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鸡IGFBP2基因3′UTR区1196C>A单核苷酸多态性的功能性鉴定及分析
被引量:
6
1
作者
于莹莹
乔书培
+5 位作者
孙婴宁
宋鹤
张潇飞
闫晓红
李辉
王宁
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2014年第11期1163-1172,共10页
鸡IGFBP2基因3′非编码区(3′UTR)1196C>A单核苷酸多态性(SNP)与鸡的腹脂重和腹脂率显著相关.生物信息学分析显示,该SNP恰好位于gga-mi R-456-3p的一个潜在靶基因结合位点处,提示IGFBP2基因可能是gga-mi R-456-3p的一个靶基因,且该SN...
鸡IGFBP2基因3′非编码区(3′UTR)1196C>A单核苷酸多态性(SNP)与鸡的腹脂重和腹脂率显著相关.生物信息学分析显示,该SNP恰好位于gga-mi R-456-3p的一个潜在靶基因结合位点处,提示IGFBP2基因可能是gga-mi R-456-3p的一个靶基因,且该SNP位点可能影响gga-mi R-456-3p对IGFBP2基因表达的调控作用.为鉴定SNP 1196C>A是否为功能性SNP,本研究分别构建了包含该SNP位点C或A等位基因的双荧光素酶报告基因载体,比较分析这两个等位基因在鸡胚成纤维细胞系(DF1)和鸡前脂肪细胞中对报告基因活性和表达的影响;利用mi RNA mimics和inhibitor分析gga-mi R-456-3p对不同等位基因报告基因活性以及内源性IGFBP2表达的影响.结果发现,在DF1细胞和鸡前脂肪细胞中,A等位基因的报告基因活性和表达均显著高于C等位基因(P<0.05);gga-mi R-456-3p仅影响C等位基因的报告基因活性和表达,而对A等位基因的报告基因活性没有明显影响;gga-mi R-456-3p调控细胞内源性IGFBP2基因的m RNA和蛋白质表达.本研究证实IGFBP2基因是gga-mi R-456-3p的靶基因,其3′UTR区SNP 1196C>A是一个功能性SNP,它影响gga-mi R-456-3p对鸡IGFBP2基因的表达调控作用.本研究结果对于鸡的分子辅助选择育种及IGFBP2基因在脂肪沉积中调控机制的阐明具有重要意义.
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关键词
鸡
IGFBP2基因
单核苷酸多态性
3′非编码区
gga-mi
R-456-3p
下载PDF
职称材料
题名
鸡IGFBP2基因3′UTR区1196C>A单核苷酸多态性的功能性鉴定及分析
被引量:
6
1
作者
于莹莹
乔书培
孙婴宁
宋鹤
张潇飞
闫晓红
李辉
王宁
机构
农业部鸡遗传育种重点实验室
齐齐哈尔大学生命科学与农林学院
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2014年第11期1163-1172,共10页
基金
国家重点基础研究发展计划(973)(2009CB941604)
国家肉鸡产业技术体系建设(CARS-42)
国家自然科学基金(31372299)资助项目~~
文摘
鸡IGFBP2基因3′非编码区(3′UTR)1196C>A单核苷酸多态性(SNP)与鸡的腹脂重和腹脂率显著相关.生物信息学分析显示,该SNP恰好位于gga-mi R-456-3p的一个潜在靶基因结合位点处,提示IGFBP2基因可能是gga-mi R-456-3p的一个靶基因,且该SNP位点可能影响gga-mi R-456-3p对IGFBP2基因表达的调控作用.为鉴定SNP 1196C>A是否为功能性SNP,本研究分别构建了包含该SNP位点C或A等位基因的双荧光素酶报告基因载体,比较分析这两个等位基因在鸡胚成纤维细胞系(DF1)和鸡前脂肪细胞中对报告基因活性和表达的影响;利用mi RNA mimics和inhibitor分析gga-mi R-456-3p对不同等位基因报告基因活性以及内源性IGFBP2表达的影响.结果发现,在DF1细胞和鸡前脂肪细胞中,A等位基因的报告基因活性和表达均显著高于C等位基因(P<0.05);gga-mi R-456-3p仅影响C等位基因的报告基因活性和表达,而对A等位基因的报告基因活性没有明显影响;gga-mi R-456-3p调控细胞内源性IGFBP2基因的m RNA和蛋白质表达.本研究证实IGFBP2基因是gga-mi R-456-3p的靶基因,其3′UTR区SNP 1196C>A是一个功能性SNP,它影响gga-mi R-456-3p对鸡IGFBP2基因的表达调控作用.本研究结果对于鸡的分子辅助选择育种及IGFBP2基因在脂肪沉积中调控机制的阐明具有重要意义.
关键词
鸡
IGFBP2基因
单核苷酸多态性
3′非编码区
gga-mi
R-456-3p
Keywords
chicken, IGFBP2 gene, SNP, 3'UTR,
gga-mi
R-456-3p
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
R3 [医药卫生—基础医学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鸡IGFBP2基因3′UTR区1196C>A单核苷酸多态性的功能性鉴定及分析
于莹莹
乔书培
孙婴宁
宋鹤
张潇飞
闫晓红
李辉
王宁
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2014
6
下载PDF
职称材料
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