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Association between heat shock factor protein 4 methylation and colorectal cancer risk and potential molecular mechanisms:A bioinformatics study
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作者 Wen-Jing Zhang Ke-Lin Yue +1 位作者 Jing-Zhai Wang Yu Zhang 《World Journal of Gastrointestinal Oncology》 SCIE 2023年第12期2150-2168,共19页
BACKGROUND We previously demonstrated that heat shock factor protein 4(HSF4)facilitates colorectal cancer(CRC)progression.DNA methylation,a major modifier of gene expression and stability,is involved in CRC developmen... BACKGROUND We previously demonstrated that heat shock factor protein 4(HSF4)facilitates colorectal cancer(CRC)progression.DNA methylation,a major modifier of gene expression and stability,is involved in CRC development and outcome.AIM To investigate the correlation between HSF4 methylation and CRC risk,and to uncover the underlying molecular mechanisms.METHODS Differences in β values of HSF4 methylation loci in multiple malignancies and their correlation with HSF4 mRNA expression were analyzed based on Shiny Methylation Analysis Resource Tool.HSF4 methylation-related genes were identified by LinkedOmics in CRC,and Gene Ontology and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes enrichment analyses were performed.Protein-protein interaction network of HSF4 methylation-related genes was constructed by String database and MCODE algorithm.RESULTS A total of 19 CpG methylation loci were identified in HSF4,and their β values were significantly increased in CRC tissues and exhibited a positive correlation with HSF4 mRNA expression.Unfortunately,the prognostic and diagnostic performance of these CpG loci in CRC patients was mediocre.In CRC,there were 1694 HSF4 methylation-related genes;1468 of which displayed positive and 226 negative associations,and they were involved in regulating phenotypes such as immune,inflammatory,and metabolic reprogramming.EGFR,RELA,STAT3,FCGR3A,POLR2K,and AXIN1 are hub genes among the HSF4 methylation-related genes.CONCLUSION HSF4 is highly methylated in CRC,but there is no significant correlation between it and the prognosis and diagnosis of CRC.HSF4 methylation may serve as one of the ways in which HSF4 mediates the CRC process. 展开更多
关键词 Colorectal cancer DNA methylation PROGNOSIS Diagnosis BIOINFORMATICS heat shock factor protein 4
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Advance in Research on Biological Function and TranscriptionalControl of Heat Shock Proteins 被引量:1
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作者 徐存拴 辛泽华 袁金云 《Developmental and Reproductive Biology》 2002年第2期130-136,共7页
The regulation of heat shock transcription factor to heat shock protein expression and the newest knowledge about the effect of heat shock protein on aging,immune response and the balance of cell survival and apoptosi... The regulation of heat shock transcription factor to heat shock protein expression and the newest knowledge about the effect of heat shock protein on aging,immune response and the balance of cell survival and apoptosis are summarized in the paper. 展开更多
关键词 heat shock protein (HSP) heat shock transcription factor (hsf) aging immune response the balance of cell survival and apoptosis
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HSF4B通过上调RhoA和Rac1促进晶状体上皮细胞迁移 被引量:4
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作者 张军 马增翼 +2 位作者 李淑莲 刘广超 胡延忠 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期377-382,共6页
热休克转录因子4(heat shock transcription factor 4,HSF4)是调控新生儿期晶状体发育的关键转录因子.它参与调控晶状体上皮细胞增生和纤维细胞分化,然而其作用机理仍不清楚.利用鼠晶状体上皮细胞mLEC/HSF4-/-和mLEC/HA-HSF4b细胞为材料... 热休克转录因子4(heat shock transcription factor 4,HSF4)是调控新生儿期晶状体发育的关键转录因子.它参与调控晶状体上皮细胞增生和纤维细胞分化,然而其作用机理仍不清楚.利用鼠晶状体上皮细胞mLEC/HSF4-/-和mLEC/HA-HSF4b细胞为材料,对HSF4在晶状体上皮细胞中的调控作用进行研究.结果发现,重建的mLEC/HA-HSF4b细胞中,高表达热休克蛋白25(Hsp25)和αB晶体蛋白(αB-crystallin).细胞划痕实验和Transwell细胞迁移实验结果表明,mLEC/HSF4-/-细胞明显比mLEC/HA-HSF4b细胞的迁徙速度慢(t检验,P=0.0001).应用免疫印迹和半定量RT-PCR实验发现,HSF4b能上调RhoA,Rac1和CDC42的表达.但后者的表达不受Hsp25和αB-crystallin调控.由此推论,HSF4b通过调控RhoA,Rac1和CDC42的表达参与调控晶状体上皮细胞向后房的迁徙.这一新发现对解释HSF4b调控晶状体发育提供了有力的证据. 展开更多
关键词 热休克转录因子4 晶状体上皮细胞 RHOA RAC1 热休克蛋白25 αB-晶体蛋白
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转录因子HSF4的生物信息学分析 被引量:2
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作者 马汝海 钟连声 +4 位作者 王天骄 潘忠诚 赵雨杰 王绍成 何群 《生命科学研究》 CAS CSCD 2016年第6期475-479,共5页
热休克转录因子4(heat shock transcription factor 4,HSF4)是热休克转录因子HSF家族成员,近年发现HSF4除发挥调控热休克蛋白(heat shock protein,HSP)表达的功能外,亦直接或间接调节许多非热休克基因的表达,参与细胞生长发育及多... 热休克转录因子4(heat shock transcription factor 4,HSF4)是热休克转录因子HSF家族成员,近年发现HSF4除发挥调控热休克蛋白(heat shock protein,HSP)表达的功能外,亦直接或间接调节许多非热休克基因的表达,参与细胞生长发育及多种生理病理过程。现对9个物种的HSF4蛋白序列进行了多序列对比、进化痕迹分析和蛋白质特定功能区域分析,发现两个保守区域:一个是75-119保守区域,其部分位于文献报道的HSF家族的DNA结合区域,该区域呈现锤子状颈环结构,中部富含亲水氨基酸,提示该颈环结构有嵌入DNA结构内部解开其双链结构起转录调控的作用;另一保守区域在176-230,呈现卷曲螺旋(coil)结构,可能跟HSF4与DNA识别、结合、固定功能相关。对HSF4的生物信息学分析可以为其功能研究奠定理论基础。 展开更多
关键词 热休克转录因子4(hsf4) 生物信息学分析 保守区域 转录调控
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肝癌SMMC-7721细胞系HSF4调控的靶基因图谱分析 被引量:1
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作者 马汝海 王天骄 +2 位作者 潘忠诚 赵雨杰 何群 《生命科学研究》 CAS CSCD 2018年第3期201-207,共7页
热休克转录因子4(heat shock transcription factor 4,HSF4)是热休克转录因子HSF家族成员,近年发现HSF4除发挥调控热休克蛋白(heat shock protein,HSP)表达的功能外,亦直接或间接调节许多非热休克基因的表达,参与细胞生长发育多种生理... 热休克转录因子4(heat shock transcription factor 4,HSF4)是热休克转录因子HSF家族成员,近年发现HSF4除发挥调控热休克蛋白(heat shock protein,HSP)表达的功能外,亦直接或间接调节许多非热休克基因的表达,参与细胞生长发育多种生理病理过程。现通过染色质免疫共沉淀联合测序(chromatin immunoprecipitation sequencing,ChIP-Seq)方法对HSF4潜在的靶基因进行检测,并用GO(gene ontology)分析方法对这些靶基因进行分析,以探求HSF4发挥的生物学功能。ChIP-Seq结果显示:在肝癌SMMC-7721细胞系基因组DNA中共有1 726个HSF4结合区域,其中102个在启动子区。GO分析结果显示:这些潜在的靶基因分别参与细胞发育、增殖和对外部刺激应答的生物过程,具有与核酸和蛋白质结合及蛋白质激活的分子功能,参与药物和有害异物代谢以及化学致癌的信号传导通路。此外,MEME4.12.0软件推测出在SMMC-7721细胞系中HSF4与DNA启动子区结合的6种模式。分析HSF4在肝癌SMMC-7721细胞系中可能调控的靶基因图谱为进一步研究HSF4在肝癌发生机制中的作用提供了有效的实验数据和理论基础。 展开更多
关键词 热休克转录因子4(hsf4) 肝肿瘤 染色质免疫共沉淀联合测序(ChIP-Seq) 靶基因 GO分析
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Bioinformatics analysis of microarray data to explore the key genes involved in HSF4 mutation-induced cataract 被引量:4
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作者 Rui Tian Yang Xu +1 位作者 Wen-Wen Dou Hui Zhang 《International Journal of Ophthalmology(English edition)》 SCIE CAS 2018年第6期910-917,共8页
AIM: To reveal the mechanisms of heat-shock transcription factor 4 (HSF4) mutation-induced cataract.METHODS: GSE22362, including 3 HSF4-null lens and 3 wild-type lens, was obtained from Gene Expression Omnibus dat... AIM: To reveal the mechanisms of heat-shock transcription factor 4 (HSF4) mutation-induced cataract.METHODS: GSE22362, including 3 HSF4-null lens and 3 wild-type lens, was obtained from Gene Expression Omnibus database. After data preprocessing, the differentially expressed genes (DEGs) were identified using the limma package. Based on Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery (DAVID) tool, functional and pathway enrichment analyses were performed for the DEGs. Followed by protein-protein interaction (PPI) network was constructed using STRING database and Cytoscape software. Furthermore, the validated microRNA (miRNA)-DEG pairs were obtained from miRWalk2.0 database, and then miRNA-DEG regulatory network was visualized by Cytoscape software. RESULTS: A total of 176 DEGs were identified in HSF4-null lens compared with wild-type lens. In the PPI network, FBJ osteosarcoma oncogene (FOS), early growth response 1 (EGR1) and heme oxygenase (decycling) 1 (HMOX1) had higher degrees and could interact with each other. Besides, mmu-miR-15a-5p and mmu-miR-26a-5p were among the top 10 miRNAs in the miRNA-DEG regulatory network. Additionally, mmu-miR-26a-5p could target EGR1 in the regulatory network. CONCLUSION: FOS, EGR1, HMOX1, mmu-miR-26a-5p and mmu-miR-15a-5p might function in the pathogenesis of HSF4 mutation-induced cataract. 展开更多
关键词 CATARACT heat-shock transcription factor 4 differentially expressed genes protein-protein interaction network regulatory network
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4NQO诱导大鼠舌黏膜癌变过程中HSF1的表达及意义
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作者 李传祝 王飞 +1 位作者 王琼 刘来奎 《口腔生物医学》 2016年第3期129-133,共5页
目的:探讨热休克因子1(HSF1)在4-硝基喹啉-1-氧化物(4NQO)饮水法诱导大鼠舌黏膜癌变过程中的表达及意义。方法:80只Wistar大鼠随机分两组,实验组用0.001%-0.004%4NQO递增性喂养大鼠8-28周,对照组则用普通自来水喂养,分别于8、16... 目的:探讨热休克因子1(HSF1)在4-硝基喹啉-1-氧化物(4NQO)饮水法诱导大鼠舌黏膜癌变过程中的表达及意义。方法:80只Wistar大鼠随机分两组,实验组用0.001%-0.004%4NQO递增性喂养大鼠8-28周,对照组则用普通自来水喂养,分别于8、16、20、24、28周处死大鼠,通过大体标本、HE染色观察大鼠舌部组织学改变,同时采用免疫组化染色方法观察HSF1在大鼠舌癌变全过程的表达情况。结果:随4NQO作用时间延长和浓度递增,大鼠舌背后部黏膜相继出现颗粒状、白色斑块、疣状突起、菜花状新生物和溃疡状改变。诱导后8、16、20、24、28周,舌癌的发生率分别为0、20.0%、50.0%、66.7%、100%。HSF1在对照组大鼠舌背黏膜上皮中不表达或者微弱表达,而在实验组大鼠随着舌黏膜异常增生程度的增加,HSF1表达明显增强;在原位癌中,HSF1弥漫分布于整个癌巢中;在舌黏膜浸润癌中HSF1在癌上皮中表达有所降低,而在癌基质成纤维细胞中HSF1表达增强。结论:4NQO饮水法可诱导大鼠舌黏膜发生癌变,成功建立大鼠舌癌模型,同时HSF1在大鼠舌癌发生、发展过程中发挥重要作用。 展开更多
关键词 4-硝基喹啉-1-氧化物 舌癌 热休克因子1 大鼠
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特应性皮炎患者皮损中热休克蛋白60、Toll样受体4和核因子-kB p65的表达 被引量:4
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作者 高英 郭在培 《临床皮肤科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期205-207,共3页
目的:研究热休克蛋白60(HSP60)、Toll样受体4(TLR4)、核因子-κB p65(NF-κB p65)在特应性皮炎(AD)患者皮损中的表达水平及其与疾病发生的关系。方法:采用SP免疫组化法检测17例AD患者急性或亚急性期炎性皮损及12份正常皮肤石蜡标本中HS... 目的:研究热休克蛋白60(HSP60)、Toll样受体4(TLR4)、核因子-κB p65(NF-κB p65)在特应性皮炎(AD)患者皮损中的表达水平及其与疾病发生的关系。方法:采用SP免疫组化法检测17例AD患者急性或亚急性期炎性皮损及12份正常皮肤石蜡标本中HSP60、TLR4、NF-κB p65的表达。结果:HSP60、TLR4、NF-κB p65在重度患者皮损角质形成细胞中均过度表达,与正常对照及中度组比较,差异有统计学意义(P<0.05);HSP60及NF-κB p65在中度患者组中的表达明显高于正常对照,差异具有统计学意义(P<0.05):HSP60、TLR4、NF-κB p65在AD皮损中的表达水平与湿疹面积及严重度指数(EASI)评分间存在正相关(P<0.05)。结论:HSP60、TLR4、NF-κB p65在AD患者皮损中存在过度表达。HSP60的表达上调可能与AD发病有关。 展开更多
关键词 皮炎 特应性 TOLL样受体4 热休克蛋白60 核因子-KB P65
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Kruppel样因子4过表达对C_2C_(12)肌原细胞中热休克蛋白25表达的影响 被引量:1
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作者 王婧 刘瑛 +4 位作者 易宇欣 张华莉 刘梅冬 肖献忠 邓恭华 《中国动脉硬化杂志》 CAS CSCD 2006年第10期841-844,共4页
目的观察Kruppel样因子4过表达对热休克蛋白25表达的影响。方法运用稳定转染pcDNA3.1/myc-His(-)和Kruppel样因子4-pcDNA3.1/myc-His(-)两种细胞株,采用逆转录聚合酶链反应观察Kruppel样因子4在生理状态和热休克反应时对热休克蛋白25 m... 目的观察Kruppel样因子4过表达对热休克蛋白25表达的影响。方法运用稳定转染pcDNA3.1/myc-His(-)和Kruppel样因子4-pcDNA3.1/myc-His(-)两种细胞株,采用逆转录聚合酶链反应观察Kruppel样因子4在生理状态和热休克反应时对热休克蛋白25 mRNA表达的影响;采用Western blot观察Kruppel样因子4在生理状态和热休克反应时对热休克蛋白25蛋白表达的影响。结果在正常状态下,两种细胞热休克蛋白25 mRNA及蛋白表达水平均较低。生理状态下,热休克恢复1 h及3 h Kruppel样因子4过表达细胞株热休克蛋白25 mRNA表达水平明显高于转空载体细胞;至热休克恢复6 h后两组细胞热休克蛋白25 mRNA表达无明显差异。在生理状态及热休克恢复不同时间后,Kruppel样因子4过表达细胞热休克蛋白25蛋白表达水平均较空载体组明显增加。结论在生理状态下和热休克反应中,Kruppel样因子4过表达均能够促进C2C12肌原细胞中热休克蛋白25高表达。 展开更多
关键词 病理学与病理生理学 Kruppel样因子4 热休克蛋白25 稳定转染 C2C12肌原细胞 过表达 空载体
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雷公藤甲素对感染性休克大鼠脑组织的保护及对TLR4/Myd88信号通路的调控 被引量:1
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作者 徐梅 汪砚雨 +2 位作者 李晓玲 林新 王勉 《浙江中医药大学学报》 CAS 2021年第7期732-738,743,共8页
[目的]研究雷公藤甲素(triptolide,TL)对感染性休克(septic shock,SS)大鼠脑组织的保护作用,并探讨相关机制。[方法]从80只无特定病原体(specific pathogen free,SPF)级SD大鼠中随机抽取15只,仅剖腹不结扎盲肠及穿孔,设为正常组;其余65... [目的]研究雷公藤甲素(triptolide,TL)对感染性休克(septic shock,SS)大鼠脑组织的保护作用,并探讨相关机制。[方法]从80只无特定病原体(specific pathogen free,SPF)级SD大鼠中随机抽取15只,仅剖腹不结扎盲肠及穿孔,设为正常组;其余65只随机分为SS组,TL低、高剂量组和阳性药物组,以盲肠结扎穿孔法建立SS模型。TL低、高剂量组建模前1h分别以TL 200、400μg·kg-1灌胃;阳性药物组以地塞米松10mg·kg-1灌胃;正常组与SS组予等量0.9%氯化钠溶液灌胃。建模后12h检测脑组织含水量;检测脑组织超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)活性和丙二醛(malondialdehyde,MDA)、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)、白介素-1β(interleukin-1β,IL-1β)含量;苏木精-伊红(hematoxylineosin,HE)染色观察海马CA1区病理学形态变化,Nissl染色观察海马CA1区神经元形态、数量;Western blot检测脑组织Toll样受体4(Toll like receptor 4,TLR4)、髓样分化因子88(myeloid differentiation factor 88,MyD88)、核转录因子-κB(nuclear transcription factor-κB,NF-κB)、磷酸化核转录因子-κB(phospho-nuclear transcription factor-κB,p-NF-κB)蛋白相对表达量。[结果]与正常组比较,SS组脑组织含水量、MDA、TNF-α、IL-1β含量增加,脑组织SOD活性减低,TLR4、MyD88蛋白相对表达量及p-NF-κB p65/NF-κB p65均升高(P<0.05);与SS组比较,TL低、高剂量组,阳性药物组脑组织含水量、MDA、TNF-α、IL-1β含量减少,脑组织SOD活性增加,TLR4、MyD88蛋白相对表达量及p-NF-κB p65/NF-κB p65均降低(P<0.05);与TL低剂量组比较,TL高剂量组、阳性药物组脑组织含水量、MDA、TNF-α、IL-1β含量减少,脑组织SOD活性增加,TLR4、MyD88蛋白相对表达量及p-NF-κB p65/NF-κB p65降低(P<0.05)。HE染色显示,SS组细胞体积缩小、数量减少、排列紊乱,多数发生空泡样改变及死亡;TL低、高剂量组及阳性药物组多数细胞边界清晰,排列较整齐,少数萎缩、深染、空泡变性。Nissl染色显示,SS组细胞排列稀疏,边缘模糊,染色浅,神经元数目减少,胞质中尼氏体数量明显减少;TL低、高剂量组,阳性药物组神经元数量增加,染色较清晰,胞质中尼氏体数量增加。[结论]TL可减轻SS大鼠脑组织水肿,减轻氧化应激及炎症反应,改善脑组织病理变化,保护神经元,其作用机制可能与抑制TLR4/MyD88信号通路相关蛋白表达有关。 展开更多
关键词 雷公藤甲素 感染性休克 氧化应激 炎症反应 病理变化 TOLL样受体4 髓样分化因子88 核转录因子-ΚB
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特应性皮炎患者外周血中HSP60、TLR4、NF-κBp65的表达
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作者 高英 郭在培 《四川大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期655-657,共3页
目的研究热休克蛋白60(HSP60)、Toll样受体4(TLR4)、核因子κBp65(NF-κBp65)在特应性皮炎(AD)患者外周血中的表达水平及其与疾病发病的关系。方法分别应用逆转录PCR法、免疫细胞化学法及酶联免疫吸附试验法检测17例AD患者外周血单个核... 目的研究热休克蛋白60(HSP60)、Toll样受体4(TLR4)、核因子κBp65(NF-κBp65)在特应性皮炎(AD)患者外周血中的表达水平及其与疾病发病的关系。方法分别应用逆转录PCR法、免疫细胞化学法及酶联免疫吸附试验法检测17例AD患者外周血单个核细胞中TLR4 mRNA、NF-κBp65及血清中HSP60的水平,15例正常人作对照。结果与正常人对照组相比,TLR4 mRNA、HSP60及NF-κBp65在AD患者外周血中过度表达,差异有统计学意义(P<0.05)。结论HSP60、TLR4、NF-κBp65在AD患者外周血中的表达水平均升高,其表达上调可能与AD发病有关。 展开更多
关键词 特应性皮炎 Toll样受体4 热休克蛋白60 NF-ΚBP65
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退行性心脏瓣膜病患者血清中MHC、IRF-4、HSP70、HSP22mRNA表达的变化及意义 被引量:2
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作者 于智勇 陈月云 《实用老年医学》 CAS 2011年第4期288-291,共4页
目的研究肌球蛋白重链(MHC)、干扰素调节因子-4(IRF-4)、热休克蛋白70(HSP70)、热休克蛋白22(HSP22)mRNA在老年退行性心脏瓣膜病(SDHVD)患者血清中的表达,探讨SDHVD的可能发病机制。方法根据彩色多普勒检查结果将所有入选者分为单纯主... 目的研究肌球蛋白重链(MHC)、干扰素调节因子-4(IRF-4)、热休克蛋白70(HSP70)、热休克蛋白22(HSP22)mRNA在老年退行性心脏瓣膜病(SDHVD)患者血清中的表达,探讨SDHVD的可能发病机制。方法根据彩色多普勒检查结果将所有入选者分为单纯主动脉瓣钙化组(AVC组,n=25)、单纯二尖瓣钙化组(MVC组,n=19)、主动脉瓣钙化合并二尖瓣钙化组(AVC+MVC组,n=21),24例心脏瓣膜无钙化的老年患者设为对照组(NVC)。应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测入选者血清MHC、IRF-4、HSP70、HSP22mRNA的表达。结果 SDHVD组与对照组相比MHC和IRF-4mRNA表达量明显降低(P<0·01),HSP70和HSP22mRNA表达量则明显增高(P<0·01),不同瓣膜钙化损伤间无明显差异(P>0·05)。SDHVD患者血清MHCmRNA、IRF-4mR-NA表达与LVEF呈正相关(r分别为0·394、0·427,P<0·05),HSP70mRNA、HSP22mRNA表达量与LVEF呈负相关(r分别为-0·409、-0·422,P<0·05)。结论 SDHVD患者血清MHC、IRF-4、HSP70、HSP22mRNA表达及心功能较心脏瓣膜无钙化者有明显变化,提示免疫炎性损伤参与SDHVD的发生发展。 展开更多
关键词 老年人 退行性心脏瓣膜病 肌球蛋白重链 干扰素调节因子-4 热休克蛋白70 热休克蛋白22
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热休克转录因子2通过HMGB1-TLR4-NF-κB信号促进克罗恩病炎症反应的作用机制研究 被引量:8
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作者 阮水良 官俏兵 《中国临床药理学与治疗学》 CAS CSCD 2019年第4期369-375,共7页
目的:研究热休克转录因子2(HSF2)通过HMGB1-TLR4-NF-κB信号促进小鼠克罗恩病炎症反应的作用机制。方法:2,4,6-三硝基苯磺酸(TNBS)构建小鼠克罗恩病模型,将小鼠分为正常组,模型组,对照组,实验组。对照组采用高迁移率族蛋白1(HMGB1)抗体... 目的:研究热休克转录因子2(HSF2)通过HMGB1-TLR4-NF-κB信号促进小鼠克罗恩病炎症反应的作用机制。方法:2,4,6-三硝基苯磺酸(TNBS)构建小鼠克罗恩病模型,将小鼠分为正常组,模型组,对照组,实验组。对照组采用高迁移率族蛋白1(HMGB1)抗体处理阻断HMGB1信号,对照组和实验组均采用重组HSF2干预。观察小鼠一般生活状况(包括:生存状态、体质量状态、大便性状、进食饮水状态、毛发光泽度、精神状态和活动状态),小鼠疾病活动指数(DAI)评估小鼠疾病情况,苏木精-伊红(HE)染色检测小鼠肠组织病理改变,免疫组织化学染色(IHC)检测小鼠肠组织中p-65的表达,酶联免疫吸附法(ELISA)检测小鼠结肠组织中炎症因子白细胞介素1β(IL-1β)、肿瘤坏死因子α(TNF-α)、白细胞介素6(IL-6)的水平,蛋白免疫印迹法(Western blot)检测结肠组织中HMGB1、Toll样受体4(TLR4)、NF-κB(p-P65)、髓样分化因子(MyD88)的表达水平。结果:TNBS成功诱导小鼠克罗恩病,实验组小鼠一般生活状态较差,且DAI评分显著高于对照组、模型组,具有统计学意义(P<0.05)。HE染色显示实验组小鼠结肠黏膜糜烂、水肿、炎症反应程度高于模型组和对照组。实验组小鼠结肠组织中炎症因子IL-1β、TNF-α、IL-6的水平显著高于模型组和对照组,差异具有统计学意义(P<0.05)。实验组组织中HMGB1、TLR4、NF-κB(p-P65)、MyD88的表达水平显著高于模型组和对照组,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论:HSF2可以通过激活HMGB1-TLR4-NF-κB信号促进小鼠克罗恩病炎症反应。 展开更多
关键词 热休克转录因子2 克罗恩病 炎症反应 高迁移率族蛋白1 TOLL样受体4 NF-ΚB
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芥菜全基因组中Hsf基因家族鉴定与分析 被引量:3
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作者 杨巍 唐兵 +8 位作者 谭国飞 付文苑 王青青 曾庆鸿 王洪亮 马建云 张睿 施绍斌 邓英 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2023年第2期295-306,共12页
【目的】通过鉴定与分析芥菜基因组中Hsf转录因子家族成员,为芥菜Hsf基因功能研究与遗传改良提高抗逆性提供理论依据。【方法】利用生物信息学方法分析芥菜Hsf热激转录因子家族成员的功能结构、保守基序、启动子顺式作用元件、系统进化... 【目的】通过鉴定与分析芥菜基因组中Hsf转录因子家族成员,为芥菜Hsf基因功能研究与遗传改良提高抗逆性提供理论依据。【方法】利用生物信息学方法分析芥菜Hsf热激转录因子家族成员的功能结构、保守基序、启动子顺式作用元件、系统进化、共线性及采用RNA-seq验证Hsf低温胁迫的基因表达。【结果】芥菜基因组中鉴定出71个Hsf基因家族成员,分布于18条染色体上,归类为3个亚家族,蛋白均含有DBD和HR-A/B结构域。BjuHsf启动子区域包含与逆境胁迫、激素、生长发育等相关顺式作用元件。系统进化与共线性分析表明,芥菜Hsf家族成员与大白菜Hsf家族成员具有更近的亲缘关系。在低温胁迫下,BjuHsf基因表达分析表明8个BjuHsf基因显著上调表达。【结论】这些显著差异表达BjuHsf基因与芥菜抗寒性极其相关,可作为芥菜耐寒性遗传改良的候选基因。 展开更多
关键词 芥菜 热激转录因子 生物信息学 表达分析
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基于TLR4/NF-κB信号通路橄榄苦苷对心源性休克大鼠心功能及心肌细胞损伤的作用
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作者 陈建斌 刘国庆 +1 位作者 欧阳建 车晓汝 《广东医学》 CAS 2022年第8期954-960,共7页
目的探讨橄榄苦苷(OL)对心源性休克(CS)大鼠心功能和心肌细胞损伤的影响及其可能作用机制。方法大鼠随机分为假手术组(生理盐水)、模型组(结扎左冠状动脉前降支近心端,生理盐水)、OL组[400 mg/(kg·d)]及左西孟旦组[1 mg/(kg·d... 目的探讨橄榄苦苷(OL)对心源性休克(CS)大鼠心功能和心肌细胞损伤的影响及其可能作用机制。方法大鼠随机分为假手术组(生理盐水)、模型组(结扎左冠状动脉前降支近心端,生理盐水)、OL组[400 mg/(kg·d)]及左西孟旦组[1 mg/(kg·d)],每组各15只,连续给药7 d。检测心功能参数;HE染色观察心肌组织形态;TTC染色观察心肌梗死情况;TUNEL染色检测心肌细胞凋亡指数;ELISA法检测血清肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞介素6(IL-6)、肌钙蛋白T(TnT)水平及肌酸激酶MB(CK-MB)活性;Western blot法检测Toll样受体4(TLR4)、髓样分化因子(MyD88)、核转录因子-κB(NF-κBp65)、磷酸化NF-κBp65(p-NF-κBp65)蛋白相对表达情况。结果与假手术组比较,模型组大鼠左心室收缩压(LVSP)、左心室压最大增率(+dp/dt max)及左心室压最大减率(-dp/dt max)降低,左心室舒张末期压(LVEDP)、血清TNF-α、IL-6、TnT水平及CK-MB活性升高(P<0.05),心肌组织大范围梗死,心肌细胞结构不完整,排列无序,组织见间质水肿,炎性细胞浸润,心肌细胞凋亡严重,心肌组织中TRL4、MyD88、p-NF-κBp65蛋白相对表达水平升高(P<0.05);与模型组比较,OL组及左西孟旦组大鼠LVSP、+dp/dt max及-dp/dt max升高,LVEDP、血清TNF-α、IL-6、TnT水平、CK-MB活性、心肌梗死面积比、心肌细胞凋亡指数降低(P<0.05),心肌结构形态逐渐变得完整,细胞排列逐渐规则,炎性细胞浸润逐渐减轻,心肌组织中TRL4、MyD88、p-NF-κBp65蛋白相对表达水平降低(P<0.05)。结论OL可改善CS大鼠心功能障碍及心肌细胞损伤,其作用机制可能与抑制TLR4/NF-κB信号通路激活,减轻炎性反应有关。 展开更多
关键词 橄榄苦苷 心源性休克 心功能 心肌细胞损伤 Toll样受体4 核转录因子-ΚB
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桑树热激转录因子(Hsf)基因家族克隆及MnHsfA1基因表达模式分析
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作者 刘丹 邱长玉 +7 位作者 韦伟 陆晓媚 黄胜 曾燕蓉 朱光书 张朝华 何骥 林强 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期2320-2329,共10页
【目的】克隆桑树热激转录因子(Hsf)基因家族成员,并分析MnHsfA1基因表达模式,为深入研究该家族在桑树热应激响应中的调控机制及桑树育种提供理论参考。【方法】以川桑幼苗为试验材料,克隆其MnHsfs基因,通过多序列比对、构建系统发育进... 【目的】克隆桑树热激转录因子(Hsf)基因家族成员,并分析MnHsfA1基因表达模式,为深入研究该家族在桑树热应激响应中的调控机制及桑树育种提供理论参考。【方法】以川桑幼苗为试验材料,克隆其MnHsfs基因,通过多序列比对、构建系统发育进化树和MEME保守基序在线预测分析,对MnHsfs蛋白的理化性质、保守结构域、信号肽、跨膜结构域、亚细胞定位和启动子顺式作用元件进行预测,利用实时荧光定量PCR检测MnHsfA1基因在高温和干旱胁迫处理下的表达模式。【结果】从桑树中克隆到14个MnHsfs基因的全长编码区(CDS)序列,分别为MnHsfA4a、MnHsfA4b、MnHsfA2、MnHsfA5、MnHsfA6b-1、MnHsfA6b-2、MnHsfB4-2、MnHsfA8、MnHsfB3、MnHsfB2b、MnHsfC1、MnHsfB2a、MnHsfB4-1和MnHsfA1,长度分别为1239、1278、1404、1431、1101、1140、1185、1197、711、996、1029、936、900和1437 bp,分别编码412、425、467、476、366、379、394、398、236、331、342、312、299和478个氨基酸残基,大部分MnHsfs蛋白是一个亲水、不稳定的酸性蛋白。MnHsfs蛋白包括结合功能域(DBD)、寡聚化功能域(OD)、AHA和KLFGV等结构域,可分为A、B和C类。MnHsfA1与苹果、菠菜和拟南芥的HsfA1相似性最高;与对照相比,MnHsfA1基因相对表达量在高温和干旱胁迫处理下均显著上调(P<0.05)。【结论】MnHsfs基因具有较高的遗传保守性,高温和干旱胁迫诱导MnHsfA1基因高表达,且MnHsfA1基因的启动子顺式作用元件中含有脱落酸、茉莉酸甲酯、赤霉素等激素响应元件以及与各种非生物胁迫相关的转录因子,推测其同时调节多种非生物胁迫。 展开更多
关键词 桑树 热激转录因子(hsf) 系统发育进化树 胁迫 顺式作用元件
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GmHSFA1基因克隆及其过量表达提高转基因大豆的耐热性 被引量:22
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作者 陈晓军 叶春江 +6 位作者 吕慧颖 徐民新 李葳 张利明 王超 罗淑萍 朱保葛 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第11期1411-1420,共10页
热激转录因子在调节植物对逆境胁迫应答和热激蛋白基因表达方面起重要作用。采用生物信息学和比较基因组学方法结合RACE技术从大豆基因组中克隆到一个新的热激转录因子基因GmHsfA1,其cDNA全长1 781 bp,包含1个1 533 bp的开放阅读框,编... 热激转录因子在调节植物对逆境胁迫应答和热激蛋白基因表达方面起重要作用。采用生物信息学和比较基因组学方法结合RACE技术从大豆基因组中克隆到一个新的热激转录因子基因GmHsfA1,其cDNA全长1 781 bp,包含1个1 533 bp的开放阅读框,编码含有510个氨基酸残基的蛋白质(GenBank登录号为AY458843)。与其他转录因子的分子结构相似,GmHSFA1也含有4个典型的结构功能域-DNA结合域、寡聚域、核定位信号和C端激活域。BLAST分析表明,GmHSFA1与其同源性最高的番茄热激转录因子LpHSFA1之间的氨基酸序列相似性为52.46%。RT-PCR、Northern和遗传转化结果显示:1)GmHsfA1在大豆的不同组织中呈现组成型表达模式;2)常温下转基因大豆植株的GmHsfA1表达水平明显高于非转基因对照;3)GmHsfA1的过量表达激活了转基因大豆植株中热激蛋白基因GmHsp22在非诱导条件下的转录,并加强了高温胁迫下另2个热激蛋白基因GmHsp23和GmHsp70的表达;4)转GmHsfA1大豆植株的耐热温度(达52℃)明显高于非转基因植株。上述结果说明,GmHsfA1的过量表达激活或促进其下游3个热激蛋白基因的转录或表达,明显提高了转基因大豆植株的耐热能力。 展开更多
关键词 大豆 热激转录因子A1(hsfA1) 转基因 热胁迫 过量表达 耐热性
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苹果Hsf家族成员的序列特征、表达与进化分析 被引量:3
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作者 张国俊 王婷婷 +2 位作者 胡利宗 李书粉 高武军 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2017年第2期71-80,共10页
为全面了解苹果基因组中热激转录因子(Hsf)的序列特征及进化,采用生物信息学手段,在苹果全基因组水平上鉴定出50个MdHsf基因,并对其系统发育关系、序列特征、表达情况以及选择压力进行详细分析。系统发育与序列分析显示:与拟南芥和水稻... 为全面了解苹果基因组中热激转录因子(Hsf)的序列特征及进化,采用生物信息学手段,在苹果全基因组水平上鉴定出50个MdHsf基因,并对其系统发育关系、序列特征、表达情况以及选择压力进行详细分析。系统发育与序列分析显示:与拟南芥和水稻相似,50个MdHsf基因可分为A、B、C 3个亚族;2个或多个MdHsf基因位于同一个末端进化支,说明该基因家族在苹果中发生了物种特异性扩增;尽管MdHsf基因的内含子数目和长度变异较大,但其蛋白的保守基序和功能结构域具有较高的保守性,这可能与功能约束有关。基于EST数目,可推知:除了MdHsfA2a和MdHsfA3a/b/c等14个基因没有相应的EST外,其余72%的基因都有转录活性。选择压力检测和结构建模分析显示:在36个MdHsf蛋白的选择压力检测中,位点模型未鉴定到正选择位点的存在;而在显著水平下(P<0.05),分支-位点模型在d和e进化分支上,共检测到5个正选择位点,它们是28R、30L、35D、51M、67V,其中28R和30L位于Hsf结构域中,35D、51M和67V位于Hsf结构域之外,这说明除了MdHsfA4d/e和MdHsf C1a/b发生快速进化外,其他成员受控于纯净选择,具有高度保守性。综合以上研究结果,苹果基因组中存在多种热激转录因子,其蛋白的保守基序和功能结构域具有较高保守性,大多具有转录活性,在进化上该家族受纯净选择主导。 展开更多
关键词 苹果 热激转录因子 表达 进化
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橘红胶囊联合阿奇霉素治疗肺炎支原体肺炎患儿痰热闭肺证临床研究
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作者 陈书挪 毛少艳 《新中医》 CAS 2024年第17期88-92,共5页
目的:观察橘红胶囊联合阿奇霉素治疗肺炎支原体肺炎(MPP)患儿痰热闭肺证的疗效以及对血清Toll样受体4(TLR4)、髓样分化因子88(MyD88)、核转录因子κB(NF-κB)水平的影响。方法:选取MPP患儿82例,按随机数字表法分为对照组和观察组各41例... 目的:观察橘红胶囊联合阿奇霉素治疗肺炎支原体肺炎(MPP)患儿痰热闭肺证的疗效以及对血清Toll样受体4(TLR4)、髓样分化因子88(MyD88)、核转录因子κB(NF-κB)水平的影响。方法:选取MPP患儿82例,按随机数字表法分为对照组和观察组各41例。对照组予阿奇霉素序贯方案治疗,观察组在对照组基础上予橘红胶囊治疗,连续治疗2周。比较2组临床疗效、症状体征消失时间、痰热闭肺证各项评分、血清T细胞亚群以及血清TLR4、MyD88、NF-κB水平。结果:2周疗程后,观察组总有效率为97.56%,高于对照组80.49%(P<0.05)。观察组退热、肺湿啰音消除、咳嗽消除时间均短于对照组(P<0.05)。治疗后,2组痰热闭肺证各项评分较治疗前降低(P<0.05),且观察组痰热闭肺证各项评分低于对照组(P<0.05)。治疗后,2组CD4^(+)、CD4^(+)/CD8^(+)较治疗前升高,CD3^(+)、CD8^(+)较治疗前下降(P<0.05);且观察组CD3^(+)、CD4^(+)、CD4^(+)/CD8^(+)高于对照组,CD8^(+)低于对照组(P<0.05)。治疗后,2组血清TLR4、MyD88、NF-κB水平较治疗前降低(P<0.05),且观察组血清TLR4、MyD88、NF-κB水平低于对照组(P<0.05)。结论:橘红胶囊联合阿奇霉素治疗MPP患儿痰热闭肺证的疗效明显,能促进患儿症状体征与中医证候的好转,提高患儿免疫功能,并有效抑制TLR4/MyD88/NF-κB炎症通路。 展开更多
关键词 肺炎支原体肺炎 痰热闭肺证 橘红胶囊 Toll样受体4 髓样分化因子88 核转录因子ΚB
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谷子HSF转录因子基因鉴定与生物信息学分析 被引量:5
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作者 李雪垠 武懿茂 +2 位作者 张凤洁 韩渊怀 王兴春 《山西农业大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2019年第4期1-8,共8页
[目的]谷子是我国北方重要杂粮作物之一,具有丰富营养和药用价值。谷子耐旱、耐贫瘠,生长周期内经常会面临干热风等不良自然环境。热激转录因子(heat shock transcription factor, HSF)是植物一类重要转录因子,通过和热激反应相关基因... [目的]谷子是我国北方重要杂粮作物之一,具有丰富营养和药用价值。谷子耐旱、耐贫瘠,生长周期内经常会面临干热风等不良自然环境。热激转录因子(heat shock transcription factor, HSF)是植物一类重要转录因子,通过和热激反应相关基因启动子顺式作用元件结合,精确调控下游基因时空表达,调节植物热激应答。本研究旨在鉴定并分析谷子热激转录因子家族基因。[方法]采用生物信息学方法,在全基因组水平上鉴定谷子HSF转录因子家族成员,并进行系统发育、基因结构、蛋白质模体、启动子顺式作用元件和基因表达分析。[结果]谷子HSF转录因子家族共有27个基因;亲缘关系较近的谷子 HSF 基因的基因结构和蛋白质氨基酸序列也较为相似;谷子绝大多数 HSF 基因只含有2个外显子,绝大多数内含子的相位是0;谷子所有 HSF 基因都含有motif1、motif2和motif3,这3个motif在谷子HSF蛋白质序列最为保守;SiHSF20 等基因启动子区域都含有ABRE、MBS、TC-rich repeats等逆境胁迫响应元件;SiHSF1 、 SiHSF2 和 SiHSF3 基因在干旱处理根组织中表达量都较高,说明这3个基因与干旱诱导表达相关。[结论] SiHSF1 、 SiHSF2 、 SiHSF3 和 SiHSF20 基因可能参与调控谷子热激应答反应。谷子 HSF 基因家族分析有助于进一步鉴定热激应答相关基因,为挖掘抗逆基因资源提供理论依据。 展开更多
关键词 谷子 热激 转录因子 hsf 基因 生物信息学
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