI3K/AKT信号通路的关键调控因子。动物实验发现,基线时,两组各项观察指标均无统计学意义(P>0.05);8周时,与CON组相比,CIH组FBG、FINS、HOMA-IR、PPARγ显著升高(P<0.05或P<0.01),肌纤维排列疏松,肌纤维横截面积、miR-27a-3p、p-IRS1/IRS1、PI3K、p-AKT/AKT显著降低(P<0.05或P<0.01),GLUT4表达呈升高趋势但无统计学意义(P>0.05);12周时,两组各项观察指标均无统计学意义(P>0.05)。结论CIH可导致大鼠IR增加和骨骼肌病理改变,而复氧可以逆转;CIH可致骨骼肌miR-27a-3p表达下调,PPARγ表达上调,IRS1/PI3K/AKT胰岛素信号转导受到抑制,而复氧干预可以逆转;miR-27a-3p可能通过调控PPARγ/IRS1/PI3K/AKT信号通路参与了CIH所致的IR。 展开更多
关键词 慢性间歇低氧-复氧 胰岛素抵抗 geo miR-27a-3p IRS1/PI3K/AKT通路
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中国地质灾害气象风险预警20年:2003-2022 被引量:1
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作者 肖锐铧 刘艳辉 +5 位作者 陈春利 苏永超 王惠卿 徐为 方志伟 梁宏锟 《中国地质灾害与防治学报》 CSCD 2024年第2期1-9,共9页
地质灾害气象风险预警业务自2003年启动以来,对我国地质灾害防灾减灾起到了重要支撑作用。文章全面总结了预警工作20年的发展历程、预警技术方法和防灾减灾成效。(1)将预警工作历程分为启动推进(2003—2009年)、深化合作(2010—2017年)... 地质灾害气象风险预警业务自2003年启动以来,对我国地质灾害防灾减灾起到了重要支撑作用。文章全面总结了预警工作20年的发展历程、预警技术方法和防灾减灾成效。(1)将预警工作历程分为启动推进(2003—2009年)、深化合作(2010—2017年)和改革提升(2018—2022年)三个阶段。(2)以24 h预警业务为主体,逐步形成了预测预报预警的递进式预警模式和较完善的预警业务系统。(3)逐步形成包括临界降水阈值模型、基于地质灾害危险性的阈值模型和动力预警模型等3套预警模型技术方法体系,2023年发布行业标准。(4)预警产品时空精度不断提高,国家级和26个省级预警空间精度高于5 km×5 km,以24 h预警为主,向72 h、中长期预测等尺度发展;超过8个省级和部分市县级开展了3 h短临预警,逐步形成支撑服务长期部署、中期防范和短临应对的业务体系。(5)有预警必有响应,2020年自然资源部将国家级预警作为启动防御响应的依据之一,18个省份在省级突发地质灾害应急预案中明确了预警响应联动工作机制。(6)多方联动防灾意识不断增强,收到预警信息后,加强巡查排查和组织人员撤离实现成功避险的案例不断增加,防灾减灾成效显著。20年来的预警工作总结,可为下一步推进地质灾害气象风险预警业务提供借鉴,支撑提升我国地质灾害防治工作能力和水平。 展开更多
关键词 地质灾害 地质灾害气象风险预警 发展历程 技术方法 减灾成效
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Evaluation of Geological Hazards for Landuse Planning in Nabq Protectorate, Southeastern Sinai Using GIS Techniques
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作者 Abdel Hamid A. Taha Elkhedr H. Ibrahim +1 位作者 Ahmed S. Shalaby Mohamed Shawky 《International Journal of Geosciences》 2013年第4期816-836,共21页
Nabq protectorate is one of wonderful natural places in Egypt. It is characterized by diversity of bio-lives such as mangrove forests, coral colonies, wild life plants and migratory birds. Ongoing growth of tourism in... Nabq protectorate is one of wonderful natural places in Egypt. It is characterized by diversity of bio-lives such as mangrove forests, coral colonies, wild life plants and migratory birds. Ongoing growth of tourism industries at Sharm El Sheikh northward into the Nabq protectorate causes severe hazards on its natural resources. The aim of the present study is to assess the present geo-environmental hazards in the Nabq protectorate. Assessment includes the analysis of satellite images, topographical, geological and other ancillary geological data using GIS technology. GIS data analyses indicate that the area is under threat from some of geo-hazards. Rough topography and mass wasting with high probability of flash flooding threaten different constructions in this area. The mobilization of coastal sand dunes, wave action and tidal currents are natural impacts on Nabq ecosystems, where moved dunes leave clay soils that are removed in some places by tropical storms increasing sea water turbidity that threaten the corals and other living organisms in the tidal flat region. The seismic activity hazard in the study area is usually active on lineaments extending parallel to the trend of the Gulf of Aqaba-Dead Sea transform fault where the Nabq protectorate occupies its southern segment. Unwise planning activities destroy the natural environmental resources in Nabq area by construction of new resorts on mangrove forests, coral colonies and raised beaches. Hazard assessment identifies land suitability and land use maps that are clearly exhibit models of traditional dams and buffer strips on coastal zone and highways as well as around the Bedouin communities which are worked on tourism and fishing. These maps are urgent in need of an assessment and rehabilitation program to mitigate geo-hazard. 展开更多
关键词 NATURAL Protectorates geo-hazard Assessments LAND Use and LAND COVER MAPS
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GeO_2-SiO_2纳米复合材料的合成及其光学特性研究 被引量:7
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作者 周延怀 冯玉英 陆海彦 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2000年第1期23-24,共2页
运用溶胶 凝胶法合成了GeO2 SiO2 纳米复合材料 ,探索了为 pH在 2的条件下通过水解Si(OC2 H5) 4和GeCl4合成GeO2 SiO2 干胶的过程。在 10 0~ 12 0 0℃下对干胶进行热处理。采用UV光谱法测定了材料的光学性质 ,观察到随热处理温度的... 运用溶胶 凝胶法合成了GeO2 SiO2 纳米复合材料 ,探索了为 pH在 2的条件下通过水解Si(OC2 H5) 4和GeCl4合成GeO2 SiO2 干胶的过程。在 10 0~ 12 0 0℃下对干胶进行热处理。采用UV光谱法测定了材料的光学性质 ,观察到随热处理温度的升高 ,样品光谱的吸收边向长波方向移动。由于温度的影响 ,晶粒长大 ,带隙能量减小 ,纳米微晶的量子尺寸效应显示出来。经X射线衍射分析 ,观察到了随热处理温度的增高 ,材料结构从无序到有序的转变过程 ,直到 110 0℃时 ,有明显的微晶生成 ,其尺寸为 5~ 10nm。 展开更多
关键词 溶胶-凝胶 纳米半导体材料 geo2-SiO2
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生物信息学分析miR-16-5p在乳腺癌中的作用及临床验证
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作者 黄亮 高东 +1 位作者 周丹丹 陈方红 《临床肿瘤学杂志》 CAS 2023年第6期488-494,共7页
目的 生物信息学分析miR-16-5p在乳腺癌(BC)中的作用并进行临床验证。方法 BC的队列数据集来自高通量基因表达数据库(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA),并通过生物信息学工具进行分析。在临床验证中,前瞻性纳入2018年1月至2022年2月接受手术... 目的 生物信息学分析miR-16-5p在乳腺癌(BC)中的作用并进行临床验证。方法 BC的队列数据集来自高通量基因表达数据库(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA),并通过生物信息学工具进行分析。在临床验证中,前瞻性纳入2018年1月至2022年2月接受手术的BC患者(BC组),获取BC组织和对应的癌旁正常组织。另纳入同期150例体检健康女性作为对照组,获取其血清样本,采用实时荧光定量PCR(qPCR)检测组织及血清miR-16-5p表达。所有BC患者至少随访3年。结果 共鉴定出195个差异表达基因(DEG),根据logFC≥1.5或logFC≤-1.5阈值,miR-16-5p表达显著下调,其受试者工作特征(ROC)曲线和Kaplan-Meier曲线分析显示,miR-16-5p区分BC组织及正常乳腺组织的曲线下面积(AUC)为0.73(95%CI:0.68~0.79),且miR-16-5p低表达的患者预后较差(P=0.013),因此miR-16-5p可作为候选miRNA。在临床验证集中,BC组织miR-16-5p相对表达量明显低于癌旁正常组织[0.46(0.29,0.66)vs. 0.82(0.56,1.08),P<0.001]。且BC患者血清miR-16-5p相对表达量也显著低于对照组[0.34(0.15,0.50)vs. 0.99(0.70,1.20),P<0.001]。ROC曲线显示,当血清miR-16-5p相对表达量≤0.520时可良好地诊断BC患者,AUC值为0.897(95%CI:0.863~0.932)。BC患者血清样本和BC组织样本中miR-16-5p相对表达量呈正相关(rs=0.373,P<0.001)。血清miR-16-5p表达与T分期、N分期、TNM分期有关(P<0.05)。血清miR-16-5p低表达组是影响BC患者患者3年内发生局部复发/远处转移及死亡的独立预测生物标志物(P<0.05)。结论 血清miR-16-5p表达对BC有诊断效能,低血清miR-16-5p表达预示着BC患者更差的疾病进展情况和3年内预后不良。 展开更多
关键词 乳腺癌 geo 癌症基因组图谱 miR-16-5p 临床验证
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基于GEO数据库的黄芪-当归药对治疗糖尿病合并心血管并发症的分子机制研究 被引量:3
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作者 董又滋 赵泉霖 王毓国 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期1190-1200,共11页
目的探究经典中药配伍组合黄芪-当归药对(芪归药对)对糖尿病合并心血管并发症的治疗作用及分子机制。方法运用BATMAN数据库对芪归药对进行分析,检索GEO数据库中关于糖尿病合并心血管并发症的相关基因芯片数据,借助GEO2R分析差异基因,构... 目的探究经典中药配伍组合黄芪-当归药对(芪归药对)对糖尿病合并心血管并发症的治疗作用及分子机制。方法运用BATMAN数据库对芪归药对进行分析,检索GEO数据库中关于糖尿病合并心血管并发症的相关基因芯片数据,借助GEO2R分析差异基因,构建靶点互作关系网络,拓扑得到芪归药对治疗糖尿病心血管并发症的关键基因;运用DAVID数据库对关键基因进行基因本体功能和KEGG通路富集分析。将20只SD大鼠随机分为健康对照组、糖尿病合并心血管并发症模型组、阳性对照二甲双胍治疗组和芪归药对治疗组,每组5只;除健康对照组外,其余各组均给予高脂高糖饲料并建立糖尿病合并心血管并发症模型;观察各组大鼠心肌细胞中PI3K、Akt3蛋白的表达情况。结果(1)在BATMAN数据库中分析得到芪归药对的相关靶点基因1332个,在GEO数据库中检索得到3个糖尿病合并心血管病变的芯片数据文件(GSE26887、GSE43950、GSE46262),利用GEO2R分析筛选出2759个差异基因;经映射得到芪归药对治疗糖尿病合并心血管并发症的关键基因247个。(2)通过STRING数据库构建关键靶点的差异蛋白相互作用(PPI)网络图,运用Cytoscape 3.7.2构建“芪归药对—活性成分—靶点”网络。采用DAVID数据库进行功能富集分析提示,芪归药对治疗糖尿病合并心血管并发症的生物学进程主要集中在RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正负调控、氧化还原过程、信号转导、凋亡过程、炎症反应、细胞增殖的正调控等,信号通路涉及新陈代谢通路、癌症通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、5'-单磷酸(cAMP)信号通路、环磷酸鸟苷酸-蛋白激酶(cGMP-PKG)信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶与丝氨酸/苏氨酸激酶(PI3K-Akt)信号通路、非酒精性脂肪肝通路、胰岛素抵抗通路等。(3)采用SD大鼠的动物模型实验结果显示,与健康对照组比较,未接受治疗的糖尿病合并心血管并发症模型组心肌细胞中PI3K、Akt3蛋白表达量均明显降低(P<0.01);芪归药对治疗组和二甲双胍治疗组心肌细胞中PI3K表达量均高于模型组(P<0.01),但低于健康对照组(P<0.01);芪归药对治疗组Akt3蛋白表达量低于健康对照组(P<0.05),二甲双胍治疗组Akt3蛋白表达量高于模型组(P<0.05)。结论芪归药对治疗糖尿病合并心血管并发症的特点是“多成分、多靶点、多途径”,多个关键基因和信号通路发挥了重要作用,进一步研究有望拓宽糖尿病中医药诊疗的思路。 展开更多
关键词 糖尿病合并心血管并发症 黄芪-当归 geo数据库 生物信息学
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基于GEO数据库和网络药理学探讨柴胡-葛根治疗原发性青光眼的机制 被引量:1
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作者 杨稀瑞 王继雪 +2 位作者 袁星星 董霏雪 赵辉 《眼科新进展》 CAS 北大核心 2022年第8期603-607,共5页
目的基于GEO数据库和网络药理学探讨柴胡-葛根治疗原发性青光眼的机制,为原发性青光眼的治疗提供新方向。方法通过TCMSP数据库筛选柴胡、葛根的有效活性成分;通过检索GeneCards、OMIM等数据库及二次挖掘GEO数据库中的芯片数据筛选原发... 目的基于GEO数据库和网络药理学探讨柴胡-葛根治疗原发性青光眼的机制,为原发性青光眼的治疗提供新方向。方法通过TCMSP数据库筛选柴胡、葛根的有效活性成分;通过检索GeneCards、OMIM等数据库及二次挖掘GEO数据库中的芯片数据筛选原发性青光眼的作用靶点;利用David平台对靶基因进行GO功能及KEGG富集分析。体外实验以小鼠视网膜神经节细胞(RGC)为研究对象,以过氧化氢诱导RGC构建氧化应激损伤模型,设置空白组、模型组、空白+中药组、模型+中药组,倒置相差显微镜下观察各组RGC形态变化,RT-PCR检测各组RGC中PI3K和AKT mRNA表达情况。结果网络药理学研究结果证实,与原发性青光眼相关的差异蛋白靶点共63个,包括IL-6、VEGFA等。GO功能及KEGG富集分析结果显示,柴胡-葛根治疗原发性青光眼的生物学过程与蛋白结合、催化、有机环状化合物结合及有机物代谢过程等有关,主要通过调节PI3K-AKT、TNF、MAPK、VEGF、JAK-STAT等信号通路发挥作用。体外实验结果显示,模型+中药组RGC从缓慢贴壁到完全贴壁,并可见少量聚集性生长及串珠样排列,细胞体缓慢增大。RT-PCR检测结果显示,与空白组相比,空白+中药组RGC中PI3K和AKT mRNA表达均下降(均为P<0.05);与模型组相比,模型+中药组RGC中PI3K和AKT mRNA表达均下降(均为P<0.05)。结论柴胡-葛根能够通过抑制PI3K-AKT信号通路抑制细胞凋亡,起到改善原发性青光眼的作用。 展开更多
关键词 geo数据库 网络药理学 柴胡-葛根 原发性青光眼 视网膜神经节细胞
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溶胶-凝胶法制备Sn掺杂GeO_2粉体
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作者 聂荣志 敬承斌 《青岛科技大学学报(自然科学版)》 CAS 2011年第4期345-350,共6页
采用溶胶-凝胶法以锗酸根离子水溶液作为前驱体制备了Sn掺杂GeO2粉体样品。用X射线衍射和红外光谱分析了试样的微观结构;用X射线能谱仪测试了试样的组成;用场发射扫描电子显微镜观察了试样的微观形貌;用紫外-可见光光谱分析了试样的禁... 采用溶胶-凝胶法以锗酸根离子水溶液作为前驱体制备了Sn掺杂GeO2粉体样品。用X射线衍射和红外光谱分析了试样的微观结构;用X射线能谱仪测试了试样的组成;用场发射扫描电子显微镜观察了试样的微观形貌;用紫外-可见光光谱分析了试样的禁带宽度。结果表明,Sn掺杂GeO2粉体试样为单一六方GeO2晶相,粒子具有包覆形貌。Sn的掺杂引起了GeO2晶格常数有规律的变化和红外吸收光谱的红移。利用漫散射紫外-可见光光谱计算出GeO2和Sn掺杂GeO2试样的禁带宽度分别为5.04eV和4.51eV。荧光光谱显示Sn掺杂GeO2试样具有新的发光性质,发光波长为325nm。 展开更多
关键词 溶胶-凝胶 Sn掺杂geo2 红外光谱 禁带宽度 光致发光
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基于多级适应性休假和θ-进入规则的Geo/G/1排队系统的队长分布(英文)
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作者 魏瑛源 唐应辉 余玅妙 《应用数学》 CSCD 北大核心 2020年第1期186-201,共16页
本文考虑带有多级适应性休假的Geo/G/1离散时间排队系统,其中在服务员休假期间到达的顾客以概率(0<θ≤1)进入系统.运用更新过程理论和全概率分解技术,从任意初始状态出发,获得时刻n^+处队长瞬态分布的z-变换的递推表达式,并在瞬时... 本文考虑带有多级适应性休假的Geo/G/1离散时间排队系统,其中在服务员休假期间到达的顾客以概率(0<θ≤1)进入系统.运用更新过程理论和全概率分解技术,从任意初始状态出发,获得时刻n^+处队长瞬态分布的z-变换的递推表达式,并在瞬时性质分析的基础上,分别得到时刻n^+;n;n^-处队长稳态分布的递推公式,所得结果进一步表明稳态队长不再具有随机分解结构.最后通过数值实例,讨论队长稳态分布对系统参数的敏感性,并阐述了队长稳态分布的递推公式在系统容量优化设计中的重要应用价值. 展开更多
关键词 离散时间geo/G/1排队 多级适应性休假 θ-进入规则 队长分布 全概率分解技术 系统容量的优化设计
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基于miRNA-mRNA网络探讨黄芪-山药药对治疗2型糖尿病的作用机制 被引量:2
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作者 李敏 陈浩雄 +1 位作者 黄佳纯 朱根福 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2023年第20期4895-4903,共9页
目的运用生物信息学和网络药理学方法挖掘黄芪-山药药对治疗2型糖尿病的微小RNA(miRNA)-mRNA转录网络,探讨其作用机制。方法通过GEO数据库挖掘2型糖尿病miRNA和mRNA芯片集,并通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)挖掘黄芪-山药药... 目的运用生物信息学和网络药理学方法挖掘黄芪-山药药对治疗2型糖尿病的微小RNA(miRNA)-mRNA转录网络,探讨其作用机制。方法通过GEO数据库挖掘2型糖尿病miRNA和mRNA芯片集,并通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)挖掘黄芪-山药药对活性成分及预测靶点,使用R语言及Perl软件筛选黄芪-山药药对治疗2型糖尿病的关键miRNAs及mRNAs,借助Cytoscape3.8.2软件与STRING数据库构建活性成分-靶点网络、miRNA-mRNA转录网络及蛋白互作(PPI)网络,并进行基因本体(GO)功能及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并借助cytoNCA完成PPI网络的拓扑分析。结果2型糖尿病中存在64个差异miRNA和6143个差异mRNA构成的605组miRNA-mRNA互作关系;黄芪-山药药对存在56个有效成分和538个药物靶点,如PGR、PTGS1、AR、SCN5A、NCOA2等。2型糖尿病-miRNA-mRNA-有效成分-中药调控网络图得到miR-1307-3p-PTPN1、miR-1307-3p-SCN5A、miR-1307-3p-BCL2、miR-1307-3p-CHEK2、miR-1307-3p-E2F2、miR-1307-3p-IL10RB、miR-1307-3p-IRF1、miR-1307-3p-MAPK1、miR-491-5p-PTGS 1共9条miRNA-mRNA相互关系。PTPN1、SCN5A、BCL2、CHEK2、E2F2、IL10RB、IRF1、MAPK1、PTGS1共9个靶点作为miRNA调控黄芪-山药药对治疗2型糖尿病的重要桥梁。GO结果富集在对类固醇激素的反应、对金属离子的反应、对药物的反应、内在凋亡信号通路、RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录起始等,KEGG结果富集在脂质和动脉粥样硬化、IL-17信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、p53信号通路等。结论2型糖尿病中存在多个miRNA-mRNA调控网络,黄芪-山药药对以多组分、多功能、多途径的形式,介导IL-17、TNF、p53、HIF-1等信号通路,miRNA-mRNA网络在黄芪-山药药对治疗2型糖尿病中发挥重要作用。 展开更多
关键词 2型糖尿病 miRNA-mRNA 黄芪-山药药对 生物信息学 geo数据库
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Geospatial Modeling for Sinkholes Hazard Map Based on GIS &RS Data
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作者 Omar Al-Kouri A’kif Al-Fugara +3 位作者 Samih Al-Rawashdeh Balqies Sadoun Balqies Sadoun Biswajeet Pradhan 《Journal of Geographic Information System》 2013年第6期584-592,共9页
The Kinta Valley is an area of karst in the north-western part of Peninsular Malaysia. Over 30 years of uncontrolled land use and development has led to significant changes in topography and geomorphology, such as the... The Kinta Valley is an area of karst in the north-western part of Peninsular Malaysia. Over 30 years of uncontrolled land use and development has led to significant changes in topography and geomorphology, such as the appearance of sinkholes. In this paper, geospatial techniques were utilized to the task of evaluating sinkholes susceptibility map using a spatial multi criteria evaluation approach (SMCE). Sinkhole location and a spatial database were applied to calculate eight inherent causative factors for limestone instability namely: lithology, structure (lineament), soil cover, slope, land use mining, urban area features, ponds and rivers. The preparation of the sinkhole geohazard map involved summing the weighted values for each hazard element, which permits the construction of geohazard model;the results of the analysis were validated using the previous actual sinkholes locations in the study area. The spatial distribution of sinkholes occurrence, urban development, faults distribution and ex-mining ponds are factors that are directly responsible for all sinkholes subsidence hazards. Further, the resulting geo-hazard map shows that 93% of recent sinkholes occur in areas where the model flags as “high” and “very high” potential hazard, located in the urbanized part of the valley, while less-developed areas to the west and southwest suffered less sinkhole development. The results can be used for hazard prevention and land-use planning. 展开更多
关键词 geo-hazard MAPPING KARST SINKHOLES geoSPATIAL Modeling
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Mn2+/N2-共掺杂Zn2GeO4晶体电子结构和光学性质的研究
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作者 蔡宏宇 吴海涛 +1 位作者 吴成国 何苏红 《原子与分子物理学报》 CAS 北大核心 2020年第5期749-755,共7页
采用基于密度泛函理论的平面波超软赝势方法对本征Zn2GeO4,Mn2+掺杂Zn2GeO4,Mn2+/N2-共掺杂Zn2GeO4超晶胞进行了几何结构优化,计算了掺杂前后体系的晶格常数、能带结构、态密度和光学性质.结果表明,Mn离子掺入后,Mn离子3d轨道与O离子2p... 采用基于密度泛函理论的平面波超软赝势方法对本征Zn2GeO4,Mn2+掺杂Zn2GeO4,Mn2+/N2-共掺杂Zn2GeO4超晶胞进行了几何结构优化,计算了掺杂前后体系的晶格常数、能带结构、态密度和光学性质.结果表明,Mn离子掺入后,Mn离子3d轨道与O离子2p轨道之间有强烈的轨道杂化效应,掺杂系统不稳定,而Mn/N离子共掺后,Mn离子和N离子之间的吸引作用克服了Mn离子之间的排斥作用,能够明显地提高掺杂浓度和体系的稳定性.光学性质计算结果表明,Mn离子与N离子共掺杂能改善Zn2GeO4电子在低能区的光学跃迁特性,增强电子在可见光区的光学跃迁;吸收谱计算结果显示,Mn离子与N离子掺入后体系对低频电磁波吸收增加. 展开更多
关键词 Mn2+/N2-共掺杂Zn2geo4 第一性原理 电子结构 光学性质
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3.5MgO·0.5MgF2·GeO2:Mn4+的溶胶-凝胶法合成及其研究
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作者 莫素青 陈晔 蒋志维 《轻工科技》 2019年第6期25-26,50,共3页
溶胶-凝胶法合成3.5MgO·0.5MgF2·GeO2:Mn4+(2%)荧光粉的激发和发射的峰值强度受三氟乙酸含量的影响较大,随着三氟乙酸含量的增加,峰值强度呈现先增后降趋势;当加入三氟乙酸的量为14mmol时3.5MgO·0.5MgF2·GeO2:Mn4+(... 溶胶-凝胶法合成3.5MgO·0.5MgF2·GeO2:Mn4+(2%)荧光粉的激发和发射的峰值强度受三氟乙酸含量的影响较大,随着三氟乙酸含量的增加,峰值强度呈现先增后降趋势;当加入三氟乙酸的量为14mmol时3.5MgO·0.5MgF2·GeO2:Mn4+(2%)荧光性能最好。3.5MgO·0.5MgF2·GeO2:Mn4+(2%)发射主峰位于660nm,最大激发峰在280nm,能够被紫外光、紫光和蓝光发射的LED芯片所激发,发射红色荧光。 展开更多
关键词 溶胶-凝胶法 三氟乙酸 红色荧光粉 氟氧化物基质 3.5MgO·0.5MgF2·geo2:Mn4+(2%)
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地质灾害易发性评价因子分级的AIFFC算法优化
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作者 陈宾 李颖懿 +4 位作者 张联志 屈添强 魏娜 刘宁 黄春林 《中国地质灾害与防治学报》 CSCD 2024年第1期72-81,共10页
针对地质灾害易发性评价因子分级数不确定的问题,引入自适应膨胀因子模糊覆盖分级方法(fuzzy cover approach for clustering based on adaptive inflation factor,AIFFC)对易发性评价因子分级进行优化。以湖南省湘乡市为研究区,提取了... 针对地质灾害易发性评价因子分级数不确定的问题,引入自适应膨胀因子模糊覆盖分级方法(fuzzy cover approach for clustering based on adaptive inflation factor,AIFFC)对易发性评价因子分级进行优化。以湖南省湘乡市为研究区,提取了坡度、坡向、高程、年平均降雨量、归一化植被指数、道路、断层、岩性和土地利用9类评价因子,运用AIFFC及自然断点法(natural breakpoint classification,NBC)对连续型因子进行分级,并分别代入加权信息量模型和随机森林模型,获取研究区易发性区划图。采用单因子分级结果精度、灾积比分析和易发性分区结果对AIFFC分级法的优越性进行检验,结果表明:各因子采用AIFFC算法分级的AUC值均高于自然断点法;基于AIFFC的随机森林模型及加权信息量模型的高易发区灾积比分别提升了56.3%、74.6%,低易发区灾积比分别降低了48%、58.1%,AUC值分别提升了7.6%、2.7%。采用AIFFC分级方法优化了地质灾害易发性评价因子分级,显著提高了地质灾害易发性评价的合理性。 展开更多
关键词 膨胀因子 模糊覆盖 加权信息量 随机森林 易发性评价 地质灾害
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DHCR7基因在胃癌中的表达及其与免疫相关基因的关系
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作者 王业忠 杨明华 +1 位作者 曹少锋 梅璐 《河南医学研究》 CAS 2024年第7期1153-1159,共7页
目的探究7-脱氢胆固醇还原酶(DHCR7)基因在胃癌中的表达及其与免疫相关基因的关系。方法使用UALCAN、TIMER数据库分析DHCR7基因在不同类型肿瘤中的表达情况。使用GEPIA、TCGA、GEO数据库分析DHCR7基因在胃癌中的表达。Kaplan-Meier Plot... 目的探究7-脱氢胆固醇还原酶(DHCR7)基因在胃癌中的表达及其与免疫相关基因的关系。方法使用UALCAN、TIMER数据库分析DHCR7基因在不同类型肿瘤中的表达情况。使用GEPIA、TCGA、GEO数据库分析DHCR7基因在胃癌中的表达。Kaplan-Meier Plotter数据库分析DHCR7基因表达与胃癌患者预后的相关性。通过cBioPortal数据库找出与DHCR7共表达的基因,并展示这些基因中相关系数比较高的基因。对胃癌中与DHCR7表达正负相关的基因进行基因本体分析(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,首先分析DHCR7基因与CD8^(+)T细胞以及招募CD8^(+)T细胞相关趋化因子的相关性;其次分析DHCR7基因与免疫激活相关基因的相关性;最后分析DHCR7表达与胃癌患者临床病理学特征的关联。结果DHCR7基因在大多数肿瘤类型中均有高表达趋势。DHCR7基因在胃癌中的表达高于正常胃黏膜。Kaplan-Meier Plotter数据库中201790-s-at芯片结果显示高表达DHCR7组患者生存期较短。与DHCR7负相关基因的GO、KEGG通路富集分析主要富集在免疫相关功能和信号通路上,DHCR7与CD8^(+)T细胞、招募CD8^(+)T细胞相关的趋化因子以及免疫激活基因都具有负相关性。DHCR7高表达与胃癌患者年龄呈正相关。结论DHCR7在胃癌组织中呈高表达,高表达DHCR7患者预后不良,DHCR7基因能够影响胃癌免疫微环境,有望成为胃癌免疫治疗的新靶点。 展开更多
关键词 7-脱氢胆固醇还原酶 胃癌 TCGA geo 免疫 CD8^(+)T细胞
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基于地质环境分析的复杂山区道路防护工程设计
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作者 敬麒麟 王宇 吕玉海 《科技资讯》 2024年第18期195-197,共3页
以复杂山区道路防护工程设计为研究对象,通过对地质环境的深入分析,结合工程地质学和地质工程力学理论,对山区道路在地质灾害作用下的稳定性和安全性进行了系统的评估。以地质勘测数据和现场调查结果为依据,提出了地质灾害预警系统、坡... 以复杂山区道路防护工程设计为研究对象,通过对地质环境的深入分析,结合工程地质学和地质工程力学理论,对山区道路在地质灾害作用下的稳定性和安全性进行了系统的评估。以地质勘测数据和现场调查结果为依据,提出了地质灾害预警系统、坡面防护结构设计、路基稳定性改善方案等针对性防护措施。通过数值模拟和实地测试验证,为复杂山区道路安全运行提供了科学和可行的技术保障,确保了工程设计的可靠性和实用性。 展开更多
关键词 复杂山区道路 地质环境分析 防护工程设计 地质灾害预警 稳定性改善
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