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Determination and Analysis of Mitochondrial ND2 Gene Sequence of Anas platyrhynchos 被引量:4
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作者 涂剑锋 司方方 +1 位作者 邢秀梅 杨福合 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2009年第3期46-49,共4页
[Objective] The study was to analyze the phylogenesis of Anas platyrhynchos. [Method] Complete sequence of mitochondrial ND2 gene of 4 Anas platyrhynchos was determined by direct DNA sequencing based on PCR products. ... [Objective] The study was to analyze the phylogenesis of Anas platyrhynchos. [Method] Complete sequence of mitochondrial ND2 gene of 4 Anas platyrhynchos was determined by direct DNA sequencing based on PCR products. Combined with ND2 gene sequences of the Anas Linnaeus accessed in GenBank, phylogenetic tree was constructed by Neighbor-joining and maximum parsimony methods. [Result] The ND2 gene sequences of 4 Anas platyrhynchos were identical(1 041 bp in length; the nucleotide contents of A, G, T, and C were 28.91%, 13.35%, 20.75% and 36.98% respectively; A+T content approximated to that of C+G). Sequences of ND2 gene of mallard were same as spotbill duck, and had high homology with others. The phylogenetic trees indicated mallard and spotbilled duck were close in genetic relationship, both shared a haplotype; then Philippine duck, green-winged teal and northern pintail fell into branch ''A". [Conclusion] The domestic duck may be domesticated from mallard and spotbilled duck. 展开更多
关键词 anas platyrhynchos ND2 gene sequence analysis Phylogenetic tree
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绿头鸭野外杂交研究综述
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作者 徐曦 王卫国 +1 位作者 冉景丞 朱小梅 《浙江林业科技》 2024年第3期107-113,共7页
本文根据整理野外观察记录和发表文献,对绿头鸭Anasplatyrhynchos和其他野生鸭类的杂交现象进行综述。绿头鸭由于人工引入到世界各地,与当地的土著种的杂交而造成的生态和遗传多样性保护问题值得关注。国内仅有少量公开发表的野外观察记... 本文根据整理野外观察记录和发表文献,对绿头鸭Anasplatyrhynchos和其他野生鸭类的杂交现象进行综述。绿头鸭由于人工引入到世界各地,与当地的土著种的杂交而造成的生态和遗传多样性保护问题值得关注。国内仅有少量公开发表的野外观察记录,并缺乏对绿头鸭野外杂交现象的系统研究。我国的基因测序研究大多用于不同野鸭对家鸭基因来源的贡献的探讨,而对野外鸭群的杂交趋势缺少监测。国外研究人员以野外鸭群为研究对象,对绿头鸭与斑嘴鸭Anaszonorhyncha在俄罗斯、东亚和北美的杂交现象、趋势和原因进行了讨论;还对北美、东亚、俄罗斯以及新西兰等地的绿头鸭和当地鸭群发生的杂交趋势进行了遗传多样性研究。这些研究表明:(1)种间杂交带来基因遗传变异的同时,更多造成了全球范围内遗传多样性减少和物种生殖努力的损失;(2)人为因素对生态环境的改变造成鸭群适宜栖息地减少而引起不同种群同域性增加,是野外杂交增加趋势的一个重要原因。因此,本文认为利用基因测序技术对野生鸭种遗传多样性展开鉴定,确认栖息地丧失对鸟类遗传多样性的影响,将是生物多样性保护与管理的重要内容与趋势之一;并提出绿头鸭野外杂交率可作为栖息地变化的一个重要指标,需引起生物多样性保护研究者和管理者的重视。 展开更多
关键词 野外杂交 绿头鸭 遗传多样性 栖息地减少
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鸭肝过氧化氢酶的分离纯化及部分性质研究 被引量:15
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作者 邱慧 郭小路 +1 位作者 易燚波 唐云明 《西南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期163-168,共6页
新鲜鸭肝经匀浆、磷酸缓冲液抽提、硫酸铵分级沉淀、DEAE-Sepharose离子交换层析、Sephacryl S-200凝胶过滤层析,得到鸭肝过氧化氢酶电泳纯制品,回收率为18.23%,比活达4780.38U/mg,纯化倍数为66.15。最适温度为40℃,最适pH为7... 新鲜鸭肝经匀浆、磷酸缓冲液抽提、硫酸铵分级沉淀、DEAE-Sepharose离子交换层析、Sephacryl S-200凝胶过滤层析,得到鸭肝过氧化氢酶电泳纯制品,回收率为18.23%,比活达4780.38U/mg,纯化倍数为66.15。最适温度为40℃,最适pH为7.0,该酶在20~40℃,pH5~8内稳定.经凝胶过滤和SDS-PAGE测得该酶的全分子量为250KD,亚基分子量为62.5KD。 展开更多
关键词 家鸭 肝脏 过氧化氢酶 分离纯化 性质
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半番鸭和北京鸭MC1R基因的克隆与序列分析 被引量:7
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作者 郑嫩珠 王安静 +5 位作者 陈晖 朱志明 缪中纬 李盛霖 董晓宁 王光瑛 《中国农学通报》 CSCD 2008年第11期38-43,共6页
羽色是半番鸭一个重要的经济性状。黑素皮质素受体1(melanocortin receptor1,MC1R)基因是控制动物黑色素合成的重要基因。根据鸡、鹌鹑、雪雁、孔雀等MC1R基因同源序列的保守区设计1对引物,以半番鸭、北京鸭总DNA为模板,PCR扩增,克隆测... 羽色是半番鸭一个重要的经济性状。黑素皮质素受体1(melanocortin receptor1,MC1R)基因是控制动物黑色素合成的重要基因。根据鸡、鹌鹑、雪雁、孔雀等MC1R基因同源序列的保守区设计1对引物,以半番鸭、北京鸭总DNA为模板,PCR扩增,克隆测序。结果,获得了2个长度为900bp的基因片段,并提交GenBank,登录号分别为EU877265和EU877264。经比对,发现北京鸭与半番鸭核苷酸序列存在8个变异位点,其中位于184bp(T/A)、229bp(G/A)、364bp(A/G)、385bp(G/A)处的变异导致了氨基酸序列分别在第62位(C/S)、77位(E/K)、122位(T/A)和129位(V/I)发生突变。为进一步研究半番鸭羽色MC1R基因单核苷酸多态性(SNP)奠定了基础;通过BLAST进行相似性搜索,结果表明,鸭与黑雁MC1R基因的核苷酸序列同源性最高为98.4%,与其他家禽的同源性也保持在92.8%~98.2%之间。可见禽类的MC1R基因编码区序列具有高度的保守性;系统进化分析表明,半番鸭、北京鸭与雪雁、黑雁、皇雁亲缘关系相近,从分子角度验证了它们在动物学分类上的地位。 展开更多
关键词 半番鸭 北京鸭 MC1R基因 克隆 序列分析
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日粮蛋白质水平对育雏期绿头野鸭生长性能的影响 被引量:5
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作者 丛立新 娄玉杰 荷艳丽 《中国家禽》 北大核心 2006年第12期9-11,共3页
本研究选用刚出壳的绿头野鸭90只,随机分成3组,每组30只,分别饲喂能量相同,蛋白质水平分别为17.00%、19.00%、21.00%的饲粮,通过饲养和代谢试验研究不同蛋白质水平日粮对育雏期(0~4周龄)绿头野鸭生长性能的影响。结果表明,随着饲粮蛋... 本研究选用刚出壳的绿头野鸭90只,随机分成3组,每组30只,分别饲喂能量相同,蛋白质水平分别为17.00%、19.00%、21.00%的饲粮,通过饲养和代谢试验研究不同蛋白质水平日粮对育雏期(0~4周龄)绿头野鸭生长性能的影响。结果表明,随着饲粮蛋白质水平的提高,蛋白质的代谢率逐渐下降,各组间差异不显著(P>0.05)。从饲料报酬的角度看,19.00%的蛋白质水平完全可以满足绿头野鸭育雏期(0~4周龄)的生长需要。 展开更多
关键词 绿头野鸭 蛋白质水平 生长性能
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绿头野板鸭挥发性风味物质的检测 被引量:3
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作者 周蓓蓓 张东红 +6 位作者 杨松 尤逢惠 闫晓明 陈蕾 陈敏 宋亚琼 崔艳芳 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期57-62,67,共7页
采用固相微萃取结合气相色谱/质谱联用技术检测了绿头野鸭鲜鸭、绿头野板鸭以及市售腊鸭的挥发性风味物质的种类及其相对含量。结果显示,板鸭84种挥发性风味物质分别为烃类17种、酮类9种、酸类7种、酯类7种、醚类2种、醛类13种、醇类17... 采用固相微萃取结合气相色谱/质谱联用技术检测了绿头野鸭鲜鸭、绿头野板鸭以及市售腊鸭的挥发性风味物质的种类及其相对含量。结果显示,板鸭84种挥发性风味物质分别为烃类17种、酮类9种、酸类7种、酯类7种、醚类2种、醛类13种、醇类17种、芳香族化合物10种、呋喃类1种、含硫化合物1种。通过与鲜鸭以及市售腊鸭的对比分析,初步判定绿头野板鸭的特征风味物质为香桧烯、(-)-柠檬烯、己醛、异戊醛、戊醛、壬醛、辛醛、2,3-辛二酮、己酸、戊酸、1-辛烯-3-醇等。为改进其加工工艺及产品品质提供理论依据。 展开更多
关键词 绿头野鸭 板鸭 风味 顶空固相微萃取 气相色谱-串联质谱技术
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蛋氨酸螯合锌对绿头野鸭生产性能的影响 被引量:2
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作者 薛会明 孙淑霞 娄玉杰 《中国畜牧兽医》 CAS 2006年第6期20-22,共3页
本试验研究蛋氨酸螯合锌对绿头野鸭生长性能及能量和蛋白质代谢的影响,探讨蛋氨酸螯合锌的最佳添加量.试验采用单因子完全随机试验设计,供试绿头野鸭54只,分为3个处理组,每组18只,设3个重复.第Ⅰ组为对照组,添加150 mg/kg硫酸锌;第Ⅱ、... 本试验研究蛋氨酸螯合锌对绿头野鸭生长性能及能量和蛋白质代谢的影响,探讨蛋氨酸螯合锌的最佳添加量.试验采用单因子完全随机试验设计,供试绿头野鸭54只,分为3个处理组,每组18只,设3个重复.第Ⅰ组为对照组,添加150 mg/kg硫酸锌;第Ⅱ、Ⅲ组为试验组,分别添加75 mg/kg硫酸锌+150 mg/kg蛋氨酸螯合锌、300 mg/kg蛋氨酸螯合锌,试验期为8周,采用3层立体笼养,每周进行称重、称料,通过饲养试验、代谢试验,测定绿头野鸭生长率、耗料量及营养物质的代谢率.研究结果表明,各试验组的平均日增重显著高于对照组(P<0.05),分别提高了12.13%、11.96%,以4~7周效果最明显;能量和蛋白质代谢率均显著高于对照组(P<0.05);料肉比显著低于对照组;从试验的总体效果看,添加75 mg/kg硫酸锌+150 mg/kg蛋氨酸螯合锌效果较好。因此,提倡蛋氨酸螯合锌与硫酸锌混合饲喂绿头野鸭效果好,成本低,建议推广使用。 展开更多
关键词 蛋氨酸螯合锌 硫酸锌 绿头野鸭 生产性能
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蛋氨酸螯合锌对绿头野鸭免疫器官指数及血液指标的影响 被引量:1
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作者 孙淑霞 李玉杰 +1 位作者 闫峰 赵晶 《中国饲料》 北大核心 2008年第2期17-18,共2页
本试验研究蛋氨酸螯合锌对绿头野鸭免疫器官指数及血液指标的影响,探讨蛋氨酸螯合锌的最佳添加剂量。试验采用单因子完全随机试验设计,1日龄供试野鸭54只,分为3个处理组,每个处理3个重复,第Ⅰ组为对照组,添加150mg/kg硫酸锌;第Ⅱ、Ⅲ组... 本试验研究蛋氨酸螯合锌对绿头野鸭免疫器官指数及血液指标的影响,探讨蛋氨酸螯合锌的最佳添加剂量。试验采用单因子完全随机试验设计,1日龄供试野鸭54只,分为3个处理组,每个处理3个重复,第Ⅰ组为对照组,添加150mg/kg硫酸锌;第Ⅱ、Ⅲ组为试验组,分别添加75mg/kg硫酸锌+150mg/kg蛋氨酸螯合锌、300mg/kg蛋氨酸螯合锌。研究结果表明,各试验组的免疫器官指数均显著高于对照组(P<0.05);尿素氮水平显著降低(P<0.05),其他血液指标均无显著变化。 展开更多
关键词 蛋氨酸螯合锌 绿头野鸭 免疫器官指数 血液指标
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不同月龄绿头鸭血液生化参数比较 被引量:2
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作者 陈琼 黄兴东 《经济动物学报》 CAS 2004年第1期39-40,共2页
比较了 1~ 3月龄 (n =15 )和 4~ 6月龄 (n =15 )绿头鸭的 17项生化参数。结果表明 ,1~ 3月龄绿头鸭的血清中CK、TG、UA含量极显著 (P <0 .0 1)高于 4~ 6月龄绿头鸭血清中的含量 ;1~ 3月龄绿头鸭的血清LDL -C含量显著 (P <0 .... 比较了 1~ 3月龄 (n =15 )和 4~ 6月龄 (n =15 )绿头鸭的 17项生化参数。结果表明 ,1~ 3月龄绿头鸭的血清中CK、TG、UA含量极显著 (P <0 .0 1)高于 4~ 6月龄绿头鸭血清中的含量 ;1~ 3月龄绿头鸭的血清LDL -C含量显著 (P <0 .0 5 )高于 4~ 6月龄绿头鸭血清中的含量 ;其他指标 2组间差异不显著。该结果说明 。 展开更多
关键词 绿头鸭 血液 生化参数 月龄
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广州地区绿头鸭乙型肝炎病毒携带调查及其在抗HBV药物评价中的应用 被引量:1
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作者 张奉学 马霄行 +4 位作者 冯劲立 李向阳 周红燕 董伯振 朱宇同 《世界中医药》 CAS 2007年第4期244-246,共3页
目的:建立先天性感染鸭乙型肝炎动物模型,筛选有效的抗乙肝病毒药物。方法:应用斑点分子杂交法(Dot Blot)对广州地区绿头鸭的乙肝病毒(DHBV)的自然感染率进行调查,并对先天性感染和后天性感染的鸭子DHBV-DNA水平进行比较分析。采用该模... 目的:建立先天性感染鸭乙型肝炎动物模型,筛选有效的抗乙肝病毒药物。方法:应用斑点分子杂交法(Dot Blot)对广州地区绿头鸭的乙肝病毒(DHBV)的自然感染率进行调查,并对先天性感染和后天性感染的鸭子DHBV-DNA水平进行比较分析。采用该模型评价了拉米夫定等的抗病毒效果,并用其筛选了中药成分。结果:广州地区绿头鸭DHBV的自然感染率中最高的是A孵化场的野水鸭,为46.7%;先天性感染的绿头鸭DHBV-DNA水平明显较后天性感染的绿头鸭稳定、持久。核苷类药物在给药时均可不同程度抑制DHBV,但在停药后均出现反跳,与临床应用治疗慢性乙型肝炎结果相似。叶下珠醇提物等显示了一定的抗病毒效果。结论:先天感染的绿头鸭是目前比较理想的乙型肝炎的动物模型。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒绿头鸭/动物模型
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上海浦东东滩湿地斑嘴鸭和绿头鸭的越冬期空间行为与栖息地利用 被引量:4
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作者 叶思嘉 马硕 +11 位作者 周锋 韦旭 岳衢 黄美玲 吴迪 金惠宇 薄顺奇 袁晓 罗梓菁 顾建明 王天厚 王正寰 《复旦学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期451-461,共11页
本研究使用GPS卫星跟踪技术,以本地区最常见的斑嘴鸭(Anas poecilorhyncha)(5只)和绿头鸭(A.platyrhynchos)(4只)为研究对象,研究了冬季斑嘴鸭和绿头鸭在浦东的栖息地空间利用特征.利用固定核空间法(FKE)测得越冬季个体的平均活动范围为... 本研究使用GPS卫星跟踪技术,以本地区最常见的斑嘴鸭(Anas poecilorhyncha)(5只)和绿头鸭(A.platyrhynchos)(4只)为研究对象,研究了冬季斑嘴鸭和绿头鸭在浦东的栖息地空间利用特征.利用固定核空间法(FKE)测得越冬季个体的平均活动范围为(15.073±25.390)km2,没有明显的种间差异.两种鸭属鸟类的主要栖息地类型为滩涂、沟渠、农田和内陆水体,观测到的利用率分别为38.45%、32.46%、19.88%和8.85%,滩涂和沟渠是最主要的栖息地类型且昼、夜均利用.农田是研究区域主要的栖息地类型,是鸭属鸟类冬季重要的取食地,但只有部分个体使用,且多在夜间.所有监测个体均在夜间保持较高的活动强度,且活动高峰出现在清晨与黄昏.本研究比较系统地揭示了上海地区冬季斑嘴鸭和绿头鸭的栖息地利用和活动节律、活动范围等时空特征,为高度城市化地区的鸟类保护和管理提供了基础资料. 展开更多
关键词 斑嘴鸭 绿头鸭 浦东东滩湿地 越冬期 栖息地 行为
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绿头鸭TLR7基因序列分析及其在组织中的表达谱 被引量:1
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作者 李靖 翟博宇 +8 位作者 朱晓艺 杜嘉楠 吴晨薇 叶颖萱 文艺 李婧妍 牛鑫鑫 曾祥伟 梁冬莹 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期66-68,79,共4页
以绿头鸭(Anas platyrhynchos)为样本,采用巣式聚合酶链式反应(巣式PCR)方法克隆出Toll样受体7(TLR7)开放式阅读框架(ORF)的全长,对序列进行生物信息学分析,采集绿头鸭的心、肝、脾、肺、肾、肠6个部位试样进行荧光定量分析,探索绿头鸭T... 以绿头鸭(Anas platyrhynchos)为样本,采用巣式聚合酶链式反应(巣式PCR)方法克隆出Toll样受体7(TLR7)开放式阅读框架(ORF)的全长,对序列进行生物信息学分析,采集绿头鸭的心、肝、脾、肺、肾、肠6个部位试样进行荧光定量分析,探索绿头鸭TLR7基因的结构和它在不同器官的分布。结果表明:绿头鸭TLR7的ORF全长3144 bp,共编码1047个氨基酸。蛋白质结构预测工具(SMART)程序预测显示,TLR7具有典型的胞内功能区、跨膜区、胞外区。同源性分析表明,绿头鸭TLR7与鸟类同源性最高,与哺乳类、两栖类、鱼类形成明显分支,具有高度的种属特异性。荧光定量显示,TLR7在测试部位都有分布,在脾中最高,肝、肠次之,肺、心最低。 展开更多
关键词 绿头鸭 基因序列 基因表达谱
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鸡、鸭、鹅MC5R真核表达载体及突变型的构建及信号通路初探 被引量:1
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作者 闵天奇 贾琼 +8 位作者 韩蕊 苏语兮 嵇祝星 王泽源 刘敏 崔子鹤 张海洁 肖霞 王志强 《中国家禽》 北大核心 2019年第1期13-19,共7页
试验旨在构建鸡、鸭、鹅黑素皮质素受体5(Melanocortin Receptor-5,MC5R)及其突变体的真核表达载体,并比较野生型与突变体MC5R在人源胚胎肾细胞(HEK293T)中的表达及功能的差异。从三种家禽血液中分别提取全基因组DNA,以其为模板,用聚合... 试验旨在构建鸡、鸭、鹅黑素皮质素受体5(Melanocortin Receptor-5,MC5R)及其突变体的真核表达载体,并比较野生型与突变体MC5R在人源胚胎肾细胞(HEK293T)中的表达及功能的差异。从三种家禽血液中分别提取全基因组DNA,以其为模板,用聚合酶链式反应(PCR)扩增目的基因编码区。用同源重组方法将扩增的目的基因片段定向插入表达载体pcDNA3.1(+)中。单点突变构建pcDNA3.1(+)-MC5Rs突变型。用脂质体法将三种禽类野生型和突变型重组质粒pcDNA3.1(+)-MC5Rs分别瞬时转染入HEK293T细胞中,用双萤光素酶报告基因法检测胞内第二信使cAMP水平的变化来反应受体的表达和激活情况。结果表明:成功构建了鸡、鸭、鹅MC5R真核表达载体与各3个突变型(D119A、F254A和H257A)。在HEK293T细胞中表达时,与野生型相比,F254A的基础活性大幅升高,D119A与H257A的基础活性变化不大;D119A与H257A对激动剂α-MSH的反应活性完全丧失,F254A对于激动剂α-MSH的反应活性降低,为进一步研究体外鸡、鸭、鹅MC5R功能奠定基础。 展开更多
关键词 MC5R 真核表达 报告基因检测
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向海地区绿头鸭体内1膜壳属(Hymenolepis spp.)绦虫的分离鉴定 被引量:1
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作者 刘莹 李杰 +5 位作者 李秀云 王丽新 翟琪安 沈冬冬 彭智伟 侯志军 《野生动物学报》 北大核心 2019年第1期138-141,共4页
为了对绿头鸭肠道内分离的绦虫进行种属鉴定,本试验对向海地区的10只绿头鸭小肠内分离出的3条绦虫进行了形态学和分子生物学的鉴定。经形态学观察测量发现,该绦虫为小型绦虫,全长35 mm,头节呈球形,具有4个吸盘和1个短而圆、可自由伸缩... 为了对绿头鸭肠道内分离的绦虫进行种属鉴定,本试验对向海地区的10只绿头鸭小肠内分离出的3条绦虫进行了形态学和分子生物学的鉴定。经形态学观察测量发现,该绦虫为小型绦虫,全长35 mm,头节呈球形,具有4个吸盘和1个短而圆、可自由伸缩的顶突。顶突上有20~30个小钩,排成一圈。成节有3个圆球形的睾丸,横列在节片中部,储精囊较发达,符合膜壳属绦虫的形态学特征。扩增cox1基因序列并进行序列建树分析,结果支持该绦虫为膜壳属绦虫。综合该虫的形态学特征及分子生物学分析,确定该绦虫为膜壳属绦虫。 展开更多
关键词 膜壳属 绦虫 绿头鸭
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浙江省绿头鸭分布与迁徙规律 被引量:1
15
作者 刘志立 方陆明 宁学芳 《浙江林业科技》 北大核心 2016年第4期24-28,共5页
选取浙江省2009-2014年56个监测站的绿头鸭(Anas platyrhynchos)监测数据,对其数量分布和活动规律进行分析。结果表明,绿头鸭主要在临安、三门、亚林所监测站周边区域越冬,在不同监测站迁徙时间有所不同。在浙江省内越冬期为10月8日至翌... 选取浙江省2009-2014年56个监测站的绿头鸭(Anas platyrhynchos)监测数据,对其数量分布和活动规律进行分析。结果表明,绿头鸭主要在临安、三门、亚林所监测站周边区域越冬,在不同监测站迁徙时间有所不同。在浙江省内越冬期为10月8日至翌年6月23日。春季在浙江省从南到北迁徙时间为3月27日至5月22日,秋季从北向南迁徙时间为10月8日至11月18日。通过数据挖掘,建立了临安监测站绿头鸭数量变化预测模型。 展开更多
关键词 绿头鸭 迁徙规律 数据挖掘 时间序列建模
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绿头鸭mtDNA限制性内切酶酶切分析 被引量:2
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作者 郑文竹 陈奕欣 吴岚 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 1995年第4期614-618,共5页
采用碱变性法制备绿头鸭肝细胞mtDNA,经纯化后测其分子量为16.7kb.用限制性内切酶进行酶切分析,结果表明BamHⅠ、pstⅠ和HindⅢ在绿卖鸭ntDNA分子上分别有4个、2个和3个酶切位点。与由番鸭、北京鸭和... 采用碱变性法制备绿头鸭肝细胞mtDNA,经纯化后测其分子量为16.7kb.用限制性内切酶进行酶切分析,结果表明BamHⅠ、pstⅠ和HindⅢ在绿卖鸭ntDNA分子上分别有4个、2个和3个酶切位点。与由番鸭、北京鸭和建昌鸭肝细胞mtDNA为材料所得的研究结果比较,发现绿头鸭与番鸭及家鸭在mtDNA种质方面存在着高度差异。 展开更多
关键词 绿头鸭 MTDNA 限制性酶切分析
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升金湖越冬小白额雁与同域家鸭肠道菌群多样性研究 被引量:1
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作者 冯佳慧 龚治忠 +1 位作者 许娜 刘刚 《四川动物》 北大核心 2022年第5期490-499,共10页
鸟类是一些疾病的宿主及传播媒介,近年来,候鸟与家禽之间的疾病传播规律已成为研究热点。本研究采用16S rRNA高通量测序技术,对来自安徽省升金湖越冬小白额雁Anser erythropus与同域家鸭Anas platyrhynchos domesticus(各15份)的粪便样... 鸟类是一些疾病的宿主及传播媒介,近年来,候鸟与家禽之间的疾病传播规律已成为研究热点。本研究采用16S rRNA高通量测序技术,对来自安徽省升金湖越冬小白额雁Anser erythropus与同域家鸭Anas platyrhynchos domesticus(各15份)的粪便样品进行了分析,将有效序列基于97%相似度归类为5879个细菌分类操作单元,小白额雁4919个,家鸭4359个,共享3378个。Alpha多样性(除Chao1指数外)和Beta多样性分析结果表明,小白额雁和同域家鸭的肠道菌群群落组成无显著性差异,优势菌群均为厚壁菌门Firmicutes、拟杆菌门Bacteroidetes、变形菌门Proteobacteria和放线菌门Actinobacteria。PICRUSt分析发现,越冬小白额雁和同域家鸭的主要功能谱是代谢和遗传信息表达与传递。在小白额雁和同域家鸭的肠道中共检测到6种潜在病原体,在一定程度上影响宿主的健康,并具有传染给其他动物甚至人类的潜在风险。本研究初步揭示了升金湖越冬小白额雁和同域家鸭的肠道菌群的组成及结构特征,为潜在人禽共患病病原体的公共卫生风险防控提供了基础数据,具有重要的流行病学和公共卫生意义。 展开更多
关键词 小白额雁 家鸭 肠道菌群 多样性分析
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CRISPR-Cas9敲减鹅硬脂酰辅酶A去饱和酶基因的慢病毒质粒构建
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作者 袁鑫 李亮 +2 位作者 何桦 胡深强 王继文 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期529-538,共10页
为进一步探究鹅卵泡颗粒细胞内源性脂肪酸合成代谢机制,利用CRISPR-Cas9技术构建靶向鹅硬脂酰辅酶A去饱和酶(stearoyl-coenzyme A desaturase,SCD)基因的慢病毒敲减质粒并进行慢病毒包装。首先设计鹅SCD基因的单链指导RNA(single-guide ... 为进一步探究鹅卵泡颗粒细胞内源性脂肪酸合成代谢机制,利用CRISPR-Cas9技术构建靶向鹅硬脂酰辅酶A去饱和酶(stearoyl-coenzyme A desaturase,SCD)基因的慢病毒敲减质粒并进行慢病毒包装。首先设计鹅SCD基因的单链指导RNA(single-guide RNA,sgRNA)序列,其次体外合成并验证裂解效率,最后利用psPAX2和pMD2.G包装质粒制备psgRNA-mCherry-T2A-Puro和pLenti-Cas9-T2A-EGFP慢病毒质粒。结果表明,慢病毒质粒被成功构建,且其感染中国仓鼠卵巢(Chinese hamster ovary,CHO)细胞后筛选出能同时表达红色荧光蛋白和增强绿色荧光蛋白的强双阳性细胞群。这为后续感染鹅原代颗粒细胞并敲减其SCD基因研究奠定了基础。 展开更多
关键词 硬脂酰辅酶A去饱和酶基因 CRISPR-Cas9技术 基因定点突变
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绿头鸭基因组微卫星分布规律研究
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作者 黄杰 徐玉荣 +3 位作者 付红燕 李毅 杨波 杨承忠 《重庆师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2021年第5期37-42,共6页
【目的】研究绿头鸭(Anas platyrhynchos)的全基因组微卫星分布特征及规律。【方法】利用生物信息学方法对已报道的绿头鸭全基因组查询搜索并进行特征分析。【结果】在绿头鸭1 070 Mbp的基因组中,1~6个碱基重复的微卫星数量有476 957个... 【目的】研究绿头鸭(Anas platyrhynchos)的全基因组微卫星分布特征及规律。【方法】利用生物信息学方法对已报道的绿头鸭全基因组查询搜索并进行特征分析。【结果】在绿头鸭1 070 Mbp的基因组中,1~6个碱基重复的微卫星数量有476 957个,总长度为9 101 935bp,相对丰度为445.77个·Mb-1,占全基因长度的0.83%。不同重复类型的微卫星中单碱基的数量最多,有326 468个,长度为5 444 144bp,占基因组微卫星总数的68.45%;然后依次是四碱基、二碱基、三碱基、五碱基和六碱基,数量分别为66 753,30 262,29 712,20 248和3 514个,长度分别为1 504 868,501 244,527 310,920 915和203 454bp,分别占基因组微卫星总数的14%,6.34%,6.22%,4.25%和0.74%。绿头鸭基因组中,分布数量最多的14种拷贝类型按数量由多到少排列依次是A,AAAC,AAAT,AT,AAT,AC,AAC,AAAAC,C,AG,AAAAT,AAAG,AAGG和AGG,这些拷贝类型的数量均超过2 500个,合计占基因组微卫星总数的95.1%,有明显的A偏倚。【结论】研究结果为绿头鸭微卫星的筛选和开展进一步的分子生物学研究奠定了基础。 展开更多
关键词 绿头鸭 基因组 微卫星 特征分析
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