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题名固始鸭白细胞介素-18全基因克隆与分子进化分析
被引量:2
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作者
陈红英
李新生
崔保安
夏平安
赵丽
方丽云
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机构
河南农业大学牧医工程学院
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出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第9期676-680,共5页
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基金
国家"十五"食品安全重大攻关专项(2001BA804A30-11)
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文摘
根据GenBank发表的鸭IL-18cDNA基因序列设计、合成一对引物,应用RT-PCR技术,无需用非特异性免疫原如PHA等刺激脾淋巴细胞,直接提取脾淋巴细胞总RNA,扩增固始鸭IL-18基因,并克隆、测序。测序结果表明固始鸭IL-18基因全序列为610bp,包含1个完整阅读框,编码1条由200个氨基酸残基组成的多肽。序列分析发现,固始鸭IL-18基因与GenBank中两条鸭IL-18基因(AF336122和DQ490137)核苷酸同源性分别为98.8%、99.8%,与AF336122有5个碱基发生非同义变异,2个碱基为同义变异,氨基酸同源性为97.5%,与DQ490137有一个碱基发生非同义变异,氨基酸同源性为99.5%。固始鸭IL-18前体蛋白第30位谷氨酸处有一个IL-1β转换酶的caspase-1切割位点及在人和其他动物中已证实的IL-1标签序列,推测鸭IL-18成熟蛋白由170个氨基酸组成。固始鸭与人和其他动物的IL-18基因进化分析表明,IL-18基因存在着种的多样性,且亲缘关系越近,同源性越高。
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关键词
固始鸭
IL-18基因
克隆
分子进化分析
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Keywords
gushi duck
interleukin-18 gene
cloning
phylogenetic analysis
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分类号
Q781
[生物学—分子生物学]
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题名地方品种固始鸭γ-干扰素基因的克隆与分子进化分析
被引量:2
- 2
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作者
陈红英
崔保安
李新生
胡功政
赵丽
王东方
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机构
河南农业大学牧医工程学院
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出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2007年第3期1-4,共4页
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基金
国家"十五"食品安全重大攻关专项(2001BA804A30-11)
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文摘
根据GenBank发表的鸭γ-干扰素cDNA基因序列,自行设计、合成1对引物,应用RT-PCR技术,无需用非特异性免疫原如ConA、PHA等刺激分离的脾淋巴细胞,直接提取总RNA,扩增固始鸭γ-干扰素基因(DuIFN-γ),并进行克隆和测序。测序结果表明,获得了DuIFN-γ全序列,其大小为515 bp,包含一个完整阅读框,编码164个氨基酸残基,推导的氨基酸有3个潜在的N-糖基化位点,有5个与二硫键形成有关的半胱氨酸。序列比较分析发现,克隆的固始鸭IFN-γ基因序列与GenBank中4条鸭IFN-γ基因序列中的3条序列(AF087134,AF100929,AJ012254)完全一致,而与另一条北京鸭核苷酸同源性为99.6%,有2个碱基发生非同义变异,氨基酸同源性为98.8%。固始鸭与人和其他种动物的IFN-γ基因序列分析和系统进化分析表明,IFN-γ基因存在种属的差异性,亲缘关系越近,同源性越高。DuIFN-γ基因的成功克隆为进一步研究固始鸭IFN-γ基因表达、生物学活性和应用奠定基础。
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关键词
固始鸭
IFN-Γ基因
克隆
进化分析
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Keywords
gushi duck
IFN-γ gene
Cloning
Phylogenetic analysis
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分类号
Q78
[生物学—分子生物学]
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