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文心兰‘南茜’谷氧还蛋白基因克隆定位及表达
被引量:
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作者
高玉莹
白玉
+5 位作者
时欢
陈晓慧
郝向阳
林玉玲
叶开温
赖钟雄
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期533-540,共8页
为研究文心兰谷氧还蛋白超家族基因ROXY在花药发育中的功能,以文心兰‘南茜’(Oncidium Gower Ramsey)为试验材料,从‘南茜’的转录组网站选取一条与拟南芥At ROXY1/2相似度最高的基因序列(命名为OnROXY1),以该序列的cDNA为模版设...
为研究文心兰谷氧还蛋白超家族基因ROXY在花药发育中的功能,以文心兰‘南茜’(Oncidium Gower Ramsey)为试验材料,从‘南茜’的转录组网站选取一条与拟南芥At ROXY1/2相似度最高的基因序列(命名为OnROXY1),以该序列的cDNA为模版设计引物,用RT-PCR从‘南茜’花器官中扩增该基因,并对扩增产物进行测序和保守结构域分析.结果表明,OnROXY1基因编码区402 bp,编码133个氨基酸,与‘南茜’转录组网站中的预测序列只有一个碱基差异,但与该预测序列的氨基酸序列和保守结构域完全一致(GenBank登录号:MF696154).OnROXY1基因具有典型的谷氧还蛋白(Glutaredoxin,GRX)基因家族的结构域和CMCC活性位点,因此该基因属于GRX基因家族,并且属于亚类CC型的GRX基因.进化树分析表明,OnROXY1与水稻的Os ROXY1、Os ROXY2和拟南芥的At ROXY1、At ROXY2蛋白序列的一致性最高,进化距离最近.亚细胞定位结果显示,OnROXY1主要定位于细胞核中,少量定位在细胞质中.RT-PCR检测发现,在不同组织部位中,OnROXY1在假鳞茎中的表达量最高,唇瓣中的表达量最低;不同花期的定量结果显示,OnROXY1在脱落干枯期时的表达量最高,盛开期时的表达量最低.本研究推测谷氧还蛋白基因OnROXY1可能在文心兰假鳞茎与根的发育、消除植物体内过多的活性氧以及延缓文心兰花器官的衰老等方面具有重要作用.
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关键词
文心兰
谷氧还蛋白基因
onroxy1
qPCR
RT-PCR
原文传递
题名
文心兰‘南茜’谷氧还蛋白基因克隆定位及表达
被引量:
1
1
作者
高玉莹
白玉
时欢
陈晓慧
郝向阳
林玉玲
叶开温
赖钟雄
机构
福建农林大学园艺植物生物工程研究所
台湾大学植物科学研究所
出处
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期533-540,共8页
基金
福建省科技重大专项专题(2015NZ0002-1)资助~~
文摘
为研究文心兰谷氧还蛋白超家族基因ROXY在花药发育中的功能,以文心兰‘南茜’(Oncidium Gower Ramsey)为试验材料,从‘南茜’的转录组网站选取一条与拟南芥At ROXY1/2相似度最高的基因序列(命名为OnROXY1),以该序列的cDNA为模版设计引物,用RT-PCR从‘南茜’花器官中扩增该基因,并对扩增产物进行测序和保守结构域分析.结果表明,OnROXY1基因编码区402 bp,编码133个氨基酸,与‘南茜’转录组网站中的预测序列只有一个碱基差异,但与该预测序列的氨基酸序列和保守结构域完全一致(GenBank登录号:MF696154).OnROXY1基因具有典型的谷氧还蛋白(Glutaredoxin,GRX)基因家族的结构域和CMCC活性位点,因此该基因属于GRX基因家族,并且属于亚类CC型的GRX基因.进化树分析表明,OnROXY1与水稻的Os ROXY1、Os ROXY2和拟南芥的At ROXY1、At ROXY2蛋白序列的一致性最高,进化距离最近.亚细胞定位结果显示,OnROXY1主要定位于细胞核中,少量定位在细胞质中.RT-PCR检测发现,在不同组织部位中,OnROXY1在假鳞茎中的表达量最高,唇瓣中的表达量最低;不同花期的定量结果显示,OnROXY1在脱落干枯期时的表达量最高,盛开期时的表达量最低.本研究推测谷氧还蛋白基因OnROXY1可能在文心兰假鳞茎与根的发育、消除植物体内过多的活性氧以及延缓文心兰花器官的衰老等方面具有重要作用.
关键词
文心兰
谷氧还蛋白基因
onroxy1
qPCR
RT-PCR
Keywords
Oncidium hybridum
glutaredoxin gene onroxy1
qPCR
RT-PCR
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
Q949.718.43 [生物学—植物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
文心兰‘南茜’谷氧还蛋白基因克隆定位及表达
高玉莹
白玉
时欢
陈晓慧
郝向阳
林玉玲
叶开温
赖钟雄
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
1
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