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异养硝化菌Acinetobacter harbinensis HITLi 7T冷休克蛋白基因生物信息学分析与不同温度下的表达
被引量:
2
1
作者
马银鹏
李伟光
+2 位作者
孟利强
姜威
张淑梅
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第9期4003-4009,共7页
Acinetobacter harbinensis HITLi 7T是一株低温氨氮去除能力较强的异养硝化细菌,在其基因组信息中发现一个冷休克蛋白基因SE27RS01265,基因全长624 bp,编码207个氨基酸。系统发育分析发现,该蛋白与Acinetobacter属菌株的冷休克蛋白同...
Acinetobacter harbinensis HITLi 7T是一株低温氨氮去除能力较强的异养硝化细菌,在其基因组信息中发现一个冷休克蛋白基因SE27RS01265,基因全长624 bp,编码207个氨基酸。系统发育分析发现,该蛋白与Acinetobacter属菌株的冷休克蛋白同源性为64.73%~82.13%,与菌株A.kookii(GenBank No:WP092820441)同源性最高。预测该蛋白分子量为23.68 kD,没有信号肽,是非分泌型的不稳定碱性疏水蛋白;二级结构主要由Alpha螺旋、延伸链、Beta转角和无规则卷曲等四部分组成。荧光定量PCR研究发现,该基因在低温条件下高表达,在12.5℃相对表达量最高。本研究为解析冷休克蛋白在菌株HITLi 7T低温生长与氨氮去除中的作用提供理论基础。
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关键词
Acinetobacter
harbinensis
HITLi
7T
冷休克蛋白基因
生物信息学分析
荧光定量PCR
原文传递
题名
异养硝化菌Acinetobacter harbinensis HITLi 7T冷休克蛋白基因生物信息学分析与不同温度下的表达
被引量:
2
1
作者
马银鹏
李伟光
孟利强
姜威
张淑梅
机构
黑龙江省科学院微生物研究所
哈尔滨工业大学市政工程学院
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第9期4003-4009,共7页
基金
国家自然科学基金(51578178,51608149)资助
文摘
Acinetobacter harbinensis HITLi 7T是一株低温氨氮去除能力较强的异养硝化细菌,在其基因组信息中发现一个冷休克蛋白基因SE27RS01265,基因全长624 bp,编码207个氨基酸。系统发育分析发现,该蛋白与Acinetobacter属菌株的冷休克蛋白同源性为64.73%~82.13%,与菌株A.kookii(GenBank No:WP092820441)同源性最高。预测该蛋白分子量为23.68 kD,没有信号肽,是非分泌型的不稳定碱性疏水蛋白;二级结构主要由Alpha螺旋、延伸链、Beta转角和无规则卷曲等四部分组成。荧光定量PCR研究发现,该基因在低温条件下高表达,在12.5℃相对表达量最高。本研究为解析冷休克蛋白在菌株HITLi 7T低温生长与氨氮去除中的作用提供理论基础。
关键词
Acinetobacter
harbinensis
HITLi
7T
冷休克蛋白基因
生物信息学分析
荧光定量PCR
Keywords
Acinetobacter
harbinensis
HITLi 7~T
Cold shock protein gene
Bioinformatics analysis
Fluorescence quantitative PCR
分类号
Q811.4 [生物学—生物工程]
X52 [环境科学与工程—环境工程]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
异养硝化菌Acinetobacter harbinensis HITLi 7T冷休克蛋白基因生物信息学分析与不同温度下的表达
马银鹏
李伟光
孟利强
姜威
张淑梅
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020
2
原文传递
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参考文献
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