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结核分枝杆菌GLCB蛋白的生物信息学分析 被引量:2
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作者 陈浩天 付玉荣 伊正君 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2020年第5期512-517,共6页
目的对结核分枝杆菌Rv1837c基因编码蛋白GLCB的结构和功能进行生物信息学分析和预测。方法自GenBank数据库中获取Rv1837c全部基因信息,运用ProtParam及ProtScale分别预测其编码的glcB蛋白理化性质和亲疏水性;使用SignalP,NetPhos和TMHM... 目的对结核分枝杆菌Rv1837c基因编码蛋白GLCB的结构和功能进行生物信息学分析和预测。方法自GenBank数据库中获取Rv1837c全部基因信息,运用ProtParam及ProtScale分别预测其编码的glcB蛋白理化性质和亲疏水性;使用SignalP,NetPhos和TMHMM分析glcB的信号肽、磷酸化位点、跨膜螺旋;分别利用SOPMA,SWISSMODEL分析glcB蛋白的二级结构并建立三级结构模型;利用Vaxijen v2.0进行抗原性分析并用ABCpred预测glcB蛋白的B细胞抗原表位。结果Rv1837c基因全长2226bp,其编码的glcB蛋白含有741个氨基酸残基,疏水系数-0.1545,为亲水性蛋白,不稳定指数为33.81,定义其为稳定蛋白。glcB蛋白无信号肽和跨膜蛋白,含有大量磷酸化位点及B细胞抗原表位。结论生物信息学分析glcB蛋白为亲水性蛋白,具有潜在多个抗原表位,可作为结核病疫苗研发的候选蛋白。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 Rv1837c glcb蛋白 生物信息学
原文传递
结核分枝杆菌glcB基因原核表达载体的构建、表达和纯化
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作者 陈曦 贾红彦 +7 位作者 古淑香 李自慧 刘忠泉 郑小静 邢爱英 杜博平 张继增 张宗德 《结核病与胸部肿瘤》 2009年第1期10-15,共6页
目的构建结核分枝杆glcB基因原核表达载体,并进行表达,纯化。方法用PcR扩增结核分枝杆菌glcB基因,并克隆入pTA2质粒。测序正确后,再亚克隆入pET30a(+)质粒,构建pET30a(+):glcB重组体。结果以重组体转化BL21(DE3)后,经0.... 目的构建结核分枝杆glcB基因原核表达载体,并进行表达,纯化。方法用PcR扩增结核分枝杆菌glcB基因,并克隆入pTA2质粒。测序正确后,再亚克隆入pET30a(+)质粒,构建pET30a(+):glcB重组体。结果以重组体转化BL21(DE3)后,经0.4mM异丙基硫代-β.D.半乳糖苷(IPTG)诱导,表达出分子量为92KD重组蛋白。SDS—PAGE分析显示,IPTG诱导4h重组蛋白的表达量最高。表达蛋白以包涵体形式存在于胞质中,表达量占全菌蛋白质的50%。经Ni-NTA柱纯化,获得纯度为90%的重组蛋白。结论成功地构建原核表达载体pET30a(+):glcB,并获得GIcB重组蛋白,为血清学诊断活动性结核病奠定了基础。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核glcb基因 glcb重组蛋白
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