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结核分枝杆菌GLCB蛋白的生物信息学分析
被引量:
2
1
作者
陈浩天
付玉荣
伊正君
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2020年第5期512-517,共6页
目的对结核分枝杆菌Rv1837c基因编码蛋白GLCB的结构和功能进行生物信息学分析和预测。方法自GenBank数据库中获取Rv1837c全部基因信息,运用ProtParam及ProtScale分别预测其编码的glcB蛋白理化性质和亲疏水性;使用SignalP,NetPhos和TMHM...
目的对结核分枝杆菌Rv1837c基因编码蛋白GLCB的结构和功能进行生物信息学分析和预测。方法自GenBank数据库中获取Rv1837c全部基因信息,运用ProtParam及ProtScale分别预测其编码的glcB蛋白理化性质和亲疏水性;使用SignalP,NetPhos和TMHMM分析glcB的信号肽、磷酸化位点、跨膜螺旋;分别利用SOPMA,SWISSMODEL分析glcB蛋白的二级结构并建立三级结构模型;利用Vaxijen v2.0进行抗原性分析并用ABCpred预测glcB蛋白的B细胞抗原表位。结果Rv1837c基因全长2226bp,其编码的glcB蛋白含有741个氨基酸残基,疏水系数-0.1545,为亲水性蛋白,不稳定指数为33.81,定义其为稳定蛋白。glcB蛋白无信号肽和跨膜蛋白,含有大量磷酸化位点及B细胞抗原表位。结论生物信息学分析glcB蛋白为亲水性蛋白,具有潜在多个抗原表位,可作为结核病疫苗研发的候选蛋白。
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关键词
结核分枝杆菌
Rv1837c
glcb蛋白
生物信息学
原文传递
结核分枝杆菌glcB基因原核表达载体的构建、表达和纯化
2
作者
陈曦
贾红彦
+7 位作者
古淑香
李自慧
刘忠泉
郑小静
邢爱英
杜博平
张继增
张宗德
《结核病与胸部肿瘤》
2009年第1期10-15,共6页
目的构建结核分枝杆glcB基因原核表达载体,并进行表达,纯化。方法用PcR扩增结核分枝杆菌glcB基因,并克隆入pTA2质粒。测序正确后,再亚克隆入pET30a(+)质粒,构建pET30a(+):glcB重组体。结果以重组体转化BL21(DE3)后,经0....
目的构建结核分枝杆glcB基因原核表达载体,并进行表达,纯化。方法用PcR扩增结核分枝杆菌glcB基因,并克隆入pTA2质粒。测序正确后,再亚克隆入pET30a(+)质粒,构建pET30a(+):glcB重组体。结果以重组体转化BL21(DE3)后,经0.4mM异丙基硫代-β.D.半乳糖苷(IPTG)诱导,表达出分子量为92KD重组蛋白。SDS—PAGE分析显示,IPTG诱导4h重组蛋白的表达量最高。表达蛋白以包涵体形式存在于胞质中,表达量占全菌蛋白质的50%。经Ni-NTA柱纯化,获得纯度为90%的重组蛋白。结论成功地构建原核表达载体pET30a(+):glcB,并获得GIcB重组蛋白,为血清学诊断活动性结核病奠定了基础。
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关键词
分枝杆菌
结核
glcb
基因
glcb
重组
蛋白
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职称材料
题名
结核分枝杆菌GLCB蛋白的生物信息学分析
被引量:
2
1
作者
陈浩天
付玉荣
伊正君
机构
潍坊医学院医学检验学系
潍坊医学院病原生物学教研室
出处
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2020年第5期512-517,共6页
基金
山东省自然科学基金重大基础研究项目(No.ZR2018ZC1054)
山东省自然科学基金面上项目(No.ZR2018MH001)。
文摘
目的对结核分枝杆菌Rv1837c基因编码蛋白GLCB的结构和功能进行生物信息学分析和预测。方法自GenBank数据库中获取Rv1837c全部基因信息,运用ProtParam及ProtScale分别预测其编码的glcB蛋白理化性质和亲疏水性;使用SignalP,NetPhos和TMHMM分析glcB的信号肽、磷酸化位点、跨膜螺旋;分别利用SOPMA,SWISSMODEL分析glcB蛋白的二级结构并建立三级结构模型;利用Vaxijen v2.0进行抗原性分析并用ABCpred预测glcB蛋白的B细胞抗原表位。结果Rv1837c基因全长2226bp,其编码的glcB蛋白含有741个氨基酸残基,疏水系数-0.1545,为亲水性蛋白,不稳定指数为33.81,定义其为稳定蛋白。glcB蛋白无信号肽和跨膜蛋白,含有大量磷酸化位点及B细胞抗原表位。结论生物信息学分析glcB蛋白为亲水性蛋白,具有潜在多个抗原表位,可作为结核病疫苗研发的候选蛋白。
关键词
结核分枝杆菌
Rv1837c
glcb蛋白
生物信息学
Keywords
Mycobacterium tuberculosis
Rv1837c
glcb
protein
bioinformatics
分类号
R378.911 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
结核分枝杆菌glcB基因原核表达载体的构建、表达和纯化
2
作者
陈曦
贾红彦
古淑香
李自慧
刘忠泉
郑小静
邢爱英
杜博平
张继增
张宗德
机构
北京市结核病胸部肿瘤研究所结核病分子生物学研究室
出处
《结核病与胸部肿瘤》
2009年第1期10-15,共6页
文摘
目的构建结核分枝杆glcB基因原核表达载体,并进行表达,纯化。方法用PcR扩增结核分枝杆菌glcB基因,并克隆入pTA2质粒。测序正确后,再亚克隆入pET30a(+)质粒,构建pET30a(+):glcB重组体。结果以重组体转化BL21(DE3)后,经0.4mM异丙基硫代-β.D.半乳糖苷(IPTG)诱导,表达出分子量为92KD重组蛋白。SDS—PAGE分析显示,IPTG诱导4h重组蛋白的表达量最高。表达蛋白以包涵体形式存在于胞质中,表达量占全菌蛋白质的50%。经Ni-NTA柱纯化,获得纯度为90%的重组蛋白。结论成功地构建原核表达载体pET30a(+):glcB,并获得GIcB重组蛋白,为血清学诊断活动性结核病奠定了基础。
关键词
分枝杆菌
结核
glcb
基因
glcb
重组
蛋白
Keywords
Mycobacterium tuberculosis
glcb
gene Recombinant
glcb
分类号
R378.911 [医药卫生—病原生物学]
R392.12 [医药卫生—免疫学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
结核分枝杆菌GLCB蛋白的生物信息学分析
陈浩天
付玉荣
伊正君
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2020
2
原文传递
2
结核分枝杆菌glcB基因原核表达载体的构建、表达和纯化
陈曦
贾红彦
古淑香
李自慧
刘忠泉
郑小静
邢爱英
杜博平
张继增
张宗德
《结核病与胸部肿瘤》
2009
0
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