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DNA-guided hepatitis B treatment,viral load is essential,but not sufficient 被引量:8
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作者 Rafael Bárcena Marugán Silvia García Garzón 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2009年第4期423-430,共8页
Hepatitis B virus (HBV) infection is a global public health problem that concerns 350 million people worldwide. Individuals with chronic hepatitis B (CriB) are at increased risk of developing liver cirrhosis, hepa... Hepatitis B virus (HBV) infection is a global public health problem that concerns 350 million people worldwide. Individuals with chronic hepatitis B (CriB) are at increased risk of developing liver cirrhosis, hepatic de-compensation and hepatocellular carcinoma. To maintain undetectable viral load reduces chronic infection complications. There is no treatment that eradicates HBV infection. Current drugs are expensive, are associated with adverse events, and are of limited efficacy. Current guidelines try to standardize the clinical practice. Nevertheless, controversy remains about management of asymptomatic patients with CriB who are hepatitis B e antigen (HBeAg)-positive with normal alanine aminotransferase, and what is the cut-off value of viral load to distinguish HBeAg- negative CriB patients and inactive carriers. We discuss in detail why DNA level alone is not sufficient to begin treatment of CriB. 展开更多
关键词 hepatitis b virus viral DNA Alaninetransaminase Antiviral drug hepatitis b e antigen Antiviral drug resistance
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Clinical relevance of hepatitis B virus variants 被引量:5
2
作者 Shan Gao Zhong-Ping Duan Carla S Coffin 《World Journal of Hepatology》 CAS 2015年第8期1086-1096,共11页
The hepatitis B virus(HBV) is a global public health problem with more than 240 million people chronically infected worldwide, who are at risk for end-stage liver disease and hepatocellular carcinoma. There are an est... The hepatitis B virus(HBV) is a global public health problem with more than 240 million people chronically infected worldwide, who are at risk for end-stage liver disease and hepatocellular carcinoma. There are an estimated 600000 deaths annually from complications of HBV-related liver disease. Antiviral therapy with nucleos/tide analogs(NA) targeting the HBV polymerase(P) can inhibit disease progression by long-term suppression of HBV replication. However, treatment may fail with first generation NA therapy due to the emergence of drugresistant mutants, as well as incomplete medication adherence. The HBV replicates via an error-prone reverse transcriptase leading to quasispecies. Due to overlapping open reading frames mutations within the HBV P can cause concomitant changes in the HBV surface gene(S) and vice versa. HBV quasispecies diversity is associated with response to antiviral therapy, disease severity and long-term clinical outcomes. Specific mutants have been associated with antiviral drug resistance, immune escape, liver fibrosis development and tumorgenesis. An understanding of HBV variants and their clinical relevance may be important for monitoring chronic hepatitis B disease progression and treatment response. In this review, we will discuss HBV molecular virology, mechanism of variant development, and their potential clinical impact. 展开更多
关键词 Molecular VIROLOGY Genetic heterogeneity QUASISPECIES drug resistance Immune ESCAPE virallymphotropism hepatitis b virus
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华北地区HBV基因亚型特点及其与核苷(酸)类抗HBV药物耐药突变的关系 被引量:11
3
作者 李晓东 李庆虹 +7 位作者 李进 周渝霞 郝玉清 戴久增 李乐 姚增涛 张玲霞 徐东平 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期629-631,634,共4页
目的研究乙型肝炎病毒(HBV)基因亚型在中国华北地区的分布情况及其对核苷(酸)类药物基因型耐药突变发生率的影响。方法提取2377例慢性乙肝(1942例)和乙肝相关肝硬化(435例)患者血清HBVDNA,采用巢式PCR扩增反转录酶(RT)基因区,对PCR产物... 目的研究乙型肝炎病毒(HBV)基因亚型在中国华北地区的分布情况及其对核苷(酸)类药物基因型耐药突变发生率的影响。方法提取2377例慢性乙肝(1942例)和乙肝相关肝硬化(435例)患者血清HBVDNA,采用巢式PCR扩增反转录酶(RT)基因区,对PCR产物直接测序,根据所测RT/S基因序列构建系统进化树确定HBV基因亚型,检测RT区耐药突变,将数据录入HBVdb数据库进行分析。结果感染HBV各基因亚型的例数为B1型10例(0.4%),B2型344例(14.5%),B3型6例(0.3%),B4型8例(0.3%),C1型28例(1.2%),C2型1937例(81.4%),C3型21例(0.9%),C4型6例(0.3%),D型17例(0.7%)。B2和C2亚型患者之间在性别、HBVDNA载量、总胆红素、丙氨酸氨基转移酶/天冬氨酸氨基转移酶(ALT/AST)水平、胆碱酯酶、凝血酶原活动度方面差异无统计学意义(P>0.05);慢性乙肝患者中,C2亚型病毒感染的拉米夫定耐药突变V173L、L180M、M204I和阿德福韦酯耐药突变A181V检出率显著高于B2亚型病毒感染(P<0.05);乙肝相关肝硬化患者中,B2亚型病毒感染的阿德福韦酯耐药突变N236T检出率显著高于C2亚型病毒感染(P=0.014)。结论我国华北地区流行的HBV以C型和B型为主,其中C2和B2为主要亚型,HBV基因亚型可能会影响临床核苷(酸)类药物的耐药突变发生率。 展开更多
关键词 肝炎病毒 乙型 基因亚型 抗药性 病毒 突变
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阿德福韦酯治疗失败的慢性乙型肝炎患者HBV反转录酶区新变异rtN236V的表型耐药特点分析 被引量:9
4
作者 王晓 刘妍 +8 位作者 思兰兰 陈丽 白文林 刘立明 王嫣 许智慧 戴久增 姚增涛 徐东平 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期256-259,共4页
目的鉴定1例阿德福韦酯(ADV)治疗失败的慢性乙型肝炎患者HBV反转录酶(RT)区的新变异rtN236V,并分析其表型耐药特点。方法从1例ADV治疗失败患者的血清中提取HBV DNA,采用巢式PCR扩增HBV RT区,将PCR产物克隆到pGEM-Teasy载体,转化JM109细... 目的鉴定1例阿德福韦酯(ADV)治疗失败的慢性乙型肝炎患者HBV反转录酶(RT)区的新变异rtN236V,并分析其表型耐药特点。方法从1例ADV治疗失败患者的血清中提取HBV DNA,采用巢式PCR扩增HBV RT区,将PCR产物克隆到pGEM-Teasy载体,转化JM109细胞。挑选34个阳性克隆进行DNA测序并分析耐药相关突变。构建1.1倍HBV野生株和耐药株重组载体,转染人肝癌细胞系HepG2细胞。转染4h后分别加入不同浓度的拉米夫定(LAM)、ADV、恩替卡韦(ETV)和替诺福韦(TDF),转染后第4天收集细胞培养液,采用实时荧光定量PCR法检测不同药物浓度作用下细胞培养上清中HBV DNA的产量,并分析其表型耐药特点。结果该例患者在接受ADV治疗15个月后出现病毒学突破和生化学突破,测序结果显示34个克隆中,20个(58.8%)为rtN236V变异株,11个(32.4%)为rtN236T变异株,2个(5.9%)为野生株,1个(2.9%)为rtA181V+N236V变异株。rtN236T、rtN236V和rtA181V+N236V变异株的相对病毒复制力分别为野生株的89.43%、83.60%和75.44%。表型耐药分析显示:rtN236T株、rtN236V株和rtA181V+N236V株对ADV的敏感性分别为野生株的1/4.75、1/3.10和1/5.10,但对LAM、ETV和TDF均敏感。结论在ADV长期治疗失败的慢性乙型肝炎患者血清病毒池中鉴定了新的变异形式rtN236V,并与rtN236T和rtA181V株伴随存在,该变异降低了病毒的复制力及对ADV的敏感性,可能是一个新的ADV耐药相关变异。 展开更多
关键词 肝炎病毒 乙型 变异 抗药性 病毒
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拉米夫定耐药慢性乙型肝炎患者HBV聚合酶基因的突变模式分析 被引量:9
5
作者 周先珊 万谟彬 郑瑞英 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第10期1250-1252,共3页
目的分析慢性乙型肝炎患者在拉米夫定(LAM)治疗过程中出现LAM耐药后,HBV聚合酶基因的突变模式及临床特征。方法对2005年12月-2007年12月于第二军医大学长海医院住院或感染科门诊诊治的慢性乙型肝炎LAM耐药患者进行HBV聚合酶基因测序,... 目的分析慢性乙型肝炎患者在拉米夫定(LAM)治疗过程中出现LAM耐药后,HBV聚合酶基因的突变模式及临床特征。方法对2005年12月-2007年12月于第二军医大学长海医院住院或感染科门诊诊治的慢性乙型肝炎LAM耐药患者进行HBV聚合酶基因测序,回顾性分析LAM耐药时HBV聚合酶基因的不同突变模式及患者临床特征。结果215例患者诊断为LAM耐药,192例患者检测到LAM相关的HBV聚合酶基因突变。患者血清HBV DNA水平为6.25±1.31(log10拷贝/ml),ALT中位水平为75U/L(19~821U/L),72.4%(139/192)的患者出现ALT升高、肝炎发作。99.0%(190/192)的患者存在YMDD基序突变,其中4种主要突变类型是:rt M204I(33.9%),rtL180 M+rt M204V(26.0%),rtL180 M+rt M204I(21.9%),rtV173L+rtL180 M+rt M204V(11.5%)。与rt M204I相比,rt M204V多以联合rtL180 M突变的形式存在(P〈0.05)。LAM耐药时,4种突变类型患者的血清HBVDNA、ALT差异均无统计学意义(P〉0.05)。结论YMDD基序突变是LAM耐药后HBV聚合酶基因突变的主要模式,LAM耐药后患者临床病情轻重可能与HBV聚合酶基因突变类型无关。 展开更多
关键词 肝炎 乙型 慢性 拉米夫定 抗药性 病毒 突变
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焦磷酸测序法在HBV阿德福韦酯耐药检测中的应用 被引量:5
6
作者 郑金梅 赵龙凤 +4 位作者 杨松 王琦 邢卉春 谢雯 成军 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第10期1199-1200,1204,共3页
目的评价焦磷酸测序法在慢性乙型肝炎(CHB)患者阿德福韦酯(ADV)耐药检测中的应用。方法选取ADV治疗失败的CHB患者,采用PCR产物焦磷酸测序法检测ADV耐药相关的rtA181V/T和rtN236T变异,并与PCR产物双脱氧测序法进行比较。计算两种方法的... 目的评价焦磷酸测序法在慢性乙型肝炎(CHB)患者阿德福韦酯(ADV)耐药检测中的应用。方法选取ADV治疗失败的CHB患者,采用PCR产物焦磷酸测序法检测ADV耐药相关的rtA181V/T和rtN236T变异,并与PCR产物双脱氧测序法进行比较。计算两种方法的耐药检出率及采用焦磷酸测序法检出的变异株在病毒群中所占的比例。结果共入选患者210例,经双脱氧测序法与焦磷酸测序法检测共确认耐药变异患者67例,耐药变异位点92个,其中焦磷酸测序法检出耐药患者64例(95.52%)、变异位点86个(93.48%),双脱氧测序法检出耐药患者52例(77.61%)、变异位点71个(77.17%),两种方法结果符合率为83.8%。焦磷酸测序法检出44例发生单位点变异的患者,其中变异株比例<50%的患者26例,最低耐药株比例为6.5%。rtA181T、rtA181V、rtN236T变异的平均变异株比例分别为34.12%、61.23%、59.69%,其中rtA181V与rtN236T的变异株比例无明显差异(P=0.909),但均高于rtA181T的变异株比例(P<0.01,P<0.05)。结论焦磷酸测序法的ADV耐药检出率优于双脱氧测序法,前者可进一步计算患者体内变异株的比例;在大部分患者中检出耐药时变异株不一定是优势株。 展开更多
关键词 肝炎 乙型 慢性 阿德福韦酯 抗药性 病毒 焦磷酸测序法
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接受拉米夫定治疗的慢性乙肝患者HBV反转录酶区新变异rtM204Q的表型特点分析 被引量:4
7
作者 王嫣 刘妍 +5 位作者 许智慧 思兰兰 陈丽 戴久增 姚增涛 徐东平 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期548-551,共4页
目的分析乙肝病毒(HBV)反转录酶(RT)区YMDD功能域新变异rtM204Q的表型特点。方法从1例接受拉米夫定(LAM)治疗的慢性乙肝患者血清中提取HBV DNA,扩增HBV全长RT区基因,PCR产物直接克隆到pGEM-Teasy载体中,随机挑选40个克隆进行DNA序列测... 目的分析乙肝病毒(HBV)反转录酶(RT)区YMDD功能域新变异rtM204Q的表型特点。方法从1例接受拉米夫定(LAM)治疗的慢性乙肝患者血清中提取HBV DNA,扩增HBV全长RT区基因,PCR产物直接克隆到pGEM-Teasy载体中,随机挑选40个克隆进行DNA序列测定并分析耐药相关变异。将Xho I/Sph I双酶切后的RT片段与载体连接成含HBV 1.1倍基因组长度的重组载体。采用FuGENE HD试剂盒,将构建的含野生株和变异株的重组载体转染至人肝癌细胞系HepG2细胞。转染4h后加入不同浓度的核苷(酸)类药物[LAM终浓度为0、0.01、0.1、1、10、100μmol/L;阿德福韦酯(ADV)终浓度为0、0.033、0.1、0.33、1、3.3μmol/L;恩替卡韦(ETV)终浓度为0、0.001、0.01、0.1、1、10μmol/L;替诺福韦酯(TDF)终浓度为0、0.01、0.1、1、10、100μmol/L],隔天换药,连续作用4d后收集细胞上清,采用实时荧光定量PCR技术检测不同药物浓度下HBV DNA的复制水平,以分析变异株的表型特点。结果对从患者血清获得的37个克隆进行测序分析,结果显示13个(35.1%)为野生型,11个(29.7%)为rtM204Q突变型,2个(5.4%)为rtM204I突变型,10个(27.0%)为rtA181T突变型,1个(2.7%)为rtA181T+rtM204Q突变型。后4种变异株的复制力分别是野生株复制力的89.95%、46.28%、55.77%和34.44%(P<0.05)。前2种变异形式的表型耐药分析结果显示,rtM204Q对LAM的敏感性为野生株的1/75.68,而rtM204I对LAM的敏感性不及野生株的1/1000。rtM204Q和rtM204I株对ADV、ETV和TDF均敏感。结论 HBV RT区新的YQDD基序变异在一定程度上抑制病毒复制力,对LAM的敏感性降低,提示这可能是一个新的LAM耐药相关变异。 展开更多
关键词 肝炎病毒 乙型 抗药性 病毒 突变
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310例接受拉米夫定治疗的慢性乙型肝炎患者HBV RT区全长测序及结果分析 被引量:3
8
作者 任伟宏 孙蕾 +1 位作者 赵素玲 顾侦芳 《国际检验医学杂志》 CAS 2010年第1期34-36,共3页
目的对接受拉米夫定(LAM)治疗慢性乙型肝炎(CHB)患者HBV P基因RT区全长测序并分析结果。方法选择接受拉米夫定治疗6个月以上的慢性乙型肝炎患者310例,收集LAM治疗后患者的血清,采用直接PCR产物基因测序法对HBV RT区碱基进行测序,后对测... 目的对接受拉米夫定(LAM)治疗慢性乙型肝炎(CHB)患者HBV P基因RT区全长测序并分析结果。方法选择接受拉米夫定治疗6个月以上的慢性乙型肝炎患者310例,收集LAM治疗后患者的血清,采用直接PCR产物基因测序法对HBV RT区碱基进行测序,后对测序数据用Chromas 223软件进行分析,找出HBV P基因RT区基因的变异位点和相应的氨基酸,进一步分析HBV耐药突变模式。结果 1)310例患者出现位点变异的有135例(43.5%),变异位点24个;2)基础变异位点和频率:rtM204 v/I 111例(82.20%),rtS213T 8例(5.92%),rtC256S 4例(2.96%),3位点差异有统计学意义(P<0.05);3)变异模式和频率:rtM204I 39例(28.89%),rtM204V+rtL108M 25例(18.51%),rtM204V+rt204I+rtL180M 11例(8.15%),rtM204I+rtL180M 6例(4.44%),rtM204V+rtL180M+rtV173L/M 5例(3.70%),rtS213T 5例(3.70%),rtM204V+rtL180M+rtV207M/L/I 4例(2.96%),rtM204V 4例(2.96%)等;4)rtM204V还可伴随rtT184 I/S/M、rtA181T、rtC256S、rtS213T、rtL229V等位点变异。结论拉米夫定长期治疗可引起主要耐药位点rtM204 v/I突变,并常有rtL180M、rtV173L、rtS213T、rtC256S、rtV207M/L等一系列补偿性耐药位点伴随;单位点突变除rtM204I一种外,还存在rtS213T、rtM204V等突变模式;联合突变模式多数包含rtM204位点,但也存在rtS213T+rtL187I、rtC256S+rtF221Y等突变模式。 展开更多
关键词 肝炎 乙型 慢性 肝炎病毒 拉米夫定 抗药性 病毒
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HBV多聚酶基因P区单位点和多位点突变、低中高HBV DNA载量、轻中重度的CHB患者外周血T淋巴细胞亚群观察 被引量:3
9
作者 杨莉 侯军良 +2 位作者 冯爱东 刘腾飞 许怡 《山东医药》 CAS 2021年第36期28-31,共4页
目的观察乙型肝炎病毒(HBV)多聚酶基因逆转录保守区(P区)单位点和多位点突变、低中高HBV DNA载量、轻中重度的慢性乙型肝炎(CHB)患者外周血T淋巴细胞亚群变化。方法CHB患者61例,采用基因测序确认HBV多聚酶基因P区位点突变,另取30例健康... 目的观察乙型肝炎病毒(HBV)多聚酶基因逆转录保守区(P区)单位点和多位点突变、低中高HBV DNA载量、轻中重度的慢性乙型肝炎(CHB)患者外周血T淋巴细胞亚群变化。方法CHB患者61例,采用基因测序确认HBV多聚酶基因P区位点突变,另取30例健康人群作对照,比较CHB患者HBV多聚酶基因P区位点突变前后及对照组CD3^(+)、CD4^(+)、CD8;T淋巴细胞变化。61例CHB患者又根据发生P区耐药基因突变的位点个数分为单位点者(29例)和多位点者(32例),根据HBV DNA载量分为低拷贝者(6例)、中拷贝者(22例)、高拷贝者(33例),根据病情程度分为轻度者(12例)、中度者(25例)、重度者(24例),比较其外周血CD3^(+)、CD4^(+)、CD8;T淋巴细胞变化。结果与健康人群比较,CHB患者发生HBV耐药基因突变后CD3^(+)、CD4^(+)、CD8;T淋巴细胞均降低(P均<0.05);与突变前比较,CHB患者突变后CD3^(+)、CD4^(+)T淋巴细胞降低(P均<0.05)。不同位点CHB患者CD3^(+)、CD4^(+)、CD8;T淋巴细胞比较均无显著性差异(P均>0.05)。不同HBV DNA载量CHB患者CD3^(+)、CD4^(+)、CD8;T淋巴细胞比较均无统计学差异(P均>0.05)。与中度者比较,重度者CD3^(+)、CD8;T淋巴细胞降低(P均<0.05)。结论CHB患者体内病毒发生耐药基因突变后,外周血CD3^(+)、CD4^(+)T淋巴细胞消耗增多;随耐药基因突变位点增多,HBV DNA载量不断增高,患者CD3^(+)、CD4^(+)、CD8;T淋巴细胞均呈消耗增多趋势。随病情加重,患者CD3^(+)、CD4^(+)T淋巴细胞消耗不断增多,尤其病情严重期,患者CD8;T淋巴细胞消耗亦增多。 展开更多
关键词 慢性乙型肝炎 病毒载量 P区耐药基因 T淋巴细胞 拉米夫定
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Fatal liver failure due to reactivation of lamivudine-resistant HBV mutant 被引量:10
10
作者 Tatehiro Kagawa Norihito Watanabe +9 位作者 Hisashi Kanouda Ichiro Takayama Tadahiko Shiba Takashi Kanai Kazuya Kawazoe Shinji Takashimizu Nobue Kumaki Kazuo Shimamura Shohei Matsuzaki Tetsuya Mine 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2004年第11期1686-1687,共2页
We report a case of fatal liver failure due to reactivation of lamivudine-resistant HBV. A 53-year-old man was followed since 1998 for HBV-related chronic hepatitis. Serum HBV-DNA was 150 MEq/mL (branched DNA signal a... We report a case of fatal liver failure due to reactivation of lamivudine-resistant HBV. A 53-year-old man was followed since 1998 for HBV-related chronic hepatitis. Serum HBV-DNA was 150 MEq/mL (branched DNA signal amplification assay) and ALT levels fluctuated between 50-200 IU/L with no clinical signs of liver cirrhosis. Lamivudine (100 mg/d) was started in May 2001 and serum HBV-DNA subsequently decreased below undetectable levels. In May 2002, serum HBV-DNA had increased to 410 MEq/mL, along with ALT flare (226 IU/L). The YMDD motif in the DNA polymerase gene had been replaced by YIDD. Lamivudine was continued and ALT spontaneously decreased to the former levels. On Oct 3 the patient presenting with general fatigue, nausea and jaundice was admitted to our hospital. The laboratory data revealed HBV reactivation and liver failure (ALT: 1828 IU/L, total bilirubin: 10 mg/dL, and prothrombin INR: 3.24). For religious reasons, the patient and his family refused blood transfusion, plasma exchange and liver transplantation. The patient died 10 d after admission. The autopsy revealed remarkable liver atrophy. 展开更多
关键词 drug resistance viral Fatal Outcome hepatitis b virus hepatitis b Chronic Humans LAMIVUDINE Male Middle Aged Mutation Recurrence Reverse Transcriptase Inhibitors
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含恩替卡韦耐药基因的HBV全基因组逆转录病毒载体的构建及包装 被引量:1
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作者 项凤梅 卢建溪 +4 位作者 王强 李永伟 陈伟 刘旭东 李刚 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期398-400,共3页
目的:构建含恩替卡韦耐药基因的HBV全基因组逆转录病毒载体,同时进行逆转录病毒载体的包装,为进一步产生含恩替卡位耐药基因的假病毒,进一步感染肝源性细胞,进行耐药机制的研究做准备。方法:采用基因扩增、重组和克隆的方法,从构建好的... 目的:构建含恩替卡韦耐药基因的HBV全基因组逆转录病毒载体,同时进行逆转录病毒载体的包装,为进一步产生含恩替卡位耐药基因的假病毒,进一步感染肝源性细胞,进行耐药机制的研究做准备。方法:采用基因扩增、重组和克隆的方法,从构建好的含恩替卡位耐药基因的重组质粒中,扩增出含恩替卡位耐药基因的HBV全基因组,然后插到pLEGFP-N1载体上,再进行重组质粒的转化、提取、纯化和测序,然后将测序成功的重组质粒扩大培养,并转染PT67细胞,最后通过荧光倒置显微镜观察和提取细胞培养上清进行病毒DNA提取。结果:凝胶电泳分析血清HBVDNA扩增可见3.2kb条带,HBVDNA和pLEGFP-N1载体连接后可见10.1kb目的条带,该重组质粒双酶切后可见3.2kb和6.9kb目的条带。突变前质粒测序显示含有HBV基因型为C型血清型adr的全基因组,突变后测序证实存在HBV逆转录酶169、184、202、250位点的预期碱基突变。荧光倒置显微镜显示,转染后的PT67细胞有明显的荧光表达,培养上清DNA提取后,经过核酸分析仪检测,最后换算结果显示培养上清假病毒颗粒可达104-105/cfu。结论:成功构建了含恩替卡韦耐药基因的HBV全基因重组质粒,并进行了包装,产生了含恩替卡位耐药基因的假病毒颗粒。 展开更多
关键词 肝炎病毒 乙型 恩替卡韦 基因组 药物耐受 病毒
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HBV序列与耐药分析信息平台的初步建立
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作者 李庆虹 李晓东 +6 位作者 庄永龙 郝玉清 刘妍 戴久增 赵达生 王业东 徐东平 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期1348-1350,共3页
目的采用生物信息和网络信息技术建立一个带有临床资料和代表性克隆基因的多功能乙型肝炎病毒(HBV)序列数据库及HBV耐药分析平台。方法平台的构建基于J2EE框架,支持Windows、Linux等操作系统,支持Oracle、Sqlserver、Mysql等数据库。整... 目的采用生物信息和网络信息技术建立一个带有临床资料和代表性克隆基因的多功能乙型肝炎病毒(HBV)序列数据库及HBV耐药分析平台。方法平台的构建基于J2EE框架,支持Windows、Linux等操作系统,支持Oracle、Sqlserver、Mysql等数据库。整合了序列比对、进化分析、抗原表位分析、耐药变异分析和耐药分析等生物信息学功能。收录的HBV基因序列、克隆和相关临床信息来源于2007年7月-2009年6月解放军302医院诊治的6880例HBV感染患者。结果初步建立了该信息平台并进行了应用。平台收录了本课题组检测分析的HBV全基因组序列516条,HBV反转录酶(RT)/S或前核心启动子/前C功能基因或调控序列11 456条,代表性HBV基因组或基因克隆613条以及患者的临床资料,实现了HBV序列比对、基因型/亚型和血清型分型、S/C/P/X蛋白氨基酸序列预测、T细胞抗原表位分析、耐药分析、患者临床信息检索等功能。应用该数据平台分析我国大样本慢性HBV感染患者HBV耐药变异和基因型流行特点,表明功能实用可靠。结论 HBV序列和耐药分析信息平台的建立有助于充分利用我国患者的HBV序列和相关信息资源,服务于乙肝患者的临床耐药检测和HBV病毒学特性研究。 展开更多
关键词 肝炎病毒 乙型 抗药性 病毒 序列分析 数据库
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慢性乙肝患者HBV反转录酶区新变异rtL180M+A181C+M204V的鉴定及表型耐药特点分析 被引量:4
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作者 刘佳慧 刘妍 +6 位作者 许智慧 王嫣 陈丽 李乐 姚增涛 胡景鑫 徐东平 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期552-555,共4页
目的鉴定经核苷(酸)类似物序贯治疗的慢性乙肝患者HBV反转录酶(RT)区的新变异rtA181C,并分析其表型耐药特点。方法 2010年6月解放军302医院确诊的慢性乙肝患者1例,提取血清HBV DNA,巢式PCR扩增HBVRT全基因,采用PCR产物直接双向测序结合... 目的鉴定经核苷(酸)类似物序贯治疗的慢性乙肝患者HBV反转录酶(RT)区的新变异rtA181C,并分析其表型耐药特点。方法 2010年6月解放军302医院确诊的慢性乙肝患者1例,提取血清HBV DNA,巢式PCR扩增HBVRT全基因,采用PCR产物直接双向测序结合克隆测序分析HBV RT区12个耐药相关突变位点。构建代表性克隆重组表达载体pTriEx-HBV1.1,瞬时转染人肝癌细胞系HepG2细胞,转染4h后加入不同浓度拉米夫定(LAM,终浓度为0、0.01、0.1、1、10、100μmol/L)、阿德福韦(ADV,终浓度为0、0.033、0.1、0.33、1、3.3μmol/L)、恩替卡韦(ETV,终浓度为0、0.001、0.01、0.1、1、10μmol/L)和替诺福韦(TDF,终浓度为0、0.01、0.1、1、10、100μmol/L),4d后采用实时荧光定量PCR检测不同药物浓度作用下培养细胞上清中HBV DNA的复制水平并分析其表型耐药特点。结果此例慢性乙肝患者序贯接受LAM治疗36个月→ADV治疗14个月→ETV治疗29个月,而后发生病毒学突破,HBV DNA由阴性升高至1.1×106IU/ml,ALT由正常升高至235U/L。直接测序显示HBV RT基因rtL180M+A181V+M204V变异,克隆测序得到18个克隆,其中9个为rtL180M+A181V+M204V变异株,7个为rtL180M+A181C+M204V变异株,1个为rtV173L+L180M+A181V变异株,1个为野生株。病毒复制力检测结果从高到低依次为:野生株>rtV173L+L180M+A181V>rtL180M+A181C+M204V>rtL180M+A181V+M204V。表型耐药分析显示,与野生株比较,rtL180M+A181V+M204V变异株和rtV173L+L180M+A181V变异株对LAM和ADV不敏感,rtL180M+A181C+M204V变异株对LAM和ETV不敏感。结论长期核苷(酸)类似物序贯治疗可引起多重耐药;rt181位点新的变异rtA181C与ETV长期用药有关,可能是新的ETV耐药变异位点。 展开更多
关键词 肝炎病毒 乙型 核苷(酸)类 突变 抗药性 病毒
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HBV反转录酶区rtA181S变异与阿德福韦酯耐药相关性研究 被引量:4
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作者 杨菁 刘妍 +5 位作者 陈容娟 许智慧 陈丽 辛绍杰 刘新光 徐东平 《传染病信息》 2013年第6期339-342,共4页
目的分析HBV反转录酶(RT)区rtA181S变异与阿德福韦酯(ADV)耐药的相关性。方法应用直接测序法筛选分析大样本慢性HBV感染者rtA181S变异的检出频率,并对1例接受ADV单药治疗失败的慢性乙型肝炎患者血清中HBV RT区基因进行克隆测序,分析相... 目的分析HBV反转录酶(RT)区rtA181S变异与阿德福韦酯(ADV)耐药的相关性。方法应用直接测序法筛选分析大样本慢性HBV感染者rtA181S变异的检出频率,并对1例接受ADV单药治疗失败的慢性乙型肝炎患者血清中HBV RT区基因进行克隆测序,分析相关变异形式。用XhoⅠ和SphⅠ双酶切pGEM-Teasy RT及pTriEx-HBV(C)载体后再连接,构建1.1倍HBV野生株和耐药株的重组质粒,转染人肝癌细胞系HepG2细胞,5 h后分别加入不同浓度的ADV(0、0.033、0.100、0.330、1.000、3.300μmol/L)。隔天换药,4 d后收集细胞上清,采用实时荧光定量PCR法检测不同药物浓度作用下细胞培养上清中的HBV DNA载量,并分析其表型耐药特点。结果 9830例慢性HBV感染者的12 000个血清样本中,有46例样本检出rtA181S变异(单独或与其他耐药变异联合出现),在653例中检出经典的rtN236T/A181V变异。其中随访的1例在接受ADV治疗19个月后出现了病毒学和生化学突破,直接测序检出rtA181S+N236T变异,克隆测序分析显示在24个克隆中11个(45.83%)为野生型,6个(25.00%)为rtN236T变异型,5个(20.83%)为rtA181S变异型,1个(4.16%)为rtA181V变异型,1个(4.16%)为rtA181S+N236T变异型。在体外实验中,rtN236T、rtA181S和rtA181S+N236T变异株的相对复制力分别是野生株的91.35%、29.90%和68.53%。表型耐药分析显示rtN236T、rtA181S和rtA181S+N236T变异株对ADV的灵敏性分别为野生株的1/4.41、1/3.05和1/5.43。结论 rtA181S是一种ADV耐药相关变异,可单独或联合其他变异引起患者耐药。但与经典ADV耐药变异相比,rtA181S变异引起的ADV耐药相对较弱,临床检出率较低。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 基因 病毒 抗药性 阿德福韦酯
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Virological response to adefovir monotherapy and the risk of adefovir resistance 被引量:6
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作者 Dong Hyun Sinn Geum-Youn Gwak +5 位作者 Moon Seok Choi Kwang Cheol Koh Seung Woon Paik Byung Chul Yoo Joon Hyeok Lee Hyang Ie Lee 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2011年第30期3526-3530,共5页
AIM:To evaluate virological response to adefovir(ADV) monotherapy and emergence of ADV-resistant mutations in lamivudine(LAM)-resistant chronic hepatitis B patients.METHODS:Seventy-seven patients with documented LAM r... AIM:To evaluate virological response to adefovir(ADV) monotherapy and emergence of ADV-resistant mutations in lamivudine(LAM)-resistant chronic hepatitis B patients.METHODS:Seventy-seven patients with documented LAM resistance who were treated with 10 mg/d ADV for>96 wk were analyzed for ADV resistance.RESULTS:At week 48 and 96,eight(10%)and 14(18%)of 77 LAM-resistant patients developed the ADV-resistant strain(rtA181V/T and/or rtN236T mutations),respectively.Hepatitis B virus(HBV)DNA levels during therapy were significantly higher in patients who developed ADV resistance than in those who did not.Incidence of ADV resistance at week 96 was 11%,8%and 6%among patients with complete virological response(HBV DNA level<60 IU/mL);0%,5%and 19%among patients with partial virological response(HBV DNA level≥60 to 2000 IU/mL);and 32%,34% and 33%among patients with inadequate virological response(HBV DNA levels>2000 IU/mL)at week 12,week 24 and week 48,respectively.HBV DNA levels >2000 IU/mL at week 24 showed best performance characteristics in predicting ADV resistance.CONCLUSION:Development of ADV resistance mutations was associated with HBV DNA levels,which could identify patients with LAM resistance who are likely to respond to ADV monotherapy. 展开更多
关键词 hepatitis b virus viral DNA ADEFOVIR LAMIVUDINE drug resistance
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1121例慢性乙型肝炎患者HBV反转录酶区的耐药突变分析(英文) 被引量:11
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作者 刘妍 王春梅 +7 位作者 纪冬 徐辰 韩萍 任晓强 许智慧 戴久增 张玲霞 徐东平 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期659-662,共4页
目的分析大样本慢性乙型肝炎患者HBV反转录酶基因上的多位点核苷(酸)类似物的耐药相关突变情况及其临床意义。方法提取1 121例患者血清HBV DNA,采用巢式PCR方法扩增HBV反转录酶(RT)基因,对PCR产物进行DNA双向测序,对12个位点上的耐药相... 目的分析大样本慢性乙型肝炎患者HBV反转录酶基因上的多位点核苷(酸)类似物的耐药相关突变情况及其临床意义。方法提取1 121例患者血清HBV DNA,采用巢式PCR方法扩增HBV反转录酶(RT)基因,对PCR产物进行DNA双向测序,对12个位点上的耐药相关突变进行检测,并结合临床资料进行分析。结果检出拉米夫定(LAM)耐药突变228例,阿德福韦(ADV)耐药突变32例,恩替卡韦(ETV)耐药突变13例,替比夫定(L-dT)耐药突变4例。多药耐药5例。LAM耐药突变中以M204V和M204I最常见,前者通常伴随L180 M突变,后者常单独出现;ADV耐药突变中以N236T±A181位碱基替换为主;ETV耐药突变发生在LAM耐药基础上,以T184位碱基替换为主;L-dT的耐药突变为M204I。结论用基因序列测定法检测HBV RT基因多位点耐药相关突变,有助于临床及时发现乙肝患者是否存在HBV基因耐药,合理进行抗病毒治疗。 展开更多
关键词 肝炎 乙型 慢性 突变 抗药性 病毒
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我国患者多重耐药乙肝病毒感染的基因型和表型特点 被引量:19
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作者 刘妍 许智慧 +10 位作者 刘立明 李乐 茹超 陈丽 白文林 李晓东 姚增涛 思兰兰 纪冬 辛绍杰 徐东平 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期539-543,共5页
目的分析我国大样本来源的慢性乙肝病毒(HBV)感染患者多重耐药HBV的基因型和表型特点。方法回顾性分析11 800例慢性乙肝患者血清中HBV反转录酶(RT)区与核苷(酸)类似物耐药相关的突变类型及频率,采用PCR产物直接测序法和克隆测序法(≥20... 目的分析我国大样本来源的慢性乙肝病毒(HBV)感染患者多重耐药HBV的基因型和表型特点。方法回顾性分析11 800例慢性乙肝患者血清中HBV反转录酶(RT)区与核苷(酸)类似物耐药相关的突变类型及频率,采用PCR产物直接测序法和克隆测序法(≥20个克隆/样本)对其中的46例多重耐药HBV突变株进行鉴定。采用体外表型耐药分析法检测核苷类与核苷酸类联合处理对多重耐药HBV的抑制效果。分析临床治疗方案在多重耐药HBV感染的发生及控制中的作用。结果在11 800例慢性HBV感染者中,共3658例(31.0%)检出核苷(酸)类耐药相关突变,其中拉米夫定(LAM)耐药突变2592例(70.9%),阿德福韦酯(ADV)耐药突变665例(18.2%),恩替卡韦(ETV)耐药突变293例(8.0%),替比夫定(LdT)耐药突变62例(1.7%),同时针对核苷类和核苷酸类的多重耐药(MDR)突变46例(1.3%)。对46例多重耐药感染样本的克隆测序显示,40例样本在同一病毒基因组上检出MDR突变,其他6例样本的MDR突变则存在于不同的HBV基因组中。基因型分析显示共有15种病毒变异形式,同时耐LAM(或LdT)和ADV,以及同时耐ETV和ADV的MDR株分别为10种和5种。体外表型耐药分析结果显示,ETV(或LAM)和ADV联合用药可有效抑制HepG2细胞内MDR HBV的复制,但对野生株无类似效果。临床用药方案分析显示,多重耐药HBV感染常出现在LAM(或)LdT、ADV、ETV序贯治疗的患者,以LAM→ADV(22例)和LAM→ADV→ETV(10例)最多见,发生多重耐药后大多出现病毒学和(或)生化学突破。LAM+ADV或ETV+ADV联合挽救治疗可成功将大多数多重耐药HBV的DNA复制控制在检测不到的水平。结论我国MDR HBV株具有多样性和复杂性,表型分析和临床观察均证实核苷与核苷酸类似物联合使用可有效控制MDR HBV复制。多重耐药HBV感染的发生与临床长期应用核苷(酸)类似物序贯治疗有关,密切监测病毒应答及耐药突变对于临床尽早制定最优的抗病毒策略具有重要意义。 展开更多
关键词 肝炎病毒 乙型 核苷(酸)类 抗药性 多种 病毒 突变
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乙型肝炎病毒反转录酶区rtI233V变异的演变及病毒学特点分析 被引量:11
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作者 叶晓玲 刘妍 +6 位作者 陈容娟 许智慧 李晓东 叶海燕 唐振祥 程书权 徐东平 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期188-193,共6页
目的分析乙型肝炎病毒(HBV)反转录酶区rtI233V变异的演变规律及其与阿德福韦酯(ADV)耐药的相关性。方法分析9830例慢性HBV感染者血清样本中HBV rtI233V变异的检出率。选择其中2例代表性患者,动态收集血清样本,扩增HBV RT基因并克隆测序(... 目的分析乙型肝炎病毒(HBV)反转录酶区rtI233V变异的演变规律及其与阿德福韦酯(ADV)耐药的相关性。方法分析9830例慢性HBV感染者血清样本中HBV rtI233V变异的检出率。选择其中2例代表性患者,动态收集血清样本,扩增HBV RT基因并克隆测序(>20个克隆/样本),观察rtI233V变异的演变过程。构建pTriEx-HBV(C)1.1倍野生株和3种变异株(rtI233V、rtN236T、rtI233V+rtN236T)复制子,瞬时转染HepG2肝癌细胞,分别加入不同浓度的拉米夫定(LAM)、ADV、恩替卡韦(ETV)和替诺福韦(TDF)。采用实时荧光定量PCR法检测不同浓度药物作用后细胞培养上清中HBV DNA的水平,分析变异病毒复制力与表型耐药的变化特点。结果9830例慢乙肝患者血清样本中共检出rtI233V位点变异28例,检出率0.28%,其中rtI233V单独变异19例,与rtN236T等经典耐药变异联合出现9例。该变异的检出患者均有ADV治疗史,其中16例(57.1%)接受ADV单药治疗6个月以上,12例(42.9%)接受包括ADV的多药序贯联合治疗1年以上。病毒复制力与表型耐药分析显示,rtI233V变异株的复制力与野生株接近,rtN236T变异株的复制力较野生株显著降低;rtI233V变异株对LAM、ADV、ETV和TDF均敏感,rtI233V+rtN236T联合变异对耐药性的影响不大,但rtI233V变异可明显恢复rtN236T变异株受损的复制力。结论rtI233V位点变异与ADV应答不佳相关,虽不直接降低病毒对ADV的敏感程度,但可增加经典ADV耐药病毒株的复制力,是一种复制力补偿变异。 展开更多
关键词 肝炎病毒 乙型 阿德福韦酯 突变 DNA复制 抗药性 病毒
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阿德福韦酯单药或联合拉米夫定治疗拉米夫定耐药慢性乙型肝炎患者的临床研究 被引量:29
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作者 周先珊 万谟彬 郑瑞英 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期135-138,共4页
目的评价拉米夫定(LAM)耐药慢性乙型肝炎患者给予阿德福韦酯(ADV)单药治疗或ADV+LAM联合治疗的有效性与安全性。方法124例LAM耐药的慢性乙型肝炎患者,其中74例接受ADV+LAM联合治疗,50例接受ADV单药治疗,两组患者基线特征无差异。在基线... 目的评价拉米夫定(LAM)耐药慢性乙型肝炎患者给予阿德福韦酯(ADV)单药治疗或ADV+LAM联合治疗的有效性与安全性。方法124例LAM耐药的慢性乙型肝炎患者,其中74例接受ADV+LAM联合治疗,50例接受ADV单药治疗,两组患者基线特征无差异。在基线或治疗期间发现病毒学突破的任一时间点上,进行HBV聚合酶基因测序以明确LAM和ADV的相关耐药突变情况,治疗期间监测所有患者的临床及实验室相关指标。结果ADV单药治疗组患者HBV DNA下降的对数值,在第12周(1.99±0.64)和第24周(2.61±0.80)均明显低于ADV+LAM治疗组(2.55±0.74,3.19±0.82,P<0.01)。ADV单药治疗组患者的病毒学应答率,在第12周(52.0%)和第24周(78.0%)时明显低于ADV+LAM治疗组(78.4%,P<0.01;91.9%,P<0.05)。在开始ADV治疗24周后,ADV+LAM治疗组中,血清HBV DNA下降到检测限以下的患者占70.3%,明显高于ADV单药治疗组的48.0%(P<0.05)。治疗第48周时,ADV+LAM治疗组43例患者疗效稳定,未出现ADV耐药,而ADV单药治疗组27例治疗时间达到48周的患者中,有4例(14.8%)出现了ADV耐药,两者之间差异显著(P<0.05)。结论ADV联合LAM治疗与ADV单药治疗相比,可使患者获得更好的病毒学应答,ADV联合LAM治疗可作为LAM耐药患者的首选治疗方案。 展开更多
关键词 肝炎 乙型 慢性 拉米夫定 阿德福韦酯 抗药性 病毒 突变
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拉米夫定耐药慢性乙型肝炎患者改用或加用阿德福韦酯治疗48周疗效比较 被引量:7
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作者 黄美金 覃后继 +3 位作者 何延专 黄其文 周耀南 丘海先 《临床肝胆病杂志》 CAS 2014年第7期636-638,共3页
目的观察拉米夫定(LAM)与阿德福韦酯(ADV)联合应用和单用ADV治疗LAM耐药HBeAg阳性慢性乙型肝炎患者的疗效及安全性。方法收集2006年1月至2011年12月在本院就诊的LAM耐药HBeAg阳性慢性乙型肝炎患者40例,单药组与联合组各20例,分别以ADV与... 目的观察拉米夫定(LAM)与阿德福韦酯(ADV)联合应用和单用ADV治疗LAM耐药HBeAg阳性慢性乙型肝炎患者的疗效及安全性。方法收集2006年1月至2011年12月在本院就诊的LAM耐药HBeAg阳性慢性乙型肝炎患者40例,单药组与联合组各20例,分别以ADV与LAM联合或单用ADV进行治疗。观察治疗24周、48周时的血清HBV DNA水平及转阴率、HBeAg转阴率、ALT复常率以及治疗过程中药物的不良反应和耐药性。组间比较计量资料采用t检验,计数资料采用卡方检验。结果两组患者在性别、年龄、治疗前的HBV DNA及ALT水平上差异均无统计学意义(P>0.05);治疗结束时联合组的血清HBV DNA转阴率和ALT复常率分别为90%及95%,而单药组的血清HBV DNA转阴率和ALT复常率分别为60%及65%,两组比较差异有统计学意义(P<0.05);治疗结束时联合组血清HBeAg转阴率为45%,单药组为35%,两组比较差异无统计学意义(χ2=0.417,P=0.519)。结论 ADV联合LAM或ADV单药治疗LAM耐药HBeAg阳性慢性乙型肝炎患者均有较好的临床疗效,但ADV与LAM联合治疗可提高HBV DNA转阴率及ALT复常率,其安全性良好,值得借鉴。 展开更多
关键词 肝炎 乙型 慢性 拉米夫定 阿德福韦酯 抗药性 病毒
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