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念珠藻属植物hetR基因的适应性进化分析
被引量:
3
1
作者
王捷
魏爱丽
+3 位作者
石瑛
李艳晖
韩雨昕
王中杰
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期23-31,共9页
以念珠藻属(Nostoc)及其近缘类群hetR基因的51条序列为研究对象,对hetR基因的编码蛋白进行生物信息学分析和系统发育分析,并使用分支模型、位点模型和分支-位点模型进行该基因位点的适应性进化研究。系统发育分析结果显示,51条hetR基因...
以念珠藻属(Nostoc)及其近缘类群hetR基因的51条序列为研究对象,对hetR基因的编码蛋白进行生物信息学分析和系统发育分析,并使用分支模型、位点模型和分支-位点模型进行该基因位点的适应性进化研究。系统发育分析结果显示,51条hetR基因蛋白序列可分为4个大分支。适应性进化分析结果表明,在3种进化模型中,大多数分支及藻株都没有检测到统计学上具有显著性的正选择位点,说明检测的位点大多处于负选择压力下。但在普通念珠藻(Nostoc commune,CHAB2802)中检测到正选择位点(126T),提示念珠藻属植物hetR基因发生了适应性改变。
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关键词
念珠藻属
hetr基因
适应性进化
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职称材料
题名
念珠藻属植物hetR基因的适应性进化分析
被引量:
3
1
作者
王捷
魏爱丽
石瑛
李艳晖
韩雨昕
王中杰
机构
太原师范学院生物系
山西大学生命科学学院
中国科学院武汉植物园
出处
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期23-31,共9页
基金
国家自然科学基金项目(51709197)
山西省“1331工程”重点创新团队建设计划(TD201718)
+1 种基金
山西省应用基础研究计划(201801D221282)
山西省高等学校科技创新项目(201802102)。
文摘
以念珠藻属(Nostoc)及其近缘类群hetR基因的51条序列为研究对象,对hetR基因的编码蛋白进行生物信息学分析和系统发育分析,并使用分支模型、位点模型和分支-位点模型进行该基因位点的适应性进化研究。系统发育分析结果显示,51条hetR基因蛋白序列可分为4个大分支。适应性进化分析结果表明,在3种进化模型中,大多数分支及藻株都没有检测到统计学上具有显著性的正选择位点,说明检测的位点大多处于负选择压力下。但在普通念珠藻(Nostoc commune,CHAB2802)中检测到正选择位点(126T),提示念珠藻属植物hetR基因发生了适应性改变。
关键词
念珠藻属
hetr基因
适应性进化
Keywords
Nostoc
hetr
gene
Adaptive evolution
分类号
Q949.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
念珠藻属植物hetR基因的适应性进化分析
王捷
魏爱丽
石瑛
李艳晖
韩雨昕
王中杰
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
3
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职称材料
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参考文献
引证文献
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